Entry information : CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Entry ID 14855
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Name (synonym) CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx06
start..stop
S start..stop
CrubAPx06 877 0 1..430 1..430
AtAPx06 761 0 1..430 1..426
AlyAPx06 759 0 1..430 1..429
AhalAPx08 749 0 1..430 1..424
Literature and cross-references CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Protein sequence: CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   430
PWM (Da):   %s   46570.78 Transmb domain:   %s   o400-422i
PI (pH):   %s   8.28
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVSLSAASH LLCSSTRVSL SPAVASSSSS TSAPLVSSTS SPHSLSSLRS VASTSLFPHS SLVQKKYPNY GRSKGMVSPK CAASDAAQLK SAKEDIKVLL RTKFCHPILV RLGWHDAGTY  NKNIEEWPQR GGANGSLRFE PELKHAANAG LISALKLIQP IKDKYPNISY ADLFQLASAT AVEEAGGPDI PMKYGRVDVV APEQCPEEGR LPDAGPPSPA DHLRDVFYRM GLNDKEIVAL  SGAHTLGRAR PDRSGWGKPE TKYTKTGPGE PGGQSWTVKW LKFDNSYFKD IKEKRDEDLL VLPTDAALFE DPSFKNYAEK YAEDPAAFFK DYAEAHAKLS NIGAKFDPPE GIIIDNAPEK 
FVAAKYSNEK KELSDSMKKK IRAEYEAIGG SPDKPLPTNY FLNIIIAIGV LVLLSTLFGG GNNNSDFSGF * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTTT CTCTCTCCGC CGCGTCTCAC TTACTCTGTT CATCCACCAG AGTCTCTCTT TCTCCCGCCG TCGCCTCCTC CTCTTCGTCC ACCTCAGCTC CTCTCGTTTC CTCTACGTCG  TCGCCACATT CTCTCTCTTC TCTTCGAAGC GTCGCATCTA CCTCTCTGTT TCCTCATTCC TCCCTCGTTC AGGTACCGTA GTTTGATCGG AAATCATACT TTTTGGAAAC TCTGTTTTGA  ATTTCCTATA ATTTCTGTTT GATTGGTTAG AAAAAGTATC CGAATTATGG GCGGAGCAAG GGGATGGTCT CACCAAAATG TGCCGCTTCT GATGCAGCTC AATTGAAAAG CGCTAAAGAA  GATATCAAAG TTCTCCTCCG GACTAAGTTT TGCCATCCCA TTTTGGTGAA GTATCCTTCT CTCTTCTGAT CTTTTTTTAT TTGATGAGTT TTCAGCTGGA TCATGTTTCA AGTGACTTTT  TGTTAGTCTG CTGTTGTTTG CTTGTTACTA GCGAGAGACA TTGGAGATGA GAATTGAATT TGTGTGTCTC ATTTGCATTG TGCTTGACAA TAGTTGCATG TTTCATTGCA GGTTAGACTG  GGGTGGCACG ATGCTGGTAC GTACAACAAG AACATTGAGG AGTGGCCACA GAGAGGTGGA GCTAATGGAA GTCTTAGATT TGAGCCTGAG CTTAAACATG CTGCAAATGC TGGTACTGCT  TCCATCACAA TTCACATGCA CTGTGGCTCT AAAACCTTTT TTTTTTTTTT TTTTTGTCTC TTCATATTCT ACTTTTGACA TTTACAGGTC TCATTAGTGC GTTAAAGCTC ATTCAACCTA  TCAAAGACAA GTATCCTAAC ATCTCTTACG CCGACTTATT CCAGTTAGCT AGTGCCACTG CAGTAGAGGT CTTCCTTCTC TATTCCTTGG ATTGGCCTAG CAGGAAGGAA ACTATGTTGA  CCTTCAAACT TTTTTGATAA CTCTGGATTT TAACTTCAGG AGGCTGGTGG TCCTGATATC CCGATGAAAT ATGGGAGAGT TGATGTCGTA GCACCTGAGC AGTGTCCAGA