Entry information : AhalPrx33Araha.2549s0014
Entry ID 14814
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx33Araha.2549s0014
Name AhalPrx33Araha.2549s0014
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx011]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx33
start..stop
S start..stop
AtPrx50 627 0 1..327 3..329
AlyPrx50 624 0 23..327 23..327
CrubPrx73 622 0 22..327 25..330
BstrPrx06 621 0 21..327 23..329
Literature and cross-references AhalPrx33Araha.2549s0014
Protein sequence: AhalPrx33Araha.2549s0014
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (304)
PWM (Da):   %s   35872.26 (33233.7) Transmb domain:   %s   i7-25o
PI (pH):   %s   8.72 (8.56) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-327
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVNKTNLLLL LLSLFLILNL SSAQLRRNFY AGSCPNVEQI VRNAVQKKVQ QTFTTIPATL RLYFHDCFVN GCDASVMIAS TDNNKAEKDH EENLSLAGDG FDTVTKAKEA LDAVPNCRNK  VSCADILTMA TRDVVNLAGG PKYDVELGRL DGLSSTAASV GGKLPHPTDD VNKLTSLFAK NGLSLNDMIA LSGAHTLGFA HCTKVFNRIY TFNKTTKVDP TVNKDYVTEL KASCPQNIDP 
RVAINMDPTT PRQFDNVYYK NLQQGKGLFT SDQVLFEDRR SKPTVDLWAS NGQLFNQAFI NSMIKLGRVG VKTGSNGNIR RDCGAFN* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAAAGAGACA TTGAGATTGA GTAAAAATAG TTTTTAAAAA TAGTTATGGT GAACAAAACG AATCTATTAT TGCTTCTTCT CTCTCTCTTT CTCATCCTCA ACCTCTCCTC CGCTCAACTC  CGCCGCAACT TCTACGCCGG AAGTTGTCCT AACGTCGAAC AAATCGTCAG AAACGCCGTT CAGAAAAAAG TCCAACAAAC TTTCACCACC ATTCCCGCCA CTCTCCGCCT CTATTTCCAC  GATTGTTTCG TCAATGTAAA ACATAATTTT TTATTGATAA TTTTCTTTTC TTGCGTAAAT TTAATTTATT ATTTTGTCTA ATTTATGGAT TAATTGATTA ATAATCATAG GGGTGTGATG  CATCTGTGAT GATAGCGTCG ACTGATAATA ATAAGGCGGA GAAGGATCAT GAGGAGAATC TATCGTTGGC CGGAGATGGA TTCGACACCG TCACTAAAGC TAAAGAAGCT CTCGACGCCG  TCCCAAATTG TCGTAACAAA GTTTCTTGCG CTGATATTCT CACTATGGCC ACTCGTGACG TCGTTAATCT TGTTAGTAAC TCATTCATAT TTATATAATA TAATGTTTTG TTAAATTAAA  ACATTATTGT TAAGTTCTTA AATTAAATTC AATATAGGCG GGTGGACCAA AATACGACGT GGAATTGGGA AGGCTGGATG GATTATCGTC AACGGCGGCT AGCGTCGGAG GGAAGTTGCC  TCATCCGACC GACGATGTCA ATAAACTCAC TTCACTTTTC GCGAAAAACG GCCTTAGCCT TAACGACATG ATCGCTCTCT CCGGTAAGAA GATTTGAACT ACTTCTTGAT CAAGAATAGT  ATCATTCGGA CCAAACAAAT TAGCTATATA TAGTAGTGAT TTCAATTTGG TAATATTTCG GTTTAGCTTC ATGTGGTTAT CGGTTTATAT ATCCGGTCCT AATTTACATT TGGTTTGATA  TTAAACATCT CAGGGGCACA CACATTAGGA TTCGCGCATT GCACAAAAGT GTTCAATCGG ATATACACTT TCAACAAGAC AACTAAAGTG GATCCCACGG TTAACAAAGA TTACGTGACA  GAGCTAAAAG CGTCGTGTCC TCAAAACATA GATCCAAGAG TGGCTATAAA CATGGACCCA ACAACACCAA GACAATTCGA CAACGTTTAC TACAAAAACT TGCAACAGGG CAAAGGATTG  TTCACGTCTG ATCAAGTCTT ATTCGAGGAT CGTCGGTCAA AGCCAACCGT TGACTTATGG GCTAGTAATG GACAGTTATT TAATCAAGCT TTTATTAACT CGATGATCAA GCTTGGTCGT  GTTGGTGTTA AAACCGGTAG TAATGGTAAT ATCCGTCGTG ATTGTGGAGC TTTTAATTAA TTTAAATATA TCTGGTTTAG ATTTTGTTTA TCTTCATTCA GTTGTATTTG GGGATTGGAT 
