Entry information : AhalPrx51Araha.53007s0001
Entry ID 14832
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx51Araha.53007s0001
Name AhalPrx51Araha.53007s0001
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx51
start..stop
S start..stop
AlyPrx34-2 721 0 1..355 1..355
BstrPrx03 669 0 6..355 4..353
AruPrx01-1 652 0 6..355 4..353
CrubPrx38 650 0 17..355 19..357
Literature and cross-references AhalPrx51Araha.53007s0001
Protein sequence: AhalPrx51Araha.53007s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   355 (323)
PWM (Da):   %s   38949.59 (35450.9)  
PI (pH):   %s   8.14 (8.21) Peptide Signal:   %s   cut: 33 range:33-355
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSASSSST SLTWTTLITL GCLMLYASLS DAQLTPTFYD NSCPNVTNIV RDTIVNELRS DPRIAASILR LHFHDCFVNG CDASILLDNT TSFRTEKDAF GNANSARGFP VIDRMKAAIE  TACPRTVSCA DMLTIAAQQS VTLAGGPSWR VPLGRRDSLQ AFLQLANANL PGPSSTLPQL KDRFKNVGLN RPSDLVALSG GHTFGKNQCR FIMNRLYNFS NTGLPDPSLN TTYLQTLRGL 
CPRNGNLSAL VDFDLRTPTV FDNKYYVNLG ERKGLIQSDQ ELFSSPNATD TIPLVRLYAN STQTFFNAFV EAMNRMGNIT PLTGTQGQIR LNCRVVNSNS LLHDVVELVD FVSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATCTTACT CATCTTCTCC ATTGAACCCA ATCAAATAGT TTTCTTTTTA CTTGTAAAAG ATGAAGTTCT CTGCTTCTTC TTCTTCTACT TCACTCACTT GGACAACCTT AATCACATTG  GGATGTCTTA TGCTATATGC CTCTTTGTCC GATGCTCAAC TTACCCCTAC CTTCTACGAC AATTCATGTC CTAATGTTAC TAACATCGTA CGAGATACCA TTGTCAACGA GTTAAGGTCA  GACCCTCGTA TCGCCGCGAG CATCCTCCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTAAATGTA AGATATTACT TTTTATCACG TTGCTAATTA TTGTATGTAA CTATAAACTA TGTATCATAT  TAGTGATTTT TTCATGTTTA TTTATTCATA TTATTTTATT GCATTTATTA TTTGAATTTG ATTATATAAC CATTTTAATG AGATTATATA TAAAACATTT CAATAGTCTA GTTTATTCAA  GATATTTTAT CTTTATTGCG TAAAGTATAT ATGGTTTTTA TGGATTACAA AAAAAAAAAA AAATTGATGT TACATCGTTA CTGGTAGGTG GTAGTAAAGA TTCAACTATA TATTTATGGA  TGTAATACAC TGACTAACAA TTTGGTTAAT TTTTTTTTTG GACTTTTGAA AGGGTTGTGA CGCATCGATC TTGTTAGACA ACACGACATC ATTTCGAACA GAGAAAGATG CATTTGGAAA  CGCAAATTCG GCTCGGGGAT TTCCCGTGAT TGATAGAATG AAAGCCGCAA TAGAGACGGC TTGCCCAAGA ACCGTTTCAT GCGCAGATAT GCTCACCATC GCGGCTCAAC AATCTGTTAC  TTTGGTATTT GCTACACTTT ATCATTCATT CATTCAATAC TGTATATAAT AATGATATAG TTACTTAACA AATTAAACAC GACAACCTAA GTTTGAAAAT AAGATATATA TTTTTGTTTG  TTTGAGAAGG TTGCAACTCC ATCCATATTT AGAATCACAA TCAACCTTTC AACCTTATGA CCAAGAATTC AACATTATTA GAGAAATATT CAAAACGCGT GGTCCCGTAA AGAAATTATG  ATAAGTTTAC TATAATTGGA TCTCATCACA ATAATGTAAT TGGTAAGACT ACGTTTTAAG TTAACCAAAA AGATTTAATT ATAACTTCAT ATTTTTCAAG AAAATATTGG AGACTAAAAA  AAACTTCCTT AGCTTTGACT ATAAATCATC TATGAATTTA TATAACATGT TTTTTTTTTC TCTTTACTTA CTCATTGGAT TTTCTGAATG ATATCATAGG CGGGAGGTCC TTCTTGGAGA  GTTCCTTTGG GAAGAAGAGA CAGCTTACAA GCATTTTTGC AACTCGCTAA TGCAAATCTT CCTGGTCCAT CCTCCACACT TCCACAACTT AAAGATAGAT TTAAAAATGT TGGCCTCAAC  CGTCCTTCTG ATCTCGTAGC TCTTTCCGGT AATTAACAAA AGGATATTAC ACACCATTTG ATATAGTTGT AATCAGCTGA GTTTTTTATT TATTGATATT GATCTTATGG TCTTTCTTTT  GTTAGGTGGC CACACATTTG GTAAAAACCA GTGCCGGTTT ATTATGAACA GACTATACAA CTTCAGCAAC ACCGGTTTAC CCGACCCTTC TCTCAACACT ACTTACCTAC AAACTCTCCG  CGGGTTGTGT CCCCGTAATG GTAATCTAAG TGCCTTGGTG GATTTTGATC TGCGTACACC TACGGTTTTC GACAACAAAT ACTATGTGAA CCTTGGTGAA CGAAAAGGTC TTATCCAGAG  CGACCAAGAG TTGTTCTCTA GCCCCAATGC CACGGACACA ATCCCTTTGG TGAGATTATA TGCTAATAGC ACACAAACCT TCTTCAATGC GTTTGTGGAG GCAATGAATA GGATGGGAAA  TATCACACCT CTCACAGGAA CTCAAGGACA AATCAGGTTG AATTGTAGGG TGGTGAATTC CAACTCTCTA CTCCATGATG TGGTTGAACT TGTTGACTTT GTTAGCTCTA TGTGAGAATA 
