Entry information : AhalPrx27Araha.14055s0005
Entry ID 14808
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx27Araha.14055s0005
Name AhalPrx27Araha.14055s0005
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx27
start..stop
S start..stop
AhalPrx37 676 0 1..346 1..346
AlyPrx38-1 673 0 1..346 1..346
AlyPrx38-2 666 0 1..346 1..346
AtPrx38 655 0 1..346 1..346
Literature and cross-references AhalPrx27Araha.14055s0005
Protein sequence: AhalPrx27Araha.14055s0005
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (324)
PWM (Da):   %s   38158.33 (35607.9)  
PI (pH):   %s   7.99 (7.68) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-346
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MHSSLMKLGF LLLLLQVSLS HAQLSPSFYD KTCPQVFDIV TNTIVNALRS DPRIAASILR LHFHDCFVNG CDASILLDNT TSFRTEKDAF GNANSARGFD VIDKMKAAVE KACPRTVSCA  DMLAIAAQES VVLAGGPSWR VPNGRRDSLR GFMDLANNNL PGPSSTLKVL KDRFKNVGLD RTSDLVALSG GHTFGKNQCQ FIIDRLYNFG ETGLPDPTLD KSYLATLRKQ CPRNGNQSVL 
VDFDLRTPTV FDNKYYVNLK ENKGLIQSDQ ELFSSPDASD TIPLVREYAD GQGKFFDAFT KAMIRMSSLS PLTGKQGEIR LNCRVVNSKS RIMDVVEDAI EFASSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCATTCCT CTTTGATGAA ATTGGGATTT CTTCTTCTTC TTCTTCAGGT CTCATTGTCT CATGCTCAAC TAAGCCCTTC CTTTTACGAT AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGACATTGTA  ACCAATACCA TTGTCAATGC ACTGAGATCA GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGTA AGATACCACT AGATTCGATA AACTCGATAA  ATTCATGTAT ATATTAAGTC TTTTGGTTCT TTGATAGTTT ATCCATAATA GTGAGAATGC TTTACGGATA GTATAAACTT GAAATAAGGA TATGATATTT ATAAACCTGA AAACGTGATA  GACATCTCGG TTTAAACTCA AACTACAGAT TTCTTTTGAT AGTTTGGTTT TGAAATTTTG GCTTTCTTTG TTAGATAAAA AAAAAACAAA GTAAGAAAAG AAAGTTATTT ATACATATAA  AAATTTCTGC TTTTCTTAGA TAAATTATTT TTTGGAAGTT TGATTTTGTT TGTTTTGACT AGTTTTTGGT TCAATTTGGA GCGGCTATAT TTACTATGGA CCAACCACTT CTTTAGGAAA  TGGATGACTA TTTTGCTTTC TTATCTCAAG TGTCAGATTT TGTCGTCAAA GTATAGTCAA AAATTAAAAT TCTTTTAGAT TATTAGATAA TAATTAGTTA ACTCATAATT TTTTCCTTGC  AATATTCTTT TGGATTATTA GATTTCGTAG CTCATTAATT TCGTGGCGTA ATAGTGGCGC ACTAATGCTG TTTTCGGATT TCGGATTCAC GTGAACAAGT TTAAGCTAGC TAGCTAGTGA  TTGTGTGATA CTAGATTTAC TATTTTTCTT GGGGTAAAAG AGAAGAAAAA AAATGCAGTA GTTGCGGGTA AATTATGTAT GTGGAAGTAT AGCTGGTTCA TATATAAATT CAAAAATTAA  ATAAACTGTT TATACAGATG TTGTGATTTA ACAATGTAAC TAATATTTTG TGTGAAAAAA GGGATGTGAT GCATCGATAT TGTTAGACAA CACAACATCG TTTAGGACAG AGAAAGATGC  GTTTGGGAAC GCTAATTCCG CTCGAGGTTT CGATGTGATC GACAAAATGA AGGCTGCCGT GGAGAAAGCA TGTCCTAGAA CTGTTTCGTG TGCTGATATG CTCGCCATCG CAGCTCAAGA  ATCTGTCGTT TTGGTATGCA TCTTTTACTA TGCTATGCAA ATGGTTTCTA GAGTATCATT TTGTTAACTT TTTAAGGAGG ATAAAGTATT TAGACCAAAT ATAATTGTTT ACTTTAGGCA  GGAGGTCCTT CATGGAGGGT TCCAAATGGA AGAAGAGACA GCTTAAGAGG GTTTATGGAT CTTGCTAATA ATAACCTTCC AGGTCCATCC TCTACCCTTA AAGTACTTAA GGATAGATTC  AAAAATGTCG GACTCGACCG TACTTCTGAT CTCGTTGCTC TTTCCGGTAT GTTATCTCAT TTGAAACATT TTCATCTATA GAATTGTAAT CACTAACAAC TCTACATGAG TATTGGTTTA  GTTTATTTAT AATTTTGATA TTTTTTCTTT CGTTAGGTGG TCACACCTTT GGCAAAAACC AATGTCAGTT CATAATAGAT CGCCTTTACA ACTTCGGTGA AACCGGTTTA CCCGATCCGA  CCCTCGATAA ATCTTACCTC GCAACACTCA GAAAACAATG TCCACGTAAC GGAAACCAGA GTGTCTTGGT AGATTTTGAT TTACGTACGC CAACAGTCTT TGACAACAAA TACTATGTGA  ATCTCAAGGA GAACAAAGGA CTTATCCAGA GCGACCAAGA GTTATTCTCT AGCCCTGATG CTTCAGACAC TATCCCTTTA GTCCGAGAAT ACGCTGATGG TCAAGGGAAA TTTTTTGATG  CGTTCACGAA GGCAATGATA AGGATGAGTA GTCTTTCACC TTTAACAGGG AAACAAGGAG AAATTAGATT GAACTGTAGA GTGGTGAATT CGAAATCGAG AATCATGGAT GTGGTAGAAG 