AGAAGGAAGA  CTCCCTGGTT AACTAATCTT CCCATTGTCT GTTTCACGGC TTCCATGAGT TTGTTTCAGA TTTTCATTTG GACTATTGAA CTAATGAGAT TGAAATATGT TTACGTTTAG ATGCTGGACC  TCCTTCACCA GCTGATCATT TGAGAGATGT ATTTTACAGG ATGGGACTGA ATGACAAGGT GATTTCTGAA TTTTTTCCAT TTTCTGTATT CTTGTCAACG TGAATATTCT CATTGGTTGT  TTTATCAAGC AGGAAATAGT TGCCTTGTCT GGTGCACATA CTTTAGGAAG AGCCAGACCA GACCGTAGCG GTTGGGGAAA ACCTGAGACA AAGTACACGG TATAATAAAT GACAAAATGA  AACTTCATTA TATTGTTCTT GCAATTATAG CGTAGAGATG TTATGGAAAC GTTCAACATG GCAGAAAACT GGACCAGGAG AACCAGGAGG ACAGTCATGG ACAGTGAAAT GGCTTAAGTT  CGACAACTCT TACTTCAAGG TCTACCTCTC TAGTCTTAGT AACTTTGGAT TGGGACTTAA GAAGACTTTT CTAAGGAGAT GAGATATGTG AATACGATCC CCAGTTTCTT AATCAATGAC  TTCTATGAAT AGCAGGATAT CAAAGAAAAG AGGGACGAAG ATCTTCTGGT GTTACCCACT GATGCTGCAC TTTTTGAAGA TCCTTCTTTC AAGGTTAGCA AACAATGATG AGTAATAAGA  TGCCGCAGAA ATAGTAGTAG TTCGTTGTTA CTTAAGGTTT TAAAACAACT TCTATTTACA GAACTATGCA GAGAAGTATG CTGAAGATCC GGCTGCATTT TTCAAGGATT ACGCTGAAGC  TCACGCCAAG CTCAGCAATA TTGGGGCAAA ATTTGACCCT CCTGAGGTAC ATAAACAAAG AGAGAGAAAT TCTAATCTTA TGTTAGCGAA CATGAACCAT GCATTTACAT CCAGTTCAGT  GACTTAACTA TATAGTCTTA AATCTGTCCC TACGATACTA ATCAGGGCAT CATCATTGAC AACGCTCCGG AGAAGTTTGT AGCTGCTAAG TATTCCAATG AAAAGGTTTG TTCTTACTAC  TTAACCCAAA TGTGTTTGTA GCTTATTGTA ATATATACGC TTTACTTGTT TTTAACTTTT CCGGGGAATA TATATGCAGA AGGAGCTTTC GGACTCAATG AAGAAGAAGA TAAGAGCAGA  GTATGAAGCA ATAGGAGGAA GCCCAGATAA GCCACTACCA ACGAATTACT TCCTCAACAT CATAATTGCC ATTGGCGTTT TGGTCCTTTT GTCCACTCTC TTTGGTGGTG GTAATAACAA 
CTCCGATTTC TCTGGTTTCT AA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTTT CTCTCTCCGC CGCGTCTCAC TTACTCTGTT CATCCACCAG AGTCTCTCTT TCTCCCGCCG TCGCCTCCTC CTCTTCGTCC ACCTCAGCTC CTCTCGTTTC CTCTACGTCG  TCGCCACATT CTCTCTCTTC TCTTCGAAGC GTCGCATCTA CCTCTCTGTT TCCTCATTCC TCCCTCGTTC AGAAAAAGTA TCCGAATTAT GGGCGGAGCA AGGGGATGGT CTCACCAAAA  TGTGCCGCTT CTGATGCAGC TCAATTGAAA AGCGCTAAAG AAGATATCAA AGTTCTCCTC CGGACTAAGT TTTGCCATCC CATTTTGGTT AGACTGGGGT GGCACGATGC TGGTACGTAC  AACAAGAACA TTGAGGAGTG GCCACAGAGA GGTGGAGCTA ATGGAAGTCT TAGATTTGAG CCTGAGCTTA AACATGCTGC AAATGCTGGT CTCATTAGTG CGTTAAAGCT CATTCAACCT  ATCAAAGACA AGTATCCTAA CATCTCTTAC GCCGACTTAT TCCAGTTAGC TAGTGCCACT GCAGTAGAGG AGGCTGGTGG TCCTGATATC CCGATGAAAT ATGGGAGAGT TGATGTCGTA  GCACCTGAGC AGTGTCCAGA AGAAGGAAGA CTCCCTGATG CTGGACCTCC TTCACCAGCT GATCATTTGA GAGATGTATT TTACAGGATG GGACTGAATG ACAAGGAAAT AGTTGCCTTG  TCTGGTGCAC ATACTTTAGG