Entry information : AhalPrx55 (Araha.51344s0001)
Entry ID 14836
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-01-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AhalPrx55 (Araha.51344s0001)
Name (synonym) AhalPrx55 (Araha.51344s0001)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx55
start..stop
S start..stop
AlyPrx02 529 0 1..262 1..262
AlyPrx01 529 0 1..262 1..262
CrubPrx51 432 6e-154 1..262 1..258
CrubPrx108 430 4e-153 1..284 1..275
Literature and cross-references AhalPrx55 (Araha.51344s0001)
Protein sequence: AhalPrx55 (Araha.51344s0001)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   304 (283)
PWM (Da):   %s   33164.48 (30932.1) Transmb domain:   %s   i5-22o
PI (pH):   %s   9.29 (9.14) Peptide Signal:   %s   cut: 22 range:22-304
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAIKNLLALV VLLSVLGVSV AFPKLIPNFD YYQSKCPDAE RIVRRVTEQY VSRKPSLAAS LLRMHFHDCF VRGCDGSVLL KTPKNDAERN AIPNLTLRGF EVVDAAKTAL EKKCPNLVSC  ADVLALVARD AVAVIKGPWW PVPLGRRDGR ISKLTDALQN LPSPFADIKT LKKNFADKGL NAKDLVVLSG GHTIGISSCA LVNTRIYNFT GKGDFDPSMN PSYVRALKKK CSPTDFKSVL 
EMDPGSAKKF DPHYFTAVAQ KKDSMACPCI SGHVALVSLL LDDWVLLLPC FAFSEAFALL SSAK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. 3'end (end of exon 4) is missing due to N in the sequence.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATCA AGAACCTTCT GGCCCTTGTG GTGCTTCTTA GCGTCCTTGG AGTTTCTGTT GCCTTTCCAA AGTTGATCCC TAACTTCGAT TACTACCAGT CTAAGTGTCC AGACGCAGAG  CGCATTGTTC GTCGTGTCAC AGAACAATAT GTTTCTCGGA AGCCAAGCCT TGCCGCTTCG CTTCTAAGGA TGCATTTTCA TGATTGTTTC GTCAGAGTAA GCTTGCTTCA CTTGTCCGAG  ACTTTAATAA TGGATATGAG AAAATACTAG CCCTAACTCT TTTTAATGAT TCATGAAGGG ATGTGATGGT TCCGTTCTTC TGAAAACTCC AAAGAATGAT GCGGAAAGAA ACGCTATCCC  CAACCTGACC CTGAGAGGCT TTGAAGTGGT GGATGCGGCC AAGACAGCGC TCGAGAAGAA GTGTCCCAAT CTCGTTTCTT GCGCTGATGT TCTTGCCTTG GTCGCCAGAG ATGCCGTCGC  AGTGGTAACG TTTTCGCATT GGACTCATTT CATAATTAAA GACTAGTATG TATATAACTT GTTGTCTTTT AACAGATCAA GGGACCATGG TGGCCGGTTC CATTGGGCCG CAGGGATGGA  CGCATCTCAA AATTGACAGA TGCATTGCAA AATTTACCAT CTCCTTTCGC CGACATAAAG ACGCTGAAGA AGAACTTTGC GGACAAGGGT CTTAACGCTA AAGACCTTGT CGTTCTCTCA  GGTATTATTT TCTTATGTGC GTGCAATCTC AAAATTAAGT TATCAATTTG AGAGTTGAAA GCTGAATAAA AATGGTTTCT TGATTAGGGG GTCACACCAT TGGAATCTCC AGTTGCGCTC  TCGTCAACAC ACGTATCTAC AACTTCACAG GAAAGGGCGA TTTTGACCCA TCCATGAACC CTAGCTACGT GAGGGCGTTG AAGAAGAAGT GCAGCCCTAC AGATTTCAAA TCCGTACTGG  AAATGGACCC AGGCAGTGCC AAGAAATTCG ACCCTCACTA CTTCACTGCC GTGGCTCAGA AGAAAGGTCT CTTCATATCT GACTCTAnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn GTGTGGCCTT CTTTCAAGAG CCGACTTCTC TTGCTTCCTT GGGTCACCAA TTAACCTCGC TATTCATGCC ATCTCCAAGT  CAAAGTGAGG CAAGTGAGCT GTTGACTTGA TTTTGTGCCG AGACCTAGTG TGCGTGTTCT GGTTTCTGGT GAGTTTTGGC TGGAAGGAGT AGCTGTCTCT GCGTGTTCAC AGCTGTAATG  GCTGCCTTGT GTCGCAGATT CGATGGCATG TCCATGCATC TCCGGCCATG TCGCACTTGT TAGCTTGCTA CTCGATGATT GGGTTCTTTT GCTGCCTTGT TTCGCTTTCT CCGAAGCTTT 
