Entry information : AhalPrx48Araha.18545s0005
Entry ID 14829
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx48Araha.18545s0005
Name AhalPrx48Araha.18545s0005
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx030]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx48
start..stop
S start..stop
AtPrx46 625 0 1..326 1..326
AlyPrx46 597 0 1..326 1..326
TsPrx46 581 0 3..326 6..330
BstrPrx22 576 0 1..326 1..326
Literature and cross-references AhalPrx48Araha.18545s0005
Protein sequence: AhalPrx48Araha.18545s0005
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (299)
PWM (Da):   %s   35304.14 (32201.6) Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   4.49 (4.39) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASSYRLNYS SVLHLFLFLS SLLTSSANLS FNFYAGSCSV AEFLVRNTVR SATSSDPTIP GKLLRLLFHD CFVQGCDASV LIQGNGTERS DPGNASLGGF SVIDRAKNAI EILCPATVSC  ADIVALAARD AVEAAGGPVV EIPTGRRDGK ESMAANVRPN IIDTDFTLDQ MIDAFSSKGL SIQDLVVLSG AHTIGASHCN AFNGRFQQDS KGNFELIDAS LDNSYAETLM NKCSSSESSS 
LTVSNDPETS SIFDNQYYRN LETHKGLFQT DSALMEDNRT RTMVEELASD EESFYQRWSE SFVKLSMVGV RVGEDGEIRR SCSSIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCGGATTCA CTTAAAACCA TGGATGATGC TGGAAATGTT GGATTCAACT AAACATGACC ATCAATGATT CTTCATTAAA TGCGTTGACT CAACTTCATC ACCTCAACTA TTTTTCAATC  TCTGACACTA ACATCAAATG CAAATTATGA AGTGAACAGT TACAGTTTAT TACGCCAACC TTCAATATCC TCGTCTCTCT CCGTTTCTAT TATCATTGTC ACTTTCCTTT TTGGGTCAAA  ACACAGAGAC AAAAAAATGG CGTCCTCTTA CAGACTAAAC TATTCCTCTG TTCTTCATCT CTTTCTGTTT CTTTCTAGTC TTCTCACTTC CTCCGCCAAC CTCTCATTTA ATTTCTACGC  CGGTTCTTGT TCTGTAGCCG AGTTTCTAGT CAGAAACACC GTTAGATCAG CTACCTCCTC CGATCCAACG ATCCCGGGGA AACTCCTCCG TCTCCTCTTC CACGACTGTT TCGTCCAGGT  AAGACACACT CATTACGAAT TACAAAGGAA AGTGAAACAA TTTGGCTTGA GATTTGTTTG TTGTTGCAAG GGTTGTGATG CGTCAGTGTT GATACAAGGG AATGGCACAG AGAGAAGTGA  TCCCGGAAAT GCCTCTCTTG GAGGATTCTC AGTCATAGAC AGAGCCAAGA ATGCCATCGA GATTTTATGT CCGGCCACTG TTTCCTGCGC TGACATAGTC GCACTTGCTG CTAGAGACGC  CGTCGAAGCT GTAACATTCA CTTTACTTCA ATCTACTGTA TATTGCTCTA ATCCGGTTTA ACCAATCCCA ACTGAACCGA AAGCATGAAA TCGAAAAAAC ATAAACCCAT TCTGTATCAT  TTACTAATAG AAAAGAAAAT AAACTGATTG AGCCACAGAT AACTGGACTC GGAGATACAT TAACCGGTTA TCCTTCTTAA GGTTTGAATG TTTTATTTTT TGGCGGGACA GGCAGGAGGA  CCGGTGGTTG AGATTCCGAC AGGGAGGAGA GACGGGAAAG AATCGATGGC TGCAAACGTA AGACCAAACA TCATCGACAC AGATTTCACT CTCGATCAAA TGATCGATGC CTTCTCTTCT  AAAGGCTTGT CCATTCAAGA TCTCGTTGTC CTCTCTGGTA TCAATCAATG TTTCTAAAAG CTTTTTATCA ATTTCACCAA AATGTTTTGC TAAACTCTAA CAGAGTATGA AACAGAGTTT  GCTTCAAGCC TACACGAATT GACTAAGCCG GATTGGTCAT TTCAATTTAC TCTTTGGTTA AGTCAATTCT TGTTGTAGCA AACTCTGTTA AACTCCTCAG ATTCTTCTTT TTTTACTTGC  ATTTAGGAGC ACACACGATT GGAGCATCAC ACTGTAACGC ATTCAATGGA AGGTTTCAAC AAGACTCGAA AGGAAACTTC GAGCTAATCG ACGCGTCTCT CGACAACTCC TACGCAGAGA  CACTAATGAA CAAGTGTTCG TCCTCGGAAT CCTCGTCATT GACAGTGAGC AACGATCCAG AGACATCTTC CATATTCGAT AACCAGTACT ATAGGAATCT GGAGACTCAC AAGGGTTTGT  TCCAGACGGA TTCTGCTTTG ATGGAGGATA ATCGGACGAG GACGATGGTG GAGGAATTAG CGAGTGATGA GGAAAGTTTT TATCAGAGAT GGAGTGAGTC GTTTGTGAAG CTGAGTATGG  TTGGTGTGAG AGTTGGTGAA GATGGTGAGA TAAGACGTTC TTGTTCTTCC ATTAATTAAA AACATTTCTG CTTCTTAATT AATTTGACCC AATTTGGATA GTTAGTATGT AATAATGTTA 
