Entry information : CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Entry ID 14874
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Name (synonym) CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx003]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx03-1
start..stop
S start..stop
CrubAPx03-1 589 0 1..287 1..287
BstrAPx03 584 0 1..287 1..287
BnAPx03-1Aa_other 545 0 1..287 1..287
AtAPx03 535 0 1..287 1..287
Literature and cross-references CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Protein sequence: CagraAPx03-1 (Cagra.2350s0046)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   31666.18 Transmb domain:   %s   o258-280i
PI (pH):   %s   6.64
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATPIVDAEY LKEITKARRD LRSLISNKNC APIMLRLAWH DAGTYDAQSK TGGPNGSIRN EEEYTHGANS GLKIALDLCE GVKAKHPKIT YADLFQLAGV VAVEVTGGPD ISFVPGRKDS  KVSTREGRLP DAKQGFQHLR DVFYRMGLSD KDIVALSGAH TLGRAHPERS GFDGPWTEEP LKFDNSYFVE LLKGESEGLL KLPTDKTLLE DPEFRRYVEL YAKDEDAFFR DYAESHKKLS 
ELGFNPSSSA GKAVADSTVL AQSAFGVAVA AAVVAFSYFY EIRKRMK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAATCCCGT TTCTCATTGG GTGGTTTATC TCTTCGGCCC AAACTTCAGT GTAACCAAAA AAGAAAGCAA AAAATCTTCA CATCACACAC CTTGACCATA TTCTTCTTCA TCGCTCTCTC  ACCAATCCCA GACGAGTAGG AGCTATGGCG ACGCCGATTG TTGACGCGGA GTACTTGAAA GAGATCACCA AGGCTCGCCG TGACCTCCGC TCTCTCATCT CGAACAAGAA CTGCGCTCCG  ATCATGCTCC GATTGGCGTA AGTTTCGATT TCTTTGGTTT TTCTTCGATT CGGTTATGTT GACTGCTCCG TATTTCGTTT TCTGCTCCTG TGAAAATCGT TGGATTGATA GTTTGGGTGT  AGAAATCGCT CGATATTGTT CAGTTTTTAA TTTGTGAGAT GTTGTCTCAT ATGGTTTTTG TGAAGATGGC ACGATGCTGG AACCTATGAT GCTCAATCGA AGACCGGTGG ACCTAATGGT  TCTATCAGGA ACGAAGAGGA GTACACTCAT GGTGCCAACA GTGGTTTGAA GATCGCTCTC GATCTCTGTG GTAGGATTTT CATTTAGTTA TTGTAGATTC GTTTTCTGGA TAGTTTCTCT  TTTTGTTGGT GAAGAGATTG CTATTTGCTC ATAATCCGCG GGTTATTCTT GAAATTTGGA TAGCCAATAC TGTTCGAAAT GATTCCATTA TGTTTTTTTT TGGAATGGAC TTTGAATTGT  TTAGTTATGA AATCCTATCT TTTATGTTTC AGAGGGCGTG AAAGCTAAGC ATCCCAAAAT CACATATGCA GACCTATTTC AGGTGATTAT GAGATTTTTC TTAGAAGTAT TATGATTACA  GTGAAGTTCT AACCATTTGA AAACTGATAT ATATCCATAA CTGATGCAAT TTTATTAGTT TTGCTACCAT AGAGTTAGTA TAGCGCATCA GATTTGAGCC TTGTTGTTTT CTGTGCTCCT  TTGTCAACAG TCTATAGAAA CTAGTACCCC