Entry information : CagraAPx01 (Cagra.1671s0409)
Entry ID 14880
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx01 (Cagra.1671s0409)
Name (synonym) CagraAPx01 (Cagra.1671s0409)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx01
start..stop
S start..stop
BstrAPx01 509 0 1..250 1..250
AhalAPx02 508 0 1..250 1..250
AtAPx01 507 0 1..250 1..250
AlyAPx01 506 0 1..250 1..250
Literature and cross-references CagraAPx01 (Cagra.1671s0409)
Protein sequence: CagraAPx01 (Cagra.1671s0409)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   250
PWM (Da):   %s   27491.7  
PI (pH):   %s   5.82
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKNYPTVSE DYLKAIEKCK RKLRGMIAEK NCAPIMVRLA WHSAGTFDCA SRTGGPFGTM RFDAEQAHGA NSGIHIALRL LEPIREQFPT ISFADFHQLA GVVAVEVTGG PDVPFHPGRE  DKPQPPPEGR LPDATKGCDH LRDVFSKQMG LSDKDIVALS GAHTLGRCHK DRSGFEGAWT SNPLIFDNSY FKELLSGEKE GLLQLVSDKA LLDDPVFRPL VEKYAADEDA FFADYAEAHM 
KLSELGFADA * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGAAGA ACTACCCAAC CGTGAGCGAA GATTACCTTA AGGCTATTGA GAAGTGCAAG AGGAAGCTGA GAGGCATGAT CGCTGAGAAG AACTGTGCAC CCATCATGGT CCGACTCGCG  TAAGTAACTA AACTTATCTG CTTGCTGTTT CTGATGTATT TAAGGATGTG CAAGACCTTC TCATGGCTGT TCTGTTTTGG CTAAAACGCA GGTGGCACTC TGCTGGTACA TTCGATTGCG  CCTCAAGGAC TGGTGGTCCC TTTGGAACAA TGAGGTTCGA TGCTGAGCAA GCTCATGGTG CCAACAGTGG TATCCACATT GCTCTTAGGT TGTTGGAACC CATCAGGGAG CAATTCCCAA  CCATCTCTTT TGCTGATTTC CATCAGGTAC ATGATCAAGT CTACAAAAAC TGTTTGCTTA GTGGTTCTGG TCATAACTCC ATGGTTTGGT TTCTAACTCA CGGTTTTCCT TTGGTGTGAA  ATTGATCATT CAGCTTGCTG GTGTTGTGGC CGTTGAAGTT ACTGGTGGCC CTGATGTTCC TTTCCACCCT GGAAGAGAGG TTAGTCTTTG CTGTGGATTT GTTTACCATG ACTATAGTTA  TCATTTGCTC AATTAGTCGA CAGAATGCTG TCTGCTTCTT TTTCTAAATA GCTATTGGAT AATGTAGTCA TTCTATCACT ACTGAGAGAC TTGATTTTGT ATTGCTAACG TGCATATCTT  GCTTTCAGGA CAAGCCCCAG CCACCTCCAG AGGGTCGTCT TCCTGATGCA ACTAAGGGAT GTGACCACTT GAGAGATGTC TTTAGTAAGC AGATGGGATT ATCTGACAAG GACATTGTCG  CTTTATCTGG TGCCCACACT CTGGTTTGTT TCTCTCCAAT TGCCTGAACA CTTTTTTTTT GTTCCAACTG TACAAACTGT AATCAGTGCC TGCAATTTAT GATAACACAG GGAAGATGCC  ACAAGGATAG GTCTGGCTTC GAAGGTGCCT GGACTTCAAA CCCTCTAATT TTCGACAACT CTTACTTCAA GTGAGTATCC AAGTATCCAC ACCCTTGATA GATGTAGGAG TATTCAATGG  TTGATATGGT TATTAATCAA AGTATATATG ACCAGGGAAC TCTTGAGCGG AGAGAAGGAA GGCCTTCTTC AGCTTGTCTC TGACAAGGCA CTATTGGACG ACCCTGTTTT CCGTCCTTTA  GTCGAGAAAT ACGCTGCTGT AAGCAACCTT TCTCTTTTCC ATGTGCTTCA CTTGGTAGTG AGAGAGAACT AATGGTTTCT TATGAAAATG TGAACAGGAT GAAGATGCCT TCTTCGCTGA  TTACGCTGAG GCCCACATGA AGCTTTCTGA GCTTGGGTAC TTATCATGAA TCTTTGAATC TAGAAAGTAA ATATTAATTC AGTGGTATGA TTTGAGTTTG TATTGTTGGT TGCAGGTTTG  CTGATGCTTA AGGTGGTGGC GTACGTGTGT CTGTCTCCGA GACTAATGGC TGTTTTTGGT TGGGGGCCGG AGGGGTCGCA TTACGTTTGA ACTTTGTCAT ATGATTGCTT AATGTACTCT 
