Entry information : CagraPrx12Cagra.2481s0001
Entry ID 14858
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx12Cagra.2481s0001
Name CagraPrx12Cagra.2481s0001
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx021]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx12
start..stop
S start..stop
CrubPrx69 730 0 1..356 1..356
BstrPrx66 672 0 1..356 1..350
AhalPrx15 667 0 1..356 1..350
AlyPrx10 667 0 1..356 1..350
Literature and cross-references CagraPrx12Cagra.2481s0001
Protein sequence: CagraPrx12Cagra.2481s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   356
PWM (Da):   %s   38868.24  
PI (pH):   %s   6.5
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MDYTKISYWS ISYLAILTLF FKDFVSSFPS GYNNGYNNHG NYNKGHGYGL TSDLNYRFYD RSCPRLQMIV KSGVWRAFKD DSRIAASLLR LHFHDCFVNG CDGSILLNDS EDFKGEKNAR  PNRNSVRGFE VIEDIKSDIE SSCPLTVSCA DIVALAAREA VVLTGGPFWS VPLGRRDSLT ASEQAANTNL PSPFEPLENI TAKFVNLGLD LKDVVVLSGA HTIGFAQCFV FKHRLFNFKG 
SGQPDPNLAA SSALLSTLKD TCPNVDSSNS KLAALDAASS VKFDNAYYVN LMNNIGLLDS DQTLMTDPTA AAMVKSYSEN PYLFSRDFAV SMVKMGNVGV LTGSDGVIRA KCGFPG* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTACA CAAAGATTTC GTATTGGTCT ATATCTTACC TAGCAATCTT AACTCTTTTC TTCAAAGACT TTGTCTCCTC GTTTCCTTCG GGATATAACA ATGGTTATAA CAACCATGGT  AATTATAACA AAGGTCACGG ATACGGACTA ACTAGCGATC TCAACTATCG ATTCTACGAT CGGTCTTGTC CTCGTCTTCA GATGATTGTT AAGTCCGGAG TTTGGAGAGC TTTTAAAGAT  GATTCTAGAA TCGCTGCGTC TCTTCTTCGA CTCCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAATGTA AGTAGTTTTG TTTCTTTACG TGACATTTCT TTTTCTTTTT TTTTAATGTT TTACGCATGC  ATATATAGTA GTGGATTATA TATCACTATT CACACATATA TACTCTTTAT ATATATATAA CTCGTGTATG TATTATAAAA ACTTTTTTTT TTGGTAGAAA AACTAATCAA GCCATTTTAG  TGAAAACTAT ACTACTCAGC TACTAAAATT TTACAAAATT TTTACATCAA ACACAAAAAG AGCTCTTTAG GCATACATAC ATACACATCA GCATTTTTTT TTTTTTTTGT AATCTGTTTT  AGTATAGGAA AGATACATAT TAGAGTAGAA GCCACTAGTT AGACTAAGGC TTTGTATATG TACATAAATG TATCAAACAT ATTTATCTCT ATATATGTAT ATAACTAGGA AAAAGGATGT  AATTAAATTG TATGTTGTAG GGATGTGATG GATCTATACT TCTGAATGAT TCCGAGGACT TCAAAGGAGA GAAGAACGCT CGACCAAACC GAAACTCAGT CCGTGGCTTC GAAGTCATTG  AAGACATTAA ATCTGACATC GAAAGTTCTT GTCCCTTAAC TGTTTCATGC GCAGACATAG TTGCCCTTGC GGCCAGAGAA GCCGTCGTCC TCGTGCGTGT GATCTTGAAA CCCCTAGCTA  ATCATTAATC TGAATTGTAA CAATATATTG TAATGAAATA ACCAAAACAT TATCTATTGG TTCATTACTT ATGATTTGGT TATATGCCAT GCAGACCGGA GGGCCGTTTT GGTCGGTGCC  TTTGGGGCGA AGGGACTCTT TAACGGCGAG TGAGCAAGCG GCAAATACAA ATCTGCCATC TCCGTTTGAG CCATTGGAGA ATATAACGGC CAAGTTTGTA AACCTTGGAC TCGATCTCAA  GGATGTTGTT GTCCTCTCAG GTTTGGTTAA TTCTTTGATT TTGGTTTTAA TTAAATTACC CAAAATATTA CTTATTCTAA AGCAAAAAAT AAAAGTTAGA ATATATTTTA CATGATTAAT  TTGAACTTTT TGATCCAAAA AGAGAAAAAA AAAAGATTAA TTTGAACTTA TGTTATCTAT GACTATTCGT GTATGTAGGA GCACATACTA TAGGATTTGC TCAATGTTTC GTGTTCAAGC  ACAGGCTCTT CAACTTCAAG GGCTCGGGCC AGCCTGATCC AAACCTAGCC GCTTCCTCGG CTCTTCTCTC TACACTAAAG GACACGTGTC CTAACGTGGA CTCTTCCAAC TCTAAGCTCG  CGGCTCTTGA CGCAGCTAGC TCGGTCAAGT TTGACAATGC TTACTACGTG AATTTGATGA ATAACATAGG ACTGTTGGAT TCCGACCAAA CCCTAATGAC GGATCCTACA GCCGCCGCCA  TGGTGAAATC GTACAGCGAG AATCCGTACC TGTTCTCGAG GGACTTTGCA GTTTCAATGG TTAAAATGGG GAATGTCGGT GTTCTGACCG GAAGTGATGG AGTGATTAGA GCAAAATGTG  GATTTCCAGG TTAAGTTATA TAGCCTTGTT TGAACGTACG TAAAACACTT AATATCATCA ATCTATAACA TATCTAGAAA TATTCTAGCA TTTAAATATA AATCATATAG ACCAAAGTCC 