TATATATGTG AGAGTTGATT AAATATGTGG CTACCCCTAC CAGAATATAT ATGTTAAGAC AATAAAAAAG GAGAAGATCT CTATCAGTGT GTGGAGTATC TCAATAGCTT TCTGTTT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGCTTCTTC TTCTTCTACT TCACTCACTT GGACAACCTT AATCACATTG GGATGTCTTA TGCTATATGC CTCTTTGTCC GATGCTCAAC TTACCCCTAC CTTCTACGAC  AATTCATGTC CTAATGTTAC TAACATCGTA CGAGATACCA TTGTCAACGA GTTAAGGTCA GACCCTCGTA TCGCCGCGAG CATCCTCCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTAAATGGT  TGTGACGCAT CGATCTTGTT AGACAACACG ACATCATTTC GAACAGAGAA AGATGCATTT GGAAACGCAA ATTCGGCTCG GGGATTTCCC GTGATTGATA GAATGAAAGC CGCAATAGAG  ACGGCTTGCC CAAGAACCGT TTCATGCGCA GATATGCTCA CCATCGCGGC TCAACAATCT GTTACTTTGG CGGGAGGTCC TTCTTGGAGA GTTCCTTTGG GAAGAAGAGA CAGCTTACAA  GCATTTTTGC AACTCGCTAA TGCAAATCTT CCTGGTCCAT CCTCCACACT TCCACAACTT AAAGATAGAT TTAAAAATGT TGGCCTCAAC CGTCCTTCTG ATCTCGTAGC TCTTTCCGGT  GGCCACACAT TTGGTAAAAA CCAGTGCCGG TTTATTATGA ACAGACTATA CAACTTCAGC AACACCGGTT TACCCGACCC TTCTCTCAAC ACTACTTACC TACAAACTCT CCGCGGGTTG  TGTCCCCGTA ATGGTAATCT AAGTGCCTTG GTGGATTTTG ATCTGCGTAC ACCTACGGTT TTCGACAACA AATACTATGT GAACCTTGGT GAACGAAAAG GTCTTATCCA GAGCGACCAA  GAGTTGTTCT CTAGCCCCAA TGCCACGGAC ACAATCCCTT TGGTGAGATT ATATGCTAAT AGCACACAAA CCTTCTTCAA TGCGTTTGTG GAGGCAATGA ATAGGATGGG AAATATCACA 
CCTCTCACAG GAACTCAAGG ACAAATCAGG TTGAATTGTA GGGTGGTGAA TTCCAACTCT CTACTCCATG ATGTGGTTGA ACTTGTTGAC TTTGTTAGCT CTATGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GGATCTTACT CATCTTCTCC ATTGAACCCA ATCAAATAGT TTTCTTTTTA CTTGTAAAAG ATGAAGTTCT CTGCTTCTTC TTCTTCTACT TCACTCACTT GGACAACCTT AATCACATTG  GGATGTCTTA TGCTATATGC CTCTTTGTCC GATGCTCAAC TTACCCCTAC CTTCTACGAC AATTCATGTC CTAATGTTAC TAACATCGTA CGAGATACCA TTGTCAACGA GTTAAGGTCA  GACCCTCGTA TCGCCGCGAG CATCCTCCGT CTTCATTTCC ACGACTGCTT TGTAAATGGT TGTGACGCAT CGATCTTGTT AGACAACACG ACATCATTTC GAACAGAGAA AGATGCATTT  GGAAACGCAA ATTCGGCTCG GGGATTTCCC GTGATTGATA GAATGAAAGC CGCAATAGAG ACGGCTTGCC CAAGAACCGT TTCATGCGCA GATATGCTCA CCATCGCGGC TCAACAATCT  GTTACTTTGG CGGGAGGTCC TTCTTGGAGA GTTCCTTTGG GAAGAAGAGA CAGCTTACAA GCATTTTTGC AACTCGCTAA TGCAAATCTT CCTGGTCCAT CCTCCACACT TCCACAACTT  AAAGATAGAT TTAAAAATGT TGGCCTCAAC CGTCCTTCTG ATCTCGTAGC TCTTTCCGGT GGCCACACAT TTGGTAAAAA CCAGTGCCGG TTTATTATGA ACAGACTATA CAACTTCAGC  AACACCGGTT TACCCGACCC TTCTCTCAAC ACTACTTACC TACAAACTCT CCGCGGGTTG TGTCCCCGTA ATGGTAATCT AAGTGCCTTG GTGGATTTTG ATCTGCGTAC ACCTACGGTT  TTCGACAACA AATACTATGT GAACCTTGGT GAACGAAAAG GTCTTATCCA GAGCGACCAA GAGTTGTTCT CTAGCCCCAA TGCCACGGAC ACAATCCCTT TGGTGAGATT ATATGCTAAT  AGCACACAAA CCTTCTTCAA TGCGTTTGTG GAGGCAATGA ATAGGATGGG AAATATCACA CCTCTCACAG GAACTCAAGG ACAAATCAGG TTGAATTGTA GGGTGGTGAA TTCCAACTCT  CTACTCCATG ATGTGGTTGA ACTTGTTGAC TTTGTTAGCT CTATGTGAGA ATATATATAT GTGAGAGTTG ATTAAATATG TGGCTACCCC TACCAGAATA TATATGTTAA GACAATAAAA 
AAGGAGAAGA TCTCTATCAG TGTGTGGAGT ATCTCAATAG CTTTCTGTTT 

Retrieve as FASTA