Entry information : AhalPrx04Araha.25338s0003
Entry ID 14785
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx04Araha.25338s0003
Name AhalPrx04Araha.25338s0003
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx033]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx04
start..stop
S start..stop
AtPrx60 619 0 1..331 1..331
AlyPrx60 616 0 1..331 1..330
BstrPrx69 586 0 1..329 1..328
CrubPrx121 541 0 1..329 1..328
Literature and cross-references AhalPrx04Araha.25338s0003
Protein sequence: AhalPrx04Araha.25338s0003
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   331 (305)
PWM (Da):   %s   35986.35 (33200.8)  
PI (pH):   %s   7.58 (7.29) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-331
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVKISTISV LILSLALLSL GHCCYGQLRV GFYSTKCPNV ENIVSKVVGE AFIKDSSIAP AMIRLYFHDC FSNGCDASLL LDGVNSEKKA SPNLSVRGYE VIDDIKSAVE KECDRVVSCA  DIIALATRDL VSLASGGKTR YEIPTGRLDG KISSALLVDL PSPQMTVSET AAKFAQRKLS LTDMVLLLGG HTIGVAHCSF IMDRLYNFQN TQQPDPSMDS KLVEELRLKC PKGSSTDGII 
NLDQNSTSSN TMDVSFYKEI NVRRGVLHID QKLANDDLTS KMVTDIANGN DFLVRFGQAM VNLGSVRLIS KAKDGEIRRS CRSPCNNPLC V* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAATTTCAA CCAAAAATGG CCGTGAAGAT CTCGACCATT TCAGTATTGA TCCTCTCCCT TGCTCTACTT AGCCTCGGCC ATTGTTGTTA TGGCCAGCTT CGAGTCGGAT TCTACAGTAC  AAAGTGTCCA AACGTCGAAA ACATTGTATC TAAAGTTGTT GGAGAGGCAT TCATCAAGGA TTCATCCATT GCACCCGCAA TGATCCGCCT TTATTTTCAC GATTGTTTTA GCAACGTAAG  TTGGTTAATA CTTATTATAC TTCAAATTTT CTAGAATGTT CTAATGAATG AGTCTTAAAA GAAATAAGTA TTGATCTTTG ATGTATTGAA AATGTATGTA GGGATGTGAT GCATCGCTTC  TTCTAGATGG TGTGAACAGT GAGAAAAAGG CGTCGCCAAA TCTAAGTGTA CGAGGATACG AAGTGATAGA TGACATTAAA TCTGCGGTCG AAAAAGAATG CGATAGGGTC GTTTCTTGTG  CTGATATCAT AGCTCTCGCG ACTAGAGATC TTGTTTCTCT TGTAAATACA TCTCTTATAT CTACAACTTT TTATTTTATA TATTATGTTT TCCTAATCAA CTGAATTAAA ATTTTTATTT  GAAGGCAAGT GGAGGGAAAA CACGATATGA GATACCAACA GGACGATTAG ACGGTAAAAT CTCTTCGGCT TTGCTCGTCG ATTTGCCATC TCCACAGATG ACCGTCTCGG AAACTGCTGC  GAAATTTGCT CAGAGGAAAC TTAGCCTTAC CGATATGGTT CTACTTCTTG GTATGTAAAG TAAACCTATT CAATTAATAA ATTCAAATCA TATATTTTTG TTGTTTACAA GTTAAACATC  ACCCTACCGA ATTTGAATTT AGTTTCTAAA ATGGCATGAC TAGTAAAAAC CACTAGACTA AATATGTTTC AGTTTTCTAA ATTTATAGTG ACATTTATTT TTTTGGTTTT AATTTATAAA  TTTATAGGAG GACATACGAT TGGAGTGGCA CATTGTTCGT TCATTATGGA CAGATTATAT AATTTTCAAA ATACGCAACA GCCTGATCCA TCCATGGATT CTAAATTGGT CGAAGAACTA  AGACTCAAAT GCCCTAAGGG TTCGTCAACT GATGGCATCA TTAATCTGGA TCAAAATTCT ACGAGCTCGA ATACTATGGA TGTATCTTTC TATAAAGAGA TAAACGTTCG CCGCGGAGTC  CTTCATATCG ATCAAAAACT TGCCAACGAC GATTTGACGA GTAAGATGGT AACGGATATA GCCAACGGTA ACGATTTCTT GGTTAGGTTT GGACAGGCAA TGGTGAACTT GGGATCGGTG  AGACTTATTA GTAAGGCCAA AGACGGGGAG ATAAGAAGAT CATGTCGTTC TCCTTGCAAC AATCCGTTAT GCGTATAAAC AGTTGAATAA AATTACGCAC TGTTTTTTTT TCCTTGTTAT 
