Entry information : AhalPrx39Araha.14772s0001
Entry ID 14820
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx39Araha.14772s0001
Name AhalPrx39Araha.14772s0001
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx39
start..stop
S start..stop
AlyPrx33 697 0 1..355 1..349
CrubPrx107 676 0 14..355 12..353
AtPrx33 674 0 14..355 13..354
BrPrx34-1Ab_other 653 0 13..355 7..349
Literature and cross-references AhalPrx39Araha.14772s0001
Protein sequence: AhalPrx39Araha.14772s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   355 (323)
PWM (Da):   %s   38990.63 (35416.8) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   6.13 (6.12) Peptide Signal:   %s   cut: 33 range:33-355
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MQFSSSSSIT SFTWIILITL GCLLLRASLS DAQLTPTFYD TSCPNVTNIV RDTIVNELRS DPRIAASILR LHFHDCFVNG CDASILLDNT TSFQTEKDAL GNANSARGFP VIDRMKAAVE  RACPRTVSCA DMLTIAAQQS VTLAGGPSWK VPLGRRDSLQ AFLSLANANL PAPFFTLPEL KANFKNVGLD RPSDLVALSG AHTFGKNQCR FIMDRLYNFS NTGLPDPTLN TTYLQTLSGQ 
CPRNGNQSVL VDFDLRTPLV FDNKYYVNLK EQKGLIQSDQ ELFSSPNATD TIPLVRSFAD GTEKFFDAFV EAMNRMGNIT PTTGTQGQIR LNCRVVNSNS LLHDVVEIVD FVSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAATTAAATA GTTTTCATTT TCCTTGTGAA AAATGCAGTT CTCTTCATCA TCTTCTATTA CTTCTTTCAC TTGGATAATC TTAATAACAT TGGGATGTCT TCTGCTTCGT GCGTCTCTGT  CCGATGCTCA ACTTACCCCT ACCTTCTACG ACACTTCATG TCCTAACGTC ACCAACATTG TAAGAGATAC CATTGTCAAC GAACTAAGAT CGGACCCTCG TATCGCTGCG AGCATCCTTC  GTCTTCACTT CCACGACTGC TTTGTTAATG TAAGATATCA CTTTTCATAT ATGAGACACA ATGCAGTTAG TATAAGATTT TCTTAATAGT CTATTGAAAT TTTACAAGAT CATAAATACC  AAAGTGAGAT CTTATACAGA TTTTTAAAAA GATTGCCTCA GTTGTTCAAC CAATGTGCTA CTATTTTTTC AAGAATATTT ATTTCTATTA TTTTATTAAA TTTATTATTT ACTTTTAATA  TTTTAGAGTG ATTATGTATA CATATTTTGA TAATATAAAA ATATTTTTAT TGAATTTTTA TTTTAGTGAG TTAAAATGGG TAAAGAGGAG TTAATCTCTC CTCATATTGT TTTCATTAAT  TATATCTTAT ATAATATGAG AAGTTTTTTT CTAACTTTTC CTAACATTGC GACATTTGGC ATTTTCTTTT GATGACACTT GTCCTCTTTC ATTTTAACTT TGTCTCTTTT AATTTATTTC  TAAAAAGAGA TATTTCTCTT ATCCTATTGG TACATTCGAC ATATATTTTT AAAATTATTA GGTTTTCAAA ATCACGTAAC GTTATTGTTA AACTATTTTA TAATGTCTTC