Entry information : CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Entry ID 14892
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Name (synonym) CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx002]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx05
start..stop
S start..stop
CrubAPx05 665 0 1..373 1..372
AlyAPx05 626 0 1..373 1..370
BstrAPx05 610 0 1..373 1..367
BnAPx04-1Aa_other 601 0 1..373 1..354
Literature and cross-references CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Protein sequence: CagraAPx05 (Cagra.12402s0001)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   373
PWM (Da):   %s   40793.67  
PI (pH):   %s   8.71
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAERVSLTLN STSFFLLSPP PPKTTTTMSS SLRTTTAASH LLRRSSSSSS SRSTLTLSSL SFTRSLVSSP LLSSSSLSQK SYRNRVASVN RSFNSTAATK CSSDPDQLKN AREDIKELLN  TKFCHPILVR LGWHDAGTYN KNIKEWPQRG GANGSLRFDI ELKHAANAGL VNALNLIKDI KEKYSGITYA DLFQLASATA IEEAGGPKIP MKYGRVDASG PEDCPEEGRL PDAGPPSPAN  HLREVFYRMG LDDKDIVALS GAHTLGRSRP ERSGWGKPET KYTKEGPGAP GGQSWTPEWL KFDNSYFTEI KEKRDEDLLV LPTDAAIFED SSFKVYAEKY AADQNAFFKD YAVAHAKLSN 
LGAEFNPPEG IVI* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAAATTACA ATAATACCCC CAAAAATGGC AGAGCGTGTG TCTCTCACAC TCAACAGCAC CAGCTTCTTC CTCCTTTCTC CTCCTCCTCC CAAAACCACC ACAACCATGT CTTCTTCTCT  CCGCACTACC ACCGCTGCTT CTCATCTCCT CCGCCGCTCC TCCTCCTCCT CCTCCTCCAG ATCTACACTC ACTCTCTCTT CTCTCTCATT CACTAGATCT CTCGTCTCTT CTCCTCTTCT  CTCTTCTTCA TCCCTCTCTC AGGTACGCTT CACTCTCTCT CTCTCTCTCT CAGATTTTGT TATATTCTAT AGTTTTCATG ACCTGATTTG ATTTCAGAAG AGTTATCGTA ACCGAGTCGC  GTCGGTGAAT CGGAGTTTTA ACTCAACCGC CGCTACGAAA TGTTCATCAG ATCCTGATCA GTTGAAGAAC GCTAGAGAAG ACATCAAAGA GCTACTCAAT ACCAAATTCT GCCATCCAAT  TTTGGTTCGT ATTGCTAAAA CCTTCCTTCT CTAAATCCGA AGTAATCAAT CGCTACGTTT GTATTGATTT TGTTTGCGTT GTGTTTTGAA TCAATAGGTT CGATTAGGGT GGCATGATGC  TGGAACGTAC AATAAGAACA TCAAGGAATG GCCACAGAGA GGTGGAGCTA ATGGAAGTCT TAGATTCGAT ATTGAGCTTA AGCATGCTGC TAATGCTGGT ACTATTATAT CACTTTGTTA  CCATATGTGT GTTAACTTCT CTTTTTACAC TTGCCTGTTT GCTTATAAGC TTTGTTTGAT GTTTTTGTAA GGTCTTGTGA ATGCTTTGAA TTTGATTAAG GATATCAAAG AGAAATACTC  TGGGATTACT TATGCTGACT TGTTCCAATT GGCTAGTGCT ACTGCTATTG AGGTGAGGTT TGATGATTTA TAAACCTTTG TTGTTAGAGT GGCTATGGAA GCATTTACTT GAAAGGTTTT  GGAATGTTTT AGGAAGCTGG AGGACCTAAG ATACCTATGA AGTATGGAAG AGTTGATGCC TCTGGTCCTG AGGATTGTCC TGAAGAAGGA AGGCTACCCG GTAACTAAGT