Entry information : CagraPrx11 (Cagra.5557s0003)
Entry ID 14857
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx11 (Cagra.5557s0003)
Name (synonym) CagraPrx11 (Cagra.5557s0003)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx040]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx11
start..stop
S start..stop
CrubPrx39 549 0 1..312 1..350
AtPrx23 507 0 1..312 1..349
AhalPrx38 506 0 1..312 1..349
AtPrx22 505 0 1..312 1..349
Literature and cross-references CagraPrx11 (Cagra.5557s0003)
Protein sequence: CagraPrx11 (Cagra.5557s0003)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   312 (283)
PWM (Da):   %s   34625.3 (31616.9)  
PI (pH):   %s   7.58 (7.66) Peptide Signal:   %s   cut: 30 range:30-312
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGFSSSFSCS AMGALILGCL LFQASNSNAQ LWPDFYFRSC RPVFDIIGNA IVDELQTDPR IAASLLRLHF HDCFVRGCDA SILLDNSTSF RTEKDAAPNA NSIRGLDVVD RMKAALEIAC  PKTVSCADIL TIASQISVLL VFNYTYLHGY LRMKLIETCG HTFGKAQCQF VTPRLYNFNG TNRPDPTLNP TYLAELRRLC PQNGNGTVLV NFDPVTPTAF DSQYYTNLRN GKGLIQSDQE 
LFSTPGADTI PLVNQYSSST FLFFRAFVDA MIRMGNLRPL TGNQGEIRKN CRVVNSRRIR DVENDDGVVS SI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Exon 3 is missing due to N in the sequence.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CGTCTTCATT TTCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGTTTCAAG CATCAAACTC TAATGCTCAG CTGTGGCCTG ACTTCTACTT TAGGAGTTGC  CGACCTGTTT TCGATATCAT TGGGAATGCC ATCGTCGATG AACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGT AAAGACTCAC  TTATCTTTTA CTAATTAAAG AAATCCATAG CGTCATCCAC TTTTACATCT ATACGTATAG AAAATACCCT ACAAGGCAAT TTTGAATTAA TAAATAATGT CTTCATGTTA TATGTAATAT  CTATATATGG CTTTTGTAGG GTTGTGATGC ATCAATCTTG CTTGACAATT CCACATCATT CCGGACCGAG AAAGATGCTG CTCCGAATGC AAATTCGATT CGAGGGCTCG ATGTCGTAGA  TAGAATGAAA GCAGCCCTTG AGATAGCTTG CCCAAAAACG GTGTCTTGTG CGGATATTCT CACCATAGCC TCTCAAATAT CAGTGCTTTT GGTATTTAAC TATACTTACC TACATGGCTA  TCTCAGGATG AAACTAATCG AAACATGTTA TATGAACAAG Annnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nAACTCTATC TACTTTGAAT TATAAAATGA CTTGGTAAAA CGAAAAGAAA CATGACTCAT CTAATAAAAA  CATACAATAT GTATCAAATC CTTAATGTTT TGTCAAAATG GTAGGTGGTC ACACATTTGG AAAAGCACAA TGCCAATTCG TGACACCTCG TCTTTACAAC TTCAACGGAA CCAACAGACC  AGACCCAACT CTAAACCCAA CTTACCTCGC CGAACTCCGT CGGTTATGCC CACAAAACGG AAACGGCACA GTTCTGGTCA ACTTCGATCC CGTGACTCCA ACCGCTTTCG ATAGTCAATA  CTACACCAAT CTTCGTAACG GGAAAGGTCT GATTCAGAGT GACCAAGAGC TCTTCTCGAC TCCAGGAGCC GACACTATTC CACTAGTAAA CCAATACAGC AGCAGCACGT TCTTGTTCTT  CCGAGCATTC GTTGATGCAA TGATCAGGAT GGGTAATCTT CGACCATTGA CTGGAAATCA AGGCGAGATA AGAAAGAACT GTAGGGTTGT GAATTCACGA AGAATTAGGG ACGTGGAGAA 