TTAATAGTTG  AATATTTTTA TCCTAATGAT TCCGTAAAGA ATCTTATATA TATAAAAATA GTTTCATTCG CAATCTATTA GGCCACTTAA TTGACATCAT TTTTTTAATT CTAATTTTTT TTTTAATCCA  TCACTAAAAA AAAAAAAAGT CAGGTCAGTA GATATAAAAT TGAATGAAAA AAAGTGCAAA GAAAAGAATA TTGTAAACGT ATGATAGTCA TGAGAAAAAA AAATGGGACT AAACATTATG  TAATTAAATC TCATTATGAT CTCAATAATA ATTnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnGTCC ACGGGCCGAG AGAAGATGTC  GGACCTATTA AGAGAGATGA CGGTCGAGGC GTTACAAATA TTTTGCTACA AATGAAAAGC CTTGAAAGAC ATATACAAGG TTTGAGACTC nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnATAA GGCAATTAAA ATATTGCTTA TTTTTCAATG ATTAGCAATA TTTTAAATTT TTTTTAATAA  AATCATGTCT TCTAAATCTT AAAATAACAT ATTTACTACA TCTTTAGTTT TTAAATAATA GTTTCCAAGA TTTTAATATA AACTTATGCA TGTATTTAAA TTATATCCAC AACACATACA  CCAAACAAAC TGAATTGTAG AGGTTAATCT ATTGTTTCTA GACAATTGTT AATATATTAC ACATTTAGCA TCTATATAGA TGCATTTGCA CCATAAAATG TTGTGTGCAA ATTACGAAAA  AGCGGTGATC TATATATAAT TTAGTAATCA AACCCCTCAA CTAAAGATAA ATCGTAAGAA AACCCCTCAA TTATATATTT AGAGAAAAAA ACTCCTCAAC TTGAAATCTT TTAATGCAAA  TTCTCCTCTG TCTACAATAT CGTAAAAATT GGACGGACTA CAATTCAATT TAAAACGTAA CCTTTCTTAG TATCTATCCT AATCGATTTC GACACCACGC AAACTTCAGA GAATCTCACT  ATGATAAATT AGGGTTCATC CATTTAGAGT TTTCACTTTG AGAAATTTAG AGCTAAGGTT TGGGGATTTA TAATCGGATT GAATGACGTT TTGTTGTTTT TGTTTATAAT TCATGTTGTT  TAAGTGTATA TATGTCATTT TCAATTTCAA TTTAATTGTA GTCCATGCAC TTTTCACAAA AATATAGACG GAGAAGGATT TGTAATAATA GATTTTAAGT TGAGGGGTTT TCTCATTAAA  TATATAGTTG ATAGAGTTTT TTACGATCCA TCTTTAGTTG AGGGGTTTTA TTACTAAAAA TCTTAAAAAG ACATAGTATT TAGTGTCTAT ATATATACTA TTTTCAAGAA AAGATTATGA  AGTTTATCCT TATAATTCAC AAAAGTACTT CTAAATTTTT TAACTGCATT GAAATGAATA TCTTCAAAAA CTGTATTAAA GTAATGTGTT TTTTTAATAC TCCATAATTA AAAAACATAT  AAATGAATAT CTTTTAAAAT TTTCTCATAA CATATGTTAA CAACTACATG TGCACTTCAT ATATAATTTA ATGTAAATTT TATTCTATAT AAAGAACAAT TGAATGCGTA ACCCACGCAT  CGCGTGGGAC ATTCTCTAGT AGATATATAA CCTTTACTCA TTACTTGCCT CAGAGGAACA AATGGTTTTA ATGGATGAAA AAAGTTCAAC GTTAAATTTT TACCTTTGGT AAGATTTAGC  TATGGGTGGT AGTACATTGA CTAATAATTT CTTAAATATA TTTTGGTCTT TTGAAAGGGT TGTGATGCGT CAATCTTGTT AGACAACACG ACATCATTTC AGACAGAGAA AGATGCGCTT  GGAAATGCAA