Entry information : CagraPrx41Cagra.2622s0035
Entry ID 14887
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx41Cagra.2622s0035
Name CagraPrx41Cagra.2622s0035
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx009]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx41
start..stop
S start..stop
CrubPrx66 669 0 1..326 1..326
BstrPrx02 629 0 1..326 4..329
AlyPrx30 629 0 1..326 4..329
AruPrx30 618 0 15..326 20..331
Literature and cross-references CagraPrx41Cagra.2622s0035
Protein sequence: CagraPrx41Cagra.2622s0035
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (302)
PWM (Da):   %s   35412.05 (32955.7)  
PI (pH):   %s   9.61 (9.62) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-326
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKPLNIAVAV AVTVLIGTFG SSEAQLQMNF YAKSCPNAEK IISDHIQNHI HHGPSLAAPL IRMHFHDCFV RGCDGSVLIN STSGNAEKDS APNLTLRGFG FVERIKTLLE AECPKTVSCA  DIIALTARDA VVATGGPSWR VPTGRRDGRI SNSTEAFNNI PPPTSNFTTL QRLFANQGLN LKDLVLLSGA HTIGVSHCSS MNTRLYNFST TVKQDPSLDT EYAANLKANK CKSLNDNTTI 
LEMDPGSRRS FDLSYYRLVL KRRGLFQSDA ALTTNSATLK MINDLVNGPE EKFYKAFAKS MEKMGRVKVK TGSSGVIRTR CSVAGS* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCTGTCTCT CTTCAGTGAC ACAAAACCAA AGAGTAGGGA GAAACAAAGA TCTAGGAAAC CACTCGAGGG AAGACTATGA AGCCATTGAA CATTGCGGTT GCGGTTGCAG TGACGGTTCT  TATTGGAACC TTTGGATCAT CGGAGGCTCA ACTTCAAATG AACTTCTACG CGAAGAGCTG TCCAAACGCA GAGAAAATAA TTTCAGATCA TATTCAAAAT CATATCCATC ATGGTCCATC  TCTTGCAGCT CCTCTCATCA GAATGCACTT CCATGATTGC TTCGTTAGGG TATGTATTTA TAATCTCTAA GATTTTAACG CACACGTATA TATACTTACT TGCAAGTTGC AAGTATTATG  AATTATGAAC ATACTTACAT TTATATTCAC ATCCAAGTTC AATAGCTTAC TAAAAATGGT AAGGTACTCC AGAAGATGTA TCATCATATT ATAATATATT TTTCTCATAT TAAGTAAATA  GAAGTGTGAA TTTTTTATGG TAACTTTGAG CTATAGCATA ATTGTTTTAT ATTAATTGCA TTTTTTTTCT TCTATATATT GTTACTGAGT TTGGAAAAAA AATATAATGA AGGGATGTGA  TGGATCGGTG TTGATAAATT CAACATCTGG GAACGCAGAG AAAGATTCAG CACCGAACCT AACACTTAGA GGATTTGGTT TCGTAGAGAG GATCAAGACT CTTCTTGAAG CAGAGTGTCC  TAAGACTGTT TCTTGCGCTG ATATTATCGC TTTAACCGCT AGAGACGCAG TTGTCGCCAC CGTAAGTGTT ACAAAATATA AATTAGCAAC ACAATATAAT TCGTTAAGTA AGAAAATTTA  TAATATGATC TATATTCTTA TACAGGGAGG TCCTTCATGG AGAGTCCCAA CGGGAAGAAG AGACGGAAGG ATCTCAAACT CTACGGAGGC TTTTAACAAC ATTCCACCGC CAACAAGTAA  CTTCACGACG TTACAGCGAC TTTTCGCTAA CCAAGGCCTT AATCTCAAAG ACCTTGTTCT GCTCTCCGGT AACTCAACAT AGCAAGAATT AGTCAAGTCA CGGCTCATGT ACGTAGTTTC  TTTAACGAGT TTGACATTTG TTTTGTGTTT TTTCAGGGGC TCATACGATT GGTGTCTCGC ATTGTTCTTC CATGAACACT CGTCTTTACA ACTTCTCGAC GACAGTGAAA CAAGATCCAT  CTCTAGATAC CGAGTACGCA GCTAACCTTA AGGCTAACAA ATGCAAGAGC CTTAACGACA ACACCACCAT CCTAGAGATG GATCCGGGGA GTAGGAGAAG CTTCGATCTC AGTTATTACA  GGCTTGTCCT AAAGAGGAGA GGTTTGTTTC AATCTGATGC TGCCTTGACG ACGAACTCAG CCACGTTGAA GATGATCAAC GACTTGGTCA ACGGTCCTGA AGAGAAGTTT TACAAAGCCT  TCGCTAAGTC GATGGAGAAG ATGGGGAGAG TTAAAGTGAA GACTGGCTCA TCAGGCGTGA TCAGGACACG CTGTTCTGTC GCCGGAAGCT AGTTTTACAT ATACCACATC GGAAGAGTGG  TGTGTGTTCT GTTATTCATT GTTGTTAATT ATCTTTAACT TTTGGGGGAT GTGTTAACGT TGTTACTTTT ATTTTGATGT TGTGTTGAAA TGTGTTTTAT GCACCCAAGA ATCATTCTAA 
ATTTACAATA ATCCTCTCAT TACTTTGTTT TCACAATGAA TAAAAC 

