Entry information : CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Entry ID 14874
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Name (synonym) CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx03-1
start..stop
S start..stop
CrubAPx03-1 589 0 1..287 1..287
BstrAPx03 584 0 1..287 1..287
BnAPx03-1Aa_other 545 0 1..287 1..287
AtAPx03 535 0 1..287 1..287
Literature and cross-references CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Protein sequence: CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   31666.18 Transmb domain:   %s   o258-280i
PI (pH):   %s   6.64
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATPIVDAEY LKEITKARRD LRSLISNKNC APIMLRLAWH DAGTYDAQSK TGGPNGSIRN EEEYTHGANS GLKIALDLCE GVKAKHPKIT YADLFQLAGV VAVEVTGGPD ISFVPGRKDS  KVSTREGRLP DAKQGFQHLR DVFYRMGLSD KDIVALSGAH TLGRAHPERS GFDGPWTEEP LKFDNSYFVE LLKGESEGLL KLPTDKTLLE DPEFRRYVEL YAKDEDAFFR DYAESHKKLS 
ELGFNPSSSA GKAVADSTVL AQSAFGVAVA AAVVAFSYFY EIRKRMK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGACGC CGATTGTTGA CGCGGAGTAC TTGAAAGAGA TCACCAAGGC TCGCCGTGAC CTCCGCTCTC TCATCTCGAA CAAGAACTGC GCTCCGATCA TGCTCCGATT GGCGTAAGTT  TCGATTTCTT TGGTTTTTCT TCGATTCGGT TATGTTGACT GCTCCGTATT TCGTTTTCTG CTCCTGTGAA AATCGTTGGA TTGATAGTTT GGGTGTAGAA ATCGCTCGAT ATTGTTCAGT  TTTTAATTTG TGAGATGTTG TCTCATATGG TTTTTGTGAA GATGGCACGA TGCTGGAACC TATGATGCTC AATCGAAGAC CGGTGGACCT AATGGTTCTA TCAGGAACGA AGAGGAGTAC  ACTCATGGTG CCAACAGTGG TTTGAAGATC GCTCTCGATC TCTGTGGTAG GATTTTCATT TAGTTATTGT AGATTCGTTT TCTGGATAGT TTCTCTTTTT GTTGGTGAAG AGATTGCTAT  TTGCTCATAA TCCGCGGGTT ATTCTTGAAA TTTGGATAGC CAATACTGTT CGAAATGATT CCATTATGTT TTTTTTTGGA ATGGACTTTG AATTGTTTAG TTATGAAATC CTATCTTTTA  TGTTTCAGAG GGCGTGAAAG CTAAGCATCC CAAAATCACA TATGCAGACC TATTTCAGGT GATTATGAGA TTTTTCTTAG AAGTATTATG ATTACAGTGA AGTTCTAACC ATTTGAAAAC  TGATATATAT CCATAACTGA TGCAATTTTA TTAGTTTTGC TACCATAGAG TTAGTATAGC GCATCAGATT TGAGCCTTGT TGTTTTCTGT GCTCCTTTGT CAACAGTCTA TAGAAACTAG  TACCCCACGT GTCTCATAGA CCCATCCCAT GTTTGGTAGA CTTAGATGAG TTGTGTAATT ATTGTCGCAG GATAGTGAAA GTGTGCAACA ATGAAATAAG AATTTTCTTT TTCTACGAAC  