Entry information : AhalPrx49Araha.12666s0022
Entry ID 14830
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx49Araha.12666s0022
Name AhalPrx49Araha.12666s0022
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx49
start..stop
S start..stop
AlyPrx12 728 0 1..358 1..359
AtPrx12 719 0 1..358 1..358
CrubPrx12 716 0 1..358 1..358
BstrPrx46 703 0 1..358 1..360
Literature and cross-references AhalPrx49Araha.12666s0022
Protein sequence: AhalPrx49Araha.12666s0022
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   358 (327)
PWM (Da):   %s   39390.18 (35923.3) Transmb domain:   %s   o4-26i
PI (pH):   %s   8.56 (8.40) Peptide Signal:   %s   cut: 32 range:32-358
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAKAYSTRVL TFLMLISLMA VTLNLLSTAE AKKRRRDVPI VKGLSWNFYQ KACPKVENII KKELKKVFKR DIGLAAAILR IHFHDCFVQG CEASVLLAGS ASGPGEQSSI PNLTLRQQAF  VVINNLRALV QKKCGQVVSC SDILALAARD SVVLSGGPDY AVPLGRRDSL AFASQETTLN NLPPPFANAS QLIADFASRN LNITDLVALS GGHTIGIAHC PSFTDRLYPN QDPTMNQFFA 
NSLKRTCPTA NSSNTQVNDI RSPDVFDNKY YVDLMNRQGL FTSDQDLFVD KRTRGIVESF AIDQQLFFDH FTVAMIKMGQ MSVLTGTQGE IRSNCSARNT QSFMSVLEEG IEEAISMI* 

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Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTGATAAAA AAAAAAAACA AAAAATGGCA AAGGCTTATT CAACACGTGT CCTCACGTTT CTGATGTTGA TCTCGCTAAT GGCGGTGACA CTGAACCTTT TGTCCACCGC AGAGGCAAAG  AAGCGGAGAA GAGATGTTCC TATAGTGAAA GGTCTCTCAT GGAACTTTTA CCAGAAAGCA TGTCCGAAAG TCGAAAACAT TATCAAAAAA GAGCTCAAGA AAGTCTTCAA GAGAGACATT  GGTTTAGCCG CAGCCATCCT TCGTATACAT TTCCATGATT GCTTCGTTCA GGTTCAATCT TTATTTACTT TTGTTTTGTT TCTTGTATTA AAACATACGA AAACTTAATT TGATTCTTTA  AGCCTACTCT AAACGGTTCT ACGTATGTAA TTACATATTC TTTCATTAAT AATAAAAAAA ACTCGTTTTT TAAATATATG AAACCATATC CACTCATCAC TCATCACTCA TCACTCATCA  CTCATCACTC ATTATACCCA CACAAACAAA AAAAGGGATT CGGGTTGTGA TCCGAACAAA GATGATAATG GGATATTTTT ACAAATTGAT ACAGGTTTGA CTTTTATTTT TAAAATCCGA  CCAAAATAAC CTTAAAGAAA AGAAAAACAC AAATATCGCC TCGAAATTCA AGAAATAAGG GTTGTCAGCT TCTCACTTTT ATTTCGTTTC AAAACATTAA TGGGTTCTTA GTGTAAACAG  AAATTAAGGG ACGAAGATAT TATCGAATAG TATTGTTTAA TATTACGTTA ATATTTAACA CATTTTTTTT GTTAAGGCAT TAATATTTAA CCCATGCAAC AGTGTTTACC GCAAAAAAAA  TTACCCAAAA