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CDS
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGCCAT TGAACATTGC GGTTGCGGTT GCAGTGACGG TTCTTATTGG AACCTTTGGA TCATCGGAGG CTCAACTTCA AATGAACTTC TACGCGAAGA GCTGTCCAAA CGCAGAGAAA  ATAATTTCAG ATCATATTCA AAATCATATC CATCATGGTC CATCTCTTGC AGCTCCTCTC ATCAGAATGC ACTTCCATGA TTGCTTCGTT AGGGGATGTG ATGGATCGGT GTTGATAAAT  TCAACATCTG GGAACGCAGA GAAAGATTCA GCACCGAACC TAACACTTAG AGGATTTGGT TTCGTAGAGA GGATCAAGAC TCTTCTTGAA GCAGAGTGTC CTAAGACTGT TTCTTGCGCT  GATATTATCG CTTTAACCGC TAGAGACGCA GTTGTCGCCA CCGGAGGTCC TTCATGGAGA GTCCCAACGG GAAGAAGAGA CGGAAGGATC TCAAACTCTA CGGAGGCTTT TAACAACATT  CCACCGCCAA CAAGTAACTT CACGACGTTA CAGCGACTTT TCGCTAACCA AGGCCTTAAT CTCAAAGACC TTGTTCTGCT CTCCGGGGCT CATACGATTG GTGTCTCGCA TTGTTCTTCC  ATGAACACTC GTCTTTACAA CTTCTCGACG ACAGTGAAAC AAGATCCATC TCTAGATACC GAGTACGCAG CTAACCTTAA GGCTAACAAA TGCAAGAGCC TTAACGACAA CACCACCATC  CTAGAGATGG ATCCGGGGAG TAGGAGAAGC TTCGATCTCA GTTATTACAG GCTTGTCCTA AAGAGGAGAG GTTTGTTTCA ATCTGATGCT GCCTTGACGA CGAACTCAGC CACGTTGAAG  ATGATCAACG ACTTGGTCAA CGGTCCTGAA GAGAAGTTTT ACAAAGCCTT CGCTAAGTCG ATGGAGAAGA TGGGGAGAGT TAAAGTGAAG ACTGGCTCAT CAGGCGTGAT CAGGACACGC 
TGTTCTGTCG CCGGAAGCTA G 

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cDNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CCCTGTCTCT CTTCAGTGAC ACAAAACCAA AGAGTAGGGA GAAACAAAGA TCTAGGAAAC CACTCGAGGG AAGACTATGA AGCCATTGAA CATTGCGGTT GCGGTTGCAG TGACGGTTCT  TATTGGAACC TTTGGATCAT CGGAGGCTCA ACTTCAAATG AACTTCTACG CGAAGAGCTG TCCAAACGCA GAGAAAATAA TTTCAGATCA TATTCAAAAT CATATCCATC ATGGTCCATC  TCTTGCAGCT CCTCTCATCA GAATGCACTT CCATGATTGC TTCGTTAGGG GATGTGATGG ATCGGTGTTG ATAAATTCAA CATCTGGGAA CGCAGAGAAA GATTCAGCAC CGAACCTAAC  ACTTAGAGGA TTTGGTTTCG TAGAGAGGAT CAAGACTCTT CTTGAAGCAG AGTGTCCTAA GACTGTTTCT TGCGCTGATA TTATCGCTTT AACCGCTAGA GACGCAGTTG TCGCCACCGG  AGGTCCTTCA TGGAGAGTCC CAACGGGAAG AAGAGACGGA AGGATCTCAA ACTCTACGGA GGCTTTTAAC AACATTCCAC CGCCAACAAG TAACTTCACG ACGTTACAGC GACTTTTCGC  TAACCAAGGC CTTAATCTCA AAGACCTTGT TCTGCTCTCC GGGGCTCATA CGATTGGTGT CTCGCATTGT TCTTCCATGA ACACTCGTCT TTACAACTTC TCGACGACAG TGAAACAAGA  TCCATCTCTA GATACCGAGT ACGCAGCTAA CCTTAAGGCT AACAAATGCA AGAGCCTTAA CGACAACACC ACCATCCTAG AGATGGATCC GGGGAGTAGG AGAAGCTTCG ATCTCAGTTA  TTACAGGCTT GTCCTAAAGA GGAGAGGTTT GTTTCAATCT GATGCTGCCT TGACGACGAA CTCAGCCACG TTGAAGATGA TCAACGACTT GGTCAACGGT CCTGAAGAGA AGTTTTACAA  AGCCTTCGCT AAGTCGATGG AGAAGATGGG GAGAGTTAAA GTGAAGACTG GCTCATCAGG CGTGATCAGG ACACGCTGTT CTGTCGCCGG AAGCTAGTTT TACATATACC ACATCGGAAG  AGTGGTGTGT GTTCTGTTAT TCATTGTTGT TAATTATCTT TAACTTTTGG GGGATGTGTT AACGTTGTTA CTTTTATTTT GATGTTGTGT TGAAATGTGT TTTATGCACC CAAGAATCAT 
TCTAAATTTA CAATAATCCT CTCATTACTT TGTTTTCACA ATGAATAAAA C 

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