Entry information : CagraPrx22Cagra.5711s0001
Entry ID 14868
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx22Cagra.5711s0001
Name CagraPrx22Cagra.5711s0001
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx007]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx22
start..stop
S start..stop
CrubPrx89 649 0 1..317 10..326
BstrPrx83 626 0 1..317 10..326
AlyPrx39 621 0 1..317 11..327
AtPrx39 619 0 1..317 10..326
Literature and cross-references CagraPrx22Cagra.5711s0001
Protein sequence: CagraPrx22Cagra.5711s0001
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317
PWM (Da):   %s   34728.69  
PI (pH):   %s   8.58
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MILAILGSVR FSEAQLKMGF YDKTCPYAEK IVQDVVNQHI HNAPSLAAGL IRMHFHDCFV RGCDGSILIN ATSRNQQVEK LAPPNLTVRG FDFIDKVKSA LESKCPGIVS CADIITLATR  DSIVAIGGPT WNVPTGRRDG RISNFIEARN NIPPPFGNFT TLITLFGNQG LDVKDLVLLS GAHTIGVSHC SSFSKRLFNF TGIGDQDPSL DSEYAANLKS RRCLSITDNT TKVEMDPGSR 
NTFDLSYFRL VLKRRGLFES DAALTMDPAA LAQVRRFAGG SQQEFFAEFA KAMEKMGRIG VKTGSDGEIR RTCAFVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGGCGAGATT CGGGTTAGCT CTTGTAATGA TTCTTGCGAT TCTAGGATCT GTGAGATTTT CAGAAGCTCA GTTGAAGATG GGATTCTACG ACAAAACATG TCCTTACGCA GAGAAGATTG  TACAAGATGT TGTCAACCAA CATATCCACA ATGCACCTTC TTTGGCTGCT GGCCTTATCA GGATGCATTT TCATGATTGC TTCGTTCGGG TATGATCACC ACTCTTTTTA GTTACAGTTC  ACTTTTGTAG GCATTTGTTT ATCATATAGT ATATGCAAAA ACGTATATTT TTTCATATGA ATACGTACGT ATTGGTGTTG ACAGGGTTGT GATGGTTCGA TCTTGATCAA CGCGACATCG  AGGAACCAAC AAGTCGAGAA GCTTGCTCCT CCGAATCTAA CTGTTAGAGG TTTCGACTTC ATCGATAAAG TAAAGTCTGC TCTAGAATCA AAATGCCCTG GAATCGTCTC ATGCGCTGAT  ATCATCACCC TCGCTACTAG AGACTCTATT GTTGCTATTG TGAGTATGCT AATACTTTAA GTTACCTCGA TAAGTCTAAA CTCTAAACTT GATCGACACT AAAACTAACG GGGTTCGATT  AATTTTGGCT TAGGGTGGAC CAACATGGAA TGTTCCAACA GGACGTAGAG ACGGACGTAT CTCTAACTTT ATCGAGGCTC GGAACAATAT CCCTCCTCCT TTTGGGAACT TCACGACTCT  TATAACCTTA TTTGGAAACC AAGGACTTGA TGTTAAAGAC CTCGTCTTAT TGTCCGGTAA AATCCAACTC CAAATTGTCT TTTTTTGGGT TTGGTTTTGT AACATGGGTT ATTATAAACG  TCGTCGTTTT TAGTGTATGG TATTTAAACA CTGTCAAATA TATTTAAACG TTTTAGGTGC ACATACGATT GGAGTGTCTC ATTGCTCATC TTTCTCAAAA CGTCTCTTCA ATTTCACTGG  TATTGGAGAC CAAGACCCAT CACTCGACAG CGAATACGCT GCCAATCTCA AGTCACGGAG ATGTTTGTCT ATCACGGACA ATACAACAAA GGTTGAAATG GATCCTGGTA GTCGAAACAC  CTTTGATCTT AGCTACTTCC GTCTTGTCCT GAAACGTCGC GGGCTTTTCG AGTCTGACGC TGCATTAACT ATGGATCCTG CGGCGTTGGC TCAGGTCAGA CGTTTCGCCG GGGGATCGCA  ACAAGAGTTC TTTGCTGAGT TCGCAAAGGC TATGGAGAAA ATGGGAAGGA TTGGTGTCAA AACCGGGTCG GATGGTGAAA TCCGAAGAAC ATGTGCATTT GTTAATTGAA AAGGTTTCTC  ACTTTTGTCT TTTTGAATGG TTTTTAATAT CGTTAATTTT GGGTGTTTTT TGTGTGACTT TTTTGGGTAT TTAATTTACA ATTTCGTGAT ATGTATTTAT GTGGTGGAAA TGTGGTTTTC 