ATTCAGCTCG GGGATTTCCC GTGATTGACA GAATGAAAGC CGCCGTAGAG AGGGCATGCC CAAGAACCGT TTCATGTGCA GATATGCTCA CCATTGCAGC TCAACAATCT  GTCACTTTGG TATGCTCCAT TGTCCCATCT TCTTTATTCA TTACAAACAT TTTTTTCGAT AGTAATATGT CAAGTAGTCA CTTTACATCA AACACGACAG TCTAAGTTTG AAAGGAAAAG  TTGGTATTTT TTTTAGGTCT TATAGAATGT CACAATACAT ATTTAGTATC AACTTTTAAA CTATATGACA AATATTCAAA ACTAATCGAG ATTTATTTAA AACGCATGGC CCCGTTAAGA  AAATTTGATA AGTTGAATAT CACTGAAATA ATTAGGTCTT ATCACTAGGA TTTATTTATT TAGTTAAAAA AAAATAGAAA AAAAAATATT TTCTTCCAAG AAACAGTGGA GACTAAAAAA  CTTCCCTTCT GAGTTTTGAG TATATAATCA ATGAACTTAT AATACATGTT TCCGTGTGAT ATATTTTTTT TCTACAAAAG TAAATATTAT TTTGAATATA ATGGTGTTAT TATACTATAG  GCAGGAGGTC CTTCTTGGAA GGTTCCTTTG GGGAGAAGAG ACAGCTTACA AGCATTTCTA AGTCTCGCTA ATGCAAATCT CCCAGCTCCA TTCTTCACAC TTCCAGAGCT TAAAGCCAAC  TTCAAAAATG TTGGCCTCGA TCGTCCTTCT GATCTTGTTG CTCTCTCCGG TAATTAACAA AAGGAAAATA AACCCCATTT GATATATTAT TTGTAATTAG CGAGTTAATT GTTGATCTAA  TTATATATGG TCTTTCTTTT GTTAGGGGCT CACACATTTG GTAAAAATCA ATGTCGATTT ATTATGGACC GATTATACAA CTTTAGCAAC ACCGGATTAC CTGACCCTAC ACTCAACACG  ACTTACCTAC AAACTCTTAG TGGACAGTGT CCTCGCAATG GTAATCAAAG TGTTTTAGTG GATTTCGATC TGCGTACGCC TTTAGTTTTC GACAACAAAT ACTATGTGAA TCTCAAAGAG  CAAAAAGGTC TTATCCAAAG CGATCAAGAG TTGTTCTCTA GCCCCAATGC CACAGACACA ATCCCCTTGG TGAGATCATT TGCTGATGGC ACAGAAAAAT TCTTTGATGC GTTTGTGGAG  GCAATGAATA GGATGGGAAA CATTACACCT ACTACAGGAA CTCAAGGACA AATCAGGTTG AATTGTAGAG TGGTGAACTC CAACTCTCTA CTCCATGATG TGGTGGAGAT AGTTGACTTT 
GTAAGCTCTA TGTGAGAATA GTTGACTAAA TATCTGGCAA CCAGACTATA TATGTTAAGA TGAATAAGCG GCTCTCAAGT TGTTACTTGA GCAGGAGCAG ATTGGTGTGT ATAGT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGCAGTTCT CTTCATCATC TTCTATTACT TCTTTCACTT GGATAATCTT AATAACATTG GGATGTCTTC TGCTTCGTGC GTCTCTGTCC GATGCTCAAC TTACCCCTAC CTTCTACGAC  ACTTCATGTC CTAACGTCAC CAACATTGTA AGAGATACCA TTGTCAACGA ACTAAGATCG GACCCTCGTA TCGCTGCGAG CATCCTTCGT CTTCACTTCC ACGACTGCTT TGTTAATGGT  TGTGATGCGT CAATCTTGTT AGACAACACG ACATCATTTC AGACAGAGAA AGATGCGCTT GGAAATGCAA ATTCAGCTCG GGGATTTCCC GTGATTGACA GAATGAAAGC CGCCGTAGAG  AGGGCATGCC CAAGAACCGT TTCATGTGCA GATATGCTCA CCATTGCAGC TCAACAATCT GTCACTTTGG