Entry information : AhalPrx35 (Araha.12227s0003)
Entry ID 14816
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-01-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AhalPrx35 (Araha.12227s0003)
Name (synonym) AhalPrx35 (Araha.12227s0003)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx020]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx35
start..stop
S start..stop
AtPrx16 519 0 1..274 1..323
AlyPrx16 513 0 1..274 1..323
CagraPrx13 485 2e-175 1..274 1..323
CrubPrx115 481 1e-173 1..274 1..323
Literature and cross-references AhalPrx35 (Araha.12227s0003)
Protein sequence: AhalPrx35 (Araha.12227s0003)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   274 (251)
PWM (Da):   %s   30649.88 (27983.4) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   10.99 (10.84) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-274
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKNQRSFSIV ALLLILFSSS VFAQLQTNFY RKSCPNVETI VRNAVRQKFQ QTFAKQAVDR DPNCRNKVSC ADILALATRD VVVLTGGPNY SVELGRRDGR LSTVASVQHS LPQPSFKLDQ  LNTMFARHGL SQTNMIALSG AHTIGFAHCG KFSKRIYNFS PKRPIDPTLN IRYALQLRQM CPIRVDPRIA INMDPTSPNT FDNAYFKNLQ KGMGLFTSDH VLFSDQRSRS TVNLFASNEA 
TFRQAFISAI TKLGRVGVKT GNAGEIRRDC SRVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Fragment (end exon 1 and start exon 2) is missing due to N in the sequence.
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAACATTAA CTTTCAGAGC CATGAAGAAC CAACGCAGCT TCTCCATTGT TGCTCTTCTT CTCATTCTCT TTTCTTCATC TGTATTTGCT CAGCTACAGA CAAATTTTTA CCGGAAGTCA  TGTCCTAACG TCGAAACTAT TGTCCGCAAC GCCGTCCGCC AAAAGTTCCA ACAGACTTTT GTTACGGCTC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnGGGTT TGATACGGTG GCAAAGGCAA AGCAGGCCGT TGATAGGGAT CCCAACTGCC GTAACAAAGT  CTCATGCGCT GACATTTTGG CTCTCGCCAC TCGTGACGTC GTCGTTTTGG TACATTTCAA CTCTTATATT GATCTTTTTC TAATTTCCTT GACACCTTTT ATTCATCTAT TCAAAATTCT  ATTATTAATG TAGGCTAAAA TAAAATGTGA AAAAAAAATT AAAATTTTTT TATTAAAAAA TGTCAAAATG GAAAAATCTA GGCTTAAAGG AAAAACAATT TGTGTATTCC TTCTTTTGTG  AAACTAAGTA ACTTGAATAC ATTACTGTTT CGTATATTAT GAAGAAACAA AATCTTGAAT GCGCGAGTAC GAAGACGTAA GTATTCATCA AACCGTGAAA AAATGTTAAT TACCTAATTA  AGTGAAAATA ATAGGATTAT TTAGCTAATT TATCCTTAAA AAACACAAAC GATTTGGTTA TTATTCTCTT TGAGTGATTA TATTTTTTCA TTTTGTGTCA TTGTTACTAA AATATGGTGA  AATTAAAGAT AATAATATAT TGTAGACTGG AGGACCGAAC TATTCGGTAG AGTTAGGGAG GAGAGATGGT AGACTATCCA CAGTGGCTAG CGTTCAACAC AGTCTACCCC AGCCTAGTTT  CAAATTGGAC CAACTTAATA CTATGTTCGC TCGTCACGGT CTATCCCAAA CTAATATGAT CGCACTCTCA GGTATTTTAA ACTGAAGCAA