GTCTCGTTGT  GTCTTCTTTG GTTACATTAT TGTATCAAAC TTTAATAATA ATGGATATCT TATGTTTCTA TAGATGCTGG TCCTCCTTCA CCTGCTAATC ATCTTAGAGA AGTTTTTTAC AGGATGGGAC  TAGATGATAA GGTGATGATT GCTGTTGAAT ATTGATAGTT ATGGAAGATA AGTAGGTTTG ATGATCCATA TTGAAAGAGT TTTTGTATGT GCAGGACATT GTTGCGTTAT CTGGTGCTCA  CACCTTAGGA AGATCTAGGC CAGAACGTAG TGGTTGGGGG AAGCCAGAGA CGAAATACAC GGTAATGTAT TATCCAGTTC TGTAACATAT TGTCGTTTTA TACGTTGTAA AGTTGGTTTC  TTTAATATAT TTTGTGTGTT TCACATTATA GAAAGAGGGA CCTGGGGCAC CAGGAGGACA GTCATGGACA CCCGAGTGGC TGAAGTTCGA CAATTCTTAC TTCACGGTTG CATTTCAGAA  CTTAACTCTT TCTTCACACT TTGTTATGAA TCTCTTCTTC TTTCCGTTTT TACTGTCTTA TTAATATAAC TAATATAACA GGAAATCAAG GAAAAGAGAG ATGAAGATCT CCTTGTCCTA  CCTACTGATG CTGCCATCTT TGAAGATTCT TCTTTCAAGG TATAAAATAA CAAGGTCAAA ACATGCATAT CCATAGCAAG AAACTTACCA AGTCTTTACC TTTAAAACTG AAAATGCAAT  GCAATTGCAG GTATATGCTG AGAAGTACGC TGCAGATCAG AATGCATTCT TCAAGGATTA CGCTGTCGCC CATGCGAAGC TCAGCAATCT TGGAGCAGAA TTCAACCCTC CTGAGGTTTG  TTATCCTTAT ATTTCCATCA TTACACTAAC ATAATTATGA AAATGATTTT AAAAGACACA CATGAGCATA CATAAAAATT GTGCAAATCT GACCGAGCAT GAGCAATAGG AAGATGTATA  GAATTCCTAC CTTTCGTAAG TCATTGATAA TCGTGTTAGA ACCATGTTAC TTAAAGAGAT AGACATCATC TTTTTTTTGC CATCAGAGTA CGTAGAATCT CCATTGATGA ATGAGTTTGC  AGGGACCCTA AACCCTAAAC CCTAAACCCT AAACCCTAAA CTCTAAACCG TATGAACTGA TTATTTGAAA ATCCTTTTTG TAGGGAATCG TAATCTAATG GGGCACCGGC ACCTAACTTA  CTCGTCCAGT AAGCTTTTCT TCTTCTTTTA TGTTTATTTT GCTGTCATCA ACCAAAAAGT CCAAATGTTC ACAAGGTTCT CTCTCTGATT TTACTTCTTT CAGGCTGCGG GACTTGTGAT  TTCAGAAGAA CTTAGTTTAA TAATGTCAAA GAAGAATATA GGAAGGAACC GAGGAACGGA TGTTGAGAGA AGCAACTTTT GCAGAGACCA AAAAGTGTTT TGATAGTTTT CAGTTTTTCA  TGGTTGAATT GTCATAATGG TTTTGGGTTT TCTGATGTTT TTCCTTGTAA TAAATTGCGG TATTATCCAA AATCCCACAA ATTTTGTTCT GACATTGAAA AAAAGAGTTT GTGTTTTAGA 
TTGGGAAAAA CTCTTATGAC TTATGAAT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCAGAGC GTGTGTCTCT CACACTCAAC AGCACCAGCT TCTTCCTCCT TTCTCCTCCT CCTCCCAAAA CCACCACAAC CATGTCTTCT TCTCTCCGCA CTACCACCGC TGCTTCTCAT  CTCCTCCGCC GCTCCTCCTC CTCCTCCTCC TCCAGATCTA CACTCACTCT CTCTTCTCTC TCATTCACTA GATCTCTCGT CTCTTCTCCT CTTCTCTCTT CTTCATCCCT CTCTCAGAAG  AGTTATCGTA ACCGAGTCGC GTCGGTGAAT CGGAGTTTTA ACTCAACCGC CGCTACGAAA TGTTCATCAG ATCCTGATCA GTTGAAGAAC GCTAGAGAAG ACATCAAAGA GCTACTCAAT  ACCAAATTCT GCCATCCAAT TTTGGTTCGA TTAGGGTGGC ATGATGCTGG AACGTACAAT AAGAACATCA AGGAATGGCC ACAGAGAGGT GGAGCTAATG GAAGTCTTAG ATTCGATATT  GAGCTTAAGC ATGCTGCTAA TGCTGGTCTT