GGGTCTCATG AAGCTTTCAG ATATAATTGT AATAAATTTC AGTTTTGGGT TTCAGTTTGC TATATCGCAA AACCTAAATT GTAACATAGA G 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAACA AAACGAATCT ATTATTGCTT CTTCTCTCTC TCTTTCTCAT CCTCAACCTC TCCTCCGCTC AACTCCGCCG CAACTTCTAC GCCGGAAGTT GTCCTAACGT CGAACAAATC  GTCAGAAACG CCGTTCAGAA AAAAGTCCAA CAAACTTTCA CCACCATTCC CGCCACTCTC CGCCTCTATT TCCACGATTG TTTCGTCAAT GGGTGTGATG CATCTGTGAT GATAGCGTCG  ACTGATAATA ATAAGGCGGA GAAGGATCAT GAGGAGAATC TATCGTTGGC CGGAGATGGA TTCGACACCG TCACTAAAGC TAAAGAAGCT CTCGACGCCG TCCCAAATTG TCGTAACAAA  GTTTCTTGCG CTGATATTCT CACTATGGCC ACTCGTGACG TCGTTAATCT TGCGGGTGGA CCAAAATACG ACGTGGAATT GGGAAGGCTG GATGGATTAT CGTCAACGGC GGCTAGCGTC  GGAGGGAAGT TGCCTCATCC GACCGACGAT GTCAATAAAC TCACTTCACT TTTCGCGAAA AACGGCCTTA GCCTTAACGA CATGATCGCT CTCTCCGGGG CACACACATT AGGATTCGCG  CATTGCACAA AAGTGTTCAA TCGGATATAC ACTTTCAACA AGACAACTAA AGTGGATCCC ACGGTTAACA AAGATTACGT GACAGAGCTA AAAGCGTCGT GTCCTCAAAA CATAGATCCA  AGAGTGGCTA TAAACATGGA CCCAACAACA CCAAGACAAT TCGACAACGT TTACTACAAA AACTTGCAAC AGGGCAAAGG ATTGTTCACG TCTGATCAAG TCTTATTCGA GGATCGTCGG  TCAAAGCCAA CCGTTGACTT ATGGGCTAGT AATGGACAGT TATTTAATCA AGCTTTTATT AACTCGATGA TCAAGCTTGG TCGTGTTGGT GTTAAAACCG GTAGTAATGG TAATATCCGT 
CGTGATTGTG GAGCTTTTAA TTAA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TAAAGAGACA TTGAGATTGA GTAAAAATAG TTTTTAAAAA TAGTTATGGT GAACAAAACG AATCTATTAT TGCTTCTTCT CTCTCTCTTT CTCATCCTCA ACCTCTCCTC CGCTCAACTC  CGCCGCAACT TCTACGCCGG AAGTTGTCCT AACGTCGAAC AAATCGTCAG AAACGCCGTT CAGAAAAAAG TCCAACAAAC TTTCACCACC ATTCCCGCCA CTCTCCGCCT CTATTTCCAC  GATTGTTTCG TCAATGGGTG TGATGCATCT GTGATGATAG CGTCGACTGA TAATAATAAG GCGGAGAAGG ATCATGAGGA GAATCTATCG TTGGCCGGAG ATGGATTCGA CACCGTCACT  AAAGCTAAAG AAGCTCTCGA CGCCGTCCCA AATTGTCGTA ACAAAGTTTC TTGCGCTGAT ATTCTCACTA TGGCCACTCG TGACGTCGTT AATCTTGCGG GTGGACCAAA ATACGACGTG  GAATTGGGAA GGCTGGATGG ATTATCGTCA ACGGCGGCTA GCGTCGGAGG GAAGTTGCCT CATCCGACCG ACGATGTCAA TAAACTCACT TCACTTTTCG CGAAAAACGG CCTTAGCCTT  AACGACATGA TCGCTCTCTC CGGGGCACAC ACATTAGGAT TCGCGCATTG CACAAAAGTG TTCAATCGGA TATACACTTT CAACAAGACA ACTAAAGTGG ATCCCACGGT TAACAAAGAT  TACGTGACAG AGCTAAAAGC GTCGTGTCCT CAAAACATAG ATCCAAGAGT GGCTATAAAC ATGGACCCAA CAACACCAAG ACAATTCGAC AACGTTTACT ACAAAAACTT GCAACAGGGC  AAAGGATTGT TCACGTCTGA TCAAGTCTTA TTCGAGGATC GTCGGTCAAA GCCAACCGTT GACTTATGGG CTAGTAATGG ACAGTTATTT AATCAAGCTT TTATTAACTC GATGATCAAG  CTTGGTCGTG TTGGTGTTAA AACCGGTAGT AATGGTAATA TCCGTCGTGA TTGTGGAGCT TTTAATTAAT TTAAATATAT CTGGTTTAGA TTTTGTTTAT CTTCATTCAG TTGTATTTGG 
GGATTGGATG GGTCTCATGA AGCTTTCAGA TATAATTGTA ATAAATTTCA GTTTTGGGTT TCAGTTTGCT ATATCGCAAA ACCTAAATTG TAACATAGAG 

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