Entry information : CagraPrx30Cagra.0645s0019
Entry ID 14876
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx30Cagra.0645s0019
Name CagraPrx30Cagra.0645s0019
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx30
start..stop
S start..stop
CrubPrx90 718 0 1..351 1..351
CrubPrx107 609 0 9..351 12..353
BstrPrx03 607 0 3..351 6..353
AlyPrx33 605 0 1..351 1..349
Literature and cross-references CagraPrx30Cagra.0645s0019
Protein sequence: CagraPrx30Cagra.0645s0019
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   351 (324)
PWM (Da):   %s   38765.56 (35638.0)  
PI (pH):   %s   6.35 (6.13) Peptide Signal:   %s   cut: 28 range:28-351
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSASFTWT TLITLVCLML HVSLSDAQLT PTFYDTSCPR VTTIVRDTIV EELRSDPRIA ASILRLHFHD CFVNGCDASI LLDNTTTFRT EKDALGNAGS ARGFPVIDRM KAAIERACPR  TVSCADMLTI AAQQSVTLAG GPSWRVPLGR RDSLQAFLQL ANDNLPSPFE SLQEIKDKFS NVGLTLPSDL VALSGGHTFG KNQCQFITNR LYNFNNTGLP DPTLDATYLQ TLRGQCPQNG 
NPRALVDFDL RTPTVFDNKY YVNLKERKGL LQTDQVLFSS PDATDTSPLV REYADGTQKF FDAFVVAMNR MGNITPLTGT QGQIRLNCKV VNSNSLLHDV VEILDNFVSS M* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAACCTAAT CACATAGTTT TCTTTTTCCT TGTAAAAGAT GAAGTTCTCT GCTTCGTTCA CTTGGACAAC CTTAATCACA TTGGTATGTC TTATGCTTCA TGTTTCTTTG TCCGATGCTC  AACTTACCCC TACATTCTAC GACACTTCAT GTCCTAGAGT TACTACCATC GTAAGAGATA CCATTGTCGA AGAGTTAAGG TCAGACCCTC GTATCGCCGC GAGCATCCTT CGTCTTCACT  TCCACGACTG CTTTGTTAAT GTATGAAATT AACTTTACAT ATATCTGTAG CGATACGAAT CACTGTGGTT CATCTTATAA ATATTAATAT GTTAGTGTAA AAAGTAGATA AAAACAAAAG  TAGATAACAA ATATACTTAG TCATCGGCAC ACGCAATCTT AGTTGATACT CTTTTTGCTC TAAATACTAA ATCTCAAGTA TGTTAGATGC CATATGTTTG CTTTTCCTAT TGAATAATTT  AATACTTATC TCTCGTCGAC AATGATGTTT CTGATTATTA TTTATTTCTT GCACAATAAT GATGCCAAAA CGTTTATGAA GTCGGATTCA CCAAGATGAA TTATGCATGT TACAGTAGGT  AGCAAGAGCA TGGTGCCGTA CCATACACGT CAGAAATTTA ACATCCATCA ATCATTTTTT TTTTGTTTTT GTTTTTGTTG AGAGAGATAT ATAATAAATA GACTTTTCAA ACATCATTAT  ACTGATAGAT ATACATATAA TTAATCTTCA TTGACTACTT AGCTTGCTTT AGAGGAACAA ATAGCTTTAA CGGTTGACAA AAAAAAATGT TTTCTGTTAA ATTGTTACAT TTGGTAAAAC  TTTAGTTATG GATGTACGTA ATACATTGAC TAACCATTTG TTATACATAA