ACCGGATTAG ACAGCTTTCT ATTTCATAAA  TTAGAACCAA GTCTAAAAGT TAAATTTTAT GATATTTAGG AGCACATACT ATCGGATTCG CACATTGTGG AAAGTTTTCG AAAAGAATTT ACAACTTTAG TCCTAAACGC CCGATTGATC  CGACTTTAAA TATTCGATAT GCGTTACAAT TGAGGCAAAT GTGCCCCATC CGGGTCGACC CGAGGATCGC GATTAACATG GATCCTACTT CTCCAAATAC CTTTGACAAT GCTTATTTCA  AAAACCTCCA AAAAGGGATG GGTTTGTTCA CGTCAGATCA TGTTTTGTTC TCTGATCAAC GGTCTAGATC AACTGTCAAT TTATTTGCTT CTAATGAAGC AACTTTTAGA CAAGCTTTTA 
TTTCGGCTAT AACGAAGTTG GGTCGGGTTG GAGTCAAAAC CGGTAACGCC GGTGAGATAA GACGGGATTG TTCACGTGTT AATTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGAACC AACGCAGCTT CTCCATTGTT GCTCTTCTTC TCATTCTCTT TTCTTCATCT GTATTTGCTC AGCTACAGAC AAATTTTTAC CGGAAGTCAT GTCCTAACGT CGAAACTATT  GTCCGCAACG CCGTCCGCCA AAAGTTCCAA CAGACTTTTG CAAAGCAGGC CGTTGATAGG GATCCCAACT GCCGTAACAA AGTCTCATGC GCTGACATTT TGGCTCTCGC CACTCGTGAC  GTCGTCGTTT TGACTGGAGG ACCGAACTAT TCGGTAGAGT TAGGGAGGAG AGATGGTAGA CTATCCACAG TGGCTAGCGT TCAACACAGT CTACCCCAGC CTAGTTTCAA ATTGGACCAA  CTTAATACTA TGTTCGCTCG TCACGGTCTA TCCCAAACTA ATATGATCGC ACTCTCAGGA GCACATACTA TCGGATTCGC ACATTGTGGA AAGTTTTCGA AAAGAATTTA CAACTTTAGT  CCTAAACGCC CGATTGATCC GACTTTAAAT ATTCGATATG CGTTACAATT GAGGCAAATG TGCCCCATCC GGGTCGACCC GAGGATCGCG ATTAACATGG ATCCTACTTC TCCAAATACC  TTTGACAATG CTTATTTCAA AAACCTCCAA AAAGGGATGG GTTTGTTCAC GTCAGATCAT GTTTTGTTCT CTGATCAACG GTCTAGATCA ACTGTCAATT TATTTGCTTC TAATGAAGCA 
ACTTTTAGAC AAGCTTTTAT TTCGGCTATA ACGAAGTTGG GTCGGGTTGG AGTCAAAACC GGTAACGCCG GTGAGATAAG ACGGGATTGT TCACGTGTTA ATTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAACATTAA CTTTCAGAGC CATGAAGAAC CAACGCAGCT TCTCCATTGT TGCTCTTCTT CTCATTCTCT TTTCTTCATC TGTATTTGCT CAGCTACAGA CAAATTTTTA CCGGAAGTCA  TGTCCTAACG TCGAAACTAT TGTCCGCAAC GCCGTCCGCC AAAAGTTCCA ACAGACTTTT GCAAAGCAGG CCGTTGATAG GGATCCCAAC TGCCGTAACA AAGTCTCATG CGCTGACATT  TTGGCTCTCG CCACTCGTGA CGTCGTCGTT TTGACTGGAG GACCGAACTA TTCGGTAGAG TTAGGGAGGA GAGATGGTAG ACTATCCACA GTGGCTAGCG TTCAACACAG TCTACCCCAG  CCTAGTTTCA AATTGGACCA ACTTAATACT ATGTTCGCTC GTCACGGTCT ATCCCAAACT AATATGATCG CACTCTCAGG AGCACATACT ATCGGATTCG CACATTGTGG AAAGTTTTCG  AAAAGAATTT ACAACTTTAG TCCTAAACGC CCGATTGATC CGACTTTAAA TATTCGATAT GCGTTACAAT TGAGGCAAAT GTGCCCCATC CGGGTCGACC CGAGGATCGC GATTAACATG  GATCCTACTT CTCCAAATAC CTTTGACAAT GCTTATTTCA AAAACCTCCA AAAAGGGATG GGTTTGTTCA CGTCAGATCA TGTTTTGTTC TCTGATCAAC GGTCTAGATC AACTGTCAAT  TTATTTGCTT CTAATGAAGC AACTTTTAGA CAAGCTTTTA TTTCGGCTAT AACGAAGTTG GGTCGGGTTG GAGTCAAAAC CGGTAACGCC GGTGAGATAA GACGGGATTG TTCACGTGTT 
AATTAG 

Retrieve as FASTA