Entry information : AhalPrx24(Araha.5406s0004)
Entry ID 14805
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-02-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AhalPrx24(Araha.5406s0004)
Name AhalPrx24(Araha.5406s0004)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx24
start..stop
S start..stop
AtPrx42 678 0 1..330 1..330
AlyPrx42 677 0 1..330 1..330
CrubPrx94 676 0 1..330 1..330
CagraPrx65 676 0 1..330 1..330
Literature and cross-references AhalPrx24(Araha.5406s0004)
Protein sequence: AhalPrx24(Araha.5406s0004)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (307)
PWM (Da):   %s   37185.06 (34727.9)  
PI (pH):   %s   7.98 (8.03) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGGKGVMMVA ILCLWALSAT SEAVTEAETG LVMNFYKDTC PQAEDIIREQ VKLLYKRHKN TAFSWLRNIF HDCAVESCDA SLLLDSTRRE LGEKEHDRSF GLRNFRYIEE IKEALERECP  GVVSCSDILV LSAREGIEAV GGPYIPLKTG RRDGLKSRTD MLESYLPDHN ESISVVLDKF KSIGIDTPGL VALLGSHSVG RTHCVKLVHR LYPEVDPSLN PDHVPHMLHK CPDSIPDPKA 
VQYVRNDRGT PMVLDNNYYR NILGNKGLLL VDHQLAHDKR TRPIVKKMAK DQAYFFKEFT RAIQILSENN PLTGSKGEIR KQCNLANKNH * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTGGTGAGA GAAATATTAC TTAACGTCTT TTGTCTTGGT ATTGAATCTT GCAGGCCCCA TGGTGAATGC AACGTTAAGG ATACGGATGA GTACAGTGTC CACTTGTCAA CGTTACAAAT  TTTGATAACC GGGTACATTG GAACTTAACC GGTAATCTAA TGATACCGGT TATTATCAAC AATTTTACAT CTTACACGTC AATTTTTTAG TTAGAACTTG CTAATCGGTG TTTAGCACTC  GTGGAGCCAC TGAGCTAGTG AGTGACATTA CTGAGAGGGT CCCCACAGAC TCATTTGGCC GACACTTGGA TAAGGAAACA AAGTGTCGGT GGTCACAGTA CTTCGTTTTT ATTGGAAAAT  CAAAATATCC AAATATGAGG TGACTTTTGA ATCTACGGAT TCAATGTGAT CTTGGTAAAA GCACCGATAC TTCTCCCAGA TTAAAAAATA AATAAATAAA TTCTAGGATT AAGAAAAGAA  GAAGAATAGA ATTTGTAGTA ACCTCTCATT TTATAGCTCT GTTAATATAT ATATAGGATA TATAATCTCT TTTATACATA TTTCCATATT TAGTTCATTT TAAACATTCT CATCAAAATT  CCTCACCTAA TGATAGTGGC TCTGTATTAA AATTAGCTAA AAGTATGAAA GAGAACATAA TTACAGGATT TCCGTATTTT TGTAGGGACA TAATATATAG TATATACCTA ATAAATTTCG  AAGTTAATGT GAAAATATTA AAACAACGTT TATGTTAAAA ACATATGAAA ATTTCTAAAT GCACTATGAA CTATTATCAT TATTTAAATT CTACCCACAA AACAGATAAA GCATAGGGAA  CACTCAAGAG TGAAGAGTGG TGAACGTGTT TTAATATAGC TCATCACATG GATCAAGATT CATTCAATAT TTGAGAAGAC TTTACATTTC ATAACTCTCT ACTGACAATT ACTACATTAA  GTAAAATAGT TGAATATATA AATAATTTCA GAACAAAAAG TAGTTGAATT AGTATAATTT AGAATAATCG AAATGTACTG GAAAAAAAAA ATTGAATCCA CCTTGACTTC ATCGAAAAGA  AAGATTCCGT AACATAAAGG AGCGGTTTAT CTATCCGCTG TATTAAAAGT TTAACAATAA CAAACGTTTT CAGATAATTG CAAATCGACC CGTGAACATT TCTTAACTTT AGCTATTAAA  CCCCATAAAT AATATTTGTT ATAGCCGCCC CCTTTGTTTG TATTAAGAAA AGAAGCAGAT TTTTTTTGTA ATGAGACCAA AATCCAAAAC TTTACTAAAT GTGAATGGTT TTGCTAACCA  GAACACCCTT