CGACGATGGT GTTGTGAGTT CTATCTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CGTCTTCATT TTCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGTTTCAAG CATCAAACTC TAATGCTCAG CTGTGGCCTG ACTTCTACTT TAGGAGTTGC  CGACCTGTTT TCGATATCAT TGGGAATGCC ATCGTCGATG AACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGG TTGTGATGCA  TCAATCTTGC TTGACAATTC CACATCATTC CGGACCGAGA AAGATGCTGC TCCGAATGCA AATTCGATTC GAGGGCTCGA TGTCGTAGAT AGAATGAAAG CAGCCCTTGA GATAGCTTGC  CCAAAAACGG TGTCTTGTGC GGATATTCTC ACCATAGCCT CTCAAATATC AGTGCTTTTG GTATTTAACT ATACTTACCT ACATGGCTAT CTCAGGATGA AACTAATCGA AACATGTGGT  CACACATTTG GAAAAGCACA ATGCCAATTC GTGACACCTC GTCTTTACAA CTTCAACGGA ACCAACAGAC CAGACCCAAC TCTAAACCCA ACTTACCTCG CCGAACTCCG TCGGTTATGC  CCACAAAACG GAAACGGCAC AGTTCTGGTC AACTTCGATC CCGTGACTCC AACCGCTTTC GATAGTCAAT ACTACACCAA TCTTCGTAAC GGGAAAGGTC TGATTCAGAG TGACCAAGAG  CTCTTCTCGA CTCCAGGAGC CGACACTATT CCACTAGTAA ACCAATACAG CAGCAGCACG TTCTTGTTCT TCCGAGCATT CGTTGATGCA ATGATCAGGA TGGGTAATCT TCGACCATTG 
ACTGGAAATC AAGGCGAGAT AAGAAAGAAC TGTAGGGTTG TGAATTCACG AAGAATTAGG GACGTGGAGA ACGACGATGG TGTTGTGAGT TCTATCTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGGTTTT CGTCTTCATT TTCTTGCAGT GCTATGGGAG CCCTAATATT GGGTTGCCTT CTGTTTCAAG CATCAAACTC TAATGCTCAG CTGTGGCCTG ACTTCTACTT TAGGAGTTGC  CGACCTGTTT TCGATATCAT TGGGAATGCC ATCGTCGATG AACTGCAGAC TGATCCTCGT ATTGCCGCGA GCCTCCTTCG TCTTCACTTC CATGACTGCT TTGTTCGGGG TTGTGATGCA  TCAATCTTGC TTGACAATTC CACATCATTC CGGACCGAGA AAGATGCTGC TCCGAATGCA AATTCGATTC GAGGGCTCGA TGTCGTAGAT AGAATGAAAG CAGCCCTTGA GATAGCTTGC  CCAAAAACGG TGTCTTGTGC GGATATTCTC ACCATAGCCT CTCAAATATC AGTGCTTTTG GTATTTAACT ATACTTACCT ACATGGCTAT CTCAGGATGA AACTAATCGA AACATGTGGT  CACACATTTG GAAAAGCACA ATGCCAATTC GTGACACCTC GTCTTTACAA CTTCAACGGA ACCAACAGAC CAGACCCAAC TCTAAACCCA ACTTACCTCG CCGAACTCCG TCGGTTATGC  CCACAAAACG GAAACGGCAC AGTTCTGGTC AACTTCGATC CCGTGACTCC AACCGCTTTC GATAGTCAAT ACTACACCAA TCTTCGTAAC GGGAAAGGTC TGATTCAGAG TGACCAAGAG  CTCTTCTCGA CTCCAGGAGC CGACACTATT CCACTAGTAA ACCAATACAG CAGCAGCACG TTCTTGTTCT TCCGAGCATT CGTTGATGCA ATGATCAGGA TGGGTAATCT TCGACCATTG 
ACTGGAAATC AAGGCGAGAT AAGAAAGAAC TGTAGGGTTG TGAATTCACG AAGAATTAGG GACGTGGAGA ACGACGATGG TGTTGTGAGT TCTATCTGA 

Retrieve as FASTA