CAGGAGGTCC TTCTTGGAAG GTTCCTTTGG GGAGAAGAGA CAGCTTACAA  GCATTTCTAA GTCTCGCTAA TGCAAATCTC CCAGCTCCAT TCTTCACACT TCCAGAGCTT AAAGCCAACT TCAAAAATGT TGGCCTCGAT CGTCCTTCTG ATCTTGTTGC TCTCTCCGGG  GCTCACACAT TTGGTAAAAA TCAATGTCGA TTTATTATGG ACCGATTATA CAACTTTAGC AACACCGGAT TACCTGACCC TACACTCAAC ACGACTTACC TACAAACTCT TAGTGGACAG  TGTCCTCGCA ATGGTAATCA AAGTGTTTTA GTGGATTTCG ATCTGCGTAC GCCTTTAGTT TTCGACAACA AATACTATGT GAATCTCAAA GAGCAAAAAG GTCTTATCCA AAGCGATCAA  GAGTTGTTCT CTAGCCCCAA TGCCACAGAC ACAATCCCCT TGGTGAGATC ATTTGCTGAT GGCACAGAAA AATTCTTTGA TGCGTTTGTG GAGGCAATGA ATAGGATGGG AAACATTACA 
CCTACTACAG GAACTCAAGG ACAAATCAGG TTGAATTGTA GAGTGGTGAA CTCCAACTCT CTACTCCATG ATGTGGTGGA GATAGTTGAC TTTGTAAGCT CTATGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAATTAAATA GTTTTCATTT TCCTTGTGAA AAATGCAGTT CTCTTCATCA TCTTCTATTA CTTCTTTCAC TTGGATAATC TTAATAACAT TGGGATGTCT TCTGCTTCGT GCGTCTCTGT  CCGATGCTCA ACTTACCCCT ACCTTCTACG ACACTTCATG TCCTAACGTC ACCAACATTG TAAGAGATAC CATTGTCAAC GAACTAAGAT CGGACCCTCG TATCGCTGCG AGCATCCTTC  GTCTTCACTT CCACGACTGC TTTGTTAATG GTTGTGATGC GTCAATCTTG TTAGACAACA CGACATCATT TCAGACAGAG AAAGATGCGC TTGGAAATGC AAATTCAGCT CGGGGATTTC  CCGTGATTGA CAGAATGAAA GCCGCCGTAG AGAGGGCATG CCCAAGAACC GTTTCATGTG CAGATATGCT CACCATTGCA GCTCAACAAT CTGTCACTTT GGCAGGAGGT CCTTCTTGGA  AGGTTCCTTT GGGGAGAAGA GACAGCTTAC AAGCATTTCT AAGTCTCGCT AATGCAAATC TCCCAGCTCC ATTCTTCACA CTTCCAGAGC TTAAAGCCAA CTTCAAAAAT GTTGGCCTCG  ATCGTCCTTC TGATCTTGTT GCTCTCTCCG GGGCTCACAC ATTTGGTAAA AATCAATGTC GATTTATTAT GGACCGATTA TACAACTTTA GCAACACCGG ATTACCTGAC CCTACACTCA  ACACGACTTA CCTACAAACT CTTAGTGGAC AGTGTCCTCG CAATGGTAAT CAAAGTGTTT TAGTGGATTT CGATCTGCGT ACGCCTTTAG TTTTCGACAA CAAATACTAT GTGAATCTCA  AAGAGCAAAA AGGTCTTATC CAAAGCGATC AAGAGTTGTT CTCTAGCCCC AATGCCACAG ACACAATCCC CTTGGTGAGA TCATTTGCTG ATGGCACAGA AAAATTCTTT GATGCGTTTG  TGGAGGCAAT GAATAGGATG GGAAACATTA CACCTACTAC AGGAACTCAA GGACAAATCA GGTTGAATTG TAGAGTGGTG AACTCCAACT CTCTACTCCA TGATGTGGTG GAGATAGTTG  ACTTTGTAAG CTCTATGTGA GAATAGTTGA CTAAATATCT GGCAACCAGA CTATATATGT TAAGATGAAT AAGCGGCTCT CAAGTTGTTA CTTGAGCAGG AGCAGATTGG TGTGTATAGT 

Retrieve as FASTA