Entry information : AhalPrx03 (Araha.37317s0001)
Entry ID 14784
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-01-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AhalPrx03 (Araha.37317s0001)
Name (synonym) AhalPrx03 (Araha.37317s0001)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx018]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx03
start..stop
S start..stop
AlyPrx37 634 0 1..316 30..345
AtPrx37 623 0 1..316 31..346
AhalPrx27 615 0 1..316 31..346
AlyPrx38-2 606 0 1..316 31..346
Literature and cross-references AhalPrx03 (Araha.37317s0001)
Protein sequence: AhalPrx03 (Araha.37317s0001)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   316
PWM (Da):   %s   34994.81  
PI (pH):   %s   8.39
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
KTCPQVFDIV TNTIVNALRL DPRIAASILR LHFHDCFVNG CDASILLDNT TSFRTEKDAF GNANSARGFD VIDKMKAAVE KACPRTVSCA DLLAIAAQES VVLAGGPSWR VPNGRRDSLR  GFMDLANDNL PAPSFTLKQL KDRFKNVGLD RASDLVALSG GHTFGKNQCR FIMDRLYNFS NSGLPDPTLD KSYLTTLRKQ CPRNGNQSVL VDFDLRTPTL FDNKYYVNLK EKKGLIQSDQ 
ELFSSPDASE TLPLVREFAD GQGKFFDAFV KAMIRMSSLS PLTGKQGEIR LNCRVVNSKP RIMDVVEDAI EFASSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. 5'end is missing due to N in the sequence
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGACATTGTA ACCAATACCA TTGTCAATGC TCTGAGATTA GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGTA  AGATACCATT AGATTTAATA TATTCATGTA TATGTTAACT CTTTTGGTTC CCTATAGTTT ATCCTAAAGA GTTATACTGA TATAATAAAC TACATGGCGA ATTAATGCTG CCTTCGGATT  CACGTAAATA AATTTATGCT ATAGATAGTT TGATACTAGA TTCACTATTT TTCTTGCAGT AAAAGGAAAA AAAAAATTAG CAGTAGATAT AACTTGTTTA TATAAAAATT GAAAGAGACT  AATTAAGATC AACTGTTTAT GGATGTTAAG ATTTTTTTTA ATTAACAATA TTTTGTTTTG AAAAAGGGAT GTGATGCGTC GATATTGTTA GACAACACCA CATCGTTTAG GACGGAGAAA  GACGCCTTTG GGAACGCTAA TTCAGCTCGG GGTTTCGATG TGATCGACAA AATGAAGGCT GCTGTAGAGA AAGCATGTCC TAGAACTGTT TCATGTGCTG ATTTGCTCGC CATCGCAGCT  CAAGAATCTG TTGTTTTGGT ATGCATCTTT TACTATGCTA TCCAAATAGT TTCTAGACAA TTTTGTTTAA TTTTAAAGGA GGAAAAGATA TTAGACCAAA TATATAATTT TACTCTAGGC  GGGAGGTCCT TCATGGAGGG TTCCAAATGG AAGAAGAGAC AGCTTAAGAG GGTTTATGGA TCTTGCTAAT GATAACCTTC CAGCTCCATC CTTTACCCTT AAACAACTTA AGGATAGATT  CAAAAATGTC GGACTCGACC GTGCTTCTGA TCTCGTTGCT CTTTCCGGTA TGTTATCATT GGAAACATTT TCACGTATAG TTGTAATAAC TAATAACTCT ATATGATAAA TTATTGGTCT  AGTTTATTTA TACTTTTGAT ATTTTTCTTT GGTTAGGTGG TCACACTTTT GGCAAAAACC AATGTCGGTT CATAATGGAT CGGCTTTACA ACTTCAGTAA CAGCGGTTTA CCCGACCCAA  CCCTTGATAA ATCTTATCTC ACCACACTCA GAAAACAATG TCCGCGTAAC GGAAACCAGA GTGTCTTGGT AGATTTTGAT TTACGTACGC CAACACTCTT TGACAACAAA TACTATGTGA  ATCTCAAAGA GAAAAAAGGT CTTATCCAGA GCGACCAAGA GTTATTCTCT AGCCCTGATG CTTCGGAAAC TCTCCCTTTA GTCCGAGAAT TCGCTGATGG TCAAGGAAAA TTTTTCGATG  CGTTCGTGAA GGCAATGATA AGGATGAGTA GTCTTTCACC TTTAACAGGG AAGCAAGGAG AAATAAGATT GAATTGTAGA GTGGTGAATT CGAAACCGAG AATCATGGAT GTGGTAGAAG 