CTAAATGAGG TAAATTATCT AAAATGCCAT CCACATTAAA ATCTCCAACA AACTTATTTA TTTGATCATA GCACTGTGTA GAACTCTAAC CAGCATGCTC TACGATCACT  CACACGTCCT TCGAAATAGC AACAAAGTGT GGTTTTAGAT TTCTTACCTA AATTAAACTT TCAGTACAAT GTCTGGCATA TATTTGATGG AACTATAAAA TAAAATGAGT AATTTCAAGT  GAAACTCCAT AAGTCACTTT TTATTAGTTA GTAAATCAAA TTTTAGAAAA TAAATATCAA GGCAACCAAC AGTCAATATG AATTATCAAC TTTTTTTTGT TTACATATAA ATTTTCGTAT  AATAAGTCTA CACTTTTCAT TGAATAAAAG ATTCTTAATC ACGACTGACG GAACATACAA TTATTGTAGG CTTATAATAA TATTTCTCAA AGTGAAAAAT GAATAAAGCT TAATGATATA  TGATCTGTCA CGTAAACTTA TAGAAACAGT AGCAAATTCA CCAACTTGCC TTAATTTACT ATAACCTTCA AATTAATTTT TTTCTTGCTC AAAAAAAAAG AAAAGAAAGA AAACTCCATT 
TCCCTTTATT TAAGGAGGCT GCATTGCTTG CCCACTGACT CAACTCAAGA GTGAAGAAAG AAAGAGAAAA AAAAAAAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA AAGGTGTGAT GATGGTGGCG ATACTTTGCC TTTGGGCACT CTCTGCAACA TCTGAAGCAG TAACAGAGGC GGAGACAGGT TTGGTGATGA ACTTCTACAA GGACACGTGT  CCTCAGGCTG AAGATATCAT CCGTGAACAA GTCAAACTCC TCTACAAACG CCACAAGAAC ACCGCTTTCT CTTGGCTCCG TAACATCTTC CACGACTGCG CCGTCGAGGT CTGATCTCTT  TCCCTCTCTC TCAATGATTA ATTCATTGTG TTAAAACATA GCTAAAGGTT TGATCTTTCA CTTGAAACAG AGCCAACGAT TTACTCTGTT TTTGCTTTGT TTTTTGGGTG TAACAGTCGT  GTGATGCGTC GCTTTTGCTG GATTCGACAA GAAGAGAGCT AGGAGAGAAA GAACATGACA GGAGCTTCGG ACTGAGAAAC TTCAGGTACA TCGAGGAGAT CAAGGAAGCT CTTGAGAGGG  AGTGTCCTGG TGTTGTCTCA TGTTCCGACA TTCTCGTCTT GTCGGCAAGA GAAGGAATCG AAGCAGTAAG TTATAACAAG TCGTGCCGTT TCTCCCTCTG ATTATGAACC TGCATGTTGT  TTTTTCTTTT TTAGGGAATG TTTTGTAAAG TTGGTGTGTT TGTGTAGGTG GGAGGACCAT ATATTCCTTT GAAGACAGGA AGGAGAGATG GACTTAAAAG CAGGACCGAT ATGCTTGAGT  CGTATCTTCC CGACCACAAC GAGAGTATCT CCGTCGTTCT TGACAAGTTC AAATCCATCG GAATCGACAC TCCCGGCCTC GTTGCCCTCC TAGGTACCGT TACCTTTCTC TTCCTTGAGT  GTCACTCAAT TGTCTCCGGT AAAAACGTAT CGCTCGAAAT TCAAAAGTGT TGACCATCCA AGAAATGTTG TTGCTAACGC CCTAGGTGGC TAGGTTAAGG GTATTTTAGT TAATTTCCTC  ATGCATGAAA ATGAAACCAC TTAAGCTAAT CTTGTCAAAT CACGAAAGGA GTATGCGATC TGAGTCGGAA AATTGAAAGT TATCCTTACC GAACTATCAC TAGTCCTCAG AAAAAGATAA  GATTATCCTT GTTTATGCTC CGGCTCAATG GTCTAGCACA AGGTTATTCT GGTCAATCAA CACATGCATG CTTAAAAATA GTAATCAAAC TAATTGACTT TACACTTATG GGATCTGAAT  TTAGGCGATC GGAATTTAAG TTTCTTGTTA GATTTTTTAA GCTTCGATAT TGAAAGATTT TGACTTTTTT GTTTTGACAC GTGCAGGGTC ACACAGCGTG GGAAGAACTC ATTGTGTCAA  GCTGGTCCAT CGTTTGTACC CTGAGGTGGA TCCGTCCTTG AACCCGGACC ACGTCCCTCA CATGCTACAC AAGTGTCCTG ACTCTATCCC TGACCCAAAG GCGGTCCAGT ACGTGCGTAA  CGACCGTGGC ACCCCCATGG TGCTAGACAA CAATTACTAC CGTAACATCC TAGGCAACAA GGGTTTGCTT CTTGTGGACC ATCAGCTCGC ACACGACAAA CGAACTAGAC CAATTGTTAA  GAAGATGGCT AAGGACCAGG CCTACTTCTT CAAGGAGTTC ACTAGGGCAA TCCAGATCTT ATCCGAGAAC AACCCTTTGA CTGGCTCTAA GGGTGAGATC AGGAAGCAAT GTAATCTTGC 