ATGCTATTGA ATTTGCTAGC TCAATGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCATTCCT CTTTGATGAA ATTGGGATTT CTTCTTCTTC TTCTTCAGGT CTCATTGTCT CATGCTCAAC TAAGCCCTTC CTTTTACGAT AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGACATTGTA  ACCAATACCA TTGTCAATGC ACTGAGATCA GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCAT CGATATTGTT AGACAACACA  ACATCGTTTA GGACAGAGAA AGATGCGTTT GGGAACGCTA ATTCCGCTCG AGGTTTCGAT GTGATCGACA AAATGAAGGC TGCCGTGGAG AAAGCATGTC CTAGAACTGT TTCGTGTGCT  GATATGCTCG CCATCGCAGC TCAAGAATCT GTCGTTTTGG CAGGAGGTCC TTCATGGAGG GTTCCAAATG GAAGAAGAGA CAGCTTAAGA GGGTTTATGG ATCTTGCTAA TAATAACCTT  CCAGGTCCAT CCTCTACCCT TAAAGTACTT AAGGATAGAT TCAAAAATGT CGGACTCGAC CGTACTTCTG ATCTCGTTGC TCTTTCCGGT GGTCACACCT TTGGCAAAAA CCAATGTCAG  TTCATAATAG ATCGCCTTTA CAACTTCGGT GAAACCGGTT TACCCGATCC GACCCTCGAT AAATCTTACC TCGCAACACT CAGAAAACAA TGTCCACGTA ACGGAAACCA GAGTGTCTTG  GTAGATTTTG ATTTACGTAC GCCAACAGTC TTTGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAG GAGAACAAAG GACTTATCCA GAGCGACCAA GAGTTATTCT CTAGCCCTGA TGCTTCAGAC  ACTATCCCTT TAGTCCGAGA ATACGCTGAT GGTCAAGGGA AATTTTTTGA TGCGTTCACG AAGGCAATGA TAAGGATGAG TAGTCTTTCA CCTTTAACAG GGAAACAAGG AGAAATTAGA 
TTGAACTGTA GAGTGGTGAA TTCGAAATCG AGAATCATGG ATGTGGTAGA AGATGCTATT GAATTTGCTA GCTCAATGTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCATTCCT CTTTGATGAA ATTGGGATTT CTTCTTCTTC TTCTTCAGGT CTCATTGTCT CATGCTCAAC TAAGCCCTTC CTTTTACGAT AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGACATTGTA  ACCAATACCA TTGTCAATGC ACTGAGATCA GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCAT CGATATTGTT AGACAACACA  ACATCGTTTA GGACAGAGAA AGATGCGTTT GGGAACGCTA ATTCCGCTCG AGGTTTCGAT GTGATCGACA AAATGAAGGC TGCCGTGGAG AAAGCATGTC CTAGAACTGT TTCGTGTGCT  GATATGCTCG CCATCGCAGC TCAAGAATCT GTCGTTTTGG CAGGAGGTCC TTCATGGAGG GTTCCAAATG GAAGAAGAGA CAGCTTAAGA GGGTTTATGG ATCTTGCTAA TAATAACCTT  CCAGGTCCAT CCTCTACCCT TAAAGTACTT AAGGATAGAT TCAAAAATGT CGGACTCGAC CGTACTTCTG ATCTCGTTGC TCTTTCCGGT GGTCACACCT TTGGCAAAAA CCAATGTCAG  TTCATAATAG ATCGCCTTTA CAACTTCGGT GAAACCGGTT TACCCGATCC GACCCTCGAT AAATCTTACC TCGCAACACT CAGAAAACAA TGTCCACGTA ACGGAAACCA GAGTGTCTTG  GTAGATTTTG ATTTACGTAC GCCAACAGTC TTTGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAG GAGAACAAAG GACTTATCCA GAGCGACCAA GAGTTATTCT CTAGCCCTGA TGCTTCAGAC  ACTATCCCTT TAGTCCGAGA ATACGCTGAT GGTCAAGGGA AATTTTTTGA TGCGTTCACG AAGGCAATGA TAAGGATGAG TAGTCTTTCA CCTTTAACAG GGAAACAAGG AGAAATTAGA 
TTGAACTGTA GAGTGGTGAA TTCGAAATCG AGAATCATGG ATGTGGTAGA AGATGCTATT GAATTTGCTA GCTCAATGTG A 

Retrieve as FASTA