Entry information : AhalPrx36Araha.1420s0012
Entry ID 14817
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx36Araha.1420s0012
Name AhalPrx36Araha.1420s0012
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx022]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx36
start..stop
S start..stop
AlyPrx48 780 0 1..405 1..405
AtPrx48 758 0 1..405 1..404
CrubPrx86 649 0 1..405 1..414
BstrPrx32 633 0 1..393 3..390
Literature and cross-references AhalPrx36Araha.1420s0012
Protein sequence: AhalPrx36Araha.1420s0012
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   405
PWM (Da):   %s   44474.93 Transmb domain:   %s   i9-28o
PI (pH):   %s   4.96
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MRFLGDYKIA LLTCSVIALS IYFAINGVEF RFANDSPGNR TGGKVSEKSP FEDEFMYMSI AEDIDRSHLH YDYYRESCPT AEKIIAKAIR DIYNVTPSVA PSLIRLLFHD CFIEGCDASV  LLDADEAHTS EKDASPNLSL KGFDVIDAIK SEIENVCPGV VSCADLLVLA AREAVLVAGG PFYPLETGRK DSAAAFRETA EQQLPAPDAT LSDILSSFSY RGFNERETVS LFGAHSIGIT  HCTFFKNRLY NFSATGKPDP ELNPGFLQEL KTKCPFSVSA SSPSASLGTG LQPSLLASDS ENSYGMSSGN RNDEVIDLSY NNEGGDGNFG TRYFRRLMQK KGLLFSDQQL MGSEVTEMWV 
RAYASDPLLF RREFAMSMMK LSSNHVLTGP LGQVRTSCSK ALPRN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGTTTC TCGGAGACTA CAAGATCGCT TTACTTACTT GCTCCGTTAT CGCTCTCAGC ATCTACTTCG CGATTAACGG CGTCGAATTT CGTTTCGCGA ACGATTCACC GGGAAATCGT  ACCGGAGGTA AGGTTTCCGA GAAATCTCCC TTCGAAGACG AATTCATGTA CATGTCAATC GCTGAAGATA TCGATCGATC TCACCTCCAC TACGATTACT ACCGTGAATC TTGCCCTACC  GCCGAGAAAA TCATCGCGAA AGCTATCAGA GATATCTACA ATGTCACACC CAGCGTAGCT CCGTCTCTTA TCCGTCTCCT CTTTCACGAT TGCTTCATCG AGGTCAGATT TTCTGATATC  TGGCTTTCCT TTCTTGTAAT TTTGATTTCG CTAAGCTCGA TCTGTGGAAG ATTGTTTGGG ATCTTGTTTC CGGAATTTTC GATTGTGATG TCTCTGTATC AGATTTGAGT TCATCTCTGT  TAGTGGAATG ATGTTTGGTC AGTAGATTTT TAAGTGTTTA TCTCTCAGTC TTGGCTACGG ATATGCACAA GTTATGTGTT TGATTCTCAG ATTTGATGTT ATTAGCATAC TTTGTGAATC  AAATACGGAT ATGCAGAAGT TATGTGTTTG ATCCTCAGAT TTGCTCATGT TACAGTTTGG ATTTGCTCAC TTTTTTTTAT CAAATTCTGT GTTTTCTTTA GCACTTGTTG TAGTTTGCTC  ATGTTACAAA TTGGTGAATT GTGTTTTTGC TGCAGGGATG TGATGCATCG GTCCTTCTAG ACGCAGATGA AGCACATACT TCTGAGAAAG ATGCATCTCC AAACCTGTCC TTGAAAGGCT  TTGATGTGAT TGACGCCATT AAGTCTGAGA TAGAGAATGT CTGTCCCGGA GTTGTGTCCT GCGCCGACCT TCTTGTATTG GCAGCTAGAG AAGCAGTCCT AGTGGTAAAT TTCCCCTCTC  TCTCTCTCTC TTCTGGTTTG TGCATGTTAA TACTTTTGCA ACGCTTAATC ATGTCTTTGG AACTCTCAGG CTGGTGGTCC ATTTTATCCT CTAGAAACTG GAAGGAAGGA TAGTGCAGCA  GCCTTCAGGG AGACTGCAGA ACAACAGCTT CCTGCACCAG ACGCTACTCT CTCCGATATT CTTTCAAGTT TTTCTTACAG AGGATTCAAC GAGAGAGAAA CCGTCAGCTT ATTCGGTACT  CTCTTACTAT TAGATGTCAA CATATCTCTT TGCTTAGCTA AATCTTGCCG TATTGGGGAA TTCCTCGCTT CTTGGAAATG GCTCTCTTTG TGACATGATT CTTTTCTTCT GAATGATCTT  AATGCAGGAG CACACAGCAT AGGCATCACG CATTGCACAT TTTTTAAGAA TCGCCTCTAC AACTTCTCAG CAACCGGGAA GCCTGACCCT GAACTCAATC CAGGGTTCCT CCAAGAACTG  AAAACCAAAT GCCCCTTCTC TGTCTCGGCT TCATCTCCAT CTGCTTCCCT TGGCACTGGT TTACAACCGT CCTTACTTGC ATCAGATTCT GAAAACAGCT ACGGTATGAG CTCAGGAAAC  AGGAACGATG AAGTGATTGA CTTGAGCTAC AACAATGAAG GAGGTGATGG AAATTTTGGA ACACGCTACT TCAGAAGACT GATGCAGAAG AAAGGGTTGC TGTTTTCTGA CCAGCAACTA  ATGGGTAGTG AAGTGACTGA GATGTGGGTG AGGGCATATG CTTCTGATCC TCTGTTGTTC CGCAGAGAAT TTGCTATGTC TATGATGAAA CTGTCAAGCA ATCATGTCTT GACTGGTCCA 
