Entry information : AhalPrx07Araha.5348s0016
Entry ID 14788
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx07Araha.5348s0016
Name AhalPrx07Araha.5348s0016
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx023]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx07
start..stop
S start..stop
AlyPrx59 657 0 1..328 1..328
AtPrx59 624 0 1..328 1..328
BstrPrx86 622 0 1..328 1..328
TsPrx59 619 0 1..328 1..331
Literature and cross-references AhalPrx07Araha.5348s0016
Protein sequence: AhalPrx07Araha.5348s0016
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   328 (300)
PWM (Da):   %s   35355.01 (32205.4) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   7.85 (6.73) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-328
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKTQTKVMGG HVLLTVFTLC MLCSGVRTQL SFDIYAKSCP NLVQIVRRQV IIALKAEIRM AASLIRLHFH DCFVNGCDAS VLLDGADSEK LAIPNINSVR GFEVIDTIKD AVENACPGVV  SCADILTLAA RDSVFLSGGP QWRVALGRKD GLVANQNSAN NLPSPFEPLD AIIAKFVAVN LNITDVVALS GAHTFGQAKC AVFSNRLFNF TGAGTPDATL ETSLLSNLQT VCPLGGNSNT 
TAPLDRNSTN AFDNNYFKNL LEGKGLLSSD QILFSSDLAV NTTKRLVEAY SRSQNLFFWD FTCSMIRMGN IANGASGEVR KNCRVINN* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGTAAGTCTT TTAAACAAGC CATCTAGACA ATGAAAACAC AAACCAAAGT GATGGGAGGA CATGTCTTGC TTACTGTATT CACTCTGTGT ATGCTTTGTT CAGGGGTTAG GACACAGCTA  AGCTTTGACA TTTATGCTAA ATCGTGCCCC AATCTTGTGC AAATTGTCCG TAGACAAGTT ATAATCGCCC TGAAGGCCGA GATACGGATG GCTGCTTCTC TCATTCGTCT TCATTTCCAC  GACTGCTTTG TTAATGTATG TATTGTTATC TCTACGTACT TTCTTCTAAA TATATTTTTC TATTAAATAA TTTTATAGGT AATTATAGGA TCGGATATTG TTACAAATTA ATATGTTCCA  TACACTTTTC ATCAGTTTCC TAAAACGTAA CTTGAGCTTT TCAGGGGTGT GATGCGTCTG TATTGTTGGA TGGAGCTGAC AGCGAGAAAC TCGCGATCCC AAACATTAAT TCTGTGAGAG  GGTTTGAAGT AATTGATACA ATCAAAGACG CTGTGGAAAA CGCATGTCCT GGGGTTGTTT CTTGTGCTGA TATCCTCACT TTGGCCGCTC GTGACTCGGT TTTCTTGGTA AGCCTTTTTG  TCCCCATTTA ACAAACATCA AAACCTTAAT ACATAGTATA TATTTTCAGG CAAATTCTTG ATTAGATTTT ACTAATTTTC ATATAACAAC TATTTCTAAT ATATATATTG TCGTAATTTG  GTTGAAATAT TTATCAATGA TTATATACTC TATTATAATA ATATTTGTGT AATTATATTT CTTCAGTCGT CTATGACTTA CACATGCATA CTCTCGGGTT TAAAGCTGGA TTATATCTAT  TCATTTTTAT ATCGCCTATA ACAGTTTCAA TTTGTAGAGC GGAGGGCCTC AGTGGAGAGT GGCATTAGGA AGAAAAGATG GATTGGTGGC AAATCAGAAC AGTGCAAACA ATCTCCCATC  TCCTTTTGAA CCTTTAGACG CTATTATCGC CAAATTTGTA GCCGTAAACC TTAACATCAC CGACGTCGTA GCTTTATCAG GTTTAACTAG TTTCTTCAAA CCTTAGTTGG TATTCTTTTC  TTCTAACTAC TTATCACTTA TGTATGACCT TTTTCATTAC AAAGGAGCTC ACACCTTTGG ACAAGCGAAG TGTGCTGTCT TCAGCAACCG ACTGTTCAAC TTTACCGGCG CGGGAACTCC  TGACGCAACA CTTGAGACAT CACTGTTGTC TAATCTGCAA ACAGTTTGTC CCCTTGGAGG AAATAGTAAC ACAACAGCGC CCCTTGACAG GAACTCTACG AACGCCTTCG ACAACAATTA  TTTCAAGAAT CTACTCGAAG GGAAAGGTCT TTTGAGCTCT GATCAGATTC TGTTCTCGAG TGATTTAGCC GTGAACACAA CAAAGAGACT AGTGGAGGCT TATAGTCGGA GCCAGAACTT  GTTTTTCTGG GACTTCACAT GTTCGATGAT CAGAATGGGA AACATTGCAA ATGGAGCTAG TGGGGAGGTT AGGAAGAACT GCAGGGTTAT CAATAATTAG CATGCGTGTG TGTTTTCGAT 
