Entry information : AhalAPx08Araha.9836s0001
Entry ID 14781
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalAPx08Araha.9836s0001
Name AhalAPx08Araha.9836s0001
Class Ascorbate peroxidase family    [Orthogroup: N/D] N/D
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalAPx08
start..stop
S start..stop
AlyAPx06 810 0 1..424 1..429
AtAPx06 786 0 1..424 1..426
CagraAPx06 745 0 1..424 1..430
CrubAPx06 744 0 1..424 1..430
Literature and cross-references AhalAPx08Araha.9836s0001
Protein sequence: AhalAPx08Araha.9836s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   424
PWM (Da):   %s   46001.52 Transmb domain:   %s   o395-417i
PI (pH):   %s   7.92
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MALSLSAASH LLCSSTRVSL SPAVTSSSLS SSSSPHSLSS LRSVASSSLF PCTTSFVLQR KHPINGTSTR MVSPKCAASD AAQLRSAKED IKVLLRTKFC HPILVRLGWH DAGTFNKSIE  EWPQRGGANG SLRFEAELKH AANAGLLNAL KLIQPIKDKY PNISYADLFQ LASATAVEEA AGPEIPMKYG RVDVVAPEQC PEEGRLPDAG PPSPADHLRD VFYRMGLDDK EIVALSGAHT  LGRARPDRSG WGKPETKYTK TGPGEAGGQS WTVKWLKFDN SYFKDIKEKR DEDLLVLPTD AALFEDPSFK NYAEKYAEDP AAFFKDYAEA HAKLSNLGAK FDPPEGIIID NAPEKFVAAK 
YSTGKKELSD SMKKKIRAEY EAIGGSPDKP LPTNYFLNII IAIGVLVLLS TLFGGNNNSD FSGF* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAATAGATC CAACTGGCAA CGCATTATTG ACACGTGTCT CTTCCGGCGC TTTCTCTCCA CCGTGACAAT GGCTCTTTCT CTCTCCGCCG CCTCTCACTT ACTCTGTTCC TCCACCAGAG  TCTCTCTTTC CCCCGCCGTC ACCTCCTCCT CTCTTTCTTC CTCTTCATCG CCACATTCTC TGTCTTCTCT TCGAAGCGTC GCGTCTTCTT CTCTGTTTCC TTGCACCACC TCCTTCGTTC  TTCAGGTATT CGTCCTTCAG TTGCGAGATT CATACTTTTG TAAATTTCTC TCTGAACATA ACATTTTCTG TTGATTTTAG AGAAAACATC CGATCAATGG GACGAGCACG AGGATGGTTT  CACCAAAATG TGCGGCTTCT GATGCAGCTC AATTGAGAAG CGCTAAAGAA GATATCAAAG TTCTTCTCCG GACTAAGTTT TGCCATCCCA TTTTGGTGAA GTATCTTTCT CTTCTTGATA  ATGTGCTACT TCTTCTTCGG ATAATGATAT AGGACGGGGA ATTTTTGAAT TCATGGAAGT AGAAATTTTG CAGCTGGATC ACGATTCTAC GGCATTGTTG TTACTAAAGA TATTGGAGGA  AGAGAACTGA ATTTGTGAGT TCTGTTGCTT TGTGTTTGAC AATAGTTACA TGTTTCATTG CAGGTTAGGT TGGGATGGCA CGATGCTGGT ACATTTAACA AGAGCATTGA GGAGTGGCCA  CAAAGAGGTG GAGCTAATGG AAGTCTTAGG TTTGAGGCTG AGCTTAAGCA TGCTGCAAAT GCCGGTACTG CTTCCAACAC AATTCACCTG CATTTTGGGC TTGAGACTTT GTTTTTGGTC  TTTATATTCT ACTTTTGACA TTTCCAGGTC TGCTTAATGC TTTAAAGCTC ATTCAGCCTA TCAAAGACAA GTATCCTAAC ATCTCTTATG CGGACTTATT CCAGTTAGCT AGTGCCACTG  CAGTAGAGGT TCTGAAATCC TGATGAAATT ATGTTGGGCT TGGCTTAGCA GGAAACTATG TTGGTCTAAA AACTTTACTG ATTTTAAACT TCAGGAGGCT GCTGGTCCTG AAATCCCGAT  GAAATATGGG