GTGAATGCTT TGAATTTGAT TAAGGATATC AAAGAGAAAT ACTCTGGGAT TACTTATGCT GACTTGTTCC AATTGGCTAG TGCTACTGCT  ATTGAGGAAG CTGGAGGACC TAAGATACCT ATGAAGTATG GAAGAGTTGA TGCCTCTGGT CCTGAGGATT GTCCTGAAGA AGGAAGGCTA CCCGATGCTG GTCCTCCTTC ACCTGCTAAT  CATCTTAGAG AAGTTTTTTA CAGGATGGGA CTAGATGATA AGGACATTGT TGCGTTATCT GGTGCTCACA CCTTAGGAAG ATCTAGGCCA GAACGTAGTG GTTGGGGGAA GCCAGAGACG  AAATACACGA AAGAGGGACC TGGGGCACCA GGAGGACAGT CATGGACACC CGAGTGGCTG AAGTTCGACA ATTCTTACTT CACGGAAATC AAGGAAAAGA GAGATGAAGA TCTCCTTGTC  CTACCTACTG ATGCTGCCAT CTTTGAAGAT TCTTCTTTCA AGGTATATGC TGAGAAGTAC GCTGCAGATC AGAATGCATT CTTCAAGGAT TACGCTGTCG CCCATGCGAA GCTCAGCAAT 
CTTGGAGCAG AATTCAACCC TCCTGAGGGA ATCGTAATCT AA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
AAAAATTACA ATAATACCCC CAAAAATGGC AGAGCGTGTG TCTCTCACAC TCAACAGCAC CAGCTTCTTC CTCCTTTCTC CTCCTCCTCC CAAAACCACC ACAACCATGT CTTCTTCTCT  CCGCACTACC ACCGCTGCTT CTCATCTCCT CCGCCGCTCC TCCTCCTCCT CCTCCTCCAG ATCTACACTC ACTCTCTCTT CTCTCTCATT CACTAGATCT CTCGTCTCTT CTCCTCTTCT  CTCTTCTTCA TCCCTCTCTC AGAAGAGTTA TCGTAACCGA GTCGCGTCGG TGAATCGGAG TTTTAACTCA ACCGCCGCTA CGAAATGTTC ATCAGATCCT GATCAGTTGA AGAACGCTAG  AGAAGACATC AAAGAGCTAC TCAATACCAA ATTCTGCCAT CCAATTTTGG TTCGATTAGG GTGGCATGAT GCTGGAACGT ACAATAAGAA CATCAAGGAA TGGCCACAGA GAGGTGGAGC  TAATGGAAGT CTTAGATTCG ATATTGAGCT TAAGCATGCT GCTAATGCTG GTCTTGTGAA TGCTTTGAAT TTGATTAAGG ATATCAAAGA GAAATACTCT GGGATTACTT ATGCTGACTT  GTTCCAATTG GCTAGTGCTA CTGCTATTGA GGAAGCTGGA GGACCTAAGA TACCTATGAA GTATGGAAGA GTTGATGCCT CTGGTCCTGA GGATTGTCCT GAAGAAGGAA GGCTACCCGA  TGCTGGTCCT CCTTCACCTG CTAATCATCT TAGAGAAGTT TTTTACAGGA TGGGACTAGA TGATAAGGAC ATTGTTGCGT TATCTGGTGC TCACACCTTA GGAAGATCTA GGCCAGAACG  TAGTGGTTGG GGGAAGCCAG AGACGAAATA CACGAAAGAG GGACCTGGGG CACCAGGAGG ACAGTCATGG ACACCCGAGT GGCTGAAGTT CGACAATTCT TACTTCACGG AAATCAAGGA  AAAGAGAGAT GAAGATCTCC TTGTCCTACC TACTGATGCT GCCATCTTTG AAGATTCTTC TTTCAAGGTA TATGCTGAGA AGTACGCTGC AGATCAGAAT GCATTCTTCA AGGATTACGC  TGTCGCCCAT GCGAAGCTCA GCAATCTTGG AGCAGAATTC AACCCTCCTG AGGGAATCGT AATCTAATGG GGCACCGGCA CCTAACTTAC TCGTCCAGCT GCGGGACTTG TGATTTCAGA  AGAACTTAGT TTAATAATGT CAAAGAAGAA TATAGGAAGG AACCGAGGAA CGGATGTTGA GAGAAGCAAC TTTTGCAGAG ACCAAAAAGT GTTTTGATAG TTTTCAGTTT TTCATGGTTG  AATTGTCATA ATGGTTTTGG GTTTTCTGAT GTTTTTCCTT GTAATAAATT GCGGTATTAT CCAAAATCCC ACAAATTTTG TTCTGACATT GAAAAAAAGA GTTTGTGTTT TAGATTGGGA 
AAAACTCTTA TGACTTATGA AT 

Retrieve as FASTA