Entry information : CagraPrx54Cagra.4396s0013
Entry ID 14900
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx54Cagra.4396s0013
Name CagraPrx54Cagra.4396s0013
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx039]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx54
start..stop
S start..stop
CrubPrx64 689 0 1..342 1..343
BstrPrx17 635 0 1..341 1..339
AlyPrx29 627 0 1..341 1..339
AhalPrx23 626 0 1..341 1..339
Literature and cross-references CagraPrx54Cagra.4396s0013
Protein sequence: CagraPrx54Cagra.4396s0013
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   342 (314)
PWM (Da):   %s   37249.34 (34087.8)  
PI (pH):   %s   4.67 (4.52) Peptide Signal:   %s   cut: 29 range:29-342
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKRKSKVVES AAVSCFLVMS LLCTYTNGDQ METNYEETLS YSYYEKTCPK VEEIVKSSLS SMFVLDPTAP AALLRLMFHD CQVQGCDASI LLEPSGDQQQ FTELDSVKNF GIRKRDLIGS  IKTSLETECP KQVSCSDVII LAAREAVALT GGPRIAVPLG RKDSLSTYSK HMADSELPPA TADVDTTLSL FAGKGMTVEE SVAIMGSHTI GVTHCNNVLS RFDNANATSQ NLDPRFETFL 
RVACPEFSPT SEAAKVTFVP NDQTAVIFDS AYYDDAIAGR GNLRIDSEIG ADPRTRPFAE AFAADQDRFF NAFSSAFVKL SSYKVLTGNE GVVRSVCDKV DD* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTTAGCTTC CGATTTAAAT TACCTTCAAA AAACAAAAAA AAAAGTGATG AAACGAAAGA GCAAAGTTGT AGAATCTGCA GCTGTGTCAT GTTTTCTCGT CATGAGCTTG TTATGTACCT  ACACTAATGG TGACCAGATG GAGACTAATT ATGAAGAGAC GTTATCTTAT AGTTACTACG AGAAAACTTG TCCCAAAGTC GAAGAGATCG TGAAATCTTC ACTTTCATCA ATGTTTGTAC  TTGATCCTAC TGCTCCTGCT GCCTTGCTAA GGCTTATGTT TCACGACTGC CAAGTTCAGG TTCTCTGATC TATCTCTAGC TTAATCAATC TCTCTTTCTT GCTGTGAGAA AATTCTCAAT  ATATGGGGTA AACTCAATTT GGGGTTTTTC TTTAAAAAGG AGAAAATAAA AAACTCAATA GGATTTGGTT GAAAATTGTA TGCCAATGAT GTTAAGTATT CGAACTTATA CATTTTACGT  GAATAAAACA TATCAGCATG TCATGATTAG GATCACTATT AGTATTAGTG ATGTATGATC ATTAATTCTG GCTTTAAAAA TGCCAGAATT GGACGTTCGT ACATGATATA TATATCTGGT  TTTTAATGGT ATATTTTTGT TTCCGCCATG TATTTGAGCT TTCGTTTTAT TTTTCTTATA AATTTGTTTG TATATTATAC GAGCCAGAGT TTGAGATGTT TCATATCATG ATTGAAATAT  GTTTTCTCTA ACTATATAAT TTATAATGCA TGTGATTGAT AAATTTGGAA GACAATAGAA CACGGATATC TTACTAAGAC CACTTTAATT AGTTAAACAT GTCACGGTCC ATTAATGTGG  ACTAATTATA TGTAGGAACA ATGTATTTTT TTCCCATATA AGTGCGCGTC ATGTCACGTA CAACACAATA TTTTAAGAGA TTAAAAAAAA AAACGATTAG ATCATTGTTC TTGGCATTTA  TTTCATCTCG TCCATCACCA TTAACTGTCT GGAACAAAAT ACATGTGGCA TATGTACACA ACAGGGCTGT GACGCATCGA TCCTACTCGA GCCAAGCGGT GACCAACAAC AGTTCACGGA  GCTTGATTCA GTCAAGAACT TCGGAATCAG AAAGAGAGAC CTGATTGGCT CTATCAAAAC CTCACTGGAG ACGGAGTGTC CGAAGCAAGT CTCATGCTCT GACGTTATCA TTCTCGCCGC  CAGAGAAGCC GTGGCTCTCA CGGGAGGCCC TCGCATCGCC GTGCCCTTAG GAAGAAAAGA CTCTCTCTCC ACTTATAGCA AACACATGGC AGACTCTGAG CTCCCTCCCG CCACTGCTGA  CGTGGACACT ACCTTAAGCC TCTTTGCCGG CAAAGGCATG ACCGTCGAAG AGTCCGTTGC CATCATGGGT ATATTATATT TTTTAATTTA ATTCGTAAAC TTATGTGCAT ATACGTATAT  AATTTATAAG ACTTGTTCTT GTCTCGTATA GGTTCACATA CTATAGGAGT GACACACTGC AACAACGTAC TATCACGTTT CGACAACGCA AACGCGACAA GCCAGAACTT GGATCCACGT  TTCGAAACGT TTTTGCGAGT TGCTTGTCCA GAGTTTTCTC CAACCTCCGA AGCCGCGAAA GTCACGTTTG TTCCCAACGA TCAAACTGCG GTGATCTTTG ATTCAGCTTA CTACGATGAT  GCCATCGCTG GACGTGGCAA TCTGAGGATT GATTCGGAGA TTGGAGCTGA CCCACGCACA CGTCCGTTCG CCGAAGCGTT TGCGGCTGAT CAAGACCGTT TCTTCAACGC CTTCTCTTCC  GCGTTTGTAA AATTGTCGTC GTACAAAGTG TTAACCGGGA ACGAAGGAGT AGTTAGAAGC GTGTGTGACA AAGTAGATGA TTGATGTATA TGATTTTCAT CAAATGTTAC ATGACAAAAA 
