Entry information : AhalPrx29Araha.13092s0001
Entry ID 14810
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx29Araha.13092s0001
Name AhalPrx29Araha.13092s0001
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx29
start..stop
S start..stop
AlyPrx32 713 0 1..352 1..352
AtPrx32 702 0 1..352 1..352
BstrPrx67 686 0 1..352 1..352
CrubPrx101 679 0 1..352 21..372
Literature and cross-references AhalPrx29Araha.13092s0001
Protein sequence: AhalPrx29Araha.13092s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   352 (323)
PWM (Da):   %s   38776.46 (35573.9)  
PI (pH):   %s   7.05 (6.88) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-352
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNFSHSSLST WTTIITLGCL LLHSSNSSAQ LTPTFYDNTC PNVFTIVRNT IVNELRSDPR IAASILRLHF HDCFVNGCDA SILLDNTTSF QTEKDAAPNA NSARGFPVID RMKAAVETAC  PRTVSCADIL TIAAQQSVNL AGGPSWRVPL GRRDSLQAFF ALANANLPAP FFTLPQLKAS FQNVGLNRPS DLVALSGGHT FGKNQCQFIM DRLYNFSNTG LPDPTLNTTY LQILRGQCPR 
NGNQTVLVDF DFRTPTVFDN KYYVNLKELK GLIQTDQELF SSPNATDTVP LVREYADGTQ KFFNAFVEAM NRMGNITPLT GTQGQIRQNC RVVNSNSLLH DVVEIVDFVS SI* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCATCTTACC AAAAATGAAT TTCTCTCATT CTTCCTTGTC AACTTGGACA ACCATAATAA CATTGGGTTG TCTTCTGCTT CATTCATCCA ATTCCAGTGC TCAGCTAACC CCAACCTTCT  ATGACAATAC ATGCCCCAAC GTCTTTACCA TCGTACGGAA CACCATCGTA AACGAGCTAA GATCAGATCC TCGTATCGCT GCAAGCATCC TTCGTCTTCA CTTCCACGAC TGCTTCGTCA  ATGTAATATA ATTATTTTTC ACCTTCTATT TTTTGGGTAA ACAATTTGAA GTAAACTTTC TTTGAGATAT ATATGTATGT ATATGTTAGT ATATTTTATA ATTACGTCCT TTAACAAAGA  AACAAAAAAC TTTTATAATT ACATCCAAGA CTTCCTTTTC CAATTTTCTT ACATATAAGT ATATAACAGA ATATATTTTG TACGAATATA TATGATTCAT GTATTTTTTT CTAACTATTT  ATGTGTTGTC AACTTACTTT AATTTACAGT TTGGATAGGC TTGTATTTAT GATAATTGAT TTCTGATAAA TATTGGGTAA AGGCGCCACT CAAGAAAAAC CAGTTACATC TTTGTCAACA  CATGGTTTGT TGATAACTAC AAAACGAAAA GACGTGGTTT AGGGCCTTCG TATTTCTAAA TTATTCAAAG GTTTAGATGA TTTTATTAAT TAGAATAATA TTTGTATATT TAGAATTAGT  TACCATGATA TGTTATCCAC ACTTATAGGT CACTGGGCTA ATTAACGAAT CTGGTTTAGA GATATATATC ACATATACAA TTTCCGGAAG TTAGATGTGA TATTTTTTGG TTTTTACTGT  CGAGTATCTT AGCTCTTGTC GTCAAGATGA CTACCATGAT CACTTATTAA GAAAATGATT CCACAACGTT TAGTAAGATT TGATCTCCCA TTCAACGAAC GTAAATTATT CGTATAATAA  TTTAAGAAAA GCATGGACCC GTACCATACC AAACACGTTA TGACTTTATA