Entry information : CagraPrx40Cagra.3706s0032
Entry ID 14886
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx40Cagra.3706s0032
Name CagraPrx40Cagra.3706s0032
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx028]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx40
start..stop
S start..stop
CrubPrx44 692 0 3..335 1..333
BstrPrx74 673 0 1..335 1..335
AhalPrx12 668 0 1..335 1..335
AlyPrx26 659 0 1..335 1..335
Literature and cross-references CagraPrx40Cagra.3706s0032
Protein sequence: CagraPrx40Cagra.3706s0032
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   335 (310)
PWM (Da):   %s   37571.76 (34714.3)  
PI (pH):   %s   8.37 (8.53) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-335
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVMYQIFLTV VVLGAVSFFP ETAEAAVMGP SMQKLTWHYY KVYNTCENAE NFIRHQVEIF YRNDKSIAPK LLRLLYSDCF VSGCDASVLL EGPNSERMAP QNRGLGGFVI IDKIKLVLEQ  RCPGVVSCAD ILNLATRDAV HLAGAPSYPV FTGRRDGLTS DKQTVDLPSP SISWDQAMAY FNSRGLSVLD MATLLGSHSM GRTHCSHVVD RLYNYNKTGK PSPTMNKYFL SEMAKQCPPR 
TKKGQTDPLV YLNPDSGSNH SFTNSFYSRI LSNKSVLEVD QQLLYNDDTK QISEEFAASF EDLRKSFALS MSKMGAINVL TKTEGEIRRD CRRRN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTATGT ATCAGATCTT CCTCACCGTG GTGGTGCTTG GAGCCGTCAG TTTCTTCCCG GAAACGGCAG AAGCGGCCGT GATGGGACCT TCGATGCAGA AGCTAACGTG GCATTACTAC  AAAGTTTACA ACACTTGCGA GAACGCCGAG AATTTTATAA GGCACCAAGT TGAGATATTT TACAGGAACG ATAAGAGCAT TGCTCCTAAG CTCCTTCGTC TCCTCTACTC CGACTGCTTC  GTCTCCGTAC GTTTCTTCTT ATCCTTATCT TACCCCATTT GAATACATGT CATATGAAAC CTAAGGATAT ATTATCATGT ACGATAGGGA TGCGACGCAT CTGTTCTTCT AGAAGGTCCG  AACTCAGAGA GAATGGCGCC ACAAAACAGA GGACTTGGAG GATTCGTGAT CATAGACAAA ATCAAACTAG TCTTGGAACA AAGATGTCCC GGTGTTGTCT CTTGCGCCGA CATTCTTAAT  CTTGCAACTC GGGATGCCGT TCATTTGGTA ACTAATCTCT CTAGTCTCTA CCTATAGCTA TAGACATGGA TCACCTTAGA TACTGACCAG CTGAGAGATA CGGTTTCGTA CAGGCTGGTG  CACCATCTTA TCCAGTATTC ACCGGGAGGA GAGATGGCTT GACGTCGGAT AAGCAAACAG TGGACTTACC ATCACCATCC ATCTCATGGG ACCAAGCCAT GGCTTATTTC AATTCTAGAG  GCTTGAGTGT CCTTGACATG GCTACACTTC TAGGTCAGTC ATCTTTTCGT CCTACCTTGT ATATCTTTAA ACCGGTTTAT ATTTAAGGAT TTATATAGGA CTGCCCATCC TGCGTTCCGG  TTCGGTAAGT GAAATTCTTG GTTCATGAAT AATAAAAAAC AAAAAGAGAC CAAAAAATCA TTCGTTTCCG TTAGATATAG GTTTGGTCTC TGCTCATACT TTGAAGGTAG TTTTAATCTG  GTCTGAATCG CTTTAACTGA ACTACTCCCT AATCAGGATC ACATTCAATG GGGAGAACAC ATTGCAGCCA CGTCGTTGAT CGTCTCTACA ATTACAACAA AACCGGTAAA CCAAGTCCGA  CTATGAACAA GTATTTCCTG TCTGAAATGG CAAAGCAATG TCCACCAAGA ACGAAGAAAG GCCAAACCGA TCCGCTTGTG TACCTAAACC CGGACTCGGG CTCAAACCAC AGTTTCACAA  ACTCATTCTA CTCAAGAATT CTATCAAACA AATCTGTACT TGAAGTGGAT CAACAACTGC TTTACAATGA TGACACCAAG CAAATTTCTG AGGAATTTGC AGCAAGTTTT GAGGATCTTC 
