Entry information : CagraAPx-R01 (Cagra.2471s0020)
Entry ID 14888
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx-R01 (Cagra.2471s0020)
Name (synonym) CagraAPx-R01 (Cagra.2471s0020)
Class Ascorbate peroxidase related    [Orthogroup: APx-R001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx-R01
start..stop
S start..stop
CrubAPx-R01 669 0 1..327 1..327
BstrAPx-R01 612 0 1..327 1..331
AlyAPx-R 592 0 3..327 2..329
AtAPx-R 583 0 3..327 2..329
Literature and cross-references CagraAPx-R01 (Cagra.2471s0020)
Protein sequence: CagraAPx-R01 (Cagra.2471s0020)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   327
PWM (Da):   %s   35866.73  
PI (pH):   %s   9.47
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTTATTASLL ETSLLRCDSS SSSFKFKLPA KTRLLPPATG KHVVRTLRAW RIRCVSDDPG WRPDLVSSRR KMVVMLSTVQ LLSHLVPPYG KAADIYPVMQ NEIRKVVTKG KAAGVLRLVF  HDAGTFELED NSGGINGSIA YELERPENTG LKKSLKVLAK AKIKVDEIQP VSWADMISVA GSEAVSICGG PIIPVLLGRL DSTQPDPEGK LPPETLSASG LKECFKRKGF STQELVALSG 
AHTIGSKGFG DPTVFDNAYY KILLEKPWTS ASKMTSMVGL PSDHALVDDD ECLRWVKRYA EDQDKFFEDF TNAYKKLVNS GAKWNKL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGG CGACGACTGC GTCACTGTTG GAGACTTCTC TTTTACGGTG CGACTCGTCT TCTTCTTCTT TCAAATTCAA ACTTCCAGCG AAAACGCGAC TGCTCCCTCC GGCGACCGGG  AAACATGTTG TGAGAACGTT AAGAGCTTGG CGTATTCGTT GCGTCTCCGA TGATCCTGGT AAGACCGGAT TCTAGTATCA TTAGCCATAT ATGTTCTATG GTTCCTGTTT CCGTCGATCT  CGGAACAGAA TAGCTTCGTT TTATAATTTG AAATGAAATG CTTAGTCCGA TTGGAAAACT TTAAATGCTT GGAGTCCGAT TCGTGCTGAG GTTGTTCTGT TTCTGCATAA TTTCTAGGTT  GGCGTCCTGA TTTGGTTTCC AGTAGAAGAA AAATGGTTGT AATGTTGTCC ACAGTGCAGC TTCTGTCTCA TTTGGTTCCG CCATATGGCA AGGCAGCTGA GTGAGTCTTA AAAATTGAAG  CTGGATTTTG GTTTGGTTAT TTGGATCAGT GTTCTTCAAG CTATTGTATT CCAATGTCTT GTGCTAATTT TGCAAATCGC ACTGTTGGAT TACAGCATTT ATCCAGTGAT GCAAAACGAA  ATAAGGAAAG TCGTGACAAA GGGTAAGGCT GCTGGTGTGC TTCGTCTAGT GTTTCATGAT GCTGGAACCT TTGAACTGGA AGATAATTCA GGTAAACAGA TAAGTTTTAA ATTGTAAACA  TTTGGTTGTT AGATCACTTC TGTTGGTTAT CTTTTCTTGC TTTCTCAGTA AAAGATACTG CAATCCACTA GCTAAGATCA ATTATCTTCT TGGTTATGAA TTTAATTGCA GGTGGCATCA  ACGGGTCTAT TGCATATGAA CTTGAGAGAC CTGAAAACAC TGGTTTGAAG AAATCCTTAA AGGCACTAAA TCCCTCTCTT TAATCTGTTA GCGTGAGCAT ATAAAGATGT AATTTTCGCA  TCTACGTAAC TGCCTTTTTT GTATATATTT GCTCATGTAT CTCAAATATG TTACTTTCGA AAATTTCATC TACTAATCTT CTTGGTAGAT GTATTCTTTG CTAGGTTCTA GCAAAAGCAA  AGATTAAGGT TGATGAGATA CAACCAGGTA CTTACTTTTT GAACTATGCA GTACATTAAA GACATGTGTC CTGTCATAAG AGTTGGTGCT AATGTTCTCA ATCTGCGTGA TCTCAGTGTC  TTGGGCAGAT ATGATCTCTG TCGCTGGATC AGAAGCAGTT TCAATATGTG GCGGCCCAAT AATTCCAGTA CTTTTGGGAA GACTTGATTC AACGTAAGGA ATATATGGTT GTAGTCCTCA  TTCGATTGAT TTCTGGTTAC TGTTTCTATA TTTCCAGCAG GGTGATTGTC TCATGTTCAC AGGCAACCTG ATCCAGAAGG CAAGCTACCT CCAGAAACCC TGAGTGCCTC TGGTTTAAAA  GAATGCTTCA AAAGAAAAGG ATTTTCGTGA GTCGCTACAC AAAGATAGCT ATGAATTGTT TTAACATGTT TTTGTATCAA CATTTTGTAA CTCGACGTCA ATGGGTTTGT GTACCATTGC  AGGACTCAGG AGCTTGTTGC TTTATCTGGG GCCCATACGA TAGGGAGTAA AGGCTTTGGG GATCCGACAG TTTTTGACAA TGCATACTAC AAAATCCTTC TTGAAAAACC ATGGACATCA  GCTTGTAAGT