AGAGTTGATG TCGTAGCACC TGAACAGTGT CCAGAAGAAG GAAGACTCCC TGGTTAACTA ATCTTTCCAT TGTCTGTTTC ATGGCTTCAA TGAGTTGGTT TCAGATTTTC  TTATGGACTA ATTAAGTTAA CGAGGTGAAA TATGCTGTGT TTTAGATGCT GGACCTCCCT CACCAGCTGA TCATTTGAGA GATGTATTTT ACAGAATGGG ACTAGATGAC AAGGTGATTT  TGATTTTGTT CCATGTCAAA CGTGAATATT CTCATTTTCT GACAGTCGAT GTTGTTTTGA CAAGCAGGAA ATAGTTGCCT TGTCTGGTGC ACATACCTTA GGAAGAGCCA GGCCAGACCG  TAGCGGTTGG GGAAAACCTG AGACAAAGTA CACGGTATAA TAAACGACAA AATGAACTCC CTTATGTTGT TGTTGCAATG ATAGTGTAGA GATGTTATGG AAACGTTCAA CATGGCAGAA  AACTGGACCA GGAGAAGCAG GAGGACAGTC ATGGACAGTG AAATGGCTTA AGTTTGACAA TTCTTACTTC AAGGTCTATC TCTCTATCTT TCTTAGTAAC TTGGTTTGGG ACTGGGGAAG  AGTTTTCTTA ATCATTGACT TCTATGACTT TGCAGGATAT CAAAGAAAAG AGGGACGAAG ATCTTCTGGT GTTACCCACT GATGCTGCGC TATTCGAAGA TCCTTCATTC AAGGTTTAAA  CAACAGTGAT TGCTAATAAG ATGCCTCAGA AGTAGTAGTT CACTGTTAAT TAAGAGAAAA TGTTTTCAAA AAACTCTGTT TTACAGAACT ATGCGGAGAA GTATGCTGAA GATCCGGCTG  CATTTTTCAA GGATTACGCT GAAGCTCATG CCAAGCTCAG CAATCTCGGC GCAAAATTTG ATCCTCCCGA GGTACAAGGA CAGAGAGAAA ATCTAATCTC TAGGCACTTG TGTTAACCAT  TATGAATGAA CCATACGTTT AAATCTAGTT CAGTGACTTA ACCATATAGC CTAAAACTAC TAATGTGTCA ACTAATCAGG GCATCATCAT TGACAACGCT CCAGAGAAGT TTGTAGCTGC  GAAGTATTCC ACGGGAAAGG TTTGTCCTTA CTAAACAAAA ATGTGTTTGT GTAGCTTATT CTAATATACA TGTTGAGGAA ACGATTCTTG TTATTAATTT TCCAGTAATA TTTTGCAGAA  GGAGCTTTCG GATTCGATGA AAAAGAAGAT AAGAGCAGAG TATGAAGCAA TTGGAGGAAG TCCAGATAAG CCATTACCGA CAAATTACTT CCTCAACATC ATAATTGCCA TTGGCGTTTT  GGTCCTCTTG TCCACTCTCT TTGGTGGTAA TAACAACTCC GATTTCTCTG GTTTCTGATT GACAAATTAG AAAAATTGTA TATTTTGATT TCTCTTACGT ATATACATAA TCACGTGGTG 
ATCAAATATT CTTTGCAAAC AAACACATCA TTGTTATAGT TTGCTTGAAT AAAATCACCT TTAATAACAT TGTTTATTTG GTGGTTTTAG ATTTTGG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTCTTT CTCTCTCCGC CGCCTCTCAC TTACTCTGTT CCTCCACCAG AGTCTCTCTT TCCCCCGCCG TCACCTCCTC CTCTCTTTCT TCCTCTTCAT CGCCACATTC TCTGTCTTCT  CTTCGAAGCG TCGCGTCTTC TTCTCTGTTT CCTTGCACCA CCTCCTTCGT TCTTCAGAGA AAACATCCGA TCAATGGGAC GAGCACGAGG ATGGTTTCAC CAAAATGTGC GGCTTCTGAT  GCAGCTCAAT TGAGAAGCGC TAAAGAAGAT ATCAAAGTTC TTCTCCGGAC TAAGTTTTGC CATCCCATTT TGGTTAGGTT GGGATGGCAC GATGCTGGTA CATTTAACAA GAGCATTGAG  GAGTGGCCAC AAAGAGGTGG AGCTAATGGA AGTCTTAGGT TTGAGGCTGA GCTTAAGCAT GCTGCAAATG CCGGTCTGCT TAATGCTTTA AAGCTCATTC AGCCTATCAA AGACAAGTAT  CCTAACATCT CTTATGCGGA CTTATTCCAG TTAGCTAGTG CCACTGCAGT AGAGGAGGCT GCTGGTCCTG AAATCCCGAT GAAATATGGG AGAGTTGATG TCGTAGCACC TGAACAGTGT  CCAGAAGAAG GAAGACTCCC TGATGCTGGA