TATTTTGGAC TTATGAAAGG GTTGTGACGC ATCGATCTTG TTGGATAACA CAACAACATT CCGAACAGAG  AAAGATGCGC TTGGAAACGC AGGTTCGGCT AGGGGATTCC CAGTGATTGA TAGAATGAAA GCCGCAATAG AGAGGGCTTG CCCGAGAACC GTTTCATGCG CTGATATGCT CACCATTGCA  GCTCAACAAT CTGTCACTTT GGTATGCTTA TGCTCTATAC TGCTCCATGT TCATTTACAA ACATTGTTTT CAACTTAACA TTTCAAGTTG TACCTTTGCA TATATCAAAC ATGACGGCCT  CAAGTTTTTA AAGAAAACAA TTGAGATATT TTTAGTCGTT TAAAAACGTC ACAATCTTTA TTTAGTATAT ATCGACTTTT GAATATATAT TTTTTAAAAG TATTGAAATT TATTTGAGAA  ATATTCGAAA CGCGTGGTCC CGTTAAGAAA ATTTGATAAC ACTATATCTC TCATTACTTG GATTTCACCT GGTTAGGCAA GACTTGAACC TTTTTCGTGA AAGAATAATT TTCATTTATT  TCAAAGAAAA AAGTAGAAAG CTTACTCTTG AGTATATAAA TATGATTTTG TGATACATGT TTGTCTTTTT CTCTTTGCAT ATTCTAGTGA TAAAAATAAT CTAAGAAGAT AGTTAATTTG  ACTGTAATGG TTATTATACT ATATTAGGCA GGAGGTCCTT CTTGGAGAGT TCCTTTGGGG AGAAGAGACA GCTTACAAGC ATTTTTGCAA CTCGCTAATG ATAATCTTCC TAGTCCATTC  GAATCACTTC AAGAAATTAA AGATAAGTTT AGCAATGTTG GCCTCACCCT TCCTTCTGAT CTCGTTGCTC TCTCCGGTAA TTAATACAAG TGTATTAAAC ATGTTTTTCA TATAGTTATA  ATCAGCTGAG TTTTGTTACT TATTGATCTT ATGGTTTCTC TTTTTTGTTA GGTGGCCATA CATTTGGTAA AAACCAGTGC CAGTTTATTA CGAACAGACT ATACAACTTT AACAATACTG  GTTTACCCGA TCCTACTCTC GACGCTACTT ACCTCCAAAC TCTTCGTGGA CAATGTCCCC AAAATGGTAA TCCAAGAGCC TTGGTGGATT TTGATCTCCG CACGCCTACG GTTTTCGACA  ACAAATACTA CGTGAATCTG AAAGAAAGAA AAGGTCTTCT CCAAACCGAT CAAGTGTTGT TCTCTAGCCC CGATGCCACA GACACGAGCC CCTTGGTGAG AGAATATGCT GATGGCACAC  AAAAGTTCTT TGATGCCTTC GTGGTGGCTA TGAACAGGAT GGGAAACATT ACACCCCTTA CAGGAACTCA AGGACAAATC AGGTTGAACT GTAAGGTGGT GAACTCCAAC TCTCTACTCC  ATGATGTGGT GGAGATTCTT GACAACTTTG TTAGCTCTAT GTGAGAATTG TGTACTAAAT ATAATATATG TGGCTACAAG AATACGTAGC AATAAATAAA ACTCTCAAGC TGTTATTACT 
TGAGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGCTTCGTT CACTTGGACA ACCTTAATCA CATTGGTATG TCTTATGCTT CATGTTTCTT TGTCCGATGC TCAACTTACC CCTACATTCT ACGACACTTC ATGTCCTAGA  GTTACTACCA TCGTAAGAGA TACCATTGTC GAAGAGTTAA GGTCAGACCC TCGTATCGCC GCGAGCATCC TTCGTCTTCA CTTCCACGAC TGCTTTGTTA ATGGTTGTGA CGCATCGATC  TTGTTGGATA ACACAACAAC ATTCCGAACA GAGAAAGATG CGCTTGGAAA CGCAGGTTCG GCTAGGGGAT TCCCAGTGAT TGATAGAATG AAAGCCGCAA TAGAGAGGGC TTGCCCGAGA  ACCGTTTCAT