AAAAACCCAC GAAAACATGC AGTAGGATAC TAGGATTGAC TTAAATGTAT AAGGACATGT CGCATTAATA CTATTCACCG GCTTTCCGTA TGTTAGTTGG ATCTCAGTTA  TGGAACGTAA ATATCTTAAA TAATTCAATA TCCAGCCAAT AATAGAAATA ATAAATATCA AGATACGATA GCATATGTGA Annnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnAA TTTGATTAGC TATATAATTT CGGAGGAAAA TTCTGAAAGT ATTTTTCATT TATATTTTTC TGTTATGAGA TTTTTTTAAA AAAATTTGTC  TGTTATGAGA AAATTAATAA ACTTTTTTAT TTTATTTTTT GAGCAAAGAG AAATTAATAA ACTAAGATAA TGTTTTAAAA ATAAACAGGG ATGTGAAGCA TCAGTGCTGC TAGCTGGATC  AGCCAGTGGA CCAGGAGAAC AATCATCAAT CCCGAACCTG ACACTACGTC AACAAGCCTT TGTCGTCATC AATAACCTTC GTGCCCTCGT CCAAAAGAAG TGTGGTCAAG TCGTCTCTTG  CTCCGATATC CTCGCTCTCG CCGCCCGCGA CTCCGTCGTC CTAGTAATCA CATCTCTCTC ACTTTTATGA CTACGCGGTC ACACTAATAC AAACCATTAG CTTACATATA TTATTCTAAT  TGATAATTAA TTTTTTGTGT GTCAATGTAG TCAGGAGGGC CAGACTATGC TGTGCCACTT GGCCGACGCG ACTCTCTGGC GTTCGCGAGC CAGGAAACGA CGTTAAATAA CTTACCACCA  CCGTTCGCCA ACGCGAGCCA GCTCATCGCC GACTTCGCCA GCAGAAACCT CAACATCACC GACTTAGTAG CACTTTCCGG TGGTCACACC ATCGGAATTG CGCATTGTCC ATCTTTCACA  GACCGGCTCT ACCCGAACCA AGACCCAACC ATGAACCAGT TCTTCGCCAA CAGCCTCAAA CGCACTTGTC CCACCGCGAA CTCGAGCAAC ACGCAAGTGA ATGACATAAG GAGTCCTGAC  GTGTTTGACA ACAAGTACTA TGTTGATCTC ATGAACCGAC AAGGGCTGTT CACTTCTGAC CAGGATCTGT TCGTGGACAA GAGGACACGT GGCATTGTGG AGAGCTTTGC GATCGACCAA  CAGCTGTTTT TCGATCATTT TACGGTGGCC ATGATCAAGA TGGGTCAGAT GAGTGTCTTG ACGGGGACAC AAGGAGAGAT TCGTTCCAAC TGTTCAGCCA GAAACACCCA AAGTTTCATG  TCCGTTTTGG AAGAAGGCAT AGAGGAAGCT ATTTCCATGA TCTAAATAAC CATAAATCTC GACCTTTTCT TTTCTTAACT CTGTTTTAAT TCAGTTCGTG GTTGGTTTGT CGAATGCTTA 
AAACTATCTG ATAAATAAGA ACGTTGCTTC ATCTCAACTT TGTTATGTAG TGTCATGTTT GTCGA 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAAAGG CTTATTCAAC ACGTGTCCTC ACGTTTCTGA TGTTGATCTC GCTAATGGCG GTGACACTGA ACCTTTTGTC CACCGCAGAG GCAAAGAAGC GGAGAAGAGA TGTTCCTATA  GTGAAAGGTC TCTCATGGAA CTTTTACCAG AAAGCATGTC CGAAAGTCGA AAACATTATC AAAAAAGAGC TCAAGAAAGT CTTCAAGAGA GACATTGGTT TAGCCGCAGC CATCCTTCGT  ATACATTTCC ATGATTGCTT CGTTCAGGGA TGTGAAGCAT CAGTGCTGCT AGCTGGATCA GCCAGTGGAC CAGGAGAACA ATCATCAATC CCGAACCTGA CACTACGTCA ACAAGCCTTT  GTCGTCATCA ATAACCTTCG TGCCCTCGTC CAAAAGAAGT GTGGTCAAGT CGTCTCTTGC TCCGATATCC