Entry information : CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Entry ID 14855
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Name (synonym) CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx06
start..stop
S start..stop
CrubAPx06 877 0 1..430 1..430
AtAPx06 761 0 1..430 1..426
AlyAPx06 759 0 1..430 1..429
AhalAPx08 749 0 1..430 1..424
Literature and cross-references CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Protein sequence: CagraAPx06 (Cagra.0096s0083)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   430
PWM (Da):   %s   46570.78 Transmb domain:   %s   o400-422i
PI (pH):   %s   8.28
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVSLSAASH LLCSSTRVSL SPAVASSSSS TSAPLVSSTS SPHSLSSLRS VASTSLFPHS SLVQKKYPNY GRSKGMVSPK CAASDAAQLK SAKEDIKVLL RTKFCHPILV RLGWHDAGTY  NKNIEEWPQR GGANGSLRFE PELKHAANAG LISALKLIQP IKDKYPNISY ADLFQLASAT AVEEAGGPDI PMKYGRVDVV APEQCPEEGR LPDAGPPSPA DHLRDVFYRM GLNDKEIVAL  SGAHTLGRAR PDRSGWGKPE TKYTKTGPGE PGGQSWTVKW LKFDNSYFKD IKEKRDEDLL VLPTDAALFE DPSFKNYAEK YAEDPAAFFK DYAEAHAKLS NIGAKFDPPE GIIIDNAPEK 
FVAAKYSNEK KELSDSMKKK IRAEYEAIGG SPDKPLPTNY FLNIIIAIGV LVLLSTLFGG GNNNSDFSGF * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGACTTCAA ATAGATCCAA CTGTCAACGT ATCGCTAAGT TACTGACACC TGTCTTTTTA AAACTCACTC TTCCCGGCGC TTCTCTCCTC CGCCGTGACA ATAATGGCTG TTTCTCTCTC  CGCCGCGTCT CACTTACTCT GTTCATCCAC CAGAGTCTCT CTTTCTCCCG CCGTCGCCTC CTCCTCTTCG TCCACCTCAG CTCCTCTCGT TTCCTCTACG TCGTCGCCAC ATTCTCTCTC  TTCTCTTCGA AGCGTCGCAT CTACCTCTCT GTTTCCTCAT TCCTCCCTCG TTCAGGTACC GTAGTTTGAT CGGAAATCAT ACTTTTTGGA AACTCTGTTT TGAATTTCCT ATAATTTCTG  TTTGATTGGT TAGAAAAAGT ATCCGAATTA TGGGCGGAGC AAGGGGATGG TCTCACCAAA ATGTGCCGCT TCTGATGCAG CTCAATTGAA AAGCGCTAAA GAAGATATCA AAGTTCTCCT  CCGGACTAAG TTTTGCCATC CCATTTTGGT GAAGTATCCT TCTCTCTTCT GATCTTTTTT TATTTGATGA GTTTTCAGCT GGATCATGTT TCAAGTGACT TTTTGTTAGT CTGCTGTTGT  TTGCTTGTTA CTAGCGAGAG ACATTGGAGA TGAGAATTGA ATTTGTGTGT CTCATTTGCA TTGTGCTTGA CAATAGTTGC ATGTTTCATT GCAGGTTAGA CTGGGGTGGC ACGATGCTGG  TACGTACAAC AAGAACATTG AGGAGTGGCC ACAGAGAGGT GGAGCTAATG GAAGTCTTAG ATTTGAGCCT GAGCTTAAAC ATGCTGCAAA TGCTGGTACT GCTTCCATCA CAATTCACAT  GCACTGTGGC TCTAAAACCT TTTTTTTTTT TTTTTTTTGT CTCTTCATAT TCTACTTTTG ACATTTACAG GTCTCATTAG TGCGTTAAAG CTCATTCAAC CTATCAAAGA CAAGTATCCT  AACATCTCTT ACGCCGACTT ATTCCAGTTA GCTAGTGCCA CTGCAGTAGA GGTCTTCCTT CTCTATTCCT TGGATTGGCC TAGCAGGAAG GAAACTATGT TGACCTTCAA ACTTTTTTGA  TAACTCTGGA TTTTAACTTC AGGAGGCTGG TGGTCCTGAT ATCCCGATGA