ATGAATAAAA TATATATGTT TATATATAAT GGTGTAAAAT CAGCCTTATG TATCTACATA TCGATCACAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTACA CAAAGATTTC GTATTGGTCT ATATCTTACC TAGCAATCTT AACTCTTTTC TTCAAAGACT TTGTCTCCTC GTTTCCTTCG GGATATAACA ATGGTTATAA CAACCATGGT  AATTATAACA AAGGTCACGG ATACGGACTA ACTAGCGATC TCAACTATCG ATTCTACGAT CGGTCTTGTC CTCGTCTTCA GATGATTGTT AAGTCCGGAG TTTGGAGAGC TTTTAAAGAT  GATTCTAGAA TCGCTGCGTC TCTTCTTCGA CTCCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAATGGA TGTGATGGAT CTATACTTCT GAATGATTCC GAGGACTTCA AAGGAGAGAA GAACGCTCGA  CCAAACCGAA ACTCAGTCCG TGGCTTCGAA GTCATTGAAG ACATTAAATC TGACATCGAA AGTTCTTGTC CCTTAACTGT TTCATGCGCA GACATAGTTG CCCTTGCGGC CAGAGAAGCC  GTCGTCCTCA CCGGAGGGCC GTTTTGGTCG GTGCCTTTGG GGCGAAGGGA CTCTTTAACG GCGAGTGAGC AAGCGGCAAA TACAAATCTG CCATCTCCGT TTGAGCCATT GGAGAATATA  ACGGCCAAGT TTGTAAACCT TGGACTCGAT CTCAAGGATG TTGTTGTCCT CTCAGGAGCA CATACTATAG GATTTGCTCA ATGTTTCGTG TTCAAGCACA GGCTCTTCAA CTTCAAGGGC  TCGGGCCAGC CTGATCCAAA CCTAGCCGCT TCCTCGGCTC TTCTCTCTAC ACTAAAGGAC ACGTGTCCTA ACGTGGACTC TTCCAACTCT AAGCTCGCGG CTCTTGACGC AGCTAGCTCG  GTCAAGTTTG ACAATGCTTA CTACGTGAAT TTGATGAATA ACATAGGACT GTTGGATTCC GACCAAACCC TAATGACGGA TCCTACAGCC GCCGCCATGG TGAAATCGTA CAGCGAGAAT 
CCGTACCTGT TCTCGAGGGA CTTTGCAGTT TCAATGGTTA AAATGGGGAA TGTCGGTGTT CTGACCGGAA GTGATGGAGT GATTAGAGCA AAATGTGGAT TTCCAGGTTA A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGACTACA CAAAGATTTC GTATTGGTCT ATATCTTACC TAGCAATCTT AACTCTTTTC TTCAAAGACT TTGTCTCCTC GTTTCCTTCG GGATATAACA ATGGTTATAA CAACCATGGT  AATTATAACA AAGGTCACGG ATACGGACTA ACTAGCGATC TCAACTATCG ATTCTACGAT CGGTCTTGTC CTCGTCTTCA GATGATTGTT AAGTCCGGAG TTTGGAGAGC TTTTAAAGAT  GATTCTAGAA TCGCTGCGTC TCTTCTTCGA CTCCATTTCC ATGATTGTTT TGTCAATGGA TGTGATGGAT CTATACTTCT GAATGATTCC GAGGACTTCA AAGGAGAGAA GAACGCTCGA  CCAAACCGAA ACTCAGTCCG TGGCTTCGAA GTCATTGAAG ACATTAAATC TGACATCGAA AGTTCTTGTC CCTTAACTGT TTCATGCGCA GACATAGTTG CCCTTGCGGC CAGAGAAGCC  GTCGTCCTCA CCGGAGGGCC GTTTTGGTCG GTGCCTTTGG GGCGAAGGGA CTCTTTAACG GCGAGTGAGC AAGCGGCAAA TACAAATCTG CCATCTCCGT TTGAGCCATT GGAGAATATA  ACGGCCAAGT TTGTAAACCT TGGACTCGAT CTCAAGGATG TTGTTGTCCT CTCAGGAGCA CATACTATAG GATTTGCTCA ATGTTTCGTG TTCAAGCACA GGCTCTTCAA CTTCAAGGGC  TCGGGCCAGC CTGATCCAAA CCTAGCCGCT TCCTCGGCTC TTCTCTCTAC ACTAAAGGAC ACGTGTCCTA ACGTGGACTC TTCCAACTCT AAGCTCGCGG CTCTTGACGC AGCTAGCTCG  GTCAAGTTTG ACAATGCTTA CTACGTGAAT TTGATGAATA ACATAGGACT GTTGGATTCC GACCAAACCC TAATGACGGA TCCTACAGCC GCCGCCATGG TGAAATCGTA CAGCGAGAAT  CCGTACCTGT TCTCGAGGGA CTTTGCAGTT TCAATGGTTA AAATGGGGAA TGTCGGTGTT CTGACCGGAA GTGATGGAGT GATTAGAGCA AAATGTGGAT TTCCAGGTTA AGTTATATAG  CCTTGTTTGA ACGTACGTAA AACACTTAAT ATCATCAATC TATAACATAT CTAGAAATAT TCTAGCATTT AAATATAAAT CATATAGACC AAAGTCCATG AATAAAATAT ATATGTTTAT 
ATATAATGGT GTAAAATCAG CCTTATGTAT CTACATATCG ATCACAG 

Retrieve as FASTA