Entry information : AhalPrx12Araha.3362s0036
Entry ID 14793
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx12Araha.3362s0036
Name AhalPrx12Araha.3362s0036
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx029]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx12
start..stop
S start..stop
AlyPrx26 695 0 1..335 1..335
AtPrx26 684 0 1..335 1..335
BstrPrx74 669 0 1..335 1..335
CagraPrx40 668 0 1..335 1..335
Literature and cross-references AhalPrx12Araha.3362s0036
Protein sequence: AhalPrx12Araha.3362s0036
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   335 (317)
PWM (Da):   %s   37659.83 (35618.7)  
PI (pH):   %s   8.83 (8.68) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:19-335
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVMIHIFLTV MVVGGVSLFP ETAEATVMGP SMQKLTWHYY KVYNTCENAE NFVRHQVEIF YKNDKSIAPK LLRLLYSDCF VSGCDASVLL EGPNSERMAP QNRGLGGFVL IDKIKIVLEQ  RCPGVVSCAD ILNLATRDAV HLAGAPSYPV FTGRRDGLTS DKHTVDLPSP SISWNQAMSY FKSRGLSVLD MATLLGSHSM GRTHCSYVVD RLYNYNKTGK PSPTMNKYFL SEMAKQCPPR 
TRKGQTDPLV YLNPDSGSNH SFTNSFYSRI LSNKSVLEVD QQLLYNDDTK QISKEFSESF EDFRKSFALS MSKMGAINVL TKTEGEIRKD CRRRN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCCATTCAA CACTAACCAG CTTCACCGTG AGATGGTTAT GATTCATATC TTCCTCACCG TGATGGTGGT TGGAGGCGTT AGTCTCTTCC CGGAGACGGC AGAAGCGACC GTGATGGGAC  CGTCGATGCA GAAGCTGACG TGGCATTACT ACAAAGTTTA TAACACTTGC GAGAATGCAG AGAATTTTGT GAGGCACCAA GTTGAAATAT TTTACAAGAA CGATAAAAGT ATTGCTCCCA  AGCTCCTTCG TCTACTCTAT TCCGACTGCT TTGTCTCCGT ACGTTTTTTC GTATTCTTGT CTTATCATTT AATCATTCAT ACATATCATA TAAAACCCAA GGATATATAT AAGTTTAACC  ACAAAACTAA TCGAGTGTTA AGAAAGTTTA ACTAGAAGAT CTACTAGTTA GTCCTCTCAC ATTGTGTGAC ACTATAATGA TAGGGATGCG ATGCATCAGT TCTACTAGAA GGTCCGAACT  CAGAGAGAAT GGCGCCACAA AACAGAGGAC TTGGAGGATT CGTGCTTATA GACAAAATCA AAATAGTCTT GGAACAAAGA TGTCCCGGTG TTGTCTCTTG CGCCGACATT CTTAATCTTG  CAACTCGGGA TGCTGTTCAT TTGGTAATCT CTCTTTCTCT GCACCTATAA CTATACATGG AACATTATAG ATACTGACAA GCTGAGAGAA ATGATTCACA CAGGCAGGTG CACCATCTTA  TCCTGTGTTC ACAGGCAGGA GAGATGGTTT GACCTCGGAC AAGCACACCG TGGACCTACC ATCGCCATCA ATCTCATGGA ACCAAGCCAT GTCTTATTTC AAATCCAGAG GCTTGAGTGT  TCTTGATATG GCTACACTTC TAGGTCAGTC ACCTTTTTCT CCCTGCCAAT ATCTTAAAAA CCGGTTTATC AGGATTTAGG AGTACTCATC CTGCGTTTCG GTCCGGTTTT CGAACTCTGT  TTCAGATAGA TATAGGTTTG GTCTCGATTC ATACTTGGAT AGTAGTTTTG GTCTGGTTTG AATTGCTTAA ACTGAATTAC TCCCTCATCA GGATCACATT CAATGGGAAG AACACATTGC  AGCTATGTCG TTGATCGACT CTACAATTAC AACAAGACCG GTAAACCAAG CCCGACTATG AACAAGTATT TCCTGTCTGA AATGGCAAAG CAATGTCCTC CAAGAACGAG GAAAGGCCAG  ACCGATCCAC TCGTGTACCT AAACCCGGAC TCAGGCTCAA ACCACAGCTT CACAAACTCA TTCTACTCAA GAATTCTATC AAACAAATCT GTACTTGAAG TAGATCAACA ACTGCTTTAC  AATGATGACA CCAAGCAAAT ATCTAAGGAA TTCTCAGAGA GTTTTGAGGA TTTCCGGAAA TCATTTGCTC TTTCGATGAG TAAGATGGGA GCGATAAATG TGTTAACTAA AACAGAAGGT  GAGATACGAA AAGATTGCAG GCGTAGAAAC TAAACACAAA AGCACAATCT CTCTCTGATC TCTGTGATTG CAAGAAGAAT ACACAGAAGG TATAAACAGG AAACAACAGG AAAAAAGATT  GAAATATTTA TGTTTCAAGA TATAAATTTG TTGTCATTTA TTACATTGTA ATCGCCGTGA AAAAGGCTTC TCTATAGCTA AAGGAGATTG ATTCTTTTGG TGTTTCGAAA AAGTCAAAAA  AAAAATTTCT GATATTCACA TAAGTATAAA GGGTATGCAG TCAAAATTGT TCCCGCACAA AAGAGAAAGG AGATTTTATT TGTCTAACCT CTTTGGTTAT GAATCTTAGA CTCTCAGTTT 