AATATGGGAG AGTTGATGTC GTAGCACCTG AGCAGTGTCC AGAAGAAGGA AGACTCCCTG GTTAACTAAT  CTTCCCATTG TCTGTTTCAC GGCTTCCATG AGTTTGTTTC AGATTTTCAT TTGGACTATT GAACTAATGA GATTGAAATA TGTTTACGTT TAGATGCTGG ACCTCCTTCA CCAGCTGATC  ATTTGAGAGA TGTATTTTAC AGGATGGGAC TGAATGACAA GGTGATTTCT GAATTTTTTC CATTTTCTGT ATTCTTGTCA ACGTGAATAT TCTCATTGGT TGTTTTATCA AGCAGGAAAT  AGTTGCCTTG TCTGGTGCAC ATACTTTAGG AAGAGCCAGA CCAGACCGTA GCGGTTGGGG AAAACCTGAG ACAAAGTACA CGGTATAATA AATGACAAAA TGAAACTTCA TTATATTGTT  CTTGCAATTA TAGCGTAGAG ATGTTATGGA AACGTTCAAC ATGGCAGAAA ACTGGACCAG GAGAACCAGG AGGACAGTCA TGGACAGTGA AATGGCTTAA GTTCGACAAC TCTTACTTCA  AGGTCTACCT CTCTAGTCTT AGTAACTTTG GATTGGGACT TAAGAAGACT TTTCTAAGGA GATGAGATAT GTGAATACGA TCCCCAGTTT CTTAATCAAT GACTTCTATG AATAGCAGGA  TATCAAAGAA AAGAGGGACG AAGATCTTCT GGTGTTACCC ACTGATGCTG CACTTTTTGA AGATCCTTCT TTCAAGGTTA GCAAACAATG ATGAGTAATA AGATGCCGCA GAAATAGTAG  TAGTTCGTTG TTACTTAAGG TTTTAAAACA ACTTCTATTT ACAGAACTAT GCAGAGAAGT ATGCTGAAGA TCCGGCTGCA TTTTTCAAGG ATTACGCTGA AGCTCACGCC AAGCTCAGCA  ATATTGGGGC AAAATTTGAC CCTCCTGAGG TACATAAACA AAGAGAGAGA AATTCTAATC TTATGTTAGC GAACATGAAC CATGCATTTA CATCCAGTTC AGTGACTTAA CTATATAGTC  TTAAATCTGT CCCTACGATA CTAATCAGGG CATCATCATT GACAACGCTC CGGAGAAGTT TGTAGCTGCT AAGTATTCCA ATGAAAAGGT TTGTTCTTAC TACTTAACCC AAATGTGTTT  GTAGCTTATT GTAATATATA CGCTTTACTT GTTTTTAACT TTTCCGGGGA ATATATATGC AGAAGGAGCT TTCGGACTCA ATGAAGAAGA AGATAAGAGC AGAGTATGAA GCAATAGGAG  GAAGCCCAGA TAAGCCACTA CCAACGAATT ACTTCCTCAA CATCATAATT GCCATTGGCG TTTTGGTCCT TTTGTCCACT CTCTTTGGTG GTGGTAATAA CAACTCCGAT TTCTCTGGTT  TCTAATTGAA AGATGGATAT ATTTTGATTA CTTGGTGTTC ATATACTCTT TGCAACAAAC ATCATTGGCA TAGTTATGCT TTGATAAAGT CACCTTTAAT AAGTGGTTTT AGATTTGAGA 
TCAGTGTGAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTTT CTCTCTCCGC CGCGTCTCAC TTACTCTGTT CATCCACCAG AGTCTCTCTT TCTCCCGCCG TCGCCTCCTC CTCTTCGTCC ACCTCAGCTC CTCTCGTTTC CTCTACGTCG  TCGCCACATT CTCTCTCTTC TCTTCGAAGC GTCGCATCTA CCTCTCTGTT TCCTCATTCC TCCCTCGTTC AGAAAAAGTA TCCGAATTAT GGGCGGAGCA AGGGGATGGT CTCACCAAAA  TGTGCCGCTT CTGATGCAGC TCAATTGAAA AGCGCTAAAG AAGATATCAA AGTTCTCCTC CGGACTAAGT TTTGCCATCC CATTTTGGTT AGACTGGGGT GGCACGATGC TGGTACGTAC  AACAAGAACA TTGAGGAGTG GCCACAGAGA GGTGGAGCTA ATGGAAGTCT TAGATTTGAG CCTGAGCTTA AACATGCTGC AAATGCTGGT CTCATTAGTG CGTTAAAGCT CATTCAACCT  ATCAAAGACA AGTATCCTAA CATCTCTTAC GCCGACTTAT TCCAGTTAGC TAGTGCCACT GCAGTAGAGG AGGCTGGTGG TCCTGATATC CCGATGAAAT ATGGGAGAGT TGATGTCGTA  GCACCTGAGC AGTGTCCAGA AGAAGGAAGA CTCCCTGATG CTGGACCTCC TTCACCAGCT