CCTCCCTCAC CAGCTGATCA TTTGAGAGAT GTATTTTACA GAATGGGACT AGATGACAAG GAAATAGTTG CCTTGTCTGG TGCACATACC  TTAGGAAGAG CCAGGCCAGA CCGTAGCGGT TGGGGAAAAC CTGAGACAAA GTACACGAAA ACTGGACCAG GAGAAGCAGG AGGACAGTCA TGGACAGTGA AATGGCTTAA GTTTGACAAT  TCTTACTTCA AGGATATCAA AGAAAAGAGG GACGAAGATC TTCTGGTGTT ACCCACTGAT GCTGCGCTAT TCGAAGATCC TTCATTCAAG AACTATGCGG AGAAGTATGC TGAAGATCCG  GCTGCATTTT TCAAGGATTA CGCTGAAGCT CATGCCAAGC TCAGCAATCT CGGCGCAAAA TTTGATCCTC CCGAGGGCAT CATCATTGAC AACGCTCCAG AGAAGTTTGT AGCTGCGAAG  TATTCCACGG GAAAGAAGGA GCTTTCGGAT TCGATGAAAA AGAAGATAAG AGCAGAGTAT GAAGCAATTG GAGGAAGTCC AGATAAGCCA TTACCGACAA ATTACTTCCT CAACATCATA 
ATTGCCATTG GCGTTTTGGT CCTCTTGTCC ACTCTCTTTG GTGGTAATAA CAACTCCGAT TTCTCTGGTT TCTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAATAGATC CAACTGGCAA CGCATTATTG ACACGTGTCT CTTCCGGCGC TTTCTCTCCA CCGTGACAAT GGCTCTTTCT CTCTCCGCCG CCTCTCACTT ACTCTGTTCC TCCACCAGAG  TCTCTCTTTC CCCCGCCGTC ACCTCCTCCT CTCTTTCTTC CTCTTCATCG CCACATTCTC TGTCTTCTCT TCGAAGCGTC GCGTCTTCTT CTCTGTTTCC TTGCACCACC TCCTTCGTTC  TTCAGAGAAA ACATCCGATC AATGGGACGA GCACGAGGAT GGTTTCACCA AAATGTGCGG CTTCTGATGC AGCTCAATTG AGAAGCGCTA AAGAAGATAT CAAAGTTCTT CTCCGGACTA  AGTTTTGCCA TCCCATTTTG GTTAGGTTGG GATGGCACGA TGCTGGTACA TTTAACAAGA GCATTGAGGA GTGGCCACAA AGAGGTGGAG CTAATGGAAG TCTTAGGTTT GAGGCTGAGC  TTAAGCATGC TGCAAATGCC GGTCTGCTTA ATGCTTTAAA GCTCATTCAG CCTATCAAAG ACAAGTATCC TAACATCTCT TATGCGGACT TATTCCAGTT AGCTAGTGCC ACTGCAGTAG  AGGAGGCTGC TGGTCCTGAA ATCCCGATGA AATATGGGAG AGTTGATGTC GTAGCACCTG AACAGTGTCC AGAAGAAGGA AGACTCCCTG ATGCTGGACC TCCCTCACCA GCTGATCATT  TGAGAGATGT ATTTTACAGA ATGGGACTAG ATGACAAGGA AATAGTTGCC TTGTCTGGTG CACATACCTT AGGAAGAGCC AGGCCAGACC GTAGCGGTTG GGGAAAACCT GAGACAAAGT  ACACGAAAAC TGGACCAGGA GAAGCAGGAG GACAGTCATG GACAGTGAAA TGGCTTAAGT TTGACAATTC TTACTTCAAG GATATCAAAG AAAAGAGGGA CGAAGATCTT CTGGTGTTAC  CCACTGATGC TGCGCTATTC GAAGATCCTT CATTCAAGAA CTATGCGGAG AAGTATGCTG AAGATCCGGC TGCATTTTTC AAGGATTACG CTGAAGCTCA TGCCAAGCTC AGCAATCTCG  GCGCAAAATT TGATCCTCCC GAGGGCATCA TCATTGACAA CGCTCCAGAG AAGTTTGTAG CTGCGAAGTA TTCCACGGGA AAGAAGGAGC TTTCGGATTC GATGAAAAAG AAGATAAGAG  CAGAGTATGA AGCAATTGGA GGAAGTCCAG ATAAGCCATT ACCGACAAAT TACTTCCTCA ACATCATAAT TGCCATTGGC GTTTTGGTCC TCTTGTCCAC TCTCTTTGGT GGTAATAACA  ACTCCGATTT CTCTGGTTTC TGATTGACAA ATTAGAAAAA TTGTATATTT TGATTTCTCT TACGTATATA CATAATCACG TGGTGATCAA ATATTCTTTG CAAACAAACA CATCATTGTT 
ATAGTTTGCT TGAATAAAAT CACCTTTAAT AACATTGTTT ATTTGGTGGT TTTAGATTTT GG 

Retrieve as FASTA