AAGAGCCAGA CCAGACCGTA GCGGTTGGGG AAAACCTGAG ACAAAGTACA CGAAAACTGG ACCAGGAGAA CCAGGAGGAC AGTCATGGAC AGTGAAATGG  CTTAAGTTCG ACAACTCTTA CTTCAAGGAT ATCAAAGAAA AGAGGGACGA AGATCTTCTG GTGTTACCCA CTGATGCTGC ACTTTTTGAA GATCCTTCTT TCAAGAACTA TGCAGAGAAG  TATGCTGAAG ATCCGGCTGC ATTTTTCAAG GATTACGCTG AAGCTCACGC CAAGCTCAGC AATATTGGGG CAAAATTTGA CCCTCCTGAG GGCATCATCA TTGACAACGC TCCGGAGAAG  TTTGTAGCTG CTAAGTATTC CAATGAAAAG AAGGAGCTTT CGGACTCAAT GAAGAAGAAG ATAAGAGCAG AGTATGAAGC AATAGGAGGA AGCCCAGATA AGCCACTACC AACGAATTAC 
TTCCTCAACA TCATAATTGC CATTGGCGTT TTGGTCCTTT TGTCCACTCT CTTTGGTGGT GGTAATAACA ACTCCGATTT CTCTGGTTTC TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGACTTCAA ATAGATCCAA CTGTCAACGT ATCGCTAAGT TACTGACACC TGTCTTTTTA AAACTCACTC TTCCCGGCGC TTCTCTCCTC CGCCGTGACA ATAATGGCTG TTTCTCTCTC  CGCCGCGTCT CACTTACTCT GTTCATCCAC CAGAGTCTCT CTTTCTCCCG CCGTCGCCTC CTCCTCTTCG TCCACCTCAG CTCCTCTCGT TTCCTCTACG TCGTCGCCAC ATTCTCTCTC  TTCTCTTCGA AGCGTCGCAT CTACCTCTCT GTTTCCTCAT TCCTCCCTCG TTCAGAAAAA GTATCCGAAT TATGGGCGGA GCAAGGGGAT GGTCTCACCA AAATGTGCCG CTTCTGATGC  AGCTCAATTG AAAAGCGCTA AAGAAGATAT CAAAGTTCTC CTCCGGACTA AGTTTTGCCA TCCCATTTTG GTTAGACTGG GGTGGCACGA TGCTGGTACG TACAACAAGA ACATTGAGGA  GTGGCCACAG AGAGGTGGAG CTAATGGAAG TCTTAGATTT GAGCCTGAGC TTAAACATGC TGCAAATGCT GGTCTCATTA GTGCGTTAAA GCTCATTCAA CCTATCAAAG ACAAGTATCC  TAACATCTCT TACGCCGACT TATTCCAGTT AGCTAGTGCC ACTGCAGTAG AGGAGGCTGG TGGTCCTGAT ATCCCGATGA AATATGGGAG AGTTGATGTC GTAGCACCTG AGCAGTGTCC  AGAAGAAGGA AGACTCCCTG ATGCTGGACC TCCTTCACCA GCTGATCATT TGAGAGATGT ATTTTACAGG ATGGGACTGA ATGACAAGGA AATAGTTGCC TTGTCTGGTG CACATACTTT  AGGAAGAGCC AGACCAGACC GTAGCGGTTG GGGAAAACCT GAGACAAAGT ACACGAAAAC TGGACCAGGA GAACCAGGAG GACAGTCATG GACAGTGAAA TGGCTTAAGT TCGACAACTC  TTACTTCAAG GATATCAAAG AAAAGAGGGA CGAAGATCTT CTGGTGTTAC CCACTGATGC TGCACTTTTT GAAGATCCTT CTTTCAAGAA CTATGCAGAG AAGTATGCTG AAGATCCGGC  TGCATTTTTC AAGGATTACG CTGAAGCTCA CGCCAAGCTC AGCAATATTG GGGCAAAATT TGACCCTCCT GAGGGCATCA TCATTGACAA CGCTCCGGAG AAGTTTGTAG CTGCTAAGTA  TTCCAATGAA AAGAAGGAGC TTTCGGACTC AATGAAGAAG AAGATAAGAG CAGAGTATGA AGCAATAGGA GGAAGCCCAG ATAAGCCACT ACCAACGAAT TACTTCCTCA ACATCATAAT  TGCCATTGGC GTTTTGGTCC TTTTGTCCAC TCTCTTTGGT GGTGGTAATA ACAACTCCGA TTTCTCTGGT TTCTAATTGA AAGATGGATA TATTTTGATT ACTTGGTGTT CATATACTCT 
TTGCAACAAA CATCATTGGC ATAGTTATGC TTTGATAAAG TCACCTTTAA TAAGTGGTTT TAGATTTGAG ATCAGTGTGA G 

Retrieve as FASTA