TTTTAATTTG GGCTGTTAAT TATTTATTTA TCTATTGTTA TGGCATCTAA GTATTTTTTG TTTATTGTTT ATTATGTTAA CATTTTTTCA TCTGCCCTTG TAATTTT 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCGTGA AGATCTCGAC CATTTCAGTA TTGATCCTCT CCCTTGCTCT ACTTAGCCTC GGCCATTGTT GTTATGGCCA GCTTCGAGTC GGATTCTACA GTACAAAGTG TCCAAACGTC  GAAAACATTG TATCTAAAGT TGTTGGAGAG GCATTCATCA AGGATTCATC CATTGCACCC GCAATGATCC GCCTTTATTT TCACGATTGT TTTAGCAACG GATGTGATGC ATCGCTTCTT  CTAGATGGTG TGAACAGTGA GAAAAAGGCG TCGCCAAATC TAAGTGTACG AGGATACGAA GTGATAGATG ACATTAAATC TGCGGTCGAA AAAGAATGCG ATAGGGTCGT TTCTTGTGCT  GATATCATAG CTCTCGCGAC TAGAGATCTT GTTTCTCTTG CAAGTGGAGG GAAAACACGA TATGAGATAC CAACAGGACG ATTAGACGGT AAAATCTCTT CGGCTTTGCT CGTCGATTTG  CCATCTCCAC AGATGACCGT CTCGGAAACT GCTGCGAAAT TTGCTCAGAG GAAACTTAGC CTTACCGATA TGGTTCTACT TCTTGGAGGA CATACGATTG GAGTGGCACA TTGTTCGTTC  ATTATGGACA GATTATATAA TTTTCAAAAT ACGCAACAGC CTGATCCATC CATGGATTCT AAATTGGTCG AAGAACTAAG ACTCAAATGC CCTAAGGGTT CGTCAACTGA TGGCATCATT  AATCTGGATC AAAATTCTAC GAGCTCGAAT ACTATGGATG TATCTTTCTA TAAAGAGATA AACGTTCGCC GCGGAGTCCT TCATATCGAT CAAAAACTTG CCAACGACGA TTTGACGAGT  AAGATGGTAA CGGATATAGC CAACGGTAAC GATTTCTTGG TTAGGTTTGG ACAGGCAATG GTGAACTTGG GATCGGTGAG ACTTATTAGT AAGGCCAAAG ACGGGGAGAT AAGAAGATCA 
TGTCGTTCTC CTTGCAACAA TCCGTTATGC GTATAA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAATTTCAA CCAAAAATGG CCGTGAAGAT CTCGACCATT TCAGTATTGA TCCTCTCCCT TGCTCTACTT AGCCTCGGCC ATTGTTGTTA TGGCCAGCTT CGAGTCGGAT TCTACAGTAC  AAAGTGTCCA AACGTCGAAA ACATTGTATC TAAAGTTGTT GGAGAGGCAT TCATCAAGGA TTCATCCATT GCACCCGCAA TGATCCGCCT TTATTTTCAC GATTGTTTTA GCAACGGATG  TGATGCATCG CTTCTTCTAG ATGGTGTGAA CAGTGAGAAA AAGGCGTCGC CAAATCTAAG TGTACGAGGA TACGAAGTGA TAGATGACAT TAAATCTGCG GTCGAAAAAG AATGCGATAG  GGTCGTTTCT TGTGCTGATA TCATAGCTCT CGCGACTAGA GATCTTGTTT CTCTTGCAAG TGGAGGGAAA ACACGATATG AGATACCAAC AGGACGATTA GACGGTAAAA TCTCTTCGGC  TTTGCTCGTC GATTTGCCAT CTCCACAGAT GACCGTCTCG GAAACTGCTG CGAAATTTGC TCAGAGGAAA CTTAGCCTTA CCGATATGGT TCTACTTCTT GGAGGACATA CGATTGGAGT  GGCACATTGT TCGTTCATTA TGGACAGATT ATATAATTTT CAAAATACGC AACAGCCTGA TCCATCCATG GATTCTAAAT TGGTCGAAGA ACTAAGACTC AAATGCCCTA AGGGTTCGTC  AACTGATGGC ATCATTAATC TGGATCAAAA TTCTACGAGC TCGAATACTA TGGATGTATC TTTCTATAAA GAGATAAACG TTCGCCGCGG AGTCCTTCAT ATCGATCAAA AACTTGCCAA  CGACGATTTG ACGAGTAAGA TGGTAACGGA TATAGCCAAC GGTAACGATT TCTTGGTTAG GTTTGGACAG GCAATGGTGA ACTTGGGATC GGTGAGACTT ATTAGTAAGG CCAAAGACGG  GGAGATAAGA AGATCATGTC GTTCTCCTTG CAACAATCCG TTATGCGTAT AAACAGTTGA ATAAAATTAC GCACTGTTTT TTTTTCCTTG TTATTTTTAA TTTGGGCTGT TAATTATTTA 
TTTATCTATT GTTATGGCAT CTAAGTATTT TTTGTTTATT GTTTATTATG TTAACATTTT TTCATCTGCC CTTGTAATTT T 

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