TTTCTGTTAT GTTTGGGAGT TGATCGGTCT CGTGTGTATC AGAATGATCA CGCGTGTAAT AATAAGAATT AATGTGGTTT GTTGGTTTGT CTAATTTAAA AA 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAAACAC AAACCAAAGT GATGGGAGGA CATGTCTTGC TTACTGTATT CACTCTGTGT ATGCTTTGTT CAGGGGTTAG GACACAGCTA AGCTTTGACA TTTATGCTAA ATCGTGCCCC  AATCTTGTGC AAATTGTCCG TAGACAAGTT ATAATCGCCC TGAAGGCCGA GATACGGATG GCTGCTTCTC TCATTCGTCT TCATTTCCAC GACTGCTTTG TTAATGGGTG TGATGCGTCT  GTATTGTTGG ATGGAGCTGA CAGCGAGAAA CTCGCGATCC CAAACATTAA TTCTGTGAGA GGGTTTGAAG TAATTGATAC AATCAAAGAC GCTGTGGAAA ACGCATGTCC TGGGGTTGTT  TCTTGTGCTG ATATCCTCAC TTTGGCCGCT CGTGACTCGG TTTTCTTGAG CGGAGGGCCT CAGTGGAGAG TGGCATTAGG AAGAAAAGAT GGATTGGTGG CAAATCAGAA CAGTGCAAAC  AATCTCCCAT CTCCTTTTGA ACCTTTAGAC GCTATTATCG CCAAATTTGT AGCCGTAAAC CTTAACATCA CCGACGTCGT AGCTTTATCA GGAGCTCACA CCTTTGGACA AGCGAAGTGT  GCTGTCTTCA GCAACCGACT GTTCAACTTT ACCGGCGCGG GAACTCCTGA CGCAACACTT GAGACATCAC TGTTGTCTAA TCTGCAAACA GTTTGTCCCC TTGGAGGAAA TAGTAACACA  ACAGCGCCCC TTGACAGGAA CTCTACGAAC GCCTTCGACA ACAATTATTT CAAGAATCTA CTCGAAGGGA AAGGTCTTTT GAGCTCTGAT CAGATTCTGT TCTCGAGTGA TTTAGCCGTG  AACACAACAA AGAGACTAGT GGAGGCTTAT AGTCGGAGCC AGAACTTGTT TTTCTGGGAC TTCACATGTT CGATGATCAG AATGGGAAAC ATTGCAAATG GAGCTAGTGG GGAGGTTAGG 
AAGAACTGCA GGGTTATCAA TAATTAG 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AGTAAGTCTT TTAAACAAGC CATCTAGACA ATGAAAACAC AAACCAAAGT GATGGGAGGA CATGTCTTGC TTACTGTATT CACTCTGTGT ATGCTTTGTT CAGGGGTTAG GACACAGCTA  AGCTTTGACA TTTATGCTAA ATCGTGCCCC AATCTTGTGC AAATTGTCCG TAGACAAGTT ATAATCGCCC TGAAGGCCGA GATACGGATG GCTGCTTCTC TCATTCGTCT TCATTTCCAC  GACTGCTTTG TTAATGGGTG TGATGCGTCT GTATTGTTGG ATGGAGCTGA CAGCGAGAAA CTCGCGATCC CAAACATTAA TTCTGTGAGA GGGTTTGAAG TAATTGATAC AATCAAAGAC  GCTGTGGAAA ACGCATGTCC TGGGGTTGTT TCTTGTGCTG ATATCCTCAC TTTGGCCGCT CGTGACTCGG TTTTCTTGAG CGGAGGGCCT CAGTGGAGAG TGGCATTAGG AAGAAAAGAT  GGATTGGTGG CAAATCAGAA CAGTGCAAAC AATCTCCCAT CTCCTTTTGA ACCTTTAGAC GCTATTATCG CCAAATTTGT AGCCGTAAAC CTTAACATCA CCGACGTCGT AGCTTTATCA  GGAGCTCACA CCTTTGGACA AGCGAAGTGT GCTGTCTTCA GCAACCGACT GTTCAACTTT ACCGGCGCGG GAACTCCTGA CGCAACACTT GAGACATCAC TGTTGTCTAA TCTGCAAACA  GTTTGTCCCC TTGGAGGAAA TAGTAACACA ACAGCGCCCC TTGACAGGAA CTCTACGAAC GCCTTCGACA ACAATTATTT CAAGAATCTA CTCGAAGGGA AAGGTCTTTT GAGCTCTGAT  CAGATTCTGT TCTCGAGTGA TTTAGCCGTG AACACAACAA AGAGACTAGT GGAGGCTTAT AGTCGGAGCC AGAACTTGTT TTTCTGGGAC TTCACATGTT CGATGATCAG AATGGGAAAC  ATTGCAAATG GAGCTAGTGG GGAGGTTAGG AAGAACTGCA GGGTTATCAA TAATTAGCAT GCGTGTGTGT TTTCGATTTT CTGTTATGTT TGGGAGTTGA TCGGTCTCGT GTGTATCAGA 
ATGATCACGC GTGTAATAAT AAGAATTAAT GTGGTTTGTT GGTTTGTCTA ATTTAAAAA 

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