Entry information : AhalPrx56Araha.30828s0009
Entry ID 14837
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx56Araha.30828s0009
Name AhalPrx56Araha.30828s0009
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx016]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx56
start..stop
S start..stop
AlyPrx13 677 0 1..336 1..336
BstrPrx54 662 0 1..336 1..336
AtPrx13 653 0 1..336 1..336
CagraPrx60 636 0 1..336 1..337
Literature and cross-references AhalPrx56Araha.30828s0009
Protein sequence: AhalPrx56Araha.30828s0009
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   336
PWM (Da):   %s   36773.64 Transmb domain:   %s   i9-31o
PI (pH):   %s   5.08
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSRRIREDIS ISLFGPKMIT VTLFLVLFYF HDQLGYSEAQ LQFGFYSETC PSAESIVRDV VQHAVTNDPG KAAVLLRLQF HDCFVEGCDG SILIKHGGND DERFAAGNAG VAGFDVIDEA  KSELERLCPG IVSCADIVAL AARDAIAEAK GPFYEVPTGR RDGRIANVGH ATNLPDVQDS INTLKSKFRE KGLSDQDLVL LSAGAHTIGT TACFFVIPRL DAQDPTINPE FFHILRSKCP 
QGGDVNVRIP LDWDSQFVFD DQILQNIKNG RGVILSDSVL YQDNSMKKII DSYLETNQSS KANFAVDFVK AMVKMGAIGV KIGVEGEIRR LCSATN* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTCGTA GAATACGAGA AGATATATCG ATTAGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATCACT GTTACATTAT TTCTAGTTTT GTTTTATTTT CATGATCAAT TAGGTTATTC GGAGGCACAA  CTTCAGTTTG GATTCTACTC AGAAACGTGT CCATCAGCAG AATCAATCGT TCGTGATGTT GTTCAACATG CGGTGACCAA CGACCCCGGA AAGGCTGCTG TCTTACTCCG TCTCCAGTTC  CACGATTGCT TCGTTGAGGT CCAATGCAAA AAAAAAAGAA GAGAACCAAT TAATAATCAT TTTTATACTA GTCATGACAT AAATTGGTTT GGTTATATGT TGTAGGGTTG TGATGGGTCA  ATACTAATCA AGCATGGTGG GAACGATGAC GAAAGGTTTG CTGCGGGTAA CGCGGGTGTG GCTGGTTTCG ATGTTATAGA CGAAGCCAAA TCAGAGCTTG AACGTCTTTG TCCGGGGATT  GTGTCTTGCG CCGACATCGT TGCTCTTGCT GCTAGAGACG CTATTGCTGA GGTAACACCT AAATAGTTTT TTTTTTCGTT TTTTTTCGTT TTTTTCGTTT TTTTTTCGTT TTTTTTAATA  CTAGGAAGTT CTGGGCCGAG ACTCATACAT TTTTCAAACT CGGACCAACC TTTAATATCT CTACCGTACT AGCTGCCATT CCTTCCTATA ACTTCTTAAA ATTTTCTAGA ATATATTTTT  CTTTTTCTTT TTATTATACT TTAATATATA GTTCTTTTTA AATACACAAT GAATAGTTTA TTGTATTCAT ATATAGGGCT AAAGAAGATC ATTTTTTTTT TTGATAAAAG TCTAAAGAAG  AAGAAGATCA TTTGATGTTA AATATTAACT TATTAGGCAA AAGGACCATT TTATGAGGTT CCAACCGGTC GGAGAGACGG TCGGATTGCA AATGTTGGTC ATGCTACAAA CTTGCCAGAT  GTTCAAGATT CCATAAACAC TTTGAAATCA AAATTTAGAG AAAAAGGGCT TTCAGATCAA GATCTTGTAC TTCTTAGTGC TGGTATTTAT CATAATCTTG ATAACTTGAT ATATAAACAC  TATCTGGAGA AAAAAGAAAA CACTATCTTG CTTACTCGAG TTTTATTTTT GTTAAAGGTG CACATACTAT TGGTACAACC GCTTGCTTCT TCGTCATACC ACGTTTAGAT GCTCAAGATC  CTACCATAAA CCCAGAATTC TTTCATATCC TAAGGTCAAA ATGTCCCCAA GGCGGAGATG TTAATGTCAG GATTCCGTTG GACTGGGATA GCCAGTTTGT GTTTGATGAC CAAATCTTGC  AAAACATCAA AAATGGCAGA GGTGTCATTC TATCGGACTC TGTCTTGTAC CAAGACAATA GTATGAAAAA AATCATTGAT TCGTACCTAG AAACTAATCA AAGTTCAAAG GCTAATTTTG 
