Entry information : AhalPrx42Araha.4285s0014
Entry ID 14823
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx42Araha.4285s0014
Name AhalPrx42Araha.4285s0014
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx016]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx42
start..stop
S start..stop
AtPrx43 644 0 45..370 1..326
CagraPrx52 622 0 45..370 1..326
AlyPrx43 621 0 45..370 1..326
BstrPrx30 615 0 45..370 1..326
Literature and cross-references AhalPrx42Araha.4285s0014
Protein sequence: AhalPrx42Araha.4285s0014
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   370
PWM (Da):   %s   40140.77  
PI (pH):   %s   6.36
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSVSIPVLMK RLCLYNSLSY LFHLFPSPSF ALSFSVELNL LKAQMVWAKA KMSLALSLVT VFLGISLADL EVGFYSNICP QAESIVRKVV SGAALSDPNL PAILLRLHFH DCFVEGCDGS  ILVNNGAISE KNAFGHEGVR GFEIVEAAKA ELEAACPGVV SCSDIVALGA RDAISLANGP AYEVPTGRRD GRVSNISLAK DMPEVSDSIQ ILKAKFMQKG LNAKDLVLLS AAHTIGTTAC  FFMSKRLYDF LPGGQPDPTI NPTFLPELTT QCPQNGDINV RLPIDRFSER LFDKQILLNI KDGFAVLQTD AGLYEDVTTR QVVDSYLGML NPFFGPTFES DFVKAIVKMG KIGIKTGLNG 
EIRRVCSAFN * 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTGTCT CTATTCCTGT CTTAATGAAG AGACTTTGTC TGTATAACTC TCTCTCTTAT CTTTTTCACC TCTTTCCCTC ACCCTCTTTC GCTCTCTCGT TCTCTGTTGA GTTGAACTTA  CTAAAAGCAC AAATGGTGTG GGCAAAGGCT AAGATGAGCC TAGCTTTGTC TCTTGTTACG GTTTTCCTCG GCATCTCTCT TGCTGATCTT GAAGTCGGAT TTTACTCCAA TATATGTCCT  CAAGCCGAGT CAATCGTTAG GAAAGTTGTC TCGGGAGCTG CTCTTTCCGA CCCTAACCTC CCAGCCATAC TTCTACGGCT CCATTTCCAT GATTGCTTTG TTGAGGTACA ATGCACTTCC  TCCTCTTTGT GCTTTCTACT ATTTGCTTGC TATTCTTACA GATTTAACCA CACGCTCAGG GATGTGATGG CTCGATCCTC GTGAACAACG GAGCAATCTC TGAAAAGAAT GCATTTGGGC  ATGAAGGCGT TAGAGGATTT GAGATAGTAG AAGCCGCCAA AGCCGAGCTT GAAGCTGCAT GCCCAGGTGT TGTCTCCTGC TCAGACATTG TTGCCTTGGG TGCACGTGAT GCCATATCTT  TGGTAAAAAA TAAATTAGAG AGAAAAAAAA CCTTTCCATC TTTATCTATC TTCTTCTCCG CTGTGATCAA TTCATGATAC AGGCGAATGG ACCGGCGTAT GAGGTGCCAA CTGGGCGGAG  AGATGGTCGT GTTTCGAACA TATCATTGGC TAAGGACATG CCGGAGGTGA GTGACTCGAT TCAGATACTA AAGGCTAAGT