Entry information : CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Entry ID 14892
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Name (synonym) CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx05
start..stop
S start..stop
CrubAPx05 665 0 1..373 1..372
AlyAPx05 626 0 1..373 1..370
BstrAPx05 610 0 1..373 1..367
BnAPx04-1Aa_other 601 0 1..373 1..354
Literature and cross-references CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Protein sequence: CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   373
PWM (Da):   %s   40793.67  
PI (pH):   %s   8.71
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAERVSLTLN STSFFLLSPP PPKTTTTMSS SLRTTTAASH LLRRSSSSSS SRSTLTLSSL SFTRSLVSSP LLSSSSLSQK SYRNRVASVN RSFNSTAATK CSSDPDQLKN AREDIKELLN  TKFCHPILVR LGWHDAGTYN KNIKEWPQRG GANGSLRFDI ELKHAANAGL VNALNLIKDI KEKYSGITYA DLFQLASATA IEEAGGPKIP MKYGRVDASG PEDCPEEGRL PDAGPPSPAN  HLREVFYRMG LDDKDIVALS GAHTLGRSRP ERSGWGKPET KYTKEGPGAP GGQSWTPEWL KFDNSYFTEI KEKRDEDLLV LPTDAAIFED SSFKVYAEKY AADQNAFFKD YAVAHAKLSN 
LGAEFNPPEG IVI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAGC GTGTGTCTCT CACACTCAAC AGCACCAGCT TCTTCCTCCT TTCTCCTCCT CCTCCCAAAA CCACCACAAC CATGTCTTCT TCTCTCCGCA CTACCACCGC TGCTTCTCAT  CTCCTCCGCC GCTCCTCCTC CTCCTCCTCC TCCAGATCTA CACTCACTCT CTCTTCTCTC TCATTCACTA GATCTCTCGT CTCTTCTCCT CTTCTCTCTT CTTCATCCCT CTCTCAGGTA  CGCTTCACTC TCTCTCTCTC TCTCTCAGAT TTTGTTATAT TCTATAGTTT TCATGACCTG ATTTGATTTC AGAAGAGTTA TCGTAACCGA GTCGCGTCGG TGAATCGGAG TTTTAACTCA  ACCGCCGCTA CGAAATGTTC ATCAGATCCT GATCAGTTGA AGAACGCTAG AGAAGACATC AAAGAGCTAC TCAATACCAA ATTCTGCCAT CCAATTTTGG TTCGTATTGC TAAAACCTTC  CTTCTCTAAA TCCGAAGTAA TCAATCGCTA CGTTTGTATT GATTTTGTTT GCGTTGTGTT TTGAATCAAT AGGTTCGATT AGGGTGGCAT GATGCTGGAA CGTACAATAA GAACATCAAG  GAATGGCCAC AGAGAGGTGG AGCTAATGGA AGTCTTAGAT TCGATATTGA GCTTAAGCAT GCTGCTAATG CTGGTACTAT TATATCACTT TGTTACCATA TGTGTGTTAA CTTCTCTTTT  TACACTTGCC TGTTTGCTTA TAAGCTTTGT TTGATGTTTT TGTAAGGTCT TGTGAATGCT TTGAATTTGA TTAAGGATAT CAAAGAGAAA TACTCTGGGA TTACTTATGC TGACTTGTTC  CAATTGGCTA GTGCTACTGC TATTGAGGTG AGGTTTGATG ATTTATAAAC CTTTGTTGTT AGAGTGGCTA TGGAAGCATT TACTTGAAAG GTTTTGGAAT GTTTTAGGAA GCTGGAGGAC  CTAAGATACC TATGAAGTAT GGAAGAGTTG ATGCCTCTGG TCCTGAGGAT TGTCCTGAAG AAGGAAGGCT ACCCGGTAAC TAAGTGTCTC GTTGTGTCTT CTTTGGTTAC ATTATTGTAT  CAAACTTTAA TAATAATGGA TATCTTATGT TTCTATAGAT