CTGTGGATTT TGTTAAAGCC ATGGTAAAGA TGGGTGCTAT CGGAGTGAAA ATCGGTGTTG AAGGAGAGAT TAGACGTTTA TGCAGTGCTA CAAACTAG 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTCGTA GAATACGAGA AGATATATCG ATTAGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATCACT GTTACATTAT TTCTAGTTTT GTTTTATTTT CATGATCAAT TAGGTTATTC GGAGGCACAA  CTTCAGTTTG GATTCTACTC AGAAACGTGT CCATCAGCAG AATCAATCGT TCGTGATGTT GTTCAACATG CGGTGACCAA CGACCCCGGA AAGGCTGCTG TCTTACTCCG TCTCCAGTTC  CACGATTGCT TCGTTGAGGG TTGTGATGGG TCAATACTAA TCAAGCATGG TGGGAACGAT GACGAAAGGT TTGCTGCGGG TAACGCGGGT GTGGCTGGTT TCGATGTTAT AGACGAAGCC  AAATCAGAGC TTGAACGTCT TTGTCCGGGG ATTGTGTCTT GCGCCGACAT CGTTGCTCTT GCTGCTAGAG ACGCTATTGC TGAGGCAAAA GGACCATTTT ATGAGGTTCC AACCGGTCGG  AGAGACGGTC GGATTGCAAA TGTTGGTCAT GCTACAAACT TGCCAGATGT TCAAGATTCC ATAAACACTT TGAAATCAAA ATTTAGAGAA AAAGGGCTTT CAGATCAAGA TCTTGTACTT  CTTAGTGCTG GTGCACATAC TATTGGTACA ACCGCTTGCT TCTTCGTCAT ACCACGTTTA GATGCTCAAG ATCCTACCAT AAACCCAGAA TTCTTTCATA TCCTAAGGTC AAAATGTCCC  CAAGGCGGAG ATGTTAATGT CAGGATTCCG TTGGACTGGG ATAGCCAGTT TGTGTTTGAT GACCAAATCT TGCAAAACAT CAAAAATGGC AGAGGTGTCA TTCTATCGGA CTCTGTCTTG  TACCAAGACA ATAGTATGAA AAAAATCATT GATTCGTACC TAGAAACTAA TCAAAGTTCA AAGGCTAATT TTGCTGTGGA TTTTGTTAAA GCCATGGTAA AGATGGGTGC TATCGGAGTG 
AAAATCGGTG TTGAAGGAGA GATTAGACGT TTATGCAGTG CTACAAACTA G 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAGTCGTA GAATACGAGA AGATATATCG ATTAGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATCACT GTTACATTAT TTCTAGTTTT GTTTTATTTT CATGATCAAT TAGGTTATTC GGAGGCACAA  CTTCAGTTTG GATTCTACTC AGAAACGTGT CCATCAGCAG AATCAATCGT TCGTGATGTT GTTCAACATG CGGTGACCAA CGACCCCGGA AAGGCTGCTG TCTTACTCCG TCTCCAGTTC  CACGATTGCT TCGTTGAGGG TTGTGATGGG TCAATACTAA TCAAGCATGG TGGGAACGAT GACGAAAGGT TTGCTGCGGG TAACGCGGGT GTGGCTGGTT TCGATGTTAT AGACGAAGCC  AAATCAGAGC TTGAACGTCT TTGTCCGGGG ATTGTGTCTT GCGCCGACAT CGTTGCTCTT GCTGCTAGAG ACGCTATTGC TGAGGCAAAA GGACCATTTT ATGAGGTTCC AACCGGTCGG  AGAGACGGTC GGATTGCAAA TGTTGGTCAT GCTACAAACT TGCCAGATGT TCAAGATTCC ATAAACACTT TGAAATCAAA ATTTAGAGAA AAAGGGCTTT CAGATCAAGA TCTTGTACTT  CTTAGTGCTG GTGCACATAC TATTGGTACA ACCGCTTGCT TCTTCGTCAT ACCACGTTTA GATGCTCAAG ATCCTACCAT AAACCCAGAA TTCTTTCATA TCCTAAGGTC AAAATGTCCC  CAAGGCGGAG ATGTTAATGT CAGGATTCCG TTGGACTGGG ATAGCCAGTT TGTGTTTGAT GACCAAATCT TGCAAAACAT CAAAAATGGC AGAGGTGTCA TTCTATCGGA CTCTGTCTTG  TACCAAGACA ATAGTATGAA AAAAATCATT GATTCGTACC TAGAAACTAA TCAAAGTTCA AAGGCTAATT TTGCTGTGGA TTTTGTTAAA GCCATGGTAA AGATGGGTGC TATCGGAGTG 
AAAATCGGTG TTGAAGGAGA GATTAGACGT TTATGCAGTG CTACAAACTA G 

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