Entry information : CagraAPx04 (Cagra.2236s0014)
Entry ID 14861
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx04 (Cagra.2236s0014)
Name (synonym) CagraAPx04 (Cagra.2236s0014)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx006]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx04
start..stop
S start..stop
CrubAPx04 577 0 44..322 1..279
AhalAPx03 553 0 44..322 1..279
AtAPx04 550 0 44..322 1..279
AlyAPx04 543 0 44..322 1..279
Literature and cross-references CagraAPx04 (Cagra.2236s0014)
Protein sequence: CagraAPx04 (Cagra.2236s0014)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   322
PWM (Da):   %s   35972.54 Transmb domain:   %s   o293-315i
PI (pH):   %s   8.73
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKHTSPLDS SSSYLYIHSS ESFFNLIHRF FELFLLALFK SLTMAVNVDA DYLKEIEKAR RDLRALISSR NCAPIMLRLA WHDAGTYDAK KKTGGANGSI RFKEELNRPH NKGLEKAVAF  CEEVKAKHPR VTYADLYQLA GVVAVEVTGG PAIPFTPGRK DADSPDEGEL PNPNEDASHL RNLFSRMGLS DRDIVALSGG HTLGRAHKER SDFEGPWTQE PLKFDNSYFV ELQKGETPGL 
LQLKTDRALV NDPKFHAFVK LYAKDEDMFF KAYAISHKKL SELGFNPPRR ISSAVTQQTL GIAVAAAVVI FTICYEASRR GK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCAAAAGGGT TCTCCCAAAA CTATTAACTT TAATACTTTG CTTTCTCCAG ATGACAAAAC ATACTTCTCC CCTAGACTCT TCTTCATCTT ATTTATATAT CCATTCCTCT GAGTCATTCT  TCAATCTTAT TCATCGATTT TTTGAGTTAT TTCTGCTTGC TCTTTTCAAA AGTCTGACAA TGGCAGTGAA CGTTGATGCA GATTACCTCA AAGAAATAGA AAAGGCTCGT AGAGACCTTC  GAGCTCTCAT CTCTTCCAGA AATTGTGCTC CCATTATGCT CCGTCTTGCG TAAGCTCTTT CTTTCTGTAC CATTCCCCGT TTCTCATTTT TTGTCTGGAT GTTTCTAACT GCATATTCTT  GTATCCATAT ATAGATGGCA TGATGCAGGA ACCTATGATG CCAAAAAGAA AACCGGAGGT GCCAATGGAT CAATCAGGTT CAAGGAAGAG CTAAACCGTC CACACAACAA AGGTTTGGAG  AAAGCAGTCG CCTTCTGCGG TGAGTTTATG CTAAAACCTT TAATCCATCA CTACTCCACT CTTAAGGACC TGACAATAAA ACGGTAGCTG ATTCCTTTGA TTTTTGTTGA TTTCAGAGGA  AGTCAAGGCT AAGCATCCAC GAGTCACTTA CGCAGACCTT TATCAGGTAA ACATTGCCAT ATAGCATCTC TAAGCCATTA AACCCATAAA AACTTCCTGC CCCCTTGATG GTTAGCTTGA  CAGATTATTT GATTTCATTT CAGCTCGCTG GAGTTGTTGC AGTGGAGGTT ACTGGTGGCC CTGCAATCCC ATTTACTCCA GGCCGTAAGG TAGTTACACT TACTGCTAAA GGGTATGCGC  TAAATCATAA TTGCCAAGTG AGTTTACTGA ATTTGAGACA TATGATATCA GGATGCTGAT TCCCCAGACG AAGGGGAGCT TCCAAATCCA AATGAAGGTT ACCCTCGCAG CTTGTAGGTC  TTGCAACGGG ATTCTATTTT ACAAACTGAC TAAACTGATT TTTGGATTAT TGCAGATGCC TCACATTTAA GAAATCTCTT CTCTCGTATG GGGCTATCGG ATAGAGACAT CGTAGCTCTC  TCTGGAGGCC ACACTTTGGT ACTAATTGCT AACTCTCCTT CAATATATCC GCTACTAAAA ATACTCCAAT GAACCAACTT GGTTGCTACT TTTGTATATA GGGCCGTGCA CATAAGGAGA  GATCCGATTT TGAAGGTCCT TGGACACAAG AACCTCTCAA GTTTGATAAT TCATATTTCG TGTAAGCCAA TAACAAAATC ACACAGAGTT AAAGTAAGAG AGAGTAAAAG TTCTGAAACT  TACGCTTGTC TGCTGATTGG TTTTTCAGAG AACTTCAAAA AGGGGAGACT CCAGGATTGC TACAACTGAA AACGGACAGG GCTCTAGTTA ATGATCCCAA GTTCCACGCT TTTGTTAAGC  TGTATGCAAA GGTAATTAGA TTTTACTACG ATTATAAGAA ACTTTTAGTT TGGATGATTC GCTGGTGTTA TCAACATTAA AAAAAGTATT ATGATGTGTA GGACGAGGAT ATGTTCTTCA  AAGCATATGC AATTTCTCAC AAGAAACTCT CAGAACTAGG ATTTAATCCG CCAAGAAGAA TTTCTTCAGC AGTGACACAG CAGACGCTTG GAATCGCTGT TGCTGCAGCT GTGGTGATCT 
