Entry information : AhalPrx17Araha.44658s0001
Entry ID 14798
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx17Araha.44658s0001
Name AhalPrx17Araha.44658s0001
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx015]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx17
start..stop
S start..stop
AlyPrx64 655 0 1..317 1..317
AtPrx64 641 0 1..317 1..317
BstrPrx12 640 0 1..317 1..317
CrubPrx43 637 0 1..317 1..317
Literature and cross-references AhalPrx17Araha.44658s0001
Protein sequence: AhalPrx17Araha.44658s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (295)
PWM (Da):   %s   34657.6 (32015.2)  
PI (pH):   %s   8.9 (9.08) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-317
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNAHMLNLLV MVIFVVTFDV QALSPHYYDH TCPQADHIVT NAVKKAMSND KTVPAALLRM HFHDCFVRGC DGSVLLDSKG KNKAEKDGPP NISLHAFYVI DNAKKALEEQ CPGIVSCADI  LSLAARDAVT LSGGPTWAVP KGRKDGRISK AIETRQLPAP TFNISQLRQN FGQRGLSMHD LVVLSGGHTL GFAHCSSFQN RLHNFNTQKE IDPTLNPSFA ASLEGVCPAH NKVKNAGSTL 
DGTVTSFDNI YYKMLIQGKS LFSSDEALLA VPSTKKLVAK YANSNEEFER AFVKSMIKMS SISGSGNEVR LNCRRVR* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTTCATCCTA AATACATTTC TTTACAGTCA AGAAATTAAA ATCTCGAAAA GTTTGTTGAA ATGAATGCAC ACATGCTCAA TCTCCTTGTC ATGGTCATCT TCGTAGTTAC TTTCGATGTC  CAAGCACTCA GTCCTCACTA CTACGACCAT ACATGTCCAC AAGCCGACCA CATTGTCACC AATGCAGTCA AGAAAGCCAT GTCAAACGAC AAAACTGTCC CTGCCGCGCT TTTGAGGATG  CATTTCCACG ACTGCTTTGT CAGAGTAACA ACTACTTACA CACTACATTC TCTTCATCTC TCAATCTTCT ATGTGTTTAT ACTCTAAATA ATGTTGTTGG TGAATTTTTT TGATCATTAA  AGGGATGTGA TGGGTCAGTT CTTTTAGACT CAAAGGGGAA GAACAAAGCA GAGAAAGATG GACCTCCAAA CATCTCACTC CATGCATTTT ATGTGATTGA CAATGCAAAG AAGGCATTAG  AAGAGCAATG TCCCGGTATC GTCTCTTGCG CCGACATTCT TTCACTCGCT GCAAGAGATG CTGTCACACT CGTGAGTCTC CATCTCATAT TCCAAATTCT AATTTTATTT GATGATTCTA  ATGATCCACC TAAAATATTA TTTGTTGTTG TTATTATAGT CAGGAGGGCC TACATGGGCA GTGCCAAAAG GGAGAAAAGA TGGAAGAATA TCAAAGGCAA TAGAAACAAG ACAACTACCA  GCTCCTACTT TCAACATTTC TCAATTGCGT CAAAATTTTG GCCAAAGAGG CCTCTCTATG CATGATCTTG TTGTTCTCTC TGGTATTCAA CATTCTCTCG TTCACTTAAG TATATCTACA  AAGATTTCTA AACTATTTTT ATTAAACTAT GCTAAAAGAT GTAACATACA TTAAAACCAA AAAAAAAAAA GATGTAACAT AGATATATGA AAAAAAAATC TAAATCCTAA ACATAATTGG  CAAAATACAA ATTTAGTTCC AATGCTTATA ATGGTATGAA TTTGGAATGT TGAATGAAAT GGCAGGAGGT CACACACTAG GATTCGCCCA TTGCTCATCG TTCCAGAATA GGCTCCATAA  CTTCAACACA CAAAAGGAGA TTGATCCAAC GCTAAACCCA TCGTTCGCAG CCAGCTTGGA GGGCGTGTGT CCAGCCCATA ACAAGGTGAA GAACGCTGGA TCGACCTTGG ATGGAACCGT  GACATCATTC GACAATATCT ACTACAAGAT GCTTATTCAA GGCAAGTCAC TATTTTCATC CGACGAAGCG CTTCTCGCAG TGCCCTCTAC TAAGAAACTC GTGGCCAAGT ATGCAAATTC  CAACGAAGAG TTCGAGAGGG CTTTTGTGAA ATCCATGATT AAGATGAGTA GTATCAGTGG GAGTGGTAAT GAGGTCAGAC TTAACTGCAG AAGGGTTCGC TAGAATCACA ATCTACGCTT  CCAACATCAA GTTACTACAT TTATATCTTT CGTTTTCTCT GATCACATTG ATTACTTGTG AGTGGGCCTT TCTAAAGATT AAGGCAGAGG TTCTTGTATC ACTATTGTCT ATCATTCTCT 