GATCATTTGA GAGATGTATT TTACAGGATG GGACTGAATG ACAAGGAAAT AGTTGCCTTG  TCTGGTGCAC ATACTTTAGG AAGAGCCAGA CCAGACCGTA GCGGTTGGGG AAAACCTGAG ACAAAGTACA CGAAAACTGG ACCAGGAGAA CCAGGAGGAC AGTCATGGAC AGTGAAATGG  CTTAAGTTCG ACAACTCTTA CTTCAAGGAT ATCAAAGAAA AGAGGGACGA AGATCTTCTG GTGTTACCCA CTGATGCTGC ACTTTTTGAA GATCCTTCTT TCAAGAACTA TGCAGAGAAG  TATGCTGAAG ATCCGGCTGC ATTTTTCAAG GATTACGCTG AAGCTCACGC CAAGCTCAGC AATATTGGGG CAAAATTTGA CCCTCCTGAG GGCATCATCA TTGACAACGC TCCGGAGAAG  TTTGTAGCTG CTAAGTATTC CAATGAAAAG AAGGAGCTTT CGGACTCAAT GAAGAAGAAG ATAAGAGCAG AGTATGAAGC AATAGGAGGA AGCCCAGATA AGCCACTACC AACGAATTAC 
TTCCTCAACA TCATAATTGC CATTGGCGTT TTGGTCCTTT TGTCCACTCT CTTTGGTGGT GGTAATAACA ACTCCGATTT CTCTGGTTTC TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GTGACTTCAA ATAGATCCAA CTGTCAACGT ATCGCTAAGT TACTGACACC TGTCTTTTTA AAACTCACTC TTCCCGGCGC TTCTCTCCTC CGCCGTGACA ATAATGGCTG TTTCTCTCTC  CGCCGCGTCT CACTTACTCT GTTCATCCAC CAGAGTCTCT CTTTCTCCCG CCGTCGCCTC CTCCTCTTCG TCCACCTCAG CTCCTCTCGT TTCCTCTACG TCGTCGCCAC ATTCTCTCTC  TTCTCTTCGA AGCGTCGCAT CTACCTCTCT GTTTCCTCAT TCCTCCCTCG TTCAGAAAAA GTATCCGAAT TATGGGCGGA GCAAGGGGAT GGTCTCACCA AAATGTGCCG CTTCTGATGC  AGCTCAATTG AAAAGCGCTA AAGAAGATAT CAAAGTTCTC CTCCGGACTA AGTTTTGCCA TCCCATTTTG GTTAGACTGG GGTGGCACGA TGCTGGTACG TACAACAAGA ACATTGAGGA  GTGGCCACAG AGAGGTGGAG CTAATGGAAG TCTTAGATTT GAGCCTGAGC TTAAACATGC TGCAAATGCT GGTCTCATTA GTGCGTTAAA GCTCATTCAA CCTATCAAAG ACAAGTATCC  TAACATCTCT TACGCCGACT TATTCCAGTT AGCTAGTGCC ACTGCAGTAG AGGAGGCTGG TGGTCCTGAT ATCCCGATGA AATATGGGAG AGTTGATGTC GTAGCACCTG AGCAGTGTCC  AGAAGAAGGA AGACTCCCTG ATGCTGGACC TCCTTCACCA GCTGATCATT TGAGAGATGT ATTTTACAGG ATGGGACTGA ATGACAAGGA AATAGTTGCC TTGTCTGGTG CACATACTTT  AGGAAGAGCC AGACCAGACC GTAGCGGTTG GGGAAAACCT GAGACAAAGT ACACGAAAAC TGGACCAGGA GAACCAGGAG GACAGTCATG GACAGTGAAA TGGCTTAAGT TCGACAACTC  TTACTTCAAG GATATCAAAG AAAAGAGGGA CGAAGATCTT CTGGTGTTAC CCACTGATGC TGCACTTTTT GAAGATCCTT CTTTCAAGAA CTATGCAGAG AAGTATGCTG AAGATCCGGC  TGCATTTTTC AAGGATTACG CTGAAGCTCA CGCCAAGCTC AGCAATATTG GGGCAAAATT TGACCCTCCT GAGGGCATCA TCATTGACAA CGCTCCGGAG AAGTTTGTAG CTGCTAAGTA  TTCCAATGAA AAGAAGGAGC TTTCGGACTC AATGAAGAAG AAGATAAGAG CAGAGTATGA AGCAATAGGA GGAAGCCCAG ATAAGCCACT ACCAACGAAT TACTTCCTCA ACATCATAAT  TGCCATTGGC GTTTTGGTCC TTTTGTCCAC TCTCTTTGGT GGTGGTAATA ACAACTCCGA TTTCTCTGGT TTCTAATTGA AAGATGGATA TATTTTGATT ACTTGGTGTT CATATACTCT 
TTGCAACAAA CATCATTGGC ATAGTTATGC TTTGATAAAG TCACCTTTAA TAAGTGGTTT TAGATTTGAG ATCAGTGTGA G 

Retrieve as FASTA