Entry information : CagraPrx35Cagra.0666s0031
Entry ID 14881
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx35Cagra.0666s0031
Name CagraPrx35Cagra.0666s0031
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx031]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx35
start..stop
S start..stop
CrubPrx84 681 0 1..327 1..327
BstrPrx19 667 0 1..327 1..327
AlyPrx21 656 0 1..327 1..327
BrPrx21-1Ab_other 635 0 1..327 1..328
Literature and cross-references CagraPrx35Cagra.0666s0031
Protein sequence: CagraPrx35Cagra.0666s0031
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327 (299)
PWM (Da):   %s   36693.47 (33452.8) Transmb domain:   %s   i7-26o
PI (pH):   %s   6.77 (6.51) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-327
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MASVKPFCLL SFFCLLLQLF SIFHIGNGEL EMNYYRESCP KAEEIIRQQV ETLYYKHGNT AVSWLRNLFH DCVVKSCDAS LLLETARGVE SEQKSTRSFG MRNFKYVKII KDALEKECPS  TVSCADIVAL SARDGIVMLK GPKIEMIKTG RRDSRGSYLA DVETLIPNHN DSLSSVLSTF DSLGIDVEAT VALLGAHSVG RVHCVNLVHR LYPTVDPTLD PSYALYLKNR CPTPTPDPNA 
VLYSRNDRET PMVVDNMYYK NIMAHKGLLV IDDELATDPR TAPFVAKMAA DNGYFHEQFS RGVRLLSETN PLTGDQGEIR KDCRYVN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCAATTATTT TAGTAGAAAA AAAAAGAGAG AAAGAGAGAG CAATGGCCAG TGTGAAGCCC TTCTGCCTCC TCAGCTTCTT TTGTCTGTTA TTACAGTTAT TCTCCATCTT CCATATCGGT  AAATACATTC TTCCCTTAGC CAATCACGTC ATGCCATGTA TCTTCTTGCT TCACAAGTTT AATTTTCCAC CGTTCAATAT TTCTATAAAC TGATAAAATA AATATATGAA AATTTTTAGG  AAATGGGGAG TTGGAGATGA ACTATTACAG AGAGAGTTGT CCAAAAGCGG AAGAGATAAT AAGACAACAA GTGGAGACGC TTTACTACAA ACACGGCAAC ACTGCCGTCT CTTGGCTCCG  TAATCTCTTC CATGACTGTG TCGTCAAGGT ATATATTAAT CAACTCTTTT TACATATAAT TCACCAATAC TAATATATAA TAATACGACA TAGTATATAT TAATGTTCTC GTGTGTGTAT  TTTTCTATAT TTTGTAGTCG TGTGATGCGT CGCTGCTGCT AGAGACAGCG AGAGGTGTGG AGTCTGAACA GAAATCGACG AGGAGCTTCG GCATGAGAAA CTTTAAGTAC GTTAAGATTA  TCAAAGACGC ACTTGAGAAA GAGTGTCCTT CCACTGTCTC TTGCGCTGAT ATCGTCGCTC TCTCTGCTAG AGACGGTATT GTCATGGTGC GTTTACACAT ATATTTACAT GCGTTTTTAC  AGTTAGTTTG TAATTTCTTT GGTTAATTTT TGTTTTTTTG GGGTGAAATT TAATAGTTGA AAGGGCCAAA AATAGAGATG ATAAAGACAG GAAGGAGAGA TAGCAGAGGA AGCTACTTGG  CAGATGTTGA GACTCTAATC CCTAACCACA ATGACTCTCT CTCCTCTGTT CTCTCCACCT TTGACTCCCT TGGCATTGAT GTAGAAGCTA CTGTCGCTCT CTTAGGTACC ATCTTTTAAC  TACATAGATC ATCTAATCTA AACGGGCATG ATCAGTAACA CTTAACTAGG ATCGAGTATG GTCCAAAACC AAAAACAAAA ACCGAAAGAT AAGAGTTTTG GTTCGATCTA AAACAAGTTT  TTGTCTTTTA ATCTTGACTC AACCATAAAA GTTTGATTCT TATCAAATAT ACATCTAGTA ATACAATAAT GTTTTATATG GAAAGCTACG TTAATAGTTA ATTTACTTTT TTTTGGGTTA  TGAATAAAAC CAGATCATTA TACAATAATT TTTTATTTCG TATTGATTCG GGCTTTGAGT TAATAATGTC TAATGATAGA GACGGAAGTA AAAAGATATA TAAAATCATA GAATTTTTCT  TAGAGATATA TGAATGATGA AATCTTGAAT AAGAATGACA TTGTTATTGA TTAGTCAATT TATATTACCG TAGGTGCTCA CTCAGTGGGC AGGGTCCACT GCGTTAACCT AGTGCACCGG  CTATACCCAA CGGTCGACCC GACTCTCGAC CCAAGTTACG CCCTTTACTT GAAGAATCGT TGCCCAACTC CAACACCGGA CCCGAACGCC GTCTTGTACT CCCGCAACGA TCGCGAGACC  CCTATGGTTG TGGACAACAT GTACTACAAG AACATCATGG CACACAAGGG GCTTCTTGTT ATCGATGATG AGCTAGCCAC CGATCCAAGA ACCGCACCGT TTGTGGCCAA GATGGCTGCA  GATAATGGTT ACTTCCACGA GCAGTTCTCA CGCGGCGTCA GGCTCTTGTC GGAGACAAAC CCGCTTACTG GAGACCAAGG GGAGATCAGG AAGGATTGTC GTTATGTGAA CTAATATTTG 