ACGTGTCTCA TAGACCCATC CCATGTTTGG TAGACTTAGA TGAGTTGTGT AATTATTGTC GCAGGATAGT GAAAGTGTGC AACAATGAAA  TAAGAATTTT CTTTTTCTAC GAACTGTTGC AGATTATGTT TTGATATGTT GACTATATCA ATTCGTTCCA AGAAAGACAG ATTGACTATG TTATTCAAGT AGAAACTAGA TTCTAGTAAA  ATGTACTCTA CTCTCAAGGA GATTGTCACA AAACCTCAAG CTATTTCCAC GCTAGAGGAT TTGTTTCATA ATTGACCAGA ATAAATCTGC CTATGTTGCC CTTCCGGTAA ATCTTGTCAT  TTAATTCCTG AATTTGTCAT GACCAGGAAG GTTTGTTAAA CTCATTTAAT AGTTTTGTTA TATTGACATA CTGTTCACCC ATCTGTGATT CTGTGTTATT GACTTAAGGA CTTGGACTGA  GTAGTATTCA AAAGTCCATC GCTTGCACCT ATTTTACATT GTGCATTACT GTTTGTATTG TTGTTTGTCC AGCTTTGTTG GTCAACAATG TGGAGGCTTT ATATATGAAT GCCCAGCAGA  AGTTTCCAAT TGGAGCAATA GTTTAATAGC AATCAAAAAT TTGAATCTGA ATAATTTATC TCATTCTCGT GTTTCAGCTT GCTGGTGTGG TAGCAGTGGA GGTTACTGGT GGACCTGACA  TCAGCTTCGT TCCTGGGAGA AAAGTATAGT TTCTCATTCT TCTAGACATT ACAACAGTTG GCCGGTTTTA GCGCTGAAGA AAATAACCAT AAATACTGTA TGTTTCTTTT TGATAGGATT  CAAAGGTCTC CACCAGGGAA GGAAGACTTC CTGATGCCAA ACAAGGTACA ATAATACTTC TATCGTTTAT AGTATACTTT GCTTTTCTCT ATTGAAATTC TTCTCATGGA ACTGGAAGAT  CTTTTCTATG AATTTACCTT GTTTATTTGA TTGTAGGTTT TCAACATCTA AGAGATGTAT TCTATCGCAT GGGACTATCT GATAAGGATA TTGTGGCACT CTCAGGTGCT CATACTCTGG  TAAATTCATT GGCCACTTAC TTAATTCCCG CTGTTTTTTT CTTTTGGGAC AAATAAAAGG TATTTGTGCT GATGATCACT TTTTGGTGTT TAGGGAAGGG CTCATCCAGA GAGGTCAGGC  TTCGATGGGC CATGGACTGA AGAGCCTCTG AAGTTTGATA ACTCCTACTT CGTGTAATTT TTATTTCCTT ATCCTCATAG ATTCTTTGTC TTTTTGATTT TTTTCTTCCA AGAAGAACAA  GCAGCAAACA GCTACTTTAC TACAGGATCT GTTTAATCCA CGAACTAATT ACTGTCTTGG TACCAGGGAA CTGCTGAAAG GAGAATCAGA GGGCTTGTTG AAACTCCCAA CTGACAAGAC  TTTATTGGAA GACCCGGAAT TCCGTCGTTA TGTTGAGCTC TATGCAAAGG TAAATTCGAG TATTGAGCTG CTTGCATGTA TATATCTCAT TTGCCCTGTT TTTGTGCTGT TAGATGTTAT  TTTGACAAGT TGTACCGGTG TTAACAGGAT GAAGATGCAT TCTTCAGAGA CTACGCTGAA TCTCACAAGA AACTCTCTGA GCTTGGTTTC AACCCAAGCT CCTCAGCAGG GAAGGCGGTT  GCAGACAGCA CAGTTCTGGC ACAGAGCGCG TTCGGGGTTG CGGTTGCTGC TGCGGTTGTG GCGTTTAGTT ACTTTTACGA GATTAGGAAG AGGATGAAAT AAATGGGAGT ACAAGGAAAA 