GTGAAGTACC AAGCGATTGA ATTTCACATG CTTCTCAATC TCTAGCTAGT TCCTTCCTGC TAGCTTCAAG AAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTATGA TTCATATCTT CCTCACCGTG ATGGTGGTTG GAGGCGTTAG TCTCTTCCCG GAGACGGCAG AAGCGACCGT GATGGGACCG TCGATGCAGA AGCTGACGTG GCATTACTAC  AAAGTTTATA ACACTTGCGA GAATGCAGAG AATTTTGTGA GGCACCAAGT TGAAATATTT TACAAGAACG ATAAAAGTAT TGCTCCCAAG CTCCTTCGTC TACTCTATTC CGACTGCTTT  GTCTCCGGAT GCGATGCATC AGTTCTACTA GAAGGTCCGA ACTCAGAGAG AATGGCGCCA CAAAACAGAG GACTTGGAGG ATTCGTGCTT ATAGACAAAA TCAAAATAGT CTTGGAACAA  AGATGTCCCG GTGTTGTCTC TTGCGCCGAC ATTCTTAATC TTGCAACTCG GGATGCTGTT CATTTGGCAG GTGCACCATC TTATCCTGTG TTCACAGGCA GGAGAGATGG TTTGACCTCG  GACAAGCACA CCGTGGACCT ACCATCGCCA TCAATCTCAT GGAACCAAGC CATGTCTTAT TTCAAATCCA GAGGCTTGAG TGTTCTTGAT ATGGCTACAC TTCTAGGATC ACATTCAATG  GGAAGAACAC ATTGCAGCTA TGTCGTTGAT CGACTCTACA ATTACAACAA GACCGGTAAA CCAAGCCCGA CTATGAACAA GTATTTCCTG TCTGAAATGG CAAAGCAATG TCCTCCAAGA  ACGAGGAAAG GCCAGACCGA TCCACTCGTG TACCTAAACC CGGACTCAGG CTCAAACCAC AGCTTCACAA ACTCATTCTA CTCAAGAATT CTATCAAACA AATCTGTACT TGAAGTAGAT  CAACAACTGC TTTACAATGA TGACACCAAG CAAATATCTA AGGAATTCTC AGAGAGTTTT GAGGATTTCC GGAAATCATT TGCTCTTTCG ATGAGTAAGA TGGGAGCGAT AAATGTGTTA 
ACTAAAACAG AAGGTGAGAT ACGAAAAGAT TGCAGGCGTA GAAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCCATTCAA CACTAACCAG CTTCACCGTG AGATGGTTAT GATTCATATC TTCCTCACCG TGATGGTGGT TGGAGGCGTT AGTCTCTTCC CGGAGACGGC AGAAGCGACC GTGATGGGAC  CGTCGATGCA GAAGCTGACG TGGCATTACT ACAAAGTTTA TAACACTTGC GAGAATGCAG AGAATTTTGT GAGGCACCAA GTTGAAATAT TTTACAAGAA CGATAAAAGT ATTGCTCCCA  AGCTCCTTCG TCTACTCTAT TCCGACTGCT TTGTCTCCGG ATGCGATGCA TCAGTTCTAC TAGAAGGTCC GAACTCAGAG AGAATGGCGC CACAAAACAG AGGACTTGGA GGATTCGTGC  TTATAGACAA AATCAAAATA GTCTTGGAAC AAAGATGTCC CGGTGTTGTC TCTTGCGCCG ACATTCTTAA TCTTGCAACT CGGGATGCTG TTCATTTGGC AGGTGCACCA TCTTATCCTG  TGTTCACAGG CAGGAGAGAT GGTTTGACCT CGGACAAGCA CACCGTGGAC CTACCATCGC CATCAATCTC ATGGAACCAA GCCATGTCTT ATTTCAAATC CAGAGGCTTG AGTGTTCTTG  ATATGGCTAC ACTTCTAGGA TCACATTCAA TGGGAAGAAC ACATTGCAGC TATGTCGTTG ATCGACTCTA CAATTACAAC AAGACCGGTA AACCAAGCCC GACTATGAAC AAGTATTTCC  TGTCTGAAAT GGCAAAGCAA TGTCCTCCAA GAACGAGGAA AGGCCAGACC GATCCACTCG TGTACCTAAA CCCGGACTCA GGCTCAAACC ACAGCTTCAC AAACTCATTC TACTCAAGAA  TTCTATCAAA CAAATCTGTA CTTGAAGTAG ATCAACAACT GCTTTACAAT GATGACACCA AGCAAATATC TAAGGAATTC TCAGAGAGTT TTGAGGATTT CCGGAAATCA TTTGCTCTTT  CGATGAGTAA GATGGGAGCG ATAAATGTGT TAACTAAAAC AGAAGGTGAG ATACGAAAAG ATTGCAGGCG TAGAAACTAA ACACAAAAGC ACAATCTCTC TCTGATCTCT GTGATTGCAA  GAAGAATACA CAGAAGGTAT AAACAGGAAA CAACAGGAAA AAAGATTGAA ATATTTATGT TTCAAGATAT AAATTTGTTG TCATTTATTA CATTGTAATC GCCGTGAAAA AGGCTTCTCT  ATAGCTAAAG GAGATTGATT CTTTTGGTGT TTCGAAAAAG TCAAAAAAAA AATTTCTGAT ATTCACATAA GTATAAAGGG TATGCAGTCA AAATTGTTCC CGCACAAAAG AGAAAGGAGA  TTTTATTTGT CTAACCTCTT TGGTTATGAA TCTTAGACTC TCAGTTTGTG AAGTACCAAG CGATTGAATT TCACATGCTT CTCAATCTCT AGCTAGTTCC TTCCTGCTAG CTTCAAGAAG 

Retrieve as FASTA