TCATGCAGAA GGGACTCAAC GCCAAAGATC TCGTGCTTCT  CAGTGGTATG TATGATGTAT CTCTTCTTCT TATTTTTCTC TCTCATTCAT GTTTGTTTGG TGGTTTCGAA TCTCTCAAAG TTTTTTGGTT CGAAGTTCAA GTTATATGAT TTTCATTTCC  CGGATCCGTG ATGTGTTTCG CATGTTGCGT CCGTTTCCTC TCCTCTTCGT GTGTTAAGTG TCACGTGCGT TACGAAAAAT CTGGTAGACC AATAGAAAAC ATTATTGGAA ATTTTTCCAG  CTAACCCAGC AGTGTTTCAA TGTTAAAATA GTCAGATTTA CTAGTTAGCT AAATTTTAAG AGAGATGAAA ATTCGTGTGT AAAAAAAAAA TTTTAAGCTT TTTTGGTCAA CTTACTATAG  GCACTTATTC AAGAATTTGG TATTTTAGTT CTAATAGATT AATACTTAAT TGAGTGTGTT ATATTAGTAG CAACTAGCAA GTAGCAACAA GTGTTCTGAT GTTGTGTCAT CTTAACCACT  AAATCTGGCA TGGCCCAGAA ATGTTAATTC ACCCCGAAAA TAGGCCTGTA ACTGTTATAC GATCGGCAGT TAATCAGACA AAACGTCATA AATATCTACC GGCCCATTCT TTAGACTAGA  TTTCAGGGTG AAATTATCAA CTTGCACGTG TGACCAAACA AAGAAGAAAC CATCAACATG CACGAGTCTA ATACAGTAGT GATCATGCGT TTTCAACCTG GTCCGGCTCA GTTTGTGTCA  CTTAAATTTT ACATTTCAAG TTCAAATGTT CAATATGAGA AAACTTTGAC AAAAATAAAA TAAAATTGTT TCTAGCTTTA AAAAATCAAA AGATCTAAAC TTGAGTGGTC TACTTTCCGT  ATCAGCTGCT CACACTATTG GAACAACGGC CTGCTTCTTC ATGTCCAAAC GGCTCTACGA TTTCTTACCC GGTGGCCAAC CTGATCCGAC TATCAATCCA ACATTCCTAC CCGAATTAAC  CACTCAGTGC CCACAAAATG GTGACATAAA CGTCCGGTTA CCAATTGACC GGTTCAGTGA ACGGCTATTC GACAAACAGA TTCTGCTCAA CATAAAGGAT GGTTTCGCTG TGCTTCAGAC  CGACGCAGGT CTTTACGAGG ATGTAACGAC TCGACAGGTC GTGGATTCCT ATCTTGGGAT GCTAAATCCA TTCTTTGGGC CAACGTTTGA GTCTGATTTC GTAAAGGCGA TAGTGAAGAT 
GGGGAAGATT GGTATAAAGA CTGGTTTGAA CGGGGAGATT CGACGGGTTT GCTCGGCCTT CAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTGTCT CTATTCCTGT CTTAATGAAG AGACTTTGTC TGTATAACTC TCTCTCTTAT CTTTTTCACC TCTTTCCCTC ACCCTCTTTC GCTCTCTCGT TCTCTGTTGA GTTGAACTTA  CTAAAAGCAC AAATGGTGTG GGCAAAGGCT AAGATGAGCC TAGCTTTGTC TCTTGTTACG GTTTTCCTCG GCATCTCTCT TGCTGATCTT GAAGTCGGAT TTTACTCCAA TATATGTCCT  CAAGCCGAGT CAATCGTTAG GAAAGTTGTC TCGGGAGCTG CTCTTTCCGA CCCTAACCTC CCAGCCATAC TTCTACGGCT CCATTTCCAT GATTGCTTTG TTGAGGGATG TGATGGCTCG  ATCCTCGTGA ACAACGGAGC AATCTCTGAA AAGAATGCAT TTGGGCATGA AGGCGTTAGA GGATTTGAGA TAGTAGAAGC CGCCAAAGCC GAGCTTGAAG CTGCATGCCC AGGTGTTGTC  TCCTGCTCAG