CGAATAAATT CCACGTATGT GAAATCGTTG TACTAAATCT TCCATTCATT TATCTATCAA TAAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATTCTTG CGATTCTAGG ATCTGTGAGA TTTTCAGAAG CTCAGTTGAA GATGGGATTC TACGACAAAA CATGTCCTTA CGCAGAGAAG ATTGTACAAG ATGTTGTCAA CCAACATATC  CACAATGCAC CTTCTTTGGC TGCTGGCCTT ATCAGGATGC ATTTTCATGA TTGCTTCGTT CGGGGTTGTG ATGGTTCGAT CTTGATCAAC GCGACATCGA GGAACCAACA AGTCGAGAAG  CTTGCTCCTC CGAATCTAAC TGTTAGAGGT TTCGACTTCA TCGATAAAGT AAAGTCTGCT CTAGAATCAA AATGCCCTGG AATCGTCTCA TGCGCTGATA TCATCACCCT CGCTACTAGA  GACTCTATTG TTGCTATTGG TGGACCAACA TGGAATGTTC CAACAGGACG TAGAGACGGA CGTATCTCTA ACTTTATCGA GGCTCGGAAC AATATCCCTC CTCCTTTTGG GAACTTCACG  ACTCTTATAA CCTTATTTGG AAACCAAGGA CTTGATGTTA AAGACCTCGT CTTATTGTCC GGTGCACATA CGATTGGAGT GTCTCATTGC TCATCTTTCT CAAAACGTCT CTTCAATTTC  ACTGGTATTG GAGACCAAGA CCCATCACTC GACAGCGAAT ACGCTGCCAA TCTCAAGTCA CGGAGATGTT TGTCTATCAC GGACAATACA ACAAAGGTTG AAATGGATCC TGGTAGTCGA  AACACCTTTG ATCTTAGCTA CTTCCGTCTT GTCCTGAAAC GTCGCGGGCT TTTCGAGTCT GACGCTGCAT TAACTATGGA TCCTGCGGCG TTGGCTCAGG TCAGACGTTT CGCCGGGGGA 
TCGCAACAAG AGTTCTTTGC TGAGTTCGCA AAGGCTATGG AGAAAATGGG AAGGATTGGT GTCAAAACCG GGTCGGATGG TGAAATCCGA AGAACATGTG CATTTGTTAA TTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TGGCGAGATT CGGGTTAGCT CTTGTAATGA TTCTTGCGAT TCTAGGATCT GTGAGATTTT CAGAAGCTCA GTTGAAGATG GGATTCTACG ACAAAACATG TCCTTACGCA GAGAAGATTG  TACAAGATGT TGTCAACCAA CATATCCACA ATGCACCTTC TTTGGCTGCT GGCCTTATCA GGATGCATTT TCATGATTGC TTCGTTCGGG GTTGTGATGG TTCGATCTTG ATCAACGCGA  CATCGAGGAA CCAACAAGTC GAGAAGCTTG CTCCTCCGAA TCTAACTGTT AGAGGTTTCG ACTTCATCGA TAAAGTAAAG TCTGCTCTAG AATCAAAATG CCCTGGAATC GTCTCATGCG  CTGATATCAT CACCCTCGCT ACTAGAGACT CTATTGTTGC TATTGGTGGA CCAACATGGA ATGTTCCAAC AGGACGTAGA GACGGACGTA TCTCTAACTT TATCGAGGCT CGGAACAATA  TCCCTCCTCC TTTTGGGAAC TTCACGACTC TTATAACCTT ATTTGGAAAC CAAGGACTTG ATGTTAAAGA CCTCGTCTTA TTGTCCGGTG CACATACGAT TGGAGTGTCT CATTGCTCAT  CTTTCTCAAA ACGTCTCTTC AATTTCACTG GTATTGGAGA CCAAGACCCA TCACTCGACA GCGAATACGC TGCCAATCTC AAGTCACGGA GATGTTTGTC TATCACGGAC AATACAACAA  AGGTTGAAAT GGATCCTGGT AGTCGAAACA CCTTTGATCT TAGCTACTTC CGTCTTGTCC TGAAACGTCG CGGGCTTTTC GAGTCTGACG CTGCATTAAC TATGGATCCT GCGGCGTTGG  CTCAGGTCAG ACGTTTCGCC GGGGGATCGC AACAAGAGTT CTTTGCTGAG TTCGCAAAGG CTATGGAGAA AATGGGAAGG ATTGGTGTCA AAACCGGGTC GGATGGTGAA ATCCGAAGAA  CATGTGCATT TGTTAATTGA AAAGGTTTCT CACTTTTGTC TTTTTGAATG GTTTTTAATA TCGTTAATTT TGGGTGTTTT TTGTGTGACT TTTTTGGGTA TTTAATTTAC AATTTCGTGA 
TATGTATTTA TGTGGTGGAA ATGTGGTTTT CCGAATAAAT TCCACGTATG TGAAATCGTT GTACTAAATC TTCCATTCAT TTATCTATCA ATAAA 

Retrieve as FASTA