Entry information : AhalPrx37Araha.14055s0006
Entry ID 14818
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx37Araha.14055s0006
Name AhalPrx37Araha.14055s0006
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx37
start..stop
S start..stop
AlyPrx38-1 692 0 1..346 1..346
AhalPrx27 654 0 1..346 1..346
AtPrx38 641 0 1..346 1..346
AlyPrx38-2 640 0 1..346 1..346
Literature and cross-references AhalPrx37Araha.14055s0006
Protein sequence: AhalPrx37Araha.14055s0006
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   346 (324)
PWM (Da):   %s   38025.33 (35458.9)  
PI (pH):   %s   8.39 (8.20) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-346
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MHSSLIKLGF LFLLLQVSLS HAQLSPSFYD KTCPQVFDIA TNTIVNALRS DPRIAASILR LHFHDCFVNG CDASILLDNT TSFRTEKDAF GNANSARGFD VIDKMKAAVE KACPRTVSCA  DLLAIAAQKS VVLAGGPSWM VPNGRRDSLR GFMDLANANL PGPSSTLKVL KDRFKNVGLD RPSDLVALSG GHTFGKNQCQ FIIDRLYNFG ETGLPDPTLD KSYLATLRKQ CPRNGNMSVL 
VDFDLRTPTV FDNKYYVNLK ENKGLIQSDQ ELFSSPDAAD TIPLVREYAN GQGKFFDAFV NAMIRMGSLS PITKKQGEIR LNCRVVNSKS KIMDVVDDAN EFASSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTTTCTTAG AGAGCAAAGA AAATGCATTC CTCTTTGATA AAATTGGGAT TTCTTTTTCT TCTTCTTCAG GTCTCATTGT CTCATGCTCA ACTAAGCCCT TCCTTTTATG ATAAAACATG  TCCGCAAGTC TTTGACATTG CAACCAATAC CATTGTCAAT GCACTGAGAT CAGACCCTCG CATCGCTGCA AGCATCCTTC GTCTTCATTT CCACGACTGC TTTGTTAATG TAAGATACCA  TTAGATTCAA AATATTCATG TATATTTTGG TTCCCTATAG TTTATCCTAA TGAGCGGGAA TGCTTTAGGA ATATTATAAA CTTGAAATTA GGATATGAAA ATTTGATAGA CATTTCAGTT  TGTAATTCAA CTCATATAGT TTCTTTCACG ATTTATTCAT TTCAAATATA AGATACTAGA TTTACTATGT TTCTTGCAGT AAAAGGAGTA AAAATGCAGT AATATAACTT GTTTATATAT  AATTAACTGT TTACGGATGT TAAGATGTGC TTTAACAATG TGTTTATCTG GACTAAATGT GAAGAGAATT ATTTTATTTT GAAAAAGGGA TGTGATGCAT CGATATTGTT AGACAACACA  ACATCGTTTA GGACGGAAAA AGATGCGTTT GGGAACGCTA ATTCCGCTCG AGGTTTCGAT GTGATCGACA AAATGAAGGC TGCGGTAGAG AAAGCATGTC CTAGAACTGT TTCATGTGCT  GATTTGCTCG CCATTGCAGC TCAAAAATCT GTCGTTTTGG TAAGAATCTT CTACTATGCT ATCCAAATGG TTTTTTAGAC CATTTTGTTA ATGTATATAT ACCGAGGATA AAATATTTAG  ACCAAATATA ATTGTTTACT TTAGGCGGGA GGTCCTTCAT GGATGGTTCC AAATGGAAGA AGAGACAGCT TAAGAGGGTT TATGGATCTT GCTAATGCGA ATCTTCCAGG TCCATCATCT  ACCCTTAAAG TACTTAAGGA TAGATTCAAA AATGTCGGAC TAGACCGTCC TTCTGATCTC GTTGCTCTTT CCGGTATGTT ATCTCATTTG AAGCATTTTC ATCTATAGTT GTAATCACTA  ATAACTCTAC ATGACTTTTG GTTTAGTTTA TTTATACTTT TGATATTTTT TCTTTCGTTA GGTGGTCACA CCTTTGGCAA AAACCAATGT CAGTTCATAA TAGATCGCCT TTACAACTTC  GGTGAAACCG GTTTACCCGA CCCAACCCTT GATAAATCTT ACCTTGCCAC GCTAAGAAAA CAATGTCCGC GTAACGGAAA CATGAGTGTC TTGGTAGATT TTGATTTACG TACGCCAACA  GTCTTTGACA ACAAATACTA TGTGAATCTC AAGGAGAACA AAGGACTTAT CCAGAGCGAC CAAGAGTTAT TCTCTAGCCC GGATGCTGCA GATACTATCC CTTTAGTCCG AGAGTACGCT  AATGGTCAAG GGAAATTTTT CGATGCGTTC GTGAATGCAA TGATAAGGAT GGGAAGCCTT TCACCTATAA CGAAGAAACA AGGAGAAATT AGATTGAATT GTAGAGTGGT GAATTCAAAA  TCGAAAATCA TGGATGTGGT GGATGATGCT AATGAATTTG CCAGTTCAAT GTGAGGAAAT GGCTTTCATT AATAATAGAT AAATTATCAA TGTTGTCACG ATGTTATATT TTTCCGTACT 
TTCTTGTTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCATTCCT CTTTGATAAA ATTGGGATTT CTTTTTCTTC TTCTTCAGGT CTCATTGTCT CATGCTCAAC TAAGCCCTTC CTTTTATGAT AAAACATGTC CGCAAGTCTT TGACATTGCA  ACCAATACCA TTGTCAATGC ACTGAGATCA GACCCTCGCA TCGCTGCAAG CATCCTTCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGGA TGTGATGCAT CGATATTGTT AGACAACACA  ACATCGTTTA GGACGGAAAA AGATGCGTTT GGGAACGCTA ATTCCGCTCG AGGTTTCGAT GTGATCGACA AAATGAAGGC TGCGGTAGAG AAAGCATGTC CTAGAACTGT TTCATGTGCT  GATTTGCTCG CCATTGCAGC TCAAAAATCT GTCGTTTTGG CGGGAGGTCC TTCATGGATG GTTCCAAATG GAAGAAGAGA CAGCTTAAGA GGGTTTATGG ATCTTGCTAA TGCGAATCTT  CCAGGTCCAT CATCTACCCT TAAAGTACTT AAGGATAGAT TCAAAAATGT CGGACTAGAC CGTCCTTCTG ATCTCGTTGC TCTTTCCGGT GGTCACACCT TTGGCAAAAA CCAATGTCAG  TTCATAATAG ATCGCCTTTA CAACTTCGGT GAAACCGGTT TACCCGACCC AACCCTTGAT AAATCTTACC TTGCCACGCT AAGAAAACAA TGTCCGCGTA ACGGAAACAT GAGTGTCTTG  GTAGATTTTG ATTTACGTAC GCCAACAGTC TTTGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAG GAGAACAAAG GACTTATCCA GAGCGACCAA GAGTTATTCT CTAGCCCGGA TGCTGCAGAT  ACTATCCCTT TAGTCCGAGA GTACGCTAAT GGTCAAGGGA AATTTTTCGA TGCGTTCGTG AATGCAATGA TAAGGATGGG AAGCCTTTCA CCTATAACGA AGAAACAAGG AGAAATTAGA 
TTGAATTGTA GAGTGGTGAA TTCAAAATCG AAAATCATGG ATGTGGTGGA TGATGCTAAT GAATTTGCCA GTTCAATGTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATTTTCTTAG AGAGCAAAGA AAATGCATTC CTCTTTGATA AAATTGGGAT TTCTTTTTCT TCTTCTTCAG GTCTCATTGT CTCATGCTCA ACTAAGCCCT TCCTTTTATG ATAAAACATG  TCCGCAAGTC TTTGACATTG CAACCAATAC CATTGTCAAT GCACTGAGAT CAGACCCTCG CATCGCTGCA AGCATCCTTC GTCTTCATTT CCACGACTGC TTTGTTAATG GATGTGATGC  ATCGATATTG TTAGACAACA CAACATCGTT TAGGACGGAA AAAGATGCGT TTGGGAACGC TAATTCCGCT CGAGGTTTCG ATGTGATCGA CAAAATGAAG GCTGCGGTAG AGAAAGCATG  TCCTAGAACT GTTTCATGTG CTGATTTGCT CGCCATTGCA GCTCAAAAAT CTGTCGTTTT GGCGGGAGGT CCTTCATGGA TGGTTCCAAA TGGAAGAAGA GACAGCTTAA GAGGGTTTAT  GGATCTTGCT AATGCGAATC TTCCAGGTCC ATCATCTACC CTTAAAGTAC TTAAGGATAG ATTCAAAAAT GTCGGACTAG ACCGTCCTTC TGATCTCGTT GCTCTTTCCG GTGGTCACAC  CTTTGGCAAA AACCAATGTC AGTTCATAAT AGATCGCCTT TACAACTTCG GTGAAACCGG TTTACCCGAC CCAACCCTTG ATAAATCTTA CCTTGCCACG CTAAGAAAAC AATGTCCGCG  TAACGGAAAC ATGAGTGTCT TGGTAGATTT TGATTTACGT ACGCCAACAG TCTTTGACAA CAAATACTAT GTGAATCTCA AGGAGAACAA AGGACTTATC CAGAGCGACC AAGAGTTATT  CTCTAGCCCG GATGCTGCAG ATACTATCCC TTTAGTCCGA GAGTACGCTA ATGGTCAAGG GAAATTTTTC GATGCGTTCG TGAATGCAAT GATAAGGATG GGAAGCCTTT CACCTATAAC  GAAGAAACAA GGAGAAATTA GATTGAATTG TAGAGTGGTG AATTCAAAAT CGAAAATCAT GGATGTGGTG GATGATGCTA ATGAATTTGC CAGTTCAATG TGAGGAAATG GCTTTCATTA 
ATAATAGATA AATTATCAAT GTTGTCACGA TGTTATATTT TTCCGTACTT TCTTGTTT 

Retrieve as FASTA