ACATTGTTGC CTTGGGTGCA CGTGATGCCA TATCTTTGGC GAATGGACCG GCGTATGAGG TGCCAACTGG GCGGAGAGAT GGTCGTGTTT CGAACATATC ATTGGCTAAG  GACATGCCGG AGGTGAGTGA CTCGATTCAG ATACTAAAGG CTAAGTTCAT GCAGAAGGGA CTCAACGCCA AAGATCTCGT GCTTCTCAGT GCTGCTCACA CTATTGGAAC AACGGCCTGC  TTCTTCATGT CCAAACGGCT CTACGATTTC TTACCCGGTG GCCAACCTGA TCCGACTATC AATCCAACAT TCCTACCCGA ATTAACCACT CAGTGCCCAC AAAATGGTGA CATAAACGTC  CGGTTACCAA TTGACCGGTT CAGTGAACGG CTATTCGACA AACAGATTCT GCTCAACATA AAGGATGGTT TCGCTGTGCT TCAGACCGAC GCAGGTCTTT ACGAGGATGT AACGACTCGA  CAGGTCGTGG ATTCCTATCT TGGGATGCTA AATCCATTCT TTGGGCCAAC GTTTGAGTCT GATTTCGTAA AGGCGATAGT GAAGATGGGG AAGATTGGTA TAAAGACTGG TTTGAACGGG 
GAGATTCGAC GGGTTTGCTC GGCCTTCAAT TGA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTGTCT CTATTCCTGT CTTAATGAAG AGACTTTGTC TGTATAACTC TCTCTCTTAT CTTTTTCACC TCTTTCCCTC ACCCTCTTTC GCTCTCTCGT TCTCTGTTGA GTTGAACTTA  CTAAAAGCAC AAATGGTGTG GGCAAAGGCT AAGATGAGCC TAGCTTTGTC TCTTGTTACG GTTTTCCTCG GCATCTCTCT TGCTGATCTT GAAGTCGGAT TTTACTCCAA TATATGTCCT  CAAGCCGAGT CAATCGTTAG GAAAGTTGTC TCGGGAGCTG CTCTTTCCGA CCCTAACCTC CCAGCCATAC TTCTACGGCT CCATTTCCAT GATTGCTTTG TTGAGGGATG TGATGGCTCG  ATCCTCGTGA ACAACGGAGC AATCTCTGAA AAGAATGCAT TTGGGCATGA AGGCGTTAGA GGATTTGAGA TAGTAGAAGC CGCCAAAGCC GAGCTTGAAG CTGCATGCCC AGGTGTTGTC  TCCTGCTCAG ACATTGTTGC CTTGGGTGCA CGTGATGCCA TATCTTTGGC GAATGGACCG GCGTATGAGG TGCCAACTGG GCGGAGAGAT GGTCGTGTTT CGAACATATC ATTGGCTAAG  GACATGCCGG AGGTGAGTGA CTCGATTCAG ATACTAAAGG CTAAGTTCAT GCAGAAGGGA CTCAACGCCA AAGATCTCGT GCTTCTCAGT GCTGCTCACA CTATTGGAAC AACGGCCTGC  TTCTTCATGT CCAAACGGCT CTACGATTTC TTACCCGGTG GCCAACCTGA TCCGACTATC AATCCAACAT TCCTACCCGA ATTAACCACT CAGTGCCCAC AAAATGGTGA CATAAACGTC  CGGTTACCAA TTGACCGGTT CAGTGAACGG CTATTCGACA AACAGATTCT GCTCAACATA AAGGATGGTT TCGCTGTGCT TCAGACCGAC GCAGGTCTTT ACGAGGATGT AACGACTCGA  CAGGTCGTGG ATTCCTATCT TGGGATGCTA AATCCATTCT TTGGGCCAAC GTTTGAGTCT GATTTCGTAA AGGCGATAGT GAAGATGGGG AAGATTGGTA TAAAGACTGG TTTGAACGGG 
GAGATTCGAC GGGTTTGCTC GGCCTTCAAT TGA 

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