CTAGGACAAG TGAGAACAAG CTGCTCAAAG GCCCTCCCCA GGAACTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGTTTC TCGGAGACTA CAAGATCGCT TTACTTACTT GCTCCGTTAT CGCTCTCAGC ATCTACTTCG CGATTAACGG CGTCGAATTT CGTTTCGCGA ACGATTCACC GGGAAATCGT  ACCGGAGGTA AGGTTTCCGA GAAATCTCCC TTCGAAGACG AATTCATGTA CATGTCAATC GCTGAAGATA TCGATCGATC TCACCTCCAC TACGATTACT ACCGTGAATC TTGCCCTACC  GCCGAGAAAA TCATCGCGAA AGCTATCAGA GATATCTACA ATGTCACACC CAGCGTAGCT CCGTCTCTTA TCCGTCTCCT CTTTCACGAT TGCTTCATCG AGGGATGTGA TGCATCGGTC  CTTCTAGACG CAGATGAAGC ACATACTTCT GAGAAAGATG CATCTCCAAA CCTGTCCTTG AAAGGCTTTG ATGTGATTGA CGCCATTAAG TCTGAGATAG AGAATGTCTG TCCCGGAGTT  GTGTCCTGCG CCGACCTTCT TGTATTGGCA GCTAGAGAAG CAGTCCTAGT GGCTGGTGGT CCATTTTATC CTCTAGAAAC TGGAAGGAAG GATAGTGCAG CAGCCTTCAG GGAGACTGCA  GAACAACAGC TTCCTGCACC AGACGCTACT CTCTCCGATA TTCTTTCAAG TTTTTCTTAC AGAGGATTCA ACGAGAGAGA AACCGTCAGC TTATTCGGAG CACACAGCAT AGGCATCACG  CATTGCACAT TTTTTAAGAA TCGCCTCTAC AACTTCTCAG CAACCGGGAA GCCTGACCCT GAACTCAATC CAGGGTTCCT CCAAGAACTG AAAACCAAAT GCCCCTTCTC TGTCTCGGCT  TCATCTCCAT CTGCTTCCCT TGGCACTGGT TTACAACCGT CCTTACTTGC ATCAGATTCT GAAAACAGCT ACGGTATGAG CTCAGGAAAC AGGAACGATG AAGTGATTGA CTTGAGCTAC  AACAATGAAG GAGGTGATGG AAATTTTGGA ACACGCTACT TCAGAAGACT GATGCAGAAG AAAGGGTTGC TGTTTTCTGA CCAGCAACTA ATGGGTAGTG AAGTGACTGA GATGTGGGTG  AGGGCATATG CTTCTGATCC TCTGTTGTTC CGCAGAGAAT TTGCTATGTC TATGATGAAA CTGTCAAGCA ATCATGTCTT GACTGGTCCA CTAGGACAAG TGAGAACAAG CTGCTCAAAG 
GCCCTCCCCA GGAACTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGGTTTC TCGGAGACTA CAAGATCGCT TTACTTACTT GCTCCGTTAT CGCTCTCAGC ATCTACTTCG CGATTAACGG CGTCGAATTT CGTTTCGCGA ACGATTCACC GGGAAATCGT  ACCGGAGGTA AGGTTTCCGA GAAATCTCCC TTCGAAGACG AATTCATGTA CATGTCAATC GCTGAAGATA TCGATCGATC TCACCTCCAC TACGATTACT ACCGTGAATC TTGCCCTACC  GCCGAGAAAA TCATCGCGAA AGCTATCAGA GATATCTACA ATGTCACACC CAGCGTAGCT CCGTCTCTTA TCCGTCTCCT CTTTCACGAT TGCTTCATCG AGGGATGTGA TGCATCGGTC  CTTCTAGACG CAGATGAAGC ACATACTTCT GAGAAAGATG CATCTCCAAA CCTGTCCTTG AAAGGCTTTG ATGTGATTGA CGCCATTAAG TCTGAGATAG AGAATGTCTG TCCCGGAGTT  GTGTCCTGCG CCGACCTTCT TGTATTGGCA GCTAGAGAAG CAGTCCTAGT GGCTGGTGGT CCATTTTATC CTCTAGAAAC TGGAAGGAAG GATAGTGCAG CAGCCTTCAG GGAGACTGCA  GAACAACAGC TTCCTGCACC AGACGCTACT CTCTCCGATA TTCTTTCAAG TTTTTCTTAC AGAGGATTCA ACGAGAGAGA AACCGTCAGC TTATTCGGAG CACACAGCAT AGGCATCACG  CATTGCACAT TTTTTAAGAA TCGCCTCTAC AACTTCTCAG CAACCGGGAA GCCTGACCCT GAACTCAATC CAGGGTTCCT CCAAGAACTG AAAACCAAAT GCCCCTTCTC TGTCTCGGCT  TCATCTCCAT CTGCTTCCCT TGGCACTGGT TTACAACCGT CCTTACTTGC ATCAGATTCT GAAAACAGCT ACGGTATGAG CTCAGGAAAC AGGAACGATG AAGTGATTGA CTTGAGCTAC  AACAATGAAG GAGGTGATGG AAATTTTGGA ACACGCTACT TCAGAAGACT GATGCAGAAG AAAGGGTTGC TGTTTTCTGA CCAGCAACTA ATGGGTAGTG AAGTGACTGA GATGTGGGTG  AGGGCATATG CTTCTGATCC TCTGTTGTTC CGCAGAGAAT TTGCTATGTC TATGATGAAA CTGTCAAGCA ATCATGTCTT GACTGGTCCA CTAGGACAAG TGAGAACAAG CTGCTCAAAG 
GCCCTCCCCA GGAACTGA 

Retrieve as FASTA