TCGCTCTCGC CGCCCGCGAC TCCGTCGTCC TATCAGGAGG GCCAGACTAT  GCTGTGCCAC TTGGCCGACG CGACTCTCTG GCGTTCGCGA GCCAGGAAAC GACGTTAAAT AACTTACCAC CACCGTTCGC CAACGCGAGC CAGCTCATCG CCGACTTCGC CAGCAGAAAC  CTCAACATCA CCGACTTAGT AGCACTTTCC GGTGGTCACA CCATCGGAAT TGCGCATTGT CCATCTTTCA CAGACCGGCT CTACCCGAAC CAAGACCCAA CCATGAACCA GTTCTTCGCC  AACAGCCTCA AACGCACTTG TCCCACCGCG AACTCGAGCA ACACGCAAGT GAATGACATA AGGAGTCCTG ACGTGTTTGA CAACAAGTAC TATGTTGATC TCATGAACCG ACAAGGGCTG  TTCACTTCTG ACCAGGATCT GTTCGTGGAC AAGAGGACAC GTGGCATTGT GGAGAGCTTT GCGATCGACC AACAGCTGTT TTTCGATCAT TTTACGGTGG CCATGATCAA GATGGGTCAG 
ATGAGTGTCT TGACGGGGAC ACAAGGAGAG ATTCGTTCCA ACTGTTCAGC CAGAAACACC CAAAGTTTCA TGTCCGTTTT GGAAGAAGGC ATAGAGGAAG CTATTTCCAT GATCTAA 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTGATAAAA AAAAAAAACA AAAAATGGCA AAGGCTTATT CAACACGTGT CCTCACGTTT CTGATGTTGA TCTCGCTAAT GGCGGTGACA CTGAACCTTT TGTCCACCGC AGAGGCAAAG  AAGCGGAGAA GAGATGTTCC TATAGTGAAA GGTCTCTCAT GGAACTTTTA CCAGAAAGCA TGTCCGAAAG TCGAAAACAT TATCAAAAAA GAGCTCAAGA AAGTCTTCAA GAGAGACATT  GGTTTAGCCG CAGCCATCCT TCGTATACAT TTCCATGATT GCTTCGTTCA GGGATGTGAA GCATCAGTGC TGCTAGCTGG ATCAGCCAGT GGACCAGGAG AACAATCATC AATCCCGAAC  CTGACACTAC GTCAACAAGC CTTTGTCGTC ATCAATAACC TTCGTGCCCT CGTCCAAAAG AAGTGTGGTC AAGTCGTCTC TTGCTCCGAT ATCCTCGCTC TCGCCGCCCG CGACTCCGTC  GTCCTATCAG GAGGGCCAGA CTATGCTGTG CCACTTGGCC GACGCGACTC TCTGGCGTTC GCGAGCCAGG AAACGACGTT AAATAACTTA CCACCACCGT TCGCCAACGC GAGCCAGCTC  ATCGCCGACT TCGCCAGCAG AAACCTCAAC ATCACCGACT TAGTAGCACT TTCCGGTGGT CACACCATCG GAATTGCGCA TTGTCCATCT TTCACAGACC GGCTCTACCC GAACCAAGAC  CCAACCATGA ACCAGTTCTT CGCCAACAGC CTCAAACGCA CTTGTCCCAC CGCGAACTCG AGCAACACGC AAGTGAATGA CATAAGGAGT CCTGACGTGT TTGACAACAA GTACTATGTT  GATCTCATGA ACCGACAAGG GCTGTTCACT TCTGACCAGG ATCTGTTCGT GGACAAGAGG ACACGTGGCA TTGTGGAGAG CTTTGCGATC GACCAACAGC TGTTTTTCGA TCATTTTACG  GTGGCCATGA TCAAGATGGG TCAGATGAGT GTCTTGACGG GGACACAAGG AGAGATTCGT TCCAACTGTT CAGCCAGAAA CACCCAAAGT TTCATGTCCG TTTTGGAAGA AGGCATAGAG  GAAGCTATTT CCATGATCTA AATAACCATA AATCTCGACC TTTTCTTTTC TTAACTCTGT TTTAATTCAG TTCGTGGTTG GTTTGTCGAA TGCTTAAAAC TATCTGATAA ATAAGAACGT 
TGCTTCATCT CAACTTTGTT ATGTAGTGTC ATGTTTGTCG A 

Retrieve as FASTA