CGGATTTGCG TATTTGTTTT TCGATGGGTT GTGATTTGAC ACATCCGTTG CGCTTTTGCT GGCTAGACAT TTTTAATAAA ATTAACTTCT CTC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGAAGA ACTACCCAAC CGTGAGCGAA GATTACCTTA AGGCTATTGA GAAGTGCAAG AGGAAGCTGA GAGGCATGAT CGCTGAGAAG AACTGTGCAC CCATCATGGT CCGACTCGCG  TGGCACTCTG CTGGTACATT CGATTGCGCC TCAAGGACTG GTGGTCCCTT TGGAACAATG AGGTTCGATG CTGAGCAAGC TCATGGTGCC AACAGTGGTA TCCACATTGC TCTTAGGTTG  TTGGAACCCA TCAGGGAGCA ATTCCCAACC ATCTCTTTTG CTGATTTCCA TCAGCTTGCT GGTGTTGTGG CCGTTGAAGT TACTGGTGGC CCTGATGTTC CTTTCCACCC TGGAAGAGAG  GACAAGCCCC AGCCACCTCC AGAGGGTCGT CTTCCTGATG CAACTAAGGG ATGTGACCAC TTGAGAGATG TCTTTAGTAA GCAGATGGGA TTATCTGACA AGGACATTGT CGCTTTATCT  GGTGCCCACA CTCTGGGAAG ATGCCACAAG GATAGGTCTG GCTTCGAAGG TGCCTGGACT TCAAACCCTC TAATTTTCGA CAACTCTTAC TTCAAGGAAC TCTTGAGCGG AGAGAAGGAA  GGCCTTCTTC AGCTTGTCTC TGACAAGGCA CTATTGGACG ACCCTGTTTT CCGTCCTTTA GTCGAGAAAT ACGCTGCTGA TGAAGATGCC TTCTTCGCTG ATTACGCTGA GGCCCACATG 
AAGCTTTCTG AGCTTGGGTT TGCTGATGCT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTAGAACGTT CTCTTCATGG AAACAGGCCC CCTATATATT TCTCGCATTT CTTCTACCTC CCAACGCTCT CATAAAAAAG TACTCGTGTC TCACCCGTGC CAGCCACTCG CATTTCTCAG  ATCTTTTTAT TATCCTCTCC TCGGAAAAAG CTAAGATGAC GAAGAACTAC CCAACCGTGA GCGAAGATTA CCTTAAGGCT ATTGAGAAGT GCAAGAGGAA GCTGAGAGGC ATGATCGCTG  AGAAGAACTG TGCACCCATC ATGGTCCGAC TCGCGTGGCA CTCTGCTGGT ACATTCGATT GCGCCTCAAG GACTGGTGGT CCCTTTGGAA CAATGAGGTT CGATGCTGAG CAAGCTCATG  GTGCCAACAG TGGTATCCAC ATTGCTCTTA GGTTGTTGGA ACCCATCAGG GAGCAATTCC CAACCATCTC TTTTGCTGAT TTCCATCAGC TTGCTGGTGT TGTGGCCGTT GAAGTTACTG  GTGGCCCTGA TGTTCCTTTC CACCCTGGAA GAGAGGACAA GCCCCAGCCA CCTCCAGAGG GTCGTCTTCC TGATGCAACT AAGGGATGTG ACCACTTGAG AGATGTCTTT AGTAAGCAGA  TGGGATTATC TGACAAGGAC ATTGTCGCTT TATCTGGTGC CCACACTCTG GGAAGATGCC ACAAGGATAG GTCTGGCTTC GAAGGTGCCT GGACTTCAAA CCCTCTAATT TTCGACAACT  CTTACTTCAA GGAACTCTTG AGCGGAGAGA AGGAAGGCCT TCTTCAGCTT GTCTCTGACA AGGCACTATT GGACGACCCT GTTTTCCGTC CTTTAGTCGA GAAATACGCT GCTGATGAAG  ATGCCTTCTT CGCTGATTAC GCTGAGGCCC ACATGAAGCT TTCTGAGCTT GGGTTTGCTG ATGCTTAAGG TGGTGGCGTA CGTGTGTCTG TCTCCGAGAC TAATGGCTGT TTTTGGTTGG  GGGCCGGAGG GGTCGCATTA CGTTTGAACT TTGTCATATG ATTGCTTAAT GTACTCTCGG ATTTGCGTAT TTGTTTTTCG ATGGGTTGTG ATTTGACACA TCCGTTGCGC TTTTGCTGGC 
TAGACATTTT TAATAAAATT AACTTCTCTC 

Retrieve as FASTA