GGAAATCCTT TGCTCTTTCG ATGAGCAAGA TGGGAGCGAT AAATGTGTTA ACTAAAACCG AAGGTGAGAT ACGAAGAGAC TGCAGGCGTA GAAACTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTATGT ATCAGATCTT CCTCACCGTG GTGGTGCTTG GAGCCGTCAG TTTCTTCCCG GAAACGGCAG AAGCGGCCGT GATGGGACCT TCGATGCAGA AGCTAACGTG GCATTACTAC  AAAGTTTACA ACACTTGCGA GAACGCCGAG AATTTTATAA GGCACCAAGT TGAGATATTT TACAGGAACG ATAAGAGCAT TGCTCCTAAG CTCCTTCGTC TCCTCTACTC CGACTGCTTC  GTCTCCGGAT GCGACGCATC TGTTCTTCTA GAAGGTCCGA ACTCAGAGAG AATGGCGCCA CAAAACAGAG GACTTGGAGG ATTCGTGATC ATAGACAAAA TCAAACTAGT CTTGGAACAA  AGATGTCCCG GTGTTGTCTC TTGCGCCGAC ATTCTTAATC TTGCAACTCG GGATGCCGTT CATTTGGCTG GTGCACCATC TTATCCAGTA TTCACCGGGA GGAGAGATGG CTTGACGTCG  GATAAGCAAA CAGTGGACTT ACCATCACCA TCCATCTCAT GGGACCAAGC CATGGCTTAT TTCAATTCTA GAGGCTTGAG TGTCCTTGAC ATGGCTACAC TTCTAGGATC ACATTCAATG  GGGAGAACAC ATTGCAGCCA CGTCGTTGAT CGTCTCTACA ATTACAACAA AACCGGTAAA CCAAGTCCGA CTATGAACAA GTATTTCCTG TCTGAAATGG CAAAGCAATG TCCACCAAGA  ACGAAGAAAG GCCAAACCGA TCCGCTTGTG TACCTAAACC CGGACTCGGG CTCAAACCAC AGTTTCACAA ACTCATTCTA CTCAAGAATT CTATCAAACA AATCTGTACT TGAAGTGGAT  CAACAACTGC TTTACAATGA TGACACCAAG CAAATTTCTG AGGAATTTGC AGCAAGTTTT GAGGATCTTC GGAAATCCTT TGCTCTTTCG ATGAGCAAGA TGGGAGCGAT AAATGTGTTA 
ACTAAAACCG AAGGTGAGAT ACGAAGAGAC TGCAGGCGTA GAAACTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTTATGT ATCAGATCTT CCTCACCGTG GTGGTGCTTG GAGCCGTCAG TTTCTTCCCG GAAACGGCAG AAGCGGCCGT GATGGGACCT TCGATGCAGA AGCTAACGTG GCATTACTAC  AAAGTTTACA ACACTTGCGA GAACGCCGAG AATTTTATAA GGCACCAAGT TGAGATATTT TACAGGAACG ATAAGAGCAT TGCTCCTAAG CTCCTTCGTC TCCTCTACTC CGACTGCTTC  GTCTCCGGAT GCGACGCATC TGTTCTTCTA GAAGGTCCGA ACTCAGAGAG AATGGCGCCA CAAAACAGAG GACTTGGAGG ATTCGTGATC ATAGACAAAA TCAAACTAGT CTTGGAACAA  AGATGTCCCG GTGTTGTCTC TTGCGCCGAC ATTCTTAATC TTGCAACTCG GGATGCCGTT CATTTGGCTG GTGCACCATC TTATCCAGTA TTCACCGGGA GGAGAGATGG CTTGACGTCG  GATAAGCAAA CAGTGGACTT ACCATCACCA TCCATCTCAT GGGACCAAGC CATGGCTTAT TTCAATTCTA GAGGCTTGAG TGTCCTTGAC ATGGCTACAC TTCTAGGATC ACATTCAATG  GGGAGAACAC ATTGCAGCCA CGTCGTTGAT CGTCTCTACA ATTACAACAA AACCGGTAAA CCAAGTCCGA CTATGAACAA GTATTTCCTG TCTGAAATGG CAAAGCAATG TCCACCAAGA  ACGAAGAAAG GCCAAACCGA TCCGCTTGTG TACCTAAACC CGGACTCGGG CTCAAACCAC AGTTTCACAA ACTCATTCTA CTCAAGAATT CTATCAAACA AATCTGTACT TGAAGTGGAT  CAACAACTGC TTTACAATGA TGACACCAAG CAAATTTCTG AGGAATTTGC AGCAAGTTTT GAGGATCTTC GGAAATCCTT TGCTCTTTCG ATGAGCAAGA TGGGAGCGAT AAATGTGTTA 
ACTAAAACCG AAGGTGAGAT ACGAAGAGAC TGCAGGCGTA GAAACTAA 

Retrieve as FASTA