TCTCCCAATT TTTATTTTGA CTAGTTTTGG TACTTGAAAA TCGTCTTTTA GTTGTCGAGA CAGATCCTCT TTCTAAAGTT GCGTGTTATA TGGGAAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGTCCT CTTACAGACT AAACTATTCC TCTGTTCTTC ATCTCTTTCT GTTTCTTTCT AGTCTTCTCA CTTCCTCCGC CAACCTCTCA TTTAATTTCT ACGCCGGTTC TTGTTCTGTA  GCCGAGTTTC TAGTCAGAAA CACCGTTAGA TCAGCTACCT CCTCCGATCC AACGATCCCG GGGAAACTCC TCCGTCTCCT CTTCCACGAC TGTTTCGTCC AGGGTTGTGA TGCGTCAGTG  TTGATACAAG GGAATGGCAC AGAGAGAAGT GATCCCGGAA ATGCCTCTCT TGGAGGATTC TCAGTCATAG ACAGAGCCAA GAATGCCATC GAGATTTTAT GTCCGGCCAC TGTTTCCTGC  GCTGACATAG TCGCACTTGC TGCTAGAGAC GCCGTCGAAG CTGCAGGAGG ACCGGTGGTT GAGATTCCGA CAGGGAGGAG AGACGGGAAA GAATCGATGG CTGCAAACGT AAGACCAAAC  ATCATCGACA CAGATTTCAC TCTCGATCAA ATGATCGATG CCTTCTCTTC TAAAGGCTTG TCCATTCAAG ATCTCGTTGT CCTCTCTGGA GCACACACGA TTGGAGCATC ACACTGTAAC  GCATTCAATG GAAGGTTTCA ACAAGACTCG AAAGGAAACT TCGAGCTAAT CGACGCGTCT CTCGACAACT CCTACGCAGA GACACTAATG AACAAGTGTT CGTCCTCGGA ATCCTCGTCA  TTGACAGTGA GCAACGATCC AGAGACATCT TCCATATTCG ATAACCAGTA CTATAGGAAT CTGGAGACTC ACAAGGGTTT GTTCCAGACG GATTCTGCTT TGATGGAGGA TAATCGGACG  AGGACGATGG TGGAGGAATT AGCGAGTGAT GAGGAAAGTT TTTATCAGAG ATGGAGTGAG TCGTTTGTGA AGCTGAGTAT GGTTGGTGTG AGAGTTGGTG AAGATGGTGA GATAAGACGT 
TCTTGTTCTT CCATTAATTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTCGGATTCA CTTAAAACCA TGGATGATGC TGGAAATGTT GGATTCAACT AAACATGACC ATCAATGATT CTTCATTAAA TGCGTTGACT CAACTTCATC ACCTCAACTA TTTTTCAATC  TCTGACACTA ACATCAAATG CAAATTATGA AGTGAACAGT TACAGTTTAT TACGCCAACC TTCAATATCC TCGTCTCTCT CCGTTTCTAT TATCATTGTC ACTTTCCTTT TTGGGTCAAA  ACACAGAGAC AAAAAAATGG CGTCCTCTTA CAGACTAAAC TATTCCTCTG TTCTTCATCT CTTTCTGTTT CTTTCTAGTC TTCTCACTTC CTCCGCCAAC CTCTCATTTA ATTTCTACGC  CGGTTCTTGT TCTGTAGCCG AGTTTCTAGT CAGAAACACC GTTAGATCAG CTACCTCCTC CGATCCAACG ATCCCGGGGA AACTCCTCCG TCTCCTCTTC CACGACTGTT TCGTCCAGGG  TTGTGATGCG TCAGTGTTGA TACAAGGGAA TGGCACAGAG AGAAGTGATC CCGGAAATGC CTCTCTTGGA GGATTCTCAG TCATAGACAG AGCCAAGAAT GCCATCGAGA TTTTATGTCC  GGCCACTGTT TCCTGCGCTG ACATAGTCGC ACTTGCTGCT AGAGACGCCG TCGAAGCTGC AGGAGGACCG GTGGTTGAGA TTCCGACAGG GAGGAGAGAC GGGAAAGAAT CGATGGCTGC  AAACGTAAGA CCAAACATCA TCGACACAGA TTTCACTCTC GATCAAATGA TCGATGCCTT CTCTTCTAAA GGCTTGTCCA TTCAAGATCT CGTTGTCCTC TCTGGAGCAC ACACGATTGG  AGCATCACAC TGTAACGCAT TCAATGGAAG GTTTCAACAA GACTCGAAAG GAAACTTCGA GCTAATCGAC GCGTCTCTCG ACAACTCCTA CGCAGAGACA CTAATGAACA AGTGTTCGTC  CTCGGAATCC TCGTCATTGA CAGTGAGCAA CGATCCAGAG ACATCTTCCA TATTCGATAA CCAGTACTAT AGGAATCTGG AGACTCACAA GGGTTTGTTC CAGACGGATT CTGCTTTGAT  GGAGGATAAT CGGACGAGGA CGATGGTGGA GGAATTAGCG AGTGATGAGG AAAGTTTTTA TCAGAGATGG AGTGAGTCGT TTGTGAAGCT GAGTATGGTT GGTGTGAGAG TTGGTGAAGA  TGGTGAGATA AGACGTTCTT GTTCTTCCAT TAATTAAAAA CATTTCTGCT TCTTAATTAA TTTGACCCAA TTTGGATAGT TAGTATGTAA TAATGTTATC TCCCAATTTT TATTTTGACT 
AGTTTTGGTA CTTGAAAATC GTCTTTTAGT TGTCGAGACA GATCCTCTTT CTAAAGTTGC GTGTTATATG GGAAA 

Retrieve as FASTA