TTACCATATG CTACGAAGCA AGCAGAAGAG GCAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACAAAAC ATACTTCTCC CCTAGACTCT TCTTCATCTT ATTTATATAT CCATTCCTCT GAGTCATTCT TCAATCTTAT TCATCGATTT TTTGAGTTAT TTCTGCTTGC TCTTTTCAAA  AGTCTGACAA TGGCAGTGAA CGTTGATGCA GATTACCTCA AAGAAATAGA AAAGGCTCGT AGAGACCTTC GAGCTCTCAT CTCTTCCAGA AATTGTGCTC CCATTATGCT CCGTCTTGCA  TGGCATGATG CAGGAACCTA TGATGCCAAA AAGAAAACCG GAGGTGCCAA TGGATCAATC AGGTTCAAGG AAGAGCTAAA CCGTCCACAC AACAAAGGTT TGGAGAAAGC AGTCGCCTTC  TGCGAGGAAG TCAAGGCTAA GCATCCACGA GTCACTTACG CAGACCTTTA TCAGCTCGCT GGAGTTGTTG CAGTGGAGGT TACTGGTGGC CCTGCAATCC CATTTACTCC AGGCCGTAAG  GATGCTGATT CCCCAGACGA AGGGGAGCTT CCAAATCCAA ATGAAGATGC CTCACATTTA AGAAATCTCT TCTCTCGTAT GGGGCTATCG GATAGAGACA TCGTAGCTCT CTCTGGAGGC  CACACTTTGG GCCGTGCACA TAAGGAGAGA TCCGATTTTG AAGGTCCTTG GACACAAGAA CCTCTCAAGT TTGATAATTC ATATTTCGTA GAACTTCAAA AAGGGGAGAC TCCAGGATTG  CTACAACTGA AAACGGACAG GGCTCTAGTT AATGATCCCA AGTTCCACGC TTTTGTTAAG CTGTATGCAA AGGACGAGGA TATGTTCTTC AAAGCATATG CAATTTCTCA CAAGAAACTC  TCAGAACTAG GATTTAATCC GCCAAGAAGA ATTTCTTCAG CAGTGACACA GCAGACGCTT GGAATCGCTG TTGCTGCAGC TGTGGTGATC TTTACCATAT GCTACGAAGC AAGCAGAAGA 
GGCAAGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GCAAAAGGGT TCTCCCAAAA CTATTAACTT TAATACTTTG CTTTCTCCAG ATGACAAAAC ATACTTCTCC CCTAGACTCT TCTTCATCTT ATTTATATAT CCATTCCTCT GAGTCATTCT  TCAATCTTAT TCATCGATTT TTTGAGTTAT TTCTGCTTGC TCTTTTCAAA AGTCTGACAA TGGCAGTGAA CGTTGATGCA GATTACCTCA AAGAAATAGA AAAGGCTCGT AGAGACCTTC  GAGCTCTCAT CTCTTCCAGA AATTGTGCTC CCATTATGCT CCGTCTTGCA TGGCATGATG CAGGAACCTA TGATGCCAAA AAGAAAACCG GAGGTGCCAA TGGATCAATC AGGTTCAAGG  AAGAGCTAAA CCGTCCACAC AACAAAGGTT TGGAGAAAGC AGTCGCCTTC TGCGAGGAAG TCAAGGCTAA GCATCCACGA GTCACTTACG CAGACCTTTA TCAGCTCGCT GGAGTTGTTG  CAGTGGAGGT TACTGGTGGC CCTGCAATCC CATTTACTCC AGGCCGTAAG GATGCTGATT CCCCAGACGA AGGGGAGCTT CCAAATCCAA ATGAAGATGC CTCACATTTA AGAAATCTCT  TCTCTCGTAT GGGGCTATCG GATAGAGACA TCGTAGCTCT CTCTGGAGGC CACACTTTGG GCCGTGCACA TAAGGAGAGA TCCGATTTTG AAGGTCCTTG GACACAAGAA CCTCTCAAGT  TTGATAATTC ATATTTCGTA GAACTTCAAA AAGGGGAGAC TCCAGGATTG CTACAACTGA AAACGGACAG GGCTCTAGTT AATGATCCCA AGTTCCACGC TTTTGTTAAG CTGTATGCAA  AGGACGAGGA TATGTTCTTC AAAGCATATG CAATTTCTCA CAAGAAACTC TCAGAACTAG GATTTAATCC GCCAAGAAGA ATTTCTTCAG CAGTGACACA GCAGACGCTT GGAATCGCTG 
TTGCTGCAGC TGTGGTGATC TTTACCATAT GCTACGAAGC AAGCAGAAGA GGCAAGTGA 

Retrieve as FASTA