TATTATAATC CGTAAACAAG TTATAAGATA GTATGAAGCA TAGTATAAAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAACGAA AGAGCAAAGT TGTAGAATCT GCAGCTGTGT CATGTTTTCT CGTCATGAGC TTGTTATGTA CCTACACTAA TGGTGACCAG ATGGAGACTA ATTATGAAGA GACGTTATCT  TATAGTTACT ACGAGAAAAC TTGTCCCAAA GTCGAAGAGA TCGTGAAATC TTCACTTTCA TCAATGTTTG TACTTGATCC TACTGCTCCT GCTGCCTTGC TAAGGCTTAT GTTTCACGAC  TGCCAAGTTC AGGGCTGTGA CGCATCGATC CTACTCGAGC CAAGCGGTGA CCAACAACAG TTCACGGAGC TTGATTCAGT CAAGAACTTC GGAATCAGAA AGAGAGACCT GATTGGCTCT  ATCAAAACCT CACTGGAGAC GGAGTGTCCG AAGCAAGTCT CATGCTCTGA CGTTATCATT CTCGCCGCCA GAGAAGCCGT GGCTCTCACG GGAGGCCCTC GCATCGCCGT GCCCTTAGGA  AGAAAAGACT CTCTCTCCAC TTATAGCAAA CACATGGCAG ACTCTGAGCT CCCTCCCGCC ACTGCTGACG TGGACACTAC CTTAAGCCTC TTTGCCGGCA AAGGCATGAC CGTCGAAGAG  TCCGTTGCCA TCATGGGTTC ACATACTATA GGAGTGACAC ACTGCAACAA CGTACTATCA CGTTTCGACA ACGCAAACGC GACAAGCCAG AACTTGGATC CACGTTTCGA AACGTTTTTG  CGAGTTGCTT GTCCAGAGTT TTCTCCAACC TCCGAAGCCG CGAAAGTCAC GTTTGTTCCC AACGATCAAA CTGCGGTGAT CTTTGATTCA GCTTACTACG ATGATGCCAT CGCTGGACGT  GGCAATCTGA GGATTGATTC GGAGATTGGA GCTGACCCAC GCACACGTCC GTTCGCCGAA GCGTTTGCGG CTGATCAAGA CCGTTTCTTC AACGCCTTCT CTTCCGCGTT TGTAAAATTG 
TCGTCGTACA AAGTGTTAAC CGGGAACGAA GGAGTAGTTA GAAGCGTGTG TGACAAAGTA GATGATTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTTTAGCTTC CGATTTAAAT TACCTTCAAA AAACAAAAAA AAAAGTGATG AAACGAAAGA GCAAAGTTGT AGAATCTGCA GCTGTGTCAT GTTTTCTCGT CATGAGCTTG TTATGTACCT  ACACTAATGG TGACCAGATG GAGACTAATT ATGAAGAGAC GTTATCTTAT AGTTACTACG AGAAAACTTG TCCCAAAGTC GAAGAGATCG TGAAATCTTC ACTTTCATCA ATGTTTGTAC  TTGATCCTAC TGCTCCTGCT GCCTTGCTAA GGCTTATGTT TCACGACTGC CAAGTTCAGG GCTGTGACGC ATCGATCCTA CTCGAGCCAA GCGGTGACCA ACAACAGTTC ACGGAGCTTG  ATTCAGTCAA GAACTTCGGA ATCAGAAAGA GAGACCTGAT TGGCTCTATC AAAACCTCAC TGGAGACGGA GTGTCCGAAG CAAGTCTCAT GCTCTGACGT TATCATTCTC GCCGCCAGAG  AAGCCGTGGC TCTCACGGGA GGCCCTCGCA TCGCCGTGCC CTTAGGAAGA AAAGACTCTC TCTCCACTTA TAGCAAACAC ATGGCAGACT CTGAGCTCCC TCCCGCCACT GCTGACGTGG  ACACTACCTT AAGCCTCTTT GCCGGCAAAG GCATGACCGT CGAAGAGTCC GTTGCCATCA TGGGTTCACA TACTATAGGA GTGACACACT GCAACAACGT ACTATCACGT TTCGACAACG  CAAACGCGAC AAGCCAGAAC TTGGATCCAC GTTTCGAAAC GTTTTTGCGA GTTGCTTGTC CAGAGTTTTC TCCAACCTCC GAAGCCGCGA AAGTCACGTT TGTTCCCAAC GATCAAACTG  CGGTGATCTT TGATTCAGCT TACTACGATG ATGCCATCGC TGGACGTGGC AATCTGAGGA TTGATTCGGA GATTGGAGCT GACCCACGCA CACGTCCGTT CGCCGAAGCG TTTGCGGCTG  ATCAAGACCG TTTCTTCAAC GCCTTCTCTT CCGCGTTTGT AAAATTGTCG TCGTACAAAG TGTTAACCGG GAACGAAGGA GTAGTTAGAA GCGTGTGTGA CAAAGTAGAT GATTGATGTA 
TATGATTTTC ATCAAATGTT ACATGACAAA AATATTATAA TCCGTAAACA AGTTATAAGA TAGTATGAAG CATAGTATAA AG 

Retrieve as FASTA