GCGCTGATAT GCTCACCATT GCAGCTCAAC AATCTGTCAC TTTGGCAGGA GGTCCTTCTT GGAGAGTTCC TTTGGGGAGA AGAGACAGCT TACAAGCATT TTTGCAACTC  GCTAATGATA ATCTTCCTAG TCCATTCGAA TCACTTCAAG AAATTAAAGA TAAGTTTAGC AATGTTGGCC TCACCCTTCC TTCTGATCTC GTTGCTCTCT CCGGTGGCCA TACATTTGGT  AAAAACCAGT GCCAGTTTAT TACGAACAGA CTATACAACT TTAACAATAC TGGTTTACCC GATCCTACTC TCGACGCTAC TTACCTCCAA ACTCTTCGTG GACAATGTCC CCAAAATGGT  AATCCAAGAG CCTTGGTGGA TTTTGATCTC CGCACGCCTA CGGTTTTCGA CAACAAATAC TACGTGAATC TGAAAGAAAG AAAAGGTCTT CTCCAAACCG ATCAAGTGTT GTTCTCTAGC  CCCGATGCCA CAGACACGAG CCCCTTGGTG AGAGAATATG CTGATGGCAC ACAAAAGTTC TTTGATGCCT TCGTGGTGGC TATGAACAGG ATGGGAAACA TTACACCCCT TACAGGAACT 
CAAGGACAAA TCAGGTTGAA CTGTAAGGTG GTGAACTCCA ACTCTCTACT CCATGATGTG GTGGAGATTC TTGACAACTT TGTTAGCTCT ATGTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAACCTAAT CACATAGTTT TCTTTTTCCT TGTAAAAGAT GAAGTTCTCT GCTTCGTTCA CTTGGACAAC CTTAATCACA TTGGTATGTC TTATGCTTCA TGTTTCTTTG TCCGATGCTC  AACTTACCCC TACATTCTAC GACACTTCAT GTCCTAGAGT TACTACCATC GTAAGAGATA CCATTGTCGA AGAGTTAAGG TCAGACCCTC GTATCGCCGC GAGCATCCTT CGTCTTCACT  TCCACGACTG CTTTGTTAAT GGTTGTGACG CATCGATCTT GTTGGATAAC ACAACAACAT TCCGAACAGA GAAAGATGCG CTTGGAAACG CAGGTTCGGC TAGGGGATTC CCAGTGATTG  ATAGAATGAA AGCCGCAATA GAGAGGGCTT GCCCGAGAAC CGTTTCATGC GCTGATATGC TCACCATTGC AGCTCAACAA TCTGTCACTT TGGCAGGAGG TCCTTCTTGG AGAGTTCCTT  TGGGGAGAAG AGACAGCTTA CAAGCATTTT TGCAACTCGC TAATGATAAT CTTCCTAGTC CATTCGAATC ACTTCAAGAA ATTAAAGATA AGTTTAGCAA TGTTGGCCTC ACCCTTCCTT  CTGATCTCGT TGCTCTCTCC GGTGGCCATA CATTTGGTAA AAACCAGTGC CAGTTTATTA CGAACAGACT ATACAACTTT AACAATACTG GTTTACCCGA TCCTACTCTC GACGCTACTT  ACCTCCAAAC TCTTCGTGGA CAATGTCCCC AAAATGGTAA TCCAAGAGCC TTGGTGGATT TTGATCTCCG CACGCCTACG GTTTTCGACA ACAAATACTA CGTGAATCTG AAAGAAAGAA  AAGGTCTTCT CCAAACCGAT CAAGTGTTGT TCTCTAGCCC CGATGCCACA GACACGAGCC CCTTGGTGAG AGAATATGCT GATGGCACAC AAAAGTTCTT TGATGCCTTC GTGGTGGCTA  TGAACAGGAT GGGAAACATT ACACCCCTTA CAGGAACTCA AGGACAAATC AGGTTGAACT GTAAGGTGGT GAACTCCAAC TCTCTACTCC ATGATGTGGT GGAGATTCTT GACAACTTTG 
TTAGCTCTAT GTGAGAATTG TGTACTAAAT ATAATATATG TGGCTACAAG AATACGTAGC AATAAATAAA ACTCTCAAGC TGTTATTACT TGAGA 

Retrieve as FASTA