Entry information : CagraPrx52 (Cagra.3467s0037/Cagra.3467s0038)
Entry ID 14898
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx52 (Cagra.3467s0037/Cagra.3467s0038)
Name (synonym) CagraPrx52 (Cagra.3467s0037/Cagra.3467s0038)
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx016]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx52
start..stop
S start..stop
AtPrx43 625 0 1..326 1..326
BstrPrx30 625 0 1..326 1..326
TsPrx43 615 0 1..326 1..326
BrPrx43-1Aa_other 605 0 1..326 1..326
Literature and cross-references CagraPrx52 (Cagra.3467s0037/Cagra.3467s0038)
Protein sequence: CagraPrx52 (Cagra.3467s0037/Cagra.3467s0038)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   326 (302)
PWM (Da):   %s   35271.17 (32642.7) Transmb domain:   %s   i183-205o220-237i
PI (pH):   %s   6.14 (5.42) Peptide Signal:   %s   cut: 25 range:25-326
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAWTKAKMSL ALSLVTVILS VSLADLKVGF YSNTCPQAES IVRRVVSGAA LSDPNLPAIL LRLHFHDCFV EGCDGSILVD NGAISEKNAF GHEGVRGFEI VEAVKAELEA ACPGVVSCSD  IVALAARDAI SLANGPAYEV PTGRRDGLVS NMSLAKDMPE ISDTIQILKA KFMQKGLNAK ELVLLSAAHT IGTTACFFMT KRLYNFLPGG QPDPTINPVF LPELTTQCPQ NGDINVRLPM 
DRISERVFDK QILQNIKDGF AVLQTDAGLY EDVTTRRVVD SYLGMLNPFF GPTFESDFVK AIVKMGKIGV KTDSKGEIRR VCSAFN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Incorrect prediction from Phytozome (Cagra.3467s0037 contains the 5'end and Cagra.3467s0038 contains the 3'end)
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATGGA CAAAGGCTAA GATGAGTCTA GCTTTGTCTC TGGTTACGGT AATCCTCAGC GTCTCTCTTG CTGATCTAAA AGTCGGGTTT TACTCCAATA CATGTCCTCA AGCCGAGTCA  ATCGTTAGGA GAGTTGTCTC AGGAGCTGCT CTTTCTGACC CTAACCTCCC AGCCATACTT CTACGTCTCC ATTTCCACGA CTGCTTTGTT GAGGTACAAT GCACTTTCCT CCTCTTTGTG  CTTTCTACTA TTATTGCAAT GCTTATAGAT TTAAGCACGT ACAGGGATGT GATGGCTCGA TCCTCGTGGA TAACGGAGCA ATCTCTGAAA AGAATGCCTT TGGGCACGAA GGCGTTAGAG  GATTTGAGAT AGTAGAAGCC GTCAAAGCCG AGCTTGAAGC TGCATGCCCC GGTGTTGTCT CCTGCTCAGA CATTGTTGCC TTGGCGGCAC GTGATGCCAT ATCTTTGGTA AAAAATCAAT  TAGAGAAAGA AAAAATTGAA TCTATTGATC TTTTGTCTTT CTTCTTCCCT GTGGTGATCA ATTCATGATA CAGGCAAATG GACCAGCGTA TGAGGTACCA ACTGGGCGGA GAGATGGTCT  GGTTTCGAAT ATGTCGCTGG CTAAGGACAT GCCTGAGATC AGCGACACGA TTCAGATACT AAAGGCTAAG TTCATGCAGA AGGGGCTCAA CGCCAAAGAG CTCGTGCTTC TCAGTGGTAT  GTATCGCTTC TTCTTGGTCT TTCTCTCTCA TTCATGTTTG TTTGGTGGTT TCAAATCTCT CGAGGTTTTT GGTTCGAAGT TCAAGTTATA TGATTTTTCG TTTCCCGAAT CCGTGATGTG  TTTCCCATGT TTCGTCCGTT TCCTCTTTCC CTTCGTGTGT TAGTGTCACG TGCTTCCGTC CTTTACGAAA TTCTGGTTGA CCAATAAAAT AAAAATAAAA ACAAAAAAGC CTAAGCCAAT  TTTCTTCCTC AGAAAAAAAA GTTCCTCATA AATTTGGATA AGAAATTCGT GAAAATATAT TAATAACAAA AAAATATGTC CAGTGTTTTT TATGTTTTTG CTAAGATTAT TGCAAAATGA  AAAGTCATTT GTTGAAAAAA ATATCTAGGC CTTTCGTCAA CTTACGTTAG GCATTTTTGC ATGAGTTTGT ATTTTATTAC AATTTCAACT ACAAAATTGA GTGTGTTCTA TTAGTAAGAT  GTGTGTTGAT TTTCTGTCAT CTAATCCACT AAATCGGGCA TGGCTCAGAA ATGTCATCAT TCACACGAAA ATATGGGTGT TATAGAAGCG GCAGTTAATC GGACAAAACA CATAAATATC  TATCGGGCCA TTCTTGTTTT TGTCATTCGA TAGAGTAGAT ATTAGGGTTA