CTGATGACAA AGTTCTTAAG TTCCTTAACT CGTACAATTT AAGTTTCCAA CCATTCCTCC CTATGTTCTG AAGATTGTTT GTAAGACTGA GATTATACAT TTACATAGTT  ATGTTCTTAT GATGCAGCCA AAATGACGAG CATGGTCGGC CTCCCTTCGG ATCATGCCTT AGTGGACGAT GATGAGTGTT TAAGGTTTCT CAGTTTCTGA ATGTTCTTAC CTTATCATTT  ATTTATCTAA TTTTCTCTTT AGTACTAGTT TTAGTAGAGT GGAGTAATGT GCTGAACACT TGGACTATAG GCTCATGGAT AAAACTGGAA TATGTTGCAC ATTGTTCATG TCATATGAGC  GATCTGGAAA ACTATTAATT GATATAGATT TGTGGTTTGA TGATGCACAG ATGGGTGAAA CGATATGCGG AAGACCAAGA CAAGTTCTTC GAAGACTTCA CCAATGCTTA TAAAAAACTA 
GTGAATTCTG GGGCTAAATG GAATAAGTTA TGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGACGG CGACGACTGC GTCACTGTTG GAGACTTCTC TTTTACGGTG CGACTCGTCT TCTTCTTCTT TCAAATTCAA ACTTCCAGCG AAAACGCGAC TGCTCCCTCC GGCGACCGGG  AAACATGTTG TGAGAACGTT AAGAGCTTGG CGTATTCGTT GCGTCTCCGA TGATCCTGGT TGGCGTCCTG ATTTGGTTTC CAGTAGAAGA AAAATGGTTG TAATGTTGTC CACAGTGCAG  CTTCTGTCTC ATTTGGTTCC GCCATATGGC AAGGCAGCTG ACATTTATCC AGTGATGCAA AACGAAATAA GGAAAGTCGT GACAAAGGGT AAGGCTGCTG GTGTGCTTCG TCTAGTGTTT  CATGATGCTG GAACCTTTGA ACTGGAAGAT AATTCAGGTG GCATCAACGG GTCTATTGCA TATGAACTTG AGAGACCTGA AAACACTGGT TTGAAGAAAT CCTTAAAGGT TCTAGCAAAA  GCAAAGATTA AGGTTGATGA GATACAACCA GTGTCTTGGG CAGATATGAT CTCTGTCGCT GGATCAGAAG CAGTTTCAAT ATGTGGCGGC CCAATAATTC CAGTACTTTT GGGAAGACTT  GATTCAACGC AACCTGATCC AGAAGGCAAG CTACCTCCAG AAACCCTGAG TGCCTCTGGT TTAAAAGAAT GCTTCAAAAG AAAAGGATTT TCGACTCAGG AGCTTGTTGC TTTATCTGGG  GCCCATACGA TAGGGAGTAA AGGCTTTGGG GATCCGACAG TTTTTGACAA TGCATACTAC AAAATCCTTC TTGAAAAACC ATGGACATCA GCTTCCAAAA TGACGAGCAT GGTCGGCCTC  CCTTCGGATC ATGCCTTAGT GGACGATGAT GAGTGTTTAA GATGGGTGAA ACGATATGCG GAAGACCAAG ACAAGTTCTT CGAAGACTTC ACCAATGCTT ATAAAAAACT AGTGAATTCT 
GGGGCTAAAT GGAATAAGTT ATGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTCGTCCCA CCGTTAAAGA TGACGACGGC GACGACTGCG TCACTGTTGG AGACTTCTCT TTTACGGTGC GACTCGTCTT CTTCTTCTTT CAAATTCAAA CTTCCAGCGA AAACGCGACT  GCTCCCTCCG GCGACCGGGA AACATGTTGT GAGAACGTTA AGAGCTTGGC GTATTCGTTG CGTCTCCGAT GATCCTGGTT GGCGTCCTGA TTTGGTTTCC AGTAGAAGAA AAATGGTTGT  AATGTTGTCC ACAGTGCAGC TTCTGTCTCA TTTGGTTCCG CCATATGGCA AGGCAGCTGA CATTTATCCA GTGATGCAAA ACGAAATAAG GAAAGTCGTG ACAAAGGGTA AGGCTGCTGG  TGTGCTTCGT CTAGTGTTTC ATGATGCTGG AACCTTTGAA CTGGAAGATA ATTCAGGTGG CATCAACGGG TCTATTGCAT ATGAACTTGA GAGACCTGAA AACACTGGTT TGAAGAAATC  CTTAAAGGTT CTAGCAAAAG CAAAGATTAA GGTTGATGAG ATACAACCAG TGTCTTGGGC AGATATGATC TCTGTCGCTG GATCAGAAGC AGTTTCAATA TGTGGCGGCC CAATAATTCC  AGTACTTTTG GGAAGACTTG ATTCAACGCA ACCTGATCCA GAAGGCAAGC TACCTCCAGA AACCCTGAGT GCCTCTGGTT TAAAAGAATG CTTCAAAAGA AAAGGATTTT CGACTCAGGA  GCTTGTTGCT TTATCTGGGG CCCATACGAT AGGGAGTAAA GGCTTTGGGG ATCCGACAGT TTTTGACAAT GCATACTACA AAATCCTTCT TGAAAAACCA TGGACATCAG CTTCCAAAAT  GACGAGCATG GTCGGCCTCC CTTCGGATCA TGCCTTAGTG GACGATGATG AGTGTTTAAG ATGGGTGAAA CGATATGCGG AAGACCAAGA CAAGTTCTTC GAAGACTTCA CCAATGCTTA  TAAAAAACTA GTGAATTCTG GGGCTAAATG GAATAAGTTA TGATGTGTAG TAGTAATATC TTTTGTTAGC TCATAAGTGT TTCAAACATG CCTGAATAAT TTGGGTGATA ATTAATAATT 
GCTTATTTGC TAGTAAGGTA AAAGTTTCTC TGCTT 

Retrieve as FASTA