GTTATAATGT TGTGAAAGAT AATAATCATA TATATGAATG TATGTATTTG AATGTTTTGG AATCAATAAG AAGAAATACC AAAACCTTTG TGGATTGAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCCAGTG TGAAGCCCTT CTGCCTCCTC AGCTTCTTTT GTCTGTTATT ACAGTTATTC TCCATCTTCC ATATCGGAAA TGGGGAGTTG GAGATGAACT ATTACAGAGA GAGTTGTCCA  AAAGCGGAAG AGATAATAAG ACAACAAGTG GAGACGCTTT ACTACAAACA CGGCAACACT GCCGTCTCTT GGCTCCGTAA TCTCTTCCAT GACTGTGTCG TCAAGTCGTG TGATGCGTCG  CTGCTGCTAG AGACAGCGAG AGGTGTGGAG TCTGAACAGA AATCGACGAG GAGCTTCGGC ATGAGAAACT TTAAGTACGT TAAGATTATC AAAGACGCAC TTGAGAAAGA GTGTCCTTCC  ACTGTCTCTT GCGCTGATAT CGTCGCTCTC TCTGCTAGAG ACGGTATTGT CATGTTGAAA GGGCCAAAAA TAGAGATGAT AAAGACAGGA AGGAGAGATA GCAGAGGAAG CTACTTGGCA  GATGTTGAGA CTCTAATCCC TAACCACAAT GACTCTCTCT CCTCTGTTCT CTCCACCTTT GACTCCCTTG GCATTGATGT AGAAGCTACT GTCGCTCTCT TAGGTGCTCA CTCAGTGGGC  AGGGTCCACT GCGTTAACCT AGTGCACCGG CTATACCCAA CGGTCGACCC GACTCTCGAC CCAAGTTACG CCCTTTACTT GAAGAATCGT TGCCCAACTC CAACACCGGA CCCGAACGCC  GTCTTGTACT CCCGCAACGA TCGCGAGACC CCTATGGTTG TGGACAACAT GTACTACAAG AACATCATGG CACACAAGGG GCTTCTTGTT ATCGATGATG AGCTAGCCAC CGATCCAAGA  ACCGCACCGT TTGTGGCCAA GATGGCTGCA GATAATGGTT ACTTCCACGA GCAGTTCTCA CGCGGCGTCA GGCTCTTGTC GGAGACAAAC CCGCTTACTG GAGACCAAGG GGAGATCAGG 
AAGGATTGTC GTTATGTGAA CTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCAATTATTT TAGTAGAAAA AAAAAGAGAG AAAGAGAGAG CAATGGCCAG TGTGAAGCCC TTCTGCCTCC TCAGCTTCTT TTGTCTGTTA TTACAGTTAT TCTCCATCTT CCATATCGGA  AATGGGGAGT TGGAGATGAA CTATTACAGA GAGAGTTGTC CAAAAGCGGA AGAGATAATA AGACAACAAG TGGAGACGCT TTACTACAAA CACGGCAACA CTGCCGTCTC TTGGCTCCGT  AATCTCTTCC ATGACTGTGT CGTCAAGTCG TGTGATGCGT CGCTGCTGCT AGAGACAGCG AGAGGTGTGG AGTCTGAACA GAAATCGACG AGGAGCTTCG GCATGAGAAA CTTTAAGTAC  GTTAAGATTA TCAAAGACGC ACTTGAGAAA GAGTGTCCTT CCACTGTCTC TTGCGCTGAT ATCGTCGCTC TCTCTGCTAG AGACGGTATT GTCATGTTGA AAGGGCCAAA AATAGAGATG  ATAAAGACAG GAAGGAGAGA TAGCAGAGGA AGCTACTTGG CAGATGTTGA GACTCTAATC CCTAACCACA ATGACTCTCT CTCCTCTGTT CTCTCCACCT TTGACTCCCT TGGCATTGAT  GTAGAAGCTA CTGTCGCTCT CTTAGGTGCT CACTCAGTGG GCAGGGTCCA CTGCGTTAAC CTAGTGCACC GGCTATACCC AACGGTCGAC CCGACTCTCG ACCCAAGTTA CGCCCTTTAC  TTGAAGAATC GTTGCCCAAC TCCAACACCG GACCCGAACG CCGTCTTGTA CTCCCGCAAC GATCGCGAGA CCCCTATGGT TGTGGACAAC ATGTACTACA AGAACATCAT GGCACACAAG  GGGCTTCTTG TTATCGATGA TGAGCTAGCC ACCGATCCAA GAACCGCACC GTTTGTGGCC AAGATGGCTG CAGATAATGG TTACTTCCAC GAGCAGTTCT CACGCGGCGT CAGGCTCTTG  TCGGAGACAA ACCCGCTTAC TGGAGACCAA GGGGAGATCA GGAAGGATTG TCGTTATGTG AACTAATATT TGGTTATAAT GTTGTGAAAG ATAATAATCA TATATATGAA TGTATGTATT 
TGAATGTTTT GGAATCAATA AGAAGAAATA CCAAAACCTT TGTGGATTGA G 

Retrieve as FASTA