Entry information : CagraPrx31Cagra.12215s0005
Entry ID 14877
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx31Cagra.12215s0005
Name CagraPrx31Cagra.12215s0005
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx018]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx31
start..stop
S start..stop
CrubPrx17-1A 680 0 1..332 1..332
BstrPrx75 629 0 8..332 3..325
AhalPrx10 612 0 1..332 1..329
AtPrx17 607 0 1..332 1..329
Literature and cross-references CagraPrx31Cagra.12215s0005
Protein sequence: CagraPrx31Cagra.12215s0005
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   332 (309)
PWM (Da):   %s   37006.55 (34405.0)  
PI (pH):   %s   5.13 (5.13) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-332
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MSLLLQPHLI LYLLILTAVV VNGEILRPRF YSETCPEAES IVRREMMKAM IKESRSVASV MRLQFHDCFV NGCDASVLLD DTPYMLGEKL SLSNINSLRS FEVVDDIKEA LEEACPATVS  CADIVIMASR DAVALTGGPD WEVKLGRKDS LTASQKDSDD IMPSPRANAT FLIDLFERFD LSVKDMVALS GSHSIGKGRC FSIMFRLYNQ SGSGKPDPAL EPRYRKKLNK LCPLGGDENV 
TGDLDATPQV FDNQYFKDLV SGRGFLNSDQ TLYTNRETRG YVKMFSENQA EFFRAFEQGM VKMGDLQSGR PGEVRLNCRV VNRSPIGVLF DS* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTTCAATCA CTGAACCCCA AAAGAATAAA AAAGCATTAA AGAAAAAAGT ATGTCTCTTC TTCTTCAACC TCACCTCATC CTCTACCTAC TAATCTTGAC GGCGGTGGTG GTTAACGGTG  AGATTCTCCG ACCAAGATTC TACAGTGAGA CATGCCCTGA AGCTGAATCC ATAGTAAGAA GAGAAATGAT GAAAGCTATG ATCAAAGAAT CAAGAAGCGT TGCTTCAGTC ATGCGTCTTC  AATTTCACGA CTGTTTTGTC AATGTAAAGC TCATAGAATC TTTCTCTTTC TCTCTTACTC TCTCTGTTCT TGATTCTTAA CTCTGTTTCT CTAATGAATC AATTCAGGGA TGTGACGCAT  CTGTGTTGCT TGATGATACA CCATACATGC TTGGTGAGAA ACTATCACTT TCCAACATCA ATTCACTGAG ATCTTTTGAA GTTGTTGATG ACATTAAAGA AGCTTTAGAG GAAGCTTGTC  CAGCTACTGT TTCTTGTGCT GATATTGTTA TCATGGCCTC TCGTGATGCT GTTGCTCTAG TAAGTAGAGA ACTCACTTTC TTTGGAACAT TCTCTGTTTA GTGGTTTCGG TTTTGTGATT  TTGGTCTTGA ATAATCAGAC AGGAGGACCT GATTGGGAGG TGAAGCTAGG GAGGAAAGAC AGTTTAACAG CGAGTCAGAA AGATTCAGAT GATATAATGC CAAGTCCAAG AGCCAATGCA  ACTTTCTTGA TTGATCTTTT CGAAAGATTC GATCTTTCTG TAAAAGACAT GGTGGCTTTA TCAGGGTCTC ACTCAATTGG TAAAGGTCGA TGTTTCTCCA TCATGTTTAG GCTTTATAAC  CAGTCCGGGT CTGGTAAACC TGATCCAGCT TTGGAACCAA GATACCGTAA GAAGCTTAAC AAGCTTTGTC CTTTGGGTGG AGATGAGAAT GTGACTGGAG ATTTGGATGC AACACCTCAG  GTTTTTGATA ATCAGTACTT CAAAGATTTG GTTTCAGGGA GAGGGTTTCT GAACTCTGAC CAGACTTTGT ATACGAATCG AGAGACAAGA GGGTATGTGA AGATGTTTAG TGAGAACCAA  GCTGAGTTCT TCAGAGCTTT TGAACAAGGG ATGGTGAAGA TGGGTGATTT GCAATCTGGG AGACCTGGAG AGGTTAGGTT AAATTGTAGA GTTGTTAATA GAAGTCCTAT TGGTGTGTTG 