CGTCATCAAC GTGCACGTGT GACCAAGAAC AGAAGAGCAC GAGTCTAATA CAGTAGTAAC TAGTGATCAT  GCCTTTGAAA CTGGACTCAG TTTGTGTCAT TTTAATATCT TAACATGAAA GAAAAACAGA AAAAGAAAAA AAAAATAGAA GGAAAGTGTA GAAACACTTC TCGTTCGTTC TAATGATTTG  TTTCAACCGT ATCATCAGCT GCTCACACTA TCGGAACAAC AGCCTGCTTC TTCATGACCA AACGCCTCTA CAACTTCTTA CCCGGTGGCC AACCTGACCC GACCATCAAT CCGGTATTCC  TACCCGAGTT AACCACTCAG TGCCCACAAA ATGGTGACAT AAACGTCCGG TTACCAATGG ACCGGATCAG TGAACGTGTA TTCGACAAGC AGATTCTACA AAACATAAAG GATGGTTTCG  CTGTGCTTCA GACCGATGCT GGTCTTTACG AGGATGTGAC GACCCGACGG GTTGTGGATT CCTATCTTGG GATGCTAAAT CCGTTCTTTG GTCCAACGTT CGAGTCCGAT TTCGTAAAGG 
CAATAGTGAA GATGGGGAAG ATTGGTGTGA AGACTGATTC TAAAGGGGAG ATTCGACGGG TTTGCTCTGC CTTCAATTGA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATGGA CAAAGGCTAA GATGAGTCTA GCTTTGTCTC TGGTTACGGT AATCCTCAGC GTCTCTCTTG CTGATCTAAA AGTCGGGTTT TACTCCAATA CATGTCCTCA AGCCGAGTCA  ATCGTTAGGA GAGTTGTCTC AGGAGCTGCT CTTTCTGACC CTAACCTCCC AGCCATACTT CTACGTCTCC ATTTCCACGA CTGCTTTGTT GAGGGATGTG ATGGCTCGAT CCTCGTGGAT  AACGGAGCAA TCTCTGAAAA GAATGCCTTT GGGCACGAAG GCGTTAGAGG ATTTGAGATA GTAGAAGCCG TCAAAGCCGA GCTTGAAGCT GCATGCCCCG GTGTTGTCTC CTGCTCAGAC  ATTGTTGCCT TGGCGGCACG TGATGCCATA TCTTTGGCAA ATGGACCAGC GTATGAGGTA CCAACTGGGC GGAGAGATGG TCTGGTTTCG AATATGTCGC TGGCTAAGGA CATGCCTGAG  ATCAGCGACA CGATTCAGAT ACTAAAGGCT AAGTTCATGC AGAAGGGGCT CAACGCCAAA GAGCTCGTGC TTCTCAGTGC TGCTCACACT ATCGGAACAA CAGCCTGCTT CTTCATGACC  AAACGCCTCT ACAACTTCTT ACCCGGTGGC CAACCTGACC CGACCATCAA TCCGGTATTC CTACCCGAGT TAACCACTCA GTGCCCACAA AATGGTGACA TAAACGTCCG GTTACCAATG  GACCGGATCA GTGAACGTGT ATTCGACAAG CAGATTCTAC AAAACATAAA GGATGGTTTC GCTGTGCTTC AGACCGATGC TGGTCTTTAC GAGGATGTGA CGACCCGACG GGTTGTGGAT  TCCTATCTTG GGATGCTAAA TCCGTTCTTT GGTCCAACGT TCGAGTCCGA TTTCGTAAAG GCAATAGTGA AGATGGGGAA GATTGGTGTG AAGACTGATT CTAAAGGGGA GATTCGACGG 
GTTTGCTCTG CCTTCAATTG A 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCATGGA CAAAGGCTAA GATGAGTCTA GCTTTGTCTC TGGTTACGGT AATCCTCAGC GTCTCTCTTG CTGATCTAAA AGTCGGGTTT TACTCCAATA CATGTCCTCA AGCCGAGTCA  ATCGTTAGGA GAGTTGTCTC AGGAGCTGCT CTTTCTGACC CTAACCTCCC AGCCATACTT CTACGTCTCC ATTTCCACGA CTGCTTTGTT GAGGGATGTG ATGGCTCGAT CCTCGTGGAT  AACGGAGCAA TCTCTGAAAA GAATGCCTTT GGGCACGAAG GCGTTAGAGG ATTTGAGATA GTAGAAGCCG TCAAAGCCGA GCTTGAAGCT GCATGCCCCG GTGTTGTCTC CTGCTCAGAC  ATTGTTGCCT TGGCGGCACG TGATGCCATA TCTTTGGCAA ATGGACCAGC GTATGAGGTA CCAACTGGGC GGAGAGATGG TCTGGTTTCG AATATGTCGC TGGCTAAGGA CATGCCTGAG  ATCAGCGACA CGATTCAGAT ACTAAAGGCT AAGTTCATGC AGAAGGGGCT CAACGCCAAA GAGCTCGTGC TTCTCAGTGC TGCTCACACT ATCGGAACAA CAGCCTGCTT CTTCATGACC  AAACGCCTCT ACAACTTCTT ACCCGGTGGC CAACCTGACC CGACCATCAA TCCGGTATTC CTACCCGAGT TAACCACTCA GTGCCCACAA AATGGTGACA TAAACGTCCG GTTACCAATG  GACCGGATCA GTGAACGTGT ATTCGACAAG CAGATTCTAC AAAACATAAA GGATGGTTTC GCTGTGCTTC AGACCGATGC TGGTCTTTAC GAGGATGTGA CGACCCGACG GGTTGTGGAT  TCCTATCTTG GGATGCTAAA TCCGTTCTTT GGTCCAACGT TCGAGTCCGA TTTCGTAAAG GCAATAGTGA AGATGGGGAA GATTGGTGTG AAGACTGATT CTAAAGGGGA GATTCGACGG 
GTTTGCTCTG CCTTCAATTG A 

Retrieve as FASTA