Entry information : AhalPrx60Araha.18948s0004
Entry ID 14841
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: AhalPrx60Araha.18948s0004
Name AhalPrx60Araha.18948s0004
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx004]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx60
start..stop
S start..stop
AlyPrx27 655 0 1..321 1..321
AtPrx27 637 0 1..321 1..321
CrubPrx100 620 0 1..318 1..318
BstrPrx44 617 0 1..321 1..320
Literature and cross-references AhalPrx60Araha.18948s0004
Protein sequence: AhalPrx60Araha.18948s0004
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   321 (298)
PWM (Da):   %s   34927.85 (32351.5)  
PI (pH):   %s   9.13 (8.91) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-321
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAASKRLVVS CLFLVLLFAQ ANSQGLKVGF YSKTCPQVEG IVRKVVFDAM KKAPTVGAPL LRMFFHDCFV RGCDGSILLD KPNNQGEKSA VPNLSLRGFG IIDDSKAALE KVCPGIVSCS  DVLALIARDA MVALEGPSWE VETGRRDGRV SNINEVNLPS PFDNITKLIN DFRAKGLNEK DLVVLSGGHT IGMGHCPLMT NRLYNFTGRG DSDPSLDSEY AAKLRQKCKP TDTTTALEMD 
PGSFKTFDVS YFTLVAKRRG LFQSDAALLD NSKTRAYVLQ QARTHGSMFF SDFGVSMVKM GRIGVLTGQA GEIRKTCRSA N* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAAAACAAA AGCTACGAGC AACAAGCTAA ATATTGTTTT CAGAAAATGG CAGCTTCTAA GCGACTAGTT GTCTCTTGCT TGTTCTTAGT GTTGTTGTTT GCTCAAGCCA ATTCACAAGG  TTTGAAAGTA GGTTTCTACA GCAAAACATG CCCACAAGTC GAGGGTATTG TTAGAAAGGT TGTGTTCGAT GCGATGAAGA AAGCACCTAC AGTTGGTGCT CCTTTGCTTA GAATGTTCTT  CCACGACTGC TTCGTTCGGG TATGTTTCTG TAATGAATCA TGACTTTTAT ATCTTTCTTA TGTCACGTTA GTTTCTTAAC AACGTGAGAT TTCTAGCAAA GCTAGAGTTG TATTCATCAA  TTGTCTATTT AATGAGTGAA TCGTATAATC AACAGGGATG TGACGGATCA ATCTTGCTAG ATAAACCGAA CAATCAAGGT GAGAAGAGTG CGGTTCCTAA CCTAAGCCTT CGAGGTTTTG  GTATCATAGA CGATTCCAAG GCGGCTCTAG AAAAAGTTTG TCCGGGAATT GTTTCTTGCT CTGATGTCTT GGCACTTATC GCTAGAGACG CAATGGTTGC AGTAAGTAAT CTTCACATAA  ATACAAAATT TCTACATACA CATAACACAT ATATAGAGCT CATGAATATG TTAATTTTTA GCTTGAAGGA CCATCGTGGG AAGTTGAAAC TGGAAGAAGA GACGGTAGGG TTTCTAATAT  CAACGAAGTC AACTTGCCAT CACCTTTTGA TAACATCACC AAGCTTATCA ACGATTTTCG CGCAAAGGGC CTCAACGAGA AGGATCTAGT CGTTCTCTCA GGTACGTAAG AGTGAATGAT  ATATATTAGT CTGAAAAATG AATAATTAAT TAGAAATCTG TTTTGGTAAT GGAAAATATA CATGTTTTTT CTAAAGGTGG GCACACTATT GGAATGGGAC ATTGTCCTCT AATGACAAAC  CGGCTTTACA ATTTCACCGG AAGAGGAGAC AGCGACCCGA GTTTGGACTC AGAGTACGCT GCTAAGCTCA GGCAGAAATG CAAGCCCACC GATACCACGA CGGCTCTAGA GATGGATCCG  GGGAGTTTCA AAACATTCGA CGTGAGCTAC TTCACGCTAG TGGCTAAGAG AAGAGGACTT TTCCAGTCGG ATGCTGCTCT ATTGGACAAC TCCAAGACTA GGGCTTATGT CTTGCAACAG  GCAAGAACTC ATGGGTCAAT GTTCTTTAGT GACTTTGGTG TCTCTATGGT GAAAATGGGT CGGATCGGAG TTCTTACGGG TCAGGCCGGG GAGATCCGTA AGACGTGTCG GTCTGCTAAT 