ATGCTATTGA ATTTGCTAGC TCAATGTGAG GAAATGTTTT TCTTTAATAA TAAATAAAGG GAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGACATTGTA ACCAATACCA TTGTCAATGC TCTGAGATTA GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGGA  TGTGATGCGT CGATATTGTT AGACAACACC ACATCGTTTA GGACGGAGAA AGACGCCTTT GGGAACGCTA ATTCAGCTCG GGGTTTCGAT GTGATCGACA AAATGAAGGC TGCTGTAGAG  AAAGCATGTC CTAGAACTGT TTCATGTGCT GATTTGCTCG CCATCGCAGC TCAAGAATCT GTTGTTTTGG CGGGAGGTCC TTCATGGAGG GTTCCAAATG GAAGAAGAGA CAGCTTAAGA  GGGTTTATGG ATCTTGCTAA TGATAACCTT CCAGCTCCAT CCTTTACCCT TAAACAACTT AAGGATAGAT TCAAAAATGT CGGACTCGAC CGTGCTTCTG ATCTCGTTGC TCTTTCCGGT  GGTCACACTT TTGGCAAAAA CCAATGTCGG TTCATAATGG ATCGGCTTTA CAACTTCAGT AACAGCGGTT TACCCGACCC AACCCTTGAT AAATCTTATC TCACCACACT CAGAAAACAA  TGTCCGCGTA ACGGAAACCA GAGTGTCTTG GTAGATTTTG ATTTACGTAC GCCAACACTC TTTGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAA GAGAAAAAAG GTCTTATCCA GAGCGACCAA  GAGTTATTCT CTAGCCCTGA TGCTTCGGAA ACTCTCCCTT TAGTCCGAGA ATTCGCTGAT GGTCAAGGAA AATTTTTCGA TGCGTTCGTG AAGGCAATGA TAAGGATGAG TAGTCTTTCA 
CCTTTAACAG GGAAGCAAGG AGAAATAAGA TTGAATTGTA GAGTGGTGAA TTCGAAACCG AGAATCATGG ATGTGGTAGA AGATGCTATT GAATTTGCTA GCTCAATGTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGACATTGTA ACCAATACCA TTGTCAATGC TCTGAGATTA GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGGA  TGTGATGCGT CGATATTGTT AGACAACACC ACATCGTTTA GGACGGAGAA AGACGCCTTT GGGAACGCTA ATTCAGCTCG GGGTTTCGAT GTGATCGACA AAATGAAGGC TGCTGTAGAG  AAAGCATGTC CTAGAACTGT TTCATGTGCT GATTTGCTCG CCATCGCAGC TCAAGAATCT GTTGTTTTGG CGGGAGGTCC TTCATGGAGG GTTCCAAATG GAAGAAGAGA CAGCTTAAGA  GGGTTTATGG ATCTTGCTAA TGATAACCTT CCAGCTCCAT CCTTTACCCT TAAACAACTT AAGGATAGAT TCAAAAATGT CGGACTCGAC CGTGCTTCTG ATCTCGTTGC TCTTTCCGGT  GGTCACACTT TTGGCAAAAA CCAATGTCGG TTCATAATGG ATCGGCTTTA CAACTTCAGT AACAGCGGTT TACCCGACCC AACCCTTGAT AAATCTTATC TCACCACACT CAGAAAACAA  TGTCCGCGTA ACGGAAACCA GAGTGTCTTG GTAGATTTTG ATTTACGTAC GCCAACACTC TTTGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAA GAGAAAAAAG GTCTTATCCA GAGCGACCAA  GAGTTATTCT CTAGCCCTGA TGCTTCGGAA ACTCTCCCTT TAGTCCGAGA ATTCGCTGAT GGTCAAGGAA AATTTTTCGA TGCGTTCGTG AAGGCAATGA TAAGGATGAG TAGTCTTTCA  CCTTTAACAG GGAAGCAAGG AGAAATAAGA TTGAATTGTA GAGTGGTGAA TTCGAAACCG AGAATCATGG ATGTGGTAGA AGATGCTATT GAATTTGCTA GCTCAATGTG AGGAAATGTT 
TTTCTTTAAT AATAAATAAA GGGAT 

Retrieve as FASTA