CTATTCAGAT AAAACCCTAT TTTACTGCCA CAATATGCTA AACTCTTTTA ATCCACCACG ATCATACTGT TTTGTTAGTA AAAAGTCAAA AAGTCAAAAA GTC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGACGC CGATTGTTGA CGCGGAGTAC TTGAAAGAGA TCACCAAGGC TCGCCGTGAC CTCCGCTCTC TCATCTCGAA CAAGAACTGC GCTCCGATCA TGCTCCGATT GGCATGGCAC  GATGCTGGAA CCTATGATGC TCAATCGAAG ACCGGTGGAC CTAATGGTTC TATCAGGAAC GAAGAGGAGT ACACTCATGG TGCCAACAGT GGTTTGAAGA TCGCTCTCGA TCTCTGTGAG  GGCGTGAAAG CTAAGCATCC CAAAATCACA TATGCAGACC TATTTCAGCT TGCTGGTGTG GTAGCAGTGG AGGTTACTGG TGGACCTGAC ATCAGCTTCG TTCCTGGGAG AAAAGATTCA  AAGGTCTCCA CCAGGGAAGG AAGACTTCCT GATGCCAAAC AAGGTTTTCA ACATCTAAGA GATGTATTCT ATCGCATGGG ACTATCTGAT AAGGATATTG TGGCACTCTC AGGTGCTCAT  ACTCTGGGAA GGGCTCATCC AGAGAGGTCA GGCTTCGATG GGCCATGGAC TGAAGAGCCT CTGAAGTTTG ATAACTCCTA CTTCGTGGAA CTGCTGAAAG GAGAATCAGA GGGCTTGTTG  AAACTCCCAA CTGACAAGAC TTTATTGGAA GACCCGGAAT TCCGTCGTTA TGTTGAGCTC TATGCAAAGG ATGAAGATGC ATTCTTCAGA GACTACGCTG AATCTCACAA GAAACTCTCT  GAGCTTGGTT TCAACCCAAG CTCCTCAGCA GGGAAGGCGG TTGCAGACAG CACAGTTCTG GCACAGAGCG CGTTCGGGGT TGCGGTTGCT GCTGCGGTTG TGGCGTTTAG TTACTTTTAC 
GAGATTAGGA AGAGGATGAA ATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAAATCCCGT TTCTCATTGG GTGGTTTATC TCTTCGGCCC AAACTTCAGT GTAACCAAAA AAGAAAGCAA AAAATCTTCA CATCACACAC CTTGACCATA TTCTTCTTCA TCGCTCTCTC  ACCAATCCCA GACGAGTAGG AGCTATGGCG ACGCCGATTG TTGACGCGGA GTACTTGAAA GAGATCACCA AGGCTCGCCG TGACCTCCGC TCTCTCATCT CGAACAAGAA CTGCGCTCCG  ATCATGCTCC GATTGGCATG GCACGATGCT GGAACCTATG ATGCTCAATC GAAGACCGGT GGACCTAATG GTTCTATCAG GAACGAAGAG GAGTACACTC ATGGTGCCAA CAGTGGTTTG  AAGATCGCTC TCGATCTCTG TGAGGGCGTG AAAGCTAAGC ATCCCAAAAT CACATATGCA GACCTATTTC AGCTTGCTGG TGTGGTAGCA GTGGAGGTTA CTGGTGGACC TGACATCAGC  TTCGTTCCTG GGAGAAAAGA TTCAAAGGTC TCCACCAGGG AAGGAAGACT TCCTGATGCC AAACAAGGTT TTCAACATCT AAGAGATGTA TTCTATCGCA TGGGACTATC TGATAAGGAT  ATTGTGGCAC TCTCAGGTGC TCATACTCTG GGAAGGGCTC ATCCAGAGAG GTCAGGCTTC GATGGGCCAT GGACTGAAGA GCCTCTGAAG TTTGATAACT CCTACTTCGT GGAACTGCTG  AAAGGAGAAT CAGAGGGCTT GTTGAAACTC CCAACTGACA AGACTTTATT GGAAGACCCG GAATTCCGTC GTTATGTTGA GCTCTATGCA AAGGATGAAG ATGCATTCTT CAGAGACTAC  GCTGAATCTC ACAAGAAACT CTCTGAGCTT GGTTTCAACC CAAGCTCCTC AGCAGGGAAG GCGGTTGCAG ACAGCACAGT TCTGGCACAG AGCGCGTTCG GGGTTGCGGT TGCTGCTGCG  GTTGTGGCGT TTAGTTACTT TTACGAGATT AGGAAGAGGA TGAAATAAAT GGGAGTACAA GGAAAACTAT TCAGATAAAA CCCTATTTTA CTGCCACAAT ATGCTAAACT CTTTTAATCC 
ACCACGATCA TACTGTTTTG TTAGTAAAAA GTCAAAAAGT CAAAAAGTC 

Retrieve as FASTA