TAAGAGATAC AAAAATGAAA ATATCTCTCT GTGATTTTAT TATTACTGTT TGCTTCTTTG TGAGTTTCAT TATCATTAAA TGTGATTGTT TTCTTGGGAA T 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGCTT CTAAGCGACT AGTTGTCTCT TGCTTGTTCT TAGTGTTGTT GTTTGCTCAA GCCAATTCAC AAGGTTTGAA AGTAGGTTTC TACAGCAAAA CATGCCCACA AGTCGAGGGT  ATTGTTAGAA AGGTTGTGTT CGATGCGATG AAGAAAGCAC CTACAGTTGG TGCTCCTTTG CTTAGAATGT TCTTCCACGA CTGCTTCGTT CGGGGATGTG ACGGATCAAT CTTGCTAGAT  AAACCGAACA ATCAAGGTGA GAAGAGTGCG GTTCCTAACC TAAGCCTTCG AGGTTTTGGT ATCATAGACG ATTCCAAGGC GGCTCTAGAA AAAGTTTGTC CGGGAATTGT TTCTTGCTCT  GATGTCTTGG CACTTATCGC TAGAGACGCA ATGGTTGCAC TTGAAGGACC ATCGTGGGAA GTTGAAACTG GAAGAAGAGA CGGTAGGGTT TCTAATATCA ACGAAGTCAA CTTGCCATCA  CCTTTTGATA ACATCACCAA GCTTATCAAC GATTTTCGCG CAAAGGGCCT CAACGAGAAG GATCTAGTCG TTCTCTCAGG TGGGCACACT ATTGGAATGG GACATTGTCC TCTAATGACA  AACCGGCTTT ACAATTTCAC CGGAAGAGGA GACAGCGACC CGAGTTTGGA CTCAGAGTAC GCTGCTAAGC TCAGGCAGAA ATGCAAGCCC ACCGATACCA CGACGGCTCT AGAGATGGAT  CCGGGGAGTT TCAAAACATT CGACGTGAGC TACTTCACGC TAGTGGCTAA GAGAAGAGGA CTTTTCCAGT CGGATGCTGC TCTATTGGAC AACTCCAAGA CTAGGGCTTA TGTCTTGCAA  CAGGCAAGAA CTCATGGGTC AATGTTCTTT AGTGACTTTG GTGTCTCTAT GGTGAAAATG GGTCGGATCG GAGTTCTTAC GGGTCAGGCC GGGGAGATCC GTAAGACGTG TCGGTCTGCT 
AATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAAAACAAA AGCTACGAGC AACAAGCTAA ATATTGTTTT CAGAAAATGG CAGCTTCTAA GCGACTAGTT GTCTCTTGCT TGTTCTTAGT GTTGTTGTTT GCTCAAGCCA ATTCACAAGG  TTTGAAAGTA GGTTTCTACA GCAAAACATG CCCACAAGTC GAGGGTATTG TTAGAAAGGT TGTGTTCGAT GCGATGAAGA AAGCACCTAC AGTTGGTGCT CCTTTGCTTA GAATGTTCTT  CCACGACTGC TTCGTTCGGG GATGTGACGG ATCAATCTTG CTAGATAAAC CGAACAATCA AGGTGAGAAG AGTGCGGTTC CTAACCTAAG CCTTCGAGGT TTTGGTATCA TAGACGATTC  CAAGGCGGCT CTAGAAAAAG TTTGTCCGGG AATTGTTTCT TGCTCTGATG TCTTGGCACT TATCGCTAGA GACGCAATGG TTGCACTTGA AGGACCATCG TGGGAAGTTG AAACTGGAAG  AAGAGACGGT AGGGTTTCTA ATATCAACGA AGTCAACTTG CCATCACCTT TTGATAACAT CACCAAGCTT ATCAACGATT TTCGCGCAAA GGGCCTCAAC GAGAAGGATC TAGTCGTTCT  CTCAGGTGGG CACACTATTG GAATGGGACA TTGTCCTCTA ATGACAAACC GGCTTTACAA TTTCACCGGA AGAGGAGACA GCGACCCGAG TTTGGACTCA GAGTACGCTG CTAAGCTCAG  GCAGAAATGC AAGCCCACCG ATACCACGAC GGCTCTAGAG ATGGATCCGG GGAGTTTCAA AACATTCGAC GTGAGCTACT TCACGCTAGT GGCTAAGAGA AGAGGACTTT TCCAGTCGGA  TGCTGCTCTA TTGGACAACT CCAAGACTAG GGCTTATGTC TTGCAACAGG CAAGAACTCA TGGGTCAATG TTCTTTAGTG ACTTTGGTGT CTCTATGGTG AAAATGGGTC GGATCGGAGT  TCTTACGGGT CAGGCCGGGG AGATCCGTAA GACGTGTCGG TCTGCTAATT AAGAGATACA AAAATGAAAA TATCTCTCTG TGATTTTATT ATTACTGTTT GCTTCTTTGT GAGTTTCATT 
ATCATTAAAT GTGATTGTTT TCTTGGGAAT 

Retrieve as FASTA