Entry information : AhalPrx63 (Araha.5348s0015)
Entry ID 14844
Creation 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-01-09 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-01-10 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: AhalPrx63 (Araha.5348s0015)
Name (synonym) AhalPrx63 (Araha.5348s0015)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx073]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Arabidopsis
Organism Arabidopsis halleri    [TaxId: 81970 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value AhalPrx63
start..stop
S start..stop
AlyPrx58 637 0 1..314 16..329
AtPrx58 622 0 1..314 16..329
TsPrx58-1 601 0 1..314 16..330
BrPrx58-1Aa_other 597 0 1..314 16..330
Literature and cross-references AhalPrx63 (Araha.5348s0015)
Protein sequence: AhalPrx63 (Araha.5348s0015)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   314
PWM (Da):   %s   33846.85  
PI (pH):   %s   4.81
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MFGVLSNAQL SSDFYSTTCP NVTAIARGLI ERASRNDVRL TAKVMRLHFH DCFVNGCDGS VLLDAAPADG VEGEKEAFQN AGSLDGFEVI DDIKTALENV CPGVVSCADI LAIAAEISVA  LAGGPSWDVL LGRRDGRTAI RADAVAALPL GPDSLEILSS KFSVHNLDTT DLVALSGAHT FGRVQCGVIN NRLHNFSGNN GQSDPSIEPD FLQTLRRQCP QGGDLTARVN LDPTSPDSFD 
NDYFKNLQNN RGVIESDQIL FSSTGAPTVA LVNRFAESQN EFFRNFARSM IKMGNVRILT GSEGEIRRDC RRVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Complete sequence from genomic. Shorter PS: mutation or sequence error?
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTCTTTCTA TCTCTCACTT TTAGAAACAA AGAGAGACCA AAAATAGGTC TAAGCAAAAC TATTCCCTTA ATTTTACTCT CGATTTTTAT GTTTGGGGTT TTGAGTAACG CTCAGCTTAG  TTCTGATTTT TATTCCACGA CCTGCCCTAA CGTCACAGCC ATCGCTAGGG GTCTGATCGA GCGAGCTAGC CGTAACGACG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC ACTTTCACGA  CTGTTTCGTG AACGTAAGAT CTATTTCTAT TCACGCATTA CCATATGTTC GTGATTTTTT TTCGTTTACT TAGTAATGAA ACCAACCGTT TAATGCGCAT GTAATGATCT CATGATTCAT  CTTGAATCCA AACCAGCACA TGTGAAGGTT TATGAATGAA GCTAACTAGG ACATGTCTGA ACATGTTTGA TTAGGCTGCA TTTATTTTTG TTTTTAGGAT TAATGGATAT TAATAGTTCA  TACACGTTGT TTGACCAAAA AACGTTGTAC CTAGTCGTTG TAAAGGGTGA TGGATCATCA AACCGAAAGA AAATTAAGTT TAGACTTTGC ATTAGTTGAG TCATCATTTT TCAAGGAAAA  GTTTGATGTT TGATTATATA TGTTTGACCG TAGATTCTGT CATTAAGCTT GGTTTCATAT TGAGAAATTA AAGTAACGGT CTTTCTTAAC CCAAACTCTA AATATCCCCT TTTTTTTGTT  TCTTCTCTAA TCTTCAACAA AGAAAAGTAC ATAGACTTTG TCAACAAAAC ATAATTAGGT TTATTTGGTT AGTGGAATTA GGTTTCTTTT AAAATTTAGA TATGCATAAA ATATTGACGT  CATAGTGTGT GAACACAGGG GTGCGATGGT TCGGTACTAT TGGACGCTGC TCCTGCGGAT GGGGTAGAGG GTGAAAAGGA GGCTTTCCAA AACGCGGGCT CTCTTGACGG ATTTGAAGTG  ATCGATGATA TCAAAACCGC CCTCGAGAAT GTTTGTCCGG GAGTGGTCTC TTGTGCCGAT ATCCTCGCTA TCGCAGCTGA AATCTCTGTT GCACTGGTAA TAACATAATT CTTGAAATTT  TGGTGCTTTC AAATACCTTT TTTTAACCAA TGGAAACATA GTCATAACCA AAACTGTGTT ACCACAACAT GCATTCAAAT TTTTCTAATA CATGTTGAGA ATAAAATTTT ATGAAAACAT  TATATTTATA TACCGTAAAA TCAATACCCT AATGTTTTTA TTTATTTTAA ATCATTTAAG GCGGGAGGGC CGTCATGGGA CGTATTGCTA GGAAGAAGAG ATGGCCGGAC AGCAATCCGT  GCAGACGCAG TGGCTGCACT TCCACTAGGT CCTGATTCTC TAGAGATTCT TTCTTCCAAA TTCTCCGTAC ACAATCTTGA CACTACTGAT CTCGTCGCTT TATCTGGTAA TGTACTCTAG  