GCTGGTCCTC CTTCACCTGC TAATCATCTT AGAGAAGTTT TTTACAGGAT GGGACTAGAT GATAAGGTGA TGATTGCTGT  TGAATATTGA TAGTTATGGA AGATAAGTAG GTTTGATGAT CCATATTGAA AGAGTTTTTG TATGTGCAGG ACATTGTTGC GTTATCTGGT GCTCACACCT TAGGAAGATC TAGGCCAGAA  CGTAGTGGTT GGGGGAAGCC AGAGACGAAA TACACGGTAA TGTATTATCC AGTTCTGTAA CATATTGTCG TTTTATACGT TGTAAAGTTG GTTTCTTTAA TATATTTTGT GTGTTTCACA  TTATAGAAAG AGGGACCTGG GGCACCAGGA GGACAGTCAT GGACACCCGA GTGGCTGAAG TTCGACAATT CTTACTTCAC GGTTGCATTT CAGAACTTAA CTCTTTCTTC ACACTTTGTT  ATGAATCTCT TCTTCTTTCC GTTTTTACTG TCTTATTAAT ATAACTAATA TAACAGGAAA TCAAGGAAAA GAGAGATGAA GATCTCCTTG TCCTACCTAC TGATGCTGCC ATCTTTGAAG  ATTCTTCTTT CAAGGTATAA AATAACAAGG TCAAAACATG CATATCCATA GCAAGAAACT TACCAAGTCT TTACCTTTAA AACTGAAAAT GCAATGCAAT TGCAGGTATA TGCTGAGAAG  TACGCTGCAG ATCAGAATGC ATTCTTCAAG GATTACGCTG TCGCCCATGC GAAGCTCAGC AATCTTGGAG CAGAATTCAA CCCTCCTGAG GTTTGTTATC CTTATATTTC CATCATTACA  CTAACATAAT TATGAAAATG ATTTTAAAAG ACACACATGA GCATACATAA AAATTGTGCA AATCTGACCG AGCATGAGCA ATAGGAAGAT GTATAGAATT CCTACCTTTC GTAAGTCATT  GATAATCGTG TTAGAACCAT GTTACTTAAA GAGATAGACA TCATCTTTTT TTTGCCATCA GAGTACGTAG AATCTCCATT GATGAATGAG TTTGCAGGGA CCCTAAACCC TAAACCCTAA  ACCCTAAACC CTAAACTCTA AACCGTATGA ACTGATTATT TGAAAATCCT TTTTGTAGGG AATCGTAATC TAATGGGGCA CCGGCACCTA ACTTACTCGT CCAGTAAGCT TTTCTTCTTC  TTTTATGTTT ATTTTGCTGT CATCAACCAA AAAGTCCAAA TGTTCACAAG GTTCTCTCTC TGATTTTACT TCTTTCAGGC TGCGGGACTT GTGATTTCAG AAGAACTTAG TTTAATAATG  TCAAAGAAGA ATATAGGAAG GAACCGAGGA ACGGATGTTG AGAGAAGCAA CTTTTGCAGA GACCAAAAAG TGTTTTGATA GTTTTCAGTT TTTCATGGTT GAATTGTCAT AATGGTTTTG  GGTTTTCTGA TGTTTTTCCT TGTAATAAAT TGCGGTATTA TCCAAAATCC CACAAATTTT GTTCTGACAT TGAAAAAAAG AGTTTGTGTT TTAGATTGGG AAAAACTCTT ATGACTTATG 
AAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAGC GTGTGTCTCT CACACTCAAC AGCACCAGCT TCTTCCTCCT TTCTCCTCCT CCTCCCAAAA CCACCACAAC CATGTCTTCT TCTCTCCGCA CTACCACCGC TGCTTCTCAT  CTCCTCCGCC GCTCCTCCTC CTCCTCCTCC TCCAGATCTA CACTCACTCT CTCTTCTCTC TCATTCACTA GATCTCTCGT CTCTTCTCCT CTTCTCTCTT CTTCATCCCT CTCTCAGAAG  AGTTATCGTA ACCGAGTCGC GTCGGTGAAT CGGAGTTTTA ACTCAACCGC CGCTACGAAA TGTTCATCAG ATCCTGATCA GTTGAAGAAC GCTAGAGAAG ACATCAAAGA GCTACTCAAT  ACCAAATTCT GCCATCCAAT TTTGGTTCGA TTAGGGTGGC ATGATGCTGG AACGTACAAT AAGAACATCA AGGAATGGCC ACAGAGAGGT GGAGCTAATG GAAGTCTTAG ATTCGATATT  GAGCTTAAGC ATGCTGCTAA TGCTGGTCTT GTGAATGCTT TGAATTTGAT TAAGGATATC