TGCTCTTCTT TCGTCAGCTA AGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATCA AGAACCTTCT GGCCCTTGTG GTGCTTCTTA GCGTCCTTGG AGTTTCTGTT GCCTTTCCAA AGTTGATCCC TAACTTCGAT TACTACCAGT CTAAGTGTCC AGACGCAGAG  CGCATTGTTC GTCGTGTCAC AGAACAATAT GTTTCTCGGA AGCCAAGCCT TGCCGCTTCG CTTCTAAGGA TGCATTTTCA TGATTGTTTC GTCAGAGGAT GTGATGGTTC CGTTCTTCTG  AAAACTCCAA AGAATGATGC GGAAAGAAAC GCTATCCCCA ACCTGACCCT GAGAGGCTTT GAAGTGGTGG ATGCGGCCAA GACAGCGCTC GAGAAGAAGT GTCCCAATCT CGTTTCTTGC  GCTGATGTTC TTGCCTTGGT CGCCAGAGAT GCCGTCGCAG TGATCAAGGG ACCATGGTGG CCGGTTCCAT TGGGCCGCAG GGATGGACGC ATCTCAAAAT TGACAGATGC ATTGCAAAAT  TTACCATCTC CTTTCGCCGA CATAAAGACG CTGAAGAAGA ACTTTGCGGA CAAGGGTCTT AACGCTAAAG ACCTTGTCGT TCTCTCAGGG GGTCACACCA TTGGAATCTC CAGTTGCGCT  CTCGTCAACA CACGTATCTA CAACTTCACA GGAAAGGGCG ATTTTGACCC ATCCATGAAC CCTAGCTACG TGAGGGCGTT GAAGAAGAAG TGCAGCCCTA CAGATTTCAA ATCCGTACTG  GAAATGGACC CAGGCAGTGC CAAGAAATTC GACCCTCACT ACTTCACTGC CGTGGCTCAG AAGAAAGATT CGATGGCATG TCCATGCATC TCCGGCCATG TCGCACTTGT TAGCTTGCTA 
CTCGATGATT GGGTTCTTTT GCTGCCTTGT TTCGCTTTCT CCGAAGCTTT TGCTCTTCTT TCGTCAGCTA AGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGATCA AGAACCTTCT GGCCCTTGTG GTGCTTCTTA GCGTCCTTGG AGTTTCTGTT GCCTTTCCAA AGTTGATCCC TAACTTCGAT TACTACCAGT CTAAGTGTCC AGACGCAGAG  CGCATTGTTC GTCGTGTCAC AGAACAATAT GTTTCTCGGA AGCCAAGCCT TGCCGCTTCG CTTCTAAGGA TGCATTTTCA TGATTGTTTC GTCAGAGGAT GTGATGGTTC CGTTCTTCTG  AAAACTCCAA AGAATGATGC GGAAAGAAAC GCTATCCCCA ACCTGACCCT GAGAGGCTTT GAAGTGGTGG ATGCGGCCAA GACAGCGCTC GAGAAGAAGT GTCCCAATCT CGTTTCTTGC  GCTGATGTTC TTGCCTTGGT CGCCAGAGAT GCCGTCGCAG TGATCAAGGG ACCATGGTGG CCGGTTCCAT TGGGCCGCAG GGATGGACGC ATCTCAAAAT TGACAGATGC ATTGCAAAAT  TTACCATCTC CTTTCGCCGA CATAAAGACG CTGAAGAAGA ACTTTGCGGA CAAGGGTCTT AACGCTAAAG ACCTTGTCGT TCTCTCAGGG GGTCACACCA TTGGAATCTC CAGTTGCGCT  CTCGTCAACA CACGTATCTA CAACTTCACA GGAAAGGGCG ATTTTGACCC ATCCATGAAC CCTAGCTACG TGAGGGCGTT GAAGAAGAAG TGCAGCCCTA CAGATTTCAA ATCCGTACTG  GAAATGGACC CAGGCAGTGC CAAGAAATTC GACCCTCACT ACTTCACTGC CGTGGCTCAG AAGAAAGATT CGATGGCATG TCCATGCATC TCCGGCCATG TCGCACTTGT TAGCTTGCTA 
CTCGATGATT GGGTTCTTTT GCTGCCTTGT TTCGCTTTCT CCGAAGCTTT TGCTCTTCTT TCGTCAGCTA AGTAA 

Retrieve as FASTA