TCAATCATTT ATTGAAGGTT GAAAAATAAC ATATTTTCAT ATTAATTATA TAAATCGTTC AAAAGTTATT  TATTATTTCA GGGAAAGCTT CAACTCTCGA ATCAGATGTA GTTGTTAACC TAATACATAA TGTTGAATTT ATGTGTTAGA AGATTTATAT AATGTAAACT AAAATGAATA CTAATTTGTT  TATACTAAAT CATCACGCCT TACTTCAGAA GAACAAACCT TTTTGGAATA TATATATATC ATTATGTTTT CAATATATGT TGACTAATTA GTGAACAAAT AATTTTTGTT TGTAAAGGGC  TGTGATGCAT CGATTCTGTT AGACAACACA ACATCCTTTC AAACTGAGAA AGACGCTGCT CCAAACGCAA ACTCGGCTCG AGGATTTCCA GTGATTGATA GAATGAAAGC AGCAGTAGAG  ACAGCATGTC CAAGAACTGT TTCATGCGCA GATATACTTA CCATCGCAGC TCAACAATCT GTAAATCTGG TATGCACCAT TAATTTATCT CTCTTTTTTC ATTTATTACA AACATTGTCT  CAAATTCTTC TGTGAAGTCG TCACGGAACA TATTAAAACA TGAAAAGATA GTATTGCAAA TAAATAGGTG GACTGCTGCA GCTTGGAAGT TGTACCTTTT AGATTTAATT AATAGTATTG  AAAAAGGTTA TCTACTATAC CAGACATGTC TATAAGATTC ATTGTGAAAA ATATTTAAAA CGCATGGTAA TAATATCAAG TCTCATTACA ATTATAAATT TCATTACAAT AAAAATATCA  AGTCTCCTAT TTTGGTAACT ATAAAGAACA TAATCATATT TTTCTAAAGT TTTTAAAACC CATGCATAAA ACTTTGGGAA CCTAATTGTT GAATTTATAT TATACATTTG TCTTTTTGGT  TTTGTTAATA GTAACTAACA CTTCGACATG GTAAGATATA CTTTCGAAAA CAAATTATTA TTTTTAAATA TAAATGTTTT AGGCAGGAGG TCCTTCTTGG AGGGTTCCTT TGGGGAGAAG  AGATAGCTTA CAAGCATTCT TTGCTCTTGC TAATGCAAAT CTTCCCGCTC CATTTTTCAC GCTCCCACAA CTTAAGGCTA GCTTTCAAAA TGTTGGACTT AACCGTCCCT CTGATCTCGT  TGCACTCTCT GGTAATTATT ATGAGATATA ATAACAAGAA TCTTCATGCT CTAATAAGTT TAAAAACTTT ATTGTTAACT TATCTCTTAT TTTGGTTAGG TGGTCACACA TTTGGTAAAA  ACCAATGCCA ATTTATTATG GATAGGCTAT ACAACTTTAG CAACACTGGT TTACCCGACC CTACTCTTAA TACTACATAC CTCCAGATAC TTCGTGGACA ATGTCCCCGG AATGGTAATC  AGACCGTCTT GGTCGATTTC GATTTTCGTA CACCGACGGT TTTTGACAAT AAATACTATG TGAATCTGAA AGAGCTAAAG GGACTTATCC AGACCGATCA AGAGTTGTTT TCCAGCCCTA  ATGCCACTGA CACAGTCCCC TTGGTGAGAG AATATGCCGA TGGCACTCAA AAATTCTTCA ATGCTTTTGT TGAAGCCATG AATAGGATGG GAAACATTAC ACCTCTCACT GGAACTCAAG  GACAAATCAG ACAGAATTGT AGGGTGGTCA ACTCCAACTC GCTGCTACAT GATGTGGTTG AAATTGTTGA CTTTGTCAGC TCTATATAAC ATAATATTGT CTCGATATAT GTGGCAACCA 