TGTTGCAGAT TATGTTTTGA TATGTTGACT ATATCAATTC GTTCCAAGAA AGACAGATTG ACTATGTTAT TCAAGTAGAA ACTAGATTCT AGTAAAATGT ACTCTACTCT CAAGGAGATT  GTCACAAAAC CTCAAGCTAT TTCCACGCTA GAGGATTTGT TTCATAATTG ACCAGAATAA ATCTGCCTAT GTTGCCCTTC CGGTAAATCT TGTCATTTAA TTCCTGAATT TGTCATGACC  AGGAAGGTTT GTTAAACTCA TTTAATAGTT TTGTTATATT GACATACTGT TCACCCATCT GTGATTCTGT GTTATTGACT TAAGGACTTG GACTGAGTAG TATTCAAAAG TCCATCGCTT  GCACCTATTT TACATTGTGC ATTACTGTTT GTATTGTTGT TTGTCCAGCT TTGTTGGTCA ACAATGTGGA GGCTTTATAT ATGAATGCCC AGCAGAAGTT TCCAATTGGA GCAATAGTTT  AATAGCAATC AAAAATTTGA ATCTGAATAA TTTATCTCAT TCTCGTGTTT CAGCTTGCTG GTGTGGTAGC AGTGGAGGTT ACTGGTGGAC CTGACATCAG CTTCGTTCCT GGGAGAAAAG  TATAGTTTCT CATTCTTCTA GACATTACAA CAGTTGGCCG GTTTTAGCGC TGAAGAAAAT AACCATAAAT ACTGTATGTT TCTTTTTGAT AGGATTCAAA GGTCTCCACC AGGGAAGGAA  GACTTCCTGA TGCCAAACAA GGTACAATAA TACTTCTATC GTTTATAGTA TACTTTGCTT TTCTCTATTG AAATTCTTCT CATGGAACTG GAAGATCTTT TCTATGAATT TACCTTGTTT  ATTTGATTGT AGGTTTTCAA CATCTAAGAG ATGTATTCTA TCGCATGGGA CTATCTGATA AGGATATTGT GGCACTCTCA GGTGCTCATA CTCTGGTAAA TTCATTGGCC ACTTACTTAA  TTCCCGCTGT TTTTTTCTTT TGGGACAAAT AAAAGGTATT TGTGCTGATG ATCACTTTTT GGTGTTTAGG GAAGGGCTCA TCCAGAGAGG TCAGGCTTCG ATGGGCCATG GACTGAAGAG  CCTCTGAAGT TTGATAACTC CTACTTCGTG TAATTTTTAT TTCCTTATCC TCATAGATTC TTTGTCTTTT TGATTTTTTT CTTCCAAGAA GAACAAGCAG CAAACAGCTA CTTTACTACA  GGATCTGTTT AATCCACGAA CTAATTACTG TCTTGGTACC AGGGAACTGC TGAAAGGAGA ATCAGAGGGC TTGTTGAAAC TCCCAACTGA CAAGACTTTA TTGGAAGACC CGGAATTCCG  TCGTTATGTT GAGCTCTATG CAAAGGTAAA TTCGAGTATT GAGCTGCTTG CATGTATATA TCTCATTTGC CCTGTTTTTG TGCTGTTAGA TGTTATTTTG ACAAGTTGTA CCGGTGTTAA  CAGGATGAAG ATGCATTCTT CAGAGACTAC GCTGAATCTC ACAAGAAACT CTCTGAGCTT GGTTTCAACC CAAGCTCCTC AGCAGGGAAG GCGGTTGCAG ACAGCACAGT TCTGGCACAG 
AGCGCGTTCG GGGTTGCGGT TGCTGCTGCG GTTGTGGCGT TTAGTTACTT TTACGAGATT AGGAAGAGGA TGAAATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGACGC CGATTGTTGA CGCGGAGTAC TTGAAAGAGA TCACCAAGGC TCGCCGTGAC CTCCGCTCTC TCATCTCGAA CAAGAACTGC GCTCCGATCA TGCTCCGATT GGCATGGCAC  GATGCTGGAA CCTATGATGC TCAATCGAAG ACCGGTGGAC CTAATGGTTC TATCAGGAAC GAAGAGGAGT