TTTGACTCTT GAACTAGAGA GATGTTATGA TTTCTATATA GTTGCAAAAT CTTTTAATAC TTAC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTCTCTTC TTCTTCAACC TCACCTCATC CTCTACCTAC TAATCTTGAC GGCGGTGGTG GTTAACGGTG AGATTCTCCG ACCAAGATTC TACAGTGAGA CATGCCCTGA AGCTGAATCC  ATAGTAAGAA GAGAAATGAT GAAAGCTATG ATCAAAGAAT CAAGAAGCGT TGCTTCAGTC ATGCGTCTTC AATTTCACGA CTGTTTTGTC AATGGATGTG ACGCATCTGT GTTGCTTGAT  GATACACCAT ACATGCTTGG TGAGAAACTA TCACTTTCCA ACATCAATTC ACTGAGATCT TTTGAAGTTG TTGATGACAT TAAAGAAGCT TTAGAGGAAG CTTGTCCAGC TACTGTTTCT  TGTGCTGATA TTGTTATCAT GGCCTCTCGT GATGCTGTTG CTCTAACAGG AGGACCTGAT TGGGAGGTGA AGCTAGGGAG GAAAGACAGT TTAACAGCGA GTCAGAAAGA TTCAGATGAT  ATAATGCCAA GTCCAAGAGC CAATGCAACT TTCTTGATTG ATCTTTTCGA AAGATTCGAT CTTTCTGTAA AAGACATGGT GGCTTTATCA GGGTCTCACT CAATTGGTAA AGGTCGATGT  TTCTCCATCA TGTTTAGGCT TTATAACCAG TCCGGGTCTG GTAAACCTGA TCCAGCTTTG GAACCAAGAT ACCGTAAGAA GCTTAACAAG CTTTGTCCTT TGGGTGGAGA TGAGAATGTG  ACTGGAGATT TGGATGCAAC ACCTCAGGTT TTTGATAATC AGTACTTCAA AGATTTGGTT TCAGGGAGAG GGTTTCTGAA CTCTGACCAG ACTTTGTATA CGAATCGAGA GACAAGAGGG  TATGTGAAGA TGTTTAGTGA GAACCAAGCT GAGTTCTTCA GAGCTTTTGA ACAAGGGATG GTGAAGATGG GTGATTTGCA ATCTGGGAGA CCTGGAGAGG TTAGGTTAAA TTGTAGAGTT 
GTTAATAGAA GTCCTATTGG TGTGTTGTTT GACTCTTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTTCAATCA CTGAACCCCA AAAGAATAAA AAAGCATTAA AGAAAAAAGT ATGTCTCTTC TTCTTCAACC TCACCTCATC CTCTACCTAC TAATCTTGAC GGCGGTGGTG GTTAACGGTG  AGATTCTCCG ACCAAGATTC TACAGTGAGA CATGCCCTGA AGCTGAATCC ATAGTAAGAA GAGAAATGAT GAAAGCTATG ATCAAAGAAT CAAGAAGCGT TGCTTCAGTC ATGCGTCTTC  AATTTCACGA CTGTTTTGTC AATGGATGTG ACGCATCTGT GTTGCTTGAT GATACACCAT ACATGCTTGG TGAGAAACTA TCACTTTCCA ACATCAATTC ACTGAGATCT TTTGAAGTTG  TTGATGACAT TAAAGAAGCT TTAGAGGAAG CTTGTCCAGC TACTGTTTCT TGTGCTGATA TTGTTATCAT GGCCTCTCGT GATGCTGTTG CTCTAACAGG AGGACCTGAT TGGGAGGTGA  AGCTAGGGAG GAAAGACAGT TTAACAGCGA GTCAGAAAGA TTCAGATGAT ATAATGCCAA GTCCAAGAGC CAATGCAACT TTCTTGATTG ATCTTTTCGA AAGATTCGAT CTTTCTGTAA  AAGACATGGT GGCTTTATCA GGGTCTCACT CAATTGGTAA AGGTCGATGT TTCTCCATCA TGTTTAGGCT TTATAACCAG TCCGGGTCTG GTAAACCTGA TCCAGCTTTG GAACCAAGAT  ACCGTAAGAA GCTTAACAAG CTTTGTCCTT TGGGTGGAGA TGAGAATGTG ACTGGAGATT TGGATGCAAC ACCTCAGGTT TTTGATAATC AGTACTTCAA AGATTTGGTT TCAGGGAGAG  GGTTTCTGAA CTCTGACCAG ACTTTGTATA CGAATCGAGA GACAAGAGGG TATGTGAAGA TGTTTAGTGA GAACCAAGCT GAGTTCTTCA GAGCTTTTGA ACAAGGGATG GTGAAGATGG  GTGATTTGCA ATCTGGGAGA CCTGGAGAGG TTAGGTTAAA TTGTAGAGTT GTTAATAGAA GTCCTATTGG TGTGTTGTTT GACTCTTGAA CTAGAGAGAT GTTATGATTT CTATATAGTT 
GCAAAATCTT TTAATACTTA C 

Retrieve as FASTA