AAAATATATG TTTTATGAAA TAAAGTGTTC TCGAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATTTCT CTCATTCTTC CTTGTCAACT TGGACAACCA TAATAACATT GGGTTGTCTT CTGCTTCATT CATCCAATTC CAGTGCTCAG CTAACCCCAA CCTTCTATGA CAATACATGC  CCCAACGTCT TTACCATCGT ACGGAACACC ATCGTAAACG AGCTAAGATC AGATCCTCGT ATCGCTGCAA GCATCCTTCG TCTTCACTTC CACGACTGCT TCGTCAATGG CTGTGATGCA  TCGATTCTGT TAGACAACAC AACATCCTTT CAAACTGAGA AAGACGCTGC TCCAAACGCA AACTCGGCTC GAGGATTTCC AGTGATTGAT AGAATGAAAG CAGCAGTAGA GACAGCATGT  CCAAGAACTG TTTCATGCGC AGATATACTT ACCATCGCAG CTCAACAATC TGTAAATCTG GCAGGAGGTC CTTCTTGGAG GGTTCCTTTG GGGAGAAGAG ATAGCTTACA AGCATTCTTT  GCTCTTGCTA ATGCAAATCT TCCCGCTCCA TTTTTCACGC TCCCACAACT TAAGGCTAGC TTTCAAAATG TTGGACTTAA CCGTCCCTCT GATCTCGTTG CACTCTCTGG TGGTCACACA  TTTGGTAAAA ACCAATGCCA ATTTATTATG GATAGGCTAT ACAACTTTAG CAACACTGGT TTACCCGACC CTACTCTTAA TACTACATAC CTCCAGATAC TTCGTGGACA ATGTCCCCGG  AATGGTAATC AGACCGTCTT GGTCGATTTC GATTTTCGTA CACCGACGGT TTTTGACAAT AAATACTATG TGAATCTGAA AGAGCTAAAG GGACTTATCC AGACCGATCA AGAGTTGTTT  TCCAGCCCTA ATGCCACTGA CACAGTCCCC TTGGTGAGAG AATATGCCGA TGGCACTCAA AAATTCTTCA ATGCTTTTGT TGAAGCCATG AATAGGATGG GAAACATTAC ACCTCTCACT 
GGAACTCAAG GACAAATCAG ACAGAATTGT AGGGTGGTCA ACTCCAACTC GCTGCTACAT GATGTGGTTG AAATTGTTGA CTTTGTCAGC TCTATATAA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCATCTTACC AAAAATGAAT TTCTCTCATT CTTCCTTGTC AACTTGGACA ACCATAATAA CATTGGGTTG TCTTCTGCTT CATTCATCCA ATTCCAGTGC TCAGCTAACC CCAACCTTCT  ATGACAATAC ATGCCCCAAC GTCTTTACCA TCGTACGGAA CACCATCGTA AACGAGCTAA GATCAGATCC TCGTATCGCT GCAAGCATCC TTCGTCTTCA CTTCCACGAC TGCTTCGTCA  ATGGCTGTGA TGCATCGATT CTGTTAGACA ACACAACATC CTTTCAAACT GAGAAAGACG CTGCTCCAAA CGCAAACTCG GCTCGAGGAT TTCCAGTGAT TGATAGAATG AAAGCAGCAG  TAGAGACAGC ATGTCCAAGA ACTGTTTCAT GCGCAGATAT ACTTACCATC GCAGCTCAAC AATCTGTAAA TCTGGCAGGA GGTCCTTCTT GGAGGGTTCC TTTGGGGAGA AGAGATAGCT  TACAAGCATT CTTTGCTCTT GCTAATGCAA ATCTTCCCGC TCCATTTTTC ACGCTCCCAC AACTTAAGGC TAGCTTTCAA AATGTTGGAC TTAACCGTCC CTCTGATCTC GTTGCACTCT  CTGGTGGTCA CACATTTGGT AAAAACCAAT GCCAATTTAT TATGGATAGG CTATACAACT TTAGCAACAC TGGTTTACCC GACCCTACTC TTAATACTAC ATACCTCCAG ATACTTCGTG  GACAATGTCC CCGGAATGGT AATCAGACCG TCTTGGTCGA TTTCGATTTT CGTACACCGA CGGTTTTTGA CAATAAATAC TATGTGAATC TGAAAGAGCT AAAGGGACTT ATCCAGACCG  ATCAAGAGTT GTTTTCCAGC CCTAATGCCA CTGACACAGT CCCCTTGGTG AGAGAATATG CCGATGGCAC TCAAAAATTC TTCAATGCTT TTGTTGAAGC CATGAATAGG ATGGGAAACA  TTACACCTCT CACTGGAACT CAAGGACAAA TCAGACAGAA TTGTAGGGTG GTCAACTCCA ACTCGCTGCT ACATGATGTG GTTGAAATTG TTGACTTTGT CAGCTCTATA TAACATAATA 
TTGTCTCGAT ATATGTGGCA ACCAAAAATA TATGTTTTAT GAAATAAAGT GTTCTCGAA 

Retrieve as FASTA