ACACTCATGG TGCCAACAGT GGTTTGAAGA TCGCTCTCGA TCTCTGTGAG  GGCGTGAAAG CTAAGCATCC CAAAATCACA TATGCAGACC TATTTCAGCT TGCTGGTGTG GTAGCAGTGG AGGTTACTGG TGGACCTGAC ATCAGCTTCG TTCCTGGGAG AAAAGATTCA  AAGGTCTCCA CCAGGGAAGG AAGACTTCCT GATGCCAAAC AAGGTTTTCA ACATCTAAGA GATGTATTCT ATCGCATGGG ACTATCTGAT AAGGATATTG TGGCACTCTC AGGTGCTCAT  ACTCTGGGAA GGGCTCATCC AGAGAGGTCA GGCTTCGATG GGCCATGGAC TGAAGAGCCT CTGAAGTTTG ATAACTCCTA CTTCGTGGAA CTGCTGAAAG GAGAATCAGA GGGCTTGTTG  AAACTCCCAA CTGACAAGAC TTTATTGGAA GACCCGGAAT TCCGTCGTTA TGTTGAGCTC TATGCAAAGG ATGAAGATGC ATTCTTCAGA GACTACGCTG AATCTCACAA GAAACTCTCT  GAGCTTGGTT TCAACCCAAG CTCCTCAGCA GGGAAGGCGG TTGCAGACAG CACAGTTCTG GCACAGAGCG CGTTCGGGGT TGCGGTTGCT GCTGCGGTTG TGGCGTTTAG TTACTTTTAC 
GAGATTAGGA AGAGGATGAA ATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAATCCCGT TTCTCATTGG GTGGTTTATC TCTTCGGCCC AAACTTCAGT GTAACCAAAA AAGAAAGCAA AAAATCTTCA CATCACACAC CTTGACCATA TTCTTCTTCA TCGCTCTCTC  ACCAATCCCA GACGAGTAGG AGCTATGGCG ACGCCGATTG TTGACGCGGA GTACTTGAAA GAGATCACCA AGGCTCGCCG TGACCTCCGC TCTCTCATCT CGAACAAGAA CTGCGCTCCG  ATCATGCTCC GATTGGCATG GCACGATGCT GGAACCTATG ATGCTCAATC GAAGACCGGT GGACCTAATG GTTCTATCAG GAACGAAGAG GAGTACACTC ATGGTGCCAA CAGTGGTTTG  AAGATCGCTC TCGATCTCTG TGAGGGCGTG AAAGCTAAGC ATCCCAAAAT CACATATGCA GACCTATTTC AGCTTGCTGG TGTGGTAGCA GTGGAGGTTA CTGGTGGACC TGACATCAGC  TTCGTTCCTG GGAGAAAAGA TTCAAAGGTC TCCACCAGGG AAGGAAGACT TCCTGATGCC AAACAAGGTT TTCAACATCT AAGAGATGTA TTCTATCGCA TGGGACTATC TGATAAGGAT  ATTGTGGCAC TCTCAGGTGC TCATACTCTG GGAAGGGCTC ATCCAGAGAG GTCAGGCTTC GATGGGCCAT GGACTGAAGA GCCTCTGAAG TTTGATAACT CCTACTTCGT GGAACTGCTG  AAAGGAGAAT CAGAGGGCTT GTTGAAACTC CCAACTGACA AGACTTTATT GGAAGACCCG GAATTCCGTC GTTATGTTGA GCTCTATGCA AAGGATGAAG ATGCATTCTT CAGAGACTAC  GCTGAATCTC ACAAGAAACT CTCTGAGCTT GGTTTCAACC CAAGCTCCTC AGCAGGGAAG GCGGTTGCAG ACAGCACAGT TCTGGCACAG AGCGCGTTCG GGGTTGCGGT TGCTGCTGCG  GTTGTGGCGT TTAGTTACTT TTACGAGATT AGGAAGAGGA TGAAATAAAT GGGAGTACAA GGAAAACTAT TCAGATAAAA CCCTATTTTA CTGCCACAAT ATGCTAAACT CTTTTAATCC 
ACCACGATCA TACTGTTTTG TTAGTAAAAA GTCAAAAAGT CAAAAAGTC 

Retrieve as FASTA