CGTGTGTGCC TGTATAGGCA TTTATTACAA GTAATAAAAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGCAC ACATGCTCAA TCTCCTTGTC ATGGTCATCT TCGTAGTTAC TTTCGATGTC CAAGCACTCA GTCCTCACTA CTACGACCAT ACATGTCCAC AAGCCGACCA CATTGTCACC  AATGCAGTCA AGAAAGCCAT GTCAAACGAC AAAACTGTCC CTGCCGCGCT TTTGAGGATG CATTTCCACG ACTGCTTTGT CAGAGGATGT GATGGGTCAG TTCTTTTAGA CTCAAAGGGG  AAGAACAAAG CAGAGAAAGA TGGACCTCCA AACATCTCAC TCCATGCATT TTATGTGATT GACAATGCAA AGAAGGCATT AGAAGAGCAA TGTCCCGGTA TCGTCTCTTG CGCCGACATT  CTTTCACTCG CTGCAAGAGA TGCTGTCACA CTCTCAGGAG GGCCTACATG GGCAGTGCCA AAAGGGAGAA AAGATGGAAG AATATCAAAG GCAATAGAAA CAAGACAACT ACCAGCTCCT  ACTTTCAACA TTTCTCAATT GCGTCAAAAT TTTGGCCAAA GAGGCCTCTC TATGCATGAT CTTGTTGTTC TCTCTGGAGG TCACACACTA GGATTCGCCC ATTGCTCATC GTTCCAGAAT  AGGCTCCATA ACTTCAACAC ACAAAAGGAG ATTGATCCAA CGCTAAACCC ATCGTTCGCA GCCAGCTTGG AGGGCGTGTG TCCAGCCCAT AACAAGGTGA AGAACGCTGG ATCGACCTTG  GATGGAACCG TGACATCATT CGACAATATC TACTACAAGA TGCTTATTCA AGGCAAGTCA CTATTTTCAT CCGACGAAGC GCTTCTCGCA GTGCCCTCTA CTAAGAAACT CGTGGCCAAG 
TATGCAAATT CCAACGAAGA GTTCGAGAGG GCTTTTGTGA AATCCATGAT TAAGATGAGT AGTATCAGTG GGAGTGGTAA TGAGGTCAGA CTTAACTGCA GAAGGGTTCG CTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTTCATCCTA AATACATTTC TTTACAGTCA AGAAATTAAA ATCTCGAAAA GTTTGTTGAA ATGAATGCAC ACATGCTCAA TCTCCTTGTC ATGGTCATCT TCGTAGTTAC TTTCGATGTC  CAAGCACTCA GTCCTCACTA CTACGACCAT ACATGTCCAC AAGCCGACCA CATTGTCACC AATGCAGTCA AGAAAGCCAT GTCAAACGAC AAAACTGTCC CTGCCGCGCT TTTGAGGATG  CATTTCCACG ACTGCTTTGT CAGAGGATGT GATGGGTCAG TTCTTTTAGA CTCAAAGGGG AAGAACAAAG CAGAGAAAGA TGGACCTCCA AACATCTCAC TCCATGCATT TTATGTGATT  GACAATGCAA AGAAGGCATT AGAAGAGCAA TGTCCCGGTA TCGTCTCTTG CGCCGACATT CTTTCACTCG CTGCAAGAGA TGCTGTCACA CTCTCAGGAG GGCCTACATG GGCAGTGCCA  AAAGGGAGAA AAGATGGAAG AATATCAAAG GCAATAGAAA CAAGACAACT ACCAGCTCCT ACTTTCAACA TTTCTCAATT GCGTCAAAAT TTTGGCCAAA GAGGCCTCTC TATGCATGAT  CTTGTTGTTC TCTCTGGAGG TCACACACTA GGATTCGCCC ATTGCTCATC GTTCCAGAAT AGGCTCCATA ACTTCAACAC ACAAAAGGAG ATTGATCCAA CGCTAAACCC ATCGTTCGCA  GCCAGCTTGG AGGGCGTGTG TCCAGCCCAT AACAAGGTGA AGAACGCTGG ATCGACCTTG GATGGAACCG TGACATCATT CGACAATATC TACTACAAGA TGCTTATTCA AGGCAAGTCA  CTATTTTCAT CCGACGAAGC GCTTCTCGCA GTGCCCTCTA CTAAGAAACT CGTGGCCAAG TATGCAAATT CCAACGAAGA GTTCGAGAGG GCTTTTGTGA AATCCATGAT TAAGATGAGT  AGTATCAGTG GGAGTGGTAA TGAGGTCAGA CTTAACTGCA GAAGGGTTCG CTAGAATCAC AATCTACGCT TCCAACATCA AGTTACTACA TTTATATCTT TCGTTTTCTC TGATCACATT 
GATTACTTGT GAGTGGGCCT TTCTAAAGAT TAAGGCAGAG GTTCTTGTAT CACTATTGTC TATCATTCTC TCGTGTGTGC CTGTATAGGC ATTTATTACA AGTAATAAAA T 

Retrieve as FASTA