AAAGAGAAAT ACTCTGGGAT TACTTATGCT GACTTGTTCC AATTGGCTAG TGCTACTGCT  ATTGAGGAAG CTGGAGGACC TAAGATACCT ATGAAGTATG GAAGAGTTGA TGCCTCTGGT CCTGAGGATT GTCCTGAAGA AGGAAGGCTA CCCGATGCTG GTCCTCCTTC ACCTGCTAAT  CATCTTAGAG AAGTTTTTTA CAGGATGGGA CTAGATGATA AGGACATTGT TGCGTTATCT GGTGCTCACA CCTTAGGAAG ATCTAGGCCA GAACGTAGTG GTTGGGGGAA GCCAGAGACG  AAATACACGA AAGAGGGACC TGGGGCACCA GGAGGACAGT CATGGACACC CGAGTGGCTG AAGTTCGACA ATTCTTACTT CACGGAAATC AAGGAAAAGA GAGATGAAGA TCTCCTTGTC  CTACCTACTG ATGCTGCCAT CTTTGAAGAT TCTTCTTTCA AGGTATATGC TGAGAAGTAC GCTGCAGATC AGAATGCATT CTTCAAGGAT TACGCTGTCG CCCATGCGAA GCTCAGCAAT 
CTTGGAGCAG AATTCAACCC TCCTGAGGGA ATCGTAATCT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAAATTACA ATAATACCCC CAAAAATGGC AGAGCGTGTG TCTCTCACAC TCAACAGCAC CAGCTTCTTC CTCCTTTCTC CTCCTCCTCC CAAAACCACC ACAACCATGT CTTCTTCTCT  CCGCACTACC ACCGCTGCTT CTCATCTCCT CCGCCGCTCC TCCTCCTCCT CCTCCTCCAG ATCTACACTC ACTCTCTCTT CTCTCTCATT CACTAGATCT CTCGTCTCTT CTCCTCTTCT  CTCTTCTTCA TCCCTCTCTC AGAAGAGTTA TCGTAACCGA GTCGCGTCGG TGAATCGGAG TTTTAACTCA ACCGCCGCTA CGAAATGTTC ATCAGATCCT GATCAGTTGA AGAACGCTAG  AGAAGACATC AAAGAGCTAC TCAATACCAA ATTCTGCCAT CCAATTTTGG TTCGATTAGG GTGGCATGAT GCTGGAACGT ACAATAAGAA CATCAAGGAA TGGCCACAGA GAGGTGGAGC  TAATGGAAGT CTTAGATTCG ATATTGAGCT TAAGCATGCT GCTAATGCTG GTCTTGTGAA TGCTTTGAAT TTGATTAAGG ATATCAAAGA GAAATACTCT GGGATTACTT ATGCTGACTT  GTTCCAATTG GCTAGTGCTA CTGCTATTGA GGAAGCTGGA GGACCTAAGA TACCTATGAA GTATGGAAGA GTTGATGCCT CTGGTCCTGA GGATTGTCCT GAAGAAGGAA GGCTACCCGA  TGCTGGTCCT CCTTCACCTG CTAATCATCT TAGAGAAGTT TTTTACAGGA TGGGACTAGA TGATAAGGAC ATTGTTGCGT TATCTGGTGC TCACACCTTA GGAAGATCTA GGCCAGAACG  TAGTGGTTGG GGGAAGCCAG AGACGAAATA CACGAAAGAG GGACCTGGGG CACCAGGAGG ACAGTCATGG ACACCCGAGT GGCTGAAGTT CGACAATTCT TACTTCACGG AAATCAAGGA  AAAGAGAGAT GAAGATCTCC TTGTCCTACC TACTGATGCT GCCATCTTTG AAGATTCTTC TTTCAAGGTA TATGCTGAGA AGTACGCTGC AGATCAGAAT GCATTCTTCA AGGATTACGC  TGTCGCCCAT GCGAAGCTCA GCAATCTTGG AGCAGAATTC AACCCTCCTG AGGGAATCGT AATCTAATGG GGCACCGGCA CCTAACTTAC TCGTCCAGCT GCGGGACTTG TGATTTCAGA  AGAACTTAGT TTAATAATGT CAAAGAAGAA TATAGGAAGG AACCGAGGAA CGGATGTTGA GAGAAGCAAC TTTTGCAGAG ACCAAAAAGT GTTTTGATAG TTTTCAGTTT TTCATGGTTG  AATTGTCATA ATGGTTTTGG GTTTTCTGAT GTTTTTCCTT GTAATAAATT GCGGTATTAT CCAAAATCCC ACAAATTTTG TTCTGACATT GAAAAAAAGA GTTTGTGTTT TAGATTGGGA 
AAAACTCTTA TGACTTATGA AT 

Retrieve as FASTA