AGTATAATTA AAGATCAAAT ACTTCAAAAG TACTTTGTTA CAATATATCT TAATGTACTG TGAATCTCAT AATAATATAT ATGTACATAT AGGTGCTCAT ACCTTCGGGA GGGTCCAGTG  TGGAGTGATA AACAATCGAC TGCACAACTT TAGTGGTAAC AACGGACAGT CGGACCCGAG TATCGAACCA GACTTCTTGC AAACGTTGCG ACGACAATGC CCGCAAGGTG GAGATCTCAC  AGCGAGGGTG AATCTTGATC CTACGAGCCC CGACTCATTT GATAACGACT ATTTCAAAAA CCTTCAAAAC AACCGCGGAG TGATTGAATC AGACCAAATC TTGTTTTCTT CAACAGGAGC  GCCTACTGTA GCTTTGGTGA ATCGTTTTGC TGAGAGCCAA AACGAGTTCT TTAGAAATTT TGCGAGATCA ATGATCAAGA TGGGAAATGT AAGGATTCTC ACAGGAAGTG AGGGAGAGAT  TCGTAGAGAC TGCAGACGGG TCAATTAATA AGTTTTGCAT GTTCAAATCA TCAAACGTAA AACTTCTTGT TATACACGAA ACAAGTGTTA TTTGTGCTTC TCCACAATTG TTTTTCTTCT 
TTTGATTTTG TTTTACTGTT AAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTTGGGG TTTTGAGTAA CGCTCAGCTT AGTTCTGATT TTTATTCCAC GACCTGCCCT AACGTCACAG CCATCGCTAG GGGTCTGATC GAGCGAGCTA GCCGTAACGA CGTCAGACTC  ACTGCTAAAG TCATGCGTCT TCACTTTCAC GACTGTTTCG TGAACGGGTG CGATGGTTCG GTACTATTGG ACGCTGCTCC TGCGGATGGG GTAGAGGGTG AAAAGGAGGC TTTCCAAAAC  GCGGGCTCTC TTGACGGATT TGAAGTGATC GATGATATCA AAACCGCCCT CGAGAATGTT TGTCCGGGAG TGGTCTCTTG TGCCGATATC CTCGCTATCG CAGCTGAAAT CTCTGTTGCA  CTGGCGGGAG GGCCGTCATG GGACGTATTG CTAGGAAGAA GAGATGGCCG GACAGCAATC CGTGCAGACG CAGTGGCTGC ACTTCCACTA GGTCCTGATT CTCTAGAGAT TCTTTCTTCC  AAATTCTCCG TACACAATCT TGACACTACT GATCTCGTCG CTTTATCTGG TGCTCATACC TTCGGGAGGG TCCAGTGTGG AGTGATAAAC AATCGACTGC ACAACTTTAG TGGTAACAAC  GGACAGTCGG ACCCGAGTAT CGAACCAGAC TTCTTGCAAA CGTTGCGACG ACAATGCCCG CAAGGTGGAG ATCTCACAGC GAGGGTGAAT CTTGATCCTA CGAGCCCCGA CTCATTTGAT  AACGACTATT TCAAAAACCT TCAAAACAAC CGCGGAGTGA TTGAATCAGA CCAAATCTTG TTTTCTTCAA CAGGAGCGCC TACTGTAGCT TTGGTGAATC GTTTTGCTGA GAGCCAAAAC 
GAGTTCTTTA GAAATTTTGC GAGATCAATG ATCAAGATGG GAAATGTAAG GATTCTCACA GGAAGTGAGG GAGAGATTCG TAGAGACTGC AGACGGGTCA ATTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTCTTTCTA TCTCTCACTT TTAGAAACAA AGAGAGACCA AAAATAGGTC TAAGCAAAAC TATTCCCTTA ATTTTACTCT CGATTTTTAT GTTTGGGGTT TTGAGTAACG CTCAGCTTAG  TTCTGATTTT TATTCCACGA CCTGCCCTAA CGTCACAGCC ATCGCTAGGG GTCTGATCGA GCGAGCTAGC CGTAACGACG TCAGACTCAC TGCTAAAGTC ATGCGTCTTC ACTTTCACGA  CTGTTTCGTG AACGGGTGCG ATGGTTCGGT ACTATTGGAC GCTGCTCCTG CGGATGGGGT AGAGGGTGAA AAGGAGGCTT TCCAAAACGC GGGCTCTCTT GACGGATTTG AAGTGATCGA  TGATATCAAA ACCGCCCTCG AGAATGTTTG TCCGGGAGTG GTCTCTTGTG CCGATATCCT CGCTATCGCA GCTGAAATCT CTGTTGCACT GGCGGGAGGG CCGTCATGGG ACGTATTGCT  AGGAAGAAGA GATGGCCGGA CAGCAATCCG TGCAGACGCA GTGGCTGCAC TTCCACTAGG TCCTGATTCT CTAGAGATTC TTTCTTCCAA ATTCTCCGTA CACAATCTTG ACACTACTGA  TCTCGTCGCT TTATCTGGTG CTCATACCTT CGGGAGGGTC CAGTGTGGAG TGATAAACAA TCGACTGCAC AACTTTAGTG GTAACAACGG ACAGTCGGAC CCGAGTATCG AACCAGACTT  CTTGCAAACG TTGCGACGAC AATGCCCGCA AGGTGGAGAT CTCACAGCGA GGGTGAATCT TGATCCTACG AGCCCCGACT CATTTGATAA CGACTATTTC AAAAACCTTC AAAACAACCG  CGGAGTGATT GAATCAGACC AAATCTTGTT TTCTTCAACA GGAGCGCCTA CTGTAGCTTT GGTGAATCGT TTTGCTGAGA GCCAAAACGA GTTCTTTAGA AATTTTGCGA GATCAATGAT  CAAGATGGGA AATGTAAGGA TTCTCACAGG AAGTGAGGGA GAGATTCGTA GAGACTGCAG ACGGGTCAAT TAATAAGTTT TGCATGTTCA AATCATCAAA CGTAAAACTT CTTGTTATAC 
ACGAAACAAG TGTTATTTGT GCTTCTCCAC AATTGTTTTT CTTCTTTTGA TTTTGTTTTA CTGTTAAG 

Retrieve as FASTA