AAACAAGAAC CATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA AAGGTGTGAT GATGGTGGCG ATACTTTGCC TTTGGGCACT CTCTGCAACA TCTGAAGCAG TAACAGAGGC GGAGACAGGT TTGGTGATGA ACTTCTACAA GGACACGTGT  CCTCAGGCTG AAGATATCAT CCGTGAACAA GTCAAACTCC TCTACAAACG CCACAAGAAC ACCGCTTTCT CTTGGCTCCG TAACATCTTC CACGACTGCG CCGTCGAGTC GTGTGATGCG  TCGCTTTTGC TGGATTCGAC AAGAAGAGAG CTAGGAGAGA AAGAACATGA CAGGAGCTTC GGACTGAGAA ACTTCAGGTA CATCGAGGAG ATCAAGGAAG CTCTTGAGAG GGAGTGTCCT  GGTGTTGTCT CATGTTCCGA CATTCTCGTC TTGTCGGCAA GAGAAGGAAT CGAAGCAGTG GGAGGACCAT ATATTCCTTT GAAGACAGGA AGGAGAGATG GACTTAAAAG CAGGACCGAT  ATGCTTGAGT CGTATCTTCC CGACCACAAC GAGAGTATCT CCGTCGTTCT TGACAAGTTC AAATCCATCG GAATCGACAC TCCCGGCCTC GTTGCCCTCC TAGGGTCACA CAGCGTGGGA  AGAACTCATT GTGTCAAGCT GGTCCATCGT TTGTACCCTG AGGTGGATCC GTCCTTGAAC CCGGACCACG TCCCTCACAT GCTACACAAG TGTCCTGACT CTATCCCTGA CCCAAAGGCG  GTCCAGTACG TGCGTAACGA CCGTGGCACC CCCATGGTGC TAGACAACAA TTACTACCGT AACATCCTAG GCAACAAGGG TTTGCTTCTT GTGGACCATC AGCTCGCACA CGACAAACGA  ACTAGACCAA TTGTTAAGAA GATGGCTAAG GACCAGGCCT ACTTCTTCAA GGAGTTCACT AGGGCAATCC AGATCTTATC CGAGAACAAC CCTTTGACTG GCTCTAAGGG TGAGATCAGG 
AAGCAATGTA ATCTTGCAAA CAAGAACCAT TGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAAAGAGAAA AAAAAAAAAA ATGGGAGGCA AAGGTGTGAT GATGGTGGCG ATACTTTGCC TTTGGGCACT CTCTGCAACA TCTGAAGCAG TAACAGAGGC GGAGACAGGT TTGGTGATGA  ACTTCTACAA GGACACGTGT CCTCAGGCTG AAGATATCAT CCGTGAACAA GTCAAACTCC TCTACAAACG CCACAAGAAC ACCGCTTTCT CTTGGCTCCG TAACATCTTC CACGACTGCG  CCGTCGAGTC GTGTGATGCG TCGCTTTTGC TGGATTCGAC AAGAAGAGAG CTAGGAGAGA AAGAACATGA CAGGAGCTTC GGACTGAGAA ACTTCAGGTA CATCGAGGAG ATCAAGGAAG  CTCTTGAGAG GGAGTGTCCT GGTGTTGTCT CATGTTCCGA CATTCTCGTC TTGTCGGCAA GAGAAGGAAT CGAAGCAGTG GGAGGACCAT ATATTCCTTT GAAGACAGGA AGGAGAGATG  GACTTAAAAG CAGGACCGAT ATGCTTGAGT CGTATCTTCC CGACCACAAC GAGAGTATCT CCGTCGTTCT TGACAAGTTC AAATCCATCG GAATCGACAC TCCCGGCCTC GTTGCCCTCC  TAGGGTCACA CAGCGTGGGA AGAACTCATT GTGTCAAGCT GGTCCATCGT TTGTACCCTG AGGTGGATCC GTCCTTGAAC CCGGACCACG TCCCTCACAT GCTACACAAG TGTCCTGACT  CTATCCCTGA CCCAAAGGCG GTCCAGTACG TGCGTAACGA CCGTGGCACC CCCATGGTGC TAGACAACAA TTACTACCGT AACATCCTAG GCAACAAGGG TTTGCTTCTT GTGGACCATC  AGCTCGCACA CGACAAACGA ACTAGACCAA TTGTTAAGAA GATGGCTAAG GACCAGGCCT ACTTCTTCAA GGAGTTCACT AGGGCAATCC AGATCTTATC CGAGAACAAC CCTTTGACTG  GCTCTAAGGG TGAGATCAGG AAGCAATGTA ATCTTGCAAA CAAGAACCAT TGAAGTTGGA AAAAGTGAGA AAGACAGAGG CTCTGGTGTG TTGGGATCTC TGCTTGGTAC GAACTAAGAT  GAATAAAAAA ATCTTTTAAG TTAAATCAAA GAAAGGGTGA TGATGAATGC ATCATGGTGG TGACCACATT CTTCTTTTGT GTGTTCTTGT TGCAGCCTTA ATGCTTTAAT TATGATGTTT 
AGTGGCT 

Retrieve as FASTA