Entry information : AhalPrx23Araha.7254s0001
Entry ID 14804
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx23Araha.7254s0001
Name AhalPrx23Araha.7254s0001
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx039]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx23
start..stop
S start..stop
AlyPrx29 678 0 1..339 1..339
AtPrx29 674 0 1..339 1..339
BstrPrx17 655 0 1..339 1..339
CrubPrx64 632 0 1..339 1..342
Literature and cross-references AhalPrx23Araha.7254s0001
Protein sequence: AhalPrx23Araha.7254s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   339 (311)
PWM (Da):   %s   36540.02 (33587.6)  
PI (pH):   %s   4.58 (4.45) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-339
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKPKSKVAES AAASCFLVIS LLCSCVNGDQ TETNNEGLSY SYYEKTCPKV EEIVRSSLSS MFILDPTSPA ALLRLMFHDC QVQGCDASIL LEPSGDQQFT ELDSAKNFGI RKRDLIGSIK  TSLELECPKQ VSCSDVIILA ARDAVALTGG PLISVPLGRK DSLSTPSKHV ADSELPPSTA DVDTTLNLFA SKGMTIEESV AIMGAHTIGV THCNNVLSRF DNANATSENM DPRFQTFLRV 
ACPEFSPTSQ AAEATFVPND QTSVIFDTAY YDDAIAGRGN LRIDSEIGAD PRTRPFVEAF AADQDRFFNA FSSAFVKLSS YKVLTGSEGV VRSVCDKVD* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTCTCTCTC TTTTTTATAT GCAAAGTCAT CTTCTCTTTT AATTACATCA AATTCCAAAC AAAAGAGAGT GAGTGATGAA ACCAAAGAGC AAAGTTGCAG AATCTGCAGC TGCATCATGT  TTTCTTGTCA TAAGCTTGTT ATGTAGCTGC GTTAATGGTG ACCAAACGGA GACTAATAAT GAAGGCTTAT CTTACAGTTA CTACGAGAAA ACTTGTCCCA AAGTCGAAGA GATCGTGAGA  TCTTCACTTT CATCAATGTT TATACTTGAT CCTACTTCTC CGGCAGCCTT GCTAAGGCTT ATGTTTCATG ACTGCCAAGT TCAGGTTCTC TATACCTCTA GCCAAATCCA TCTCTCATTC  TCACTCTAAG AAAATTCTCA ATTTATGTTT TCAACTTAAT ATGGTTTGGT TTGAAAAGTG TTTATAAATT ATGTTTGGGA TTCGAATTTA TACACTTTGT GAATAAACAT ATCCATATGC  TAATCATGTA TTGATTATTC CGTCAATAAT ATTGCGAAAA TTGGACGTCC GTACATGCTA TCTGGTATAT TTTTTTCTAA CATGATGAGC TTTCGTTTTT TTAAAAAACA TTTGTTGAGA  TGTTTTATAT ATAATTTAAA ATTTTTGCTA ACTACGTAAT TTCTCTTGCA TGTGATCCAT AAATTTAGAA GACTACAAGA TGCGAAAAAA TTAATATAAA AAAGAAATAA ACAAGATGCG  AAATGCGAAG ACCACTTTAA TTAGTTAAAC ATGTCACGGC CCCAAGGTGG ACTATATGTA TGACAAATGA AGTAATTTTG TTTCATACCA GCGCCCATCA TGTCATTTAC AACATGGGAA  TATAGTGGTT TCGTGACTAA AATTATAGGC ATTTTGTTTT AGCAACATTA TTATTTTGTC GTTTTAAGTT TTTGGTTAAA TATAGCAACA TTAATTTCAT TAATATATTG GGTACGTACG  AAAAACATAT AAATTGCTCG AGTATTGGAT ATGATCACAT GCTAATCTGA GTTAATACAA TTTATGGATA ATTACTCGGA AAATAGTAGA TAGATTACGT ACATGCATGT AAATTCACTG  TTTTATTATA TAAGCGGATA AGCCACATAT ATTAGTATAT ATAACCCTTT TTTATCCGAC ATAAATTATA AGTCACAAAT TCTCTTTTAA AGAGATGGAG AAAAACTCGA ATTAGATAAT  TGTTCTTGGT ATTTATTTCA TCTCATCATC ATTAATTGTC GGGAACAAAA ATATGTGGCT TATGTAACAG GGTTGTGACG CATCAATCCT ACTCGAACCA AGTGGGGACC AACAGTTCAC  TGAGCTTGAT TCAGCCAAGA ACTTCGGAAT CAGAAAGAGG GACCTGATTG GCTCTATCAA AACCTCACTG GAACTTGAGT GTCCCAAGCA AGTCTCATGC TCCGACGTCA TCATCCTCGC  CGCCAGAGAC GCCGTGGCTC TCACCGGAGG CCCACTCATT TCCGTGCCAC TAGGACGAAA AGACTCTCTC TCCACTCCAA GCAAACATGT GGCAGACTCT GAGCTTCCTC CCTCCACTGC  TGACGTGGAC ACTACCTTGA ACCTCTTTGC AAGCAAAGGC ATGACCATTG AAGAGTCCGT AGCCATCATG GGTATATAAA CTTTTATTTA TTTCTTATAA TAAGACTCTG AAATAATTAT  AGGGCATATT TAATTCATAT AATAAGATTT CTTCTCTTGT AGGTGCGCAT ACGATAGGAG TCACACATTG CAACAACGTA TTATCGCGTT TCGATAACGC AAACGCGACA AGTGAGAACA  TGGATCCACG TTTTCAAACG TTTTTGCGTG TGGCTTGTCC AGAGTTTTCT CCAACTTCTC AAGCTGCGGA AGCCACATTT GTCCCCAACG ATCAAACTTC AGTGATCTTC GATACAGCTT  ATTACGATGA TGCAATCGCG GGACGTGGAA ATCTTAGAAT TGACTCGGAG ATTGGAGCTG ATCCACGTAC ACGTCCGTTT GTCGAAGCGT TTGCGGCTGA CCAAGACCGC TTCTTCAACG 
CTTTCTCTTC CGCGTTTGTA AAATTGTCGT CTTACAAAGT GTTAACCGGG AGTGAAGGAG TAGTTAGAAG CGTATGTGAC AAGGTTGACT GA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACCAA AGAGCAAAGT TGCAGAATCT GCAGCTGCAT CATGTTTTCT TGTCATAAGC TTGTTATGTA GCTGCGTTAA TGGTGACCAA ACGGAGACTA ATAATGAAGG CTTATCTTAC  AGTTACTACG AGAAAACTTG TCCCAAAGTC GAAGAGATCG TGAGATCTTC ACTTTCATCA ATGTTTATAC TTGATCCTAC TTCTCCGGCA GCCTTGCTAA GGCTTATGTT TCATGACTGC  CAAGTTCAGG GTTGTGACGC ATCAATCCTA CTCGAACCAA GTGGGGACCA ACAGTTCACT GAGCTTGATT CAGCCAAGAA CTTCGGAATC AGAAAGAGGG ACCTGATTGG CTCTATCAAA  ACCTCACTGG AACTTGAGTG TCCCAAGCAA GTCTCATGCT CCGACGTCAT CATCCTCGCC GCCAGAGACG CCGTGGCTCT CACCGGAGGC CCACTCATTT CCGTGCCACT AGGACGAAAA  GACTCTCTCT CCACTCCAAG CAAACATGTG GCAGACTCTG AGCTTCCTCC CTCCACTGCT GACGTGGACA CTACCTTGAA CCTCTTTGCA AGCAAAGGCA TGACCATTGA AGAGTCCGTA  GCCATCATGG GTGCGCATAC GATAGGAGTC ACACATTGCA ACAACGTATT ATCGCGTTTC GATAACGCAA ACGCGACAAG TGAGAACATG GATCCACGTT TTCAAACGTT TTTGCGTGTG  GCTTGTCCAG AGTTTTCTCC AACTTCTCAA GCTGCGGAAG CCACATTTGT CCCCAACGAT CAAACTTCAG TGATCTTCGA TACAGCTTAT TACGATGATG CAATCGCGGG ACGTGGAAAT  CTTAGAATTG ACTCGGAGAT TGGAGCTGAT CCACGTACAC GTCCGTTTGT CGAAGCGTTT GCGGCTGACC AAGACCGCTT CTTCAACGCT TTCTCTTCCG CGTTTGTAAA ATTGTCGTCT 
TACAAAGTGT TAACCGGGAG TGAAGGAGTA GTTAGAAGCG TATGTGACAA GGTTGACTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTCTCTCTC TTTTTTATAT GCAAAGTCAT CTTCTCTTTT AATTACATCA AATTCCAAAC AAAAGAGAGT GAGTGATGAA ACCAAAGAGC AAAGTTGCAG AATCTGCAGC TGCATCATGT  TTTCTTGTCA TAAGCTTGTT ATGTAGCTGC GTTAATGGTG ACCAAACGGA GACTAATAAT GAAGGCTTAT CTTACAGTTA CTACGAGAAA ACTTGTCCCA AAGTCGAAGA GATCGTGAGA  TCTTCACTTT CATCAATGTT TATACTTGAT CCTACTTCTC CGGCAGCCTT GCTAAGGCTT ATGTTTCATG ACTGCCAAGT TCAGGGTTGT GACGCATCAA TCCTACTCGA ACCAAGTGGG  GACCAACAGT TCACTGAGCT TGATTCAGCC AAGAACTTCG GAATCAGAAA GAGGGACCTG ATTGGCTCTA TCAAAACCTC ACTGGAACTT GAGTGTCCCA AGCAAGTCTC ATGCTCCGAC  GTCATCATCC TCGCCGCCAG AGACGCCGTG GCTCTCACCG GAGGCCCACT CATTTCCGTG CCACTAGGAC GAAAAGACTC TCTCTCCACT CCAAGCAAAC ATGTGGCAGA CTCTGAGCTT  CCTCCCTCCA CTGCTGACGT GGACACTACC TTGAACCTCT TTGCAAGCAA AGGCATGACC ATTGAAGAGT CCGTAGCCAT CATGGGTGCG CATACGATAG GAGTCACACA TTGCAACAAC  GTATTATCGC GTTTCGATAA CGCAAACGCG ACAAGTGAGA ACATGGATCC ACGTTTTCAA ACGTTTTTGC GTGTGGCTTG TCCAGAGTTT TCTCCAACTT CTCAAGCTGC GGAAGCCACA  TTTGTCCCCA ACGATCAAAC TTCAGTGATC TTCGATACAG CTTATTACGA TGATGCAATC GCGGGACGTG GAAATCTTAG AATTGACTCG GAGATTGGAG CTGATCCACG TACACGTCCG  TTTGTCGAAG CGTTTGCGGC TGACCAAGAC CGCTTCTTCA ACGCTTTCTC TTCCGCGTTT GTAAAATTGT CGTCTTACAA AGTGTTAACC GGGAGTGAAG GAGTAGTTAG AAGCGTATGT 
GACAAGGTTG ACTGA 

Retrieve as FASTA