Entry information : CagraPrx57 (Cagra.0086s0006)
Entry ID 14903
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status partial
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx57 (Cagra.0086s0006)
Name (synonym) CagraPrx57 (Cagra.0086s0006)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx032]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx57
start..stop
S start..stop
CrubPrx58 297 3e-101 2..148 1..146
CrubPrx58 239 3e-78 108..267 185..340
BstrPrx68 292 4e-99 1..148 1..147
BstrPrx68 250 1e-82 108..267 186..341
AlyPrx61 289 8e-98 1..148 1..147
AlyPrx61 244 3e-80 144..267 218..341
AtPrx61 285 3e-96 2..148 1..146
AtPrx61 241 3e-79 144..267 217..340
Literature and cross-references CagraPrx57 (Cagra.0086s0006)
Protein sequence: CagraPrx57 (Cagra.0086s0006)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   267 (241)
PWM (Da):   %s   29409.78 (26561.2) Transmb domain:   %s   i7-29o
PI (pH):   %s   7.72 (7.72) Peptide Signal:   %s   cut: 27 range:27-267
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MMQFVKFFPL LALVVISLAG TATVEAATGM NPPVKLTWHY YKITNTCDDA ETYIRYQVEK LYKSDNTIAP KLLRLLYSDC MVNGCDASVL LQGPNSERTA PQNRGLGGFV IIDKIKQVLE  SRCPGVVSCA DILNLATRDA VHMSTGKPDP SMNTTLVSQL RYLCPPRTQK GQTDPLVYLN PDSGSSNRFS SSYYSRVLSH NAVLGVDQEL LNNEDTKEIT QEFAVGFEDF RKSFALAMSR 
MGSINVLTGT AGEIRRDCKV TNANYGA* 

Retrieve as FASTA  
Remarks Partial sequence from genomic. Exon 3 is missing due to N in the sequence.
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGCAGT TTGTGAAATT TTTCCCACTA TTGGCCCTCG TAGTCATAAG CTTAGCCGGA ACGGCGACAG TAGAGGCTGC GACGGGAATG AACCCTCCGG TGAAGCTGAC TTGGCATTAC  TACAAAATTA CTAACACTTG TGATGATGCG GAGACTTATA TTAGATACCA AGTCGAAAAG CTTTATAAGA GTGATAATAC CATTGCCCCC AAGCTACTTC GTCTCCTCTA CTCCGATTGT  ATGGTTAATG TAAGTAAAAG ACGTCTTTCT ATATAACTGT GACATTAACA TTATCTTCAT TTCTCTAAAT AACCTATGGT GTTGCTTTAT GTTATAGGGA TGTGATGCTT CGGTTCTTTT  GCAAGGACCA AACTCAGAGA GGACAGCTCC GCAGAATCGA GGGCTTGGAG GTTTTGTGAT AATCGATAAG ATAAAACAAG TTCTTGAATC ACGTTGTCCT GGTGTTGTTT CTTGCGCTGA  TATCCTCAAC CTTGCCACTA GGGATGCTGT TCACATGGTA CATnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn  nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nACTACAAGA GCACAGGGAA ACCAGACCCG AGCATGAACA CGACATTGGT GTCACAACTT CGATATCTTT GTCCTCCAAG AACACAAAAG GGCCAAACCG  ATCCACTGGT TTACCTAAAC CCAGACTCAG GCTCGAGCAA CAGGTTCAGC AGCTCTTACT ATTCTCGTGT CCTGTCTCAT AACGCTGTCT TGGGAGTAGA CCAAGAATTG CTCAACAACG  AGGACACAAA GGAGATCACG CAAGAGTTCG CTGTAGGTTT CGAAGACTTC AGAAAGTCTT TTGCTTTGGC AATGTCGAGG ATGGGATCTA TCAATGTATT GACCGGAACA GCTGGAGAGA 
TTCGCCGAGA CTGCAAAGTT ACCAACGCTA ACTACGGAGC TTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGCAGT TTGTGAAATT TTTCCCACTA TTGGCCCTCG TAGTCATAAG CTTAGCCGGA ACGGCGACAG TAGAGGCTGC GACGGGAATG AACCCTCCGG TGAAGCTGAC TTGGCATTAC  TACAAAATTA CTAACACTTG TGATGATGCG GAGACTTATA TTAGATACCA AGTCGAAAAG CTTTATAAGA GTGATAATAC CATTGCCCCC AAGCTACTTC GTCTCCTCTA CTCCGATTGT  ATGGTTAATG GATGTGATGC TTCGGTTCTT TTGCAAGGAC CAAACTCAGA GAGGACAGCT CCGCAGAATC GAGGGCTTGG AGGTTTTGTG ATAATCGATA AGATAAAACA AGTTCTTGAA  TCACGTTGTC CTGGTGTTGT TTCTTGCGCT GATATCCTCA ACCTTGCCAC TAGGGATGCT GTTCACATGA GCACAGGGAA ACCAGACCCG AGCATGAACA CGACATTGGT GTCACAACTT  CGATATCTTT GTCCTCCAAG AACACAAAAG GGCCAAACCG ATCCACTGGT TTACCTAAAC CCAGACTCAG GCTCGAGCAA CAGGTTCAGC AGCTCTTACT ATTCTCGTGT CCTGTCTCAT  AACGCTGTCT TGGGAGTAGA CCAAGAATTG CTCAACAACG AGGACACAAA GGAGATCACG CAAGAGTTCG CTGTAGGTTT CGAAGACTTC AGAAAGTCTT TTGCTTTGGC AATGTCGAGG 
ATGGGATCTA TCAATGTATT GACCGGAACA GCTGGAGAGA TTCGCCGAGA CTGCAAAGTT ACCAACGCTA ACTACGGAGC TTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGATGCAGT TTGTGAAATT TTTCCCACTA TTGGCCCTCG TAGTCATAAG CTTAGCCGGA ACGGCGACAG TAGAGGCTGC GACGGGAATG AACCCTCCGG TGAAGCTGAC TTGGCATTAC  TACAAAATTA CTAACACTTG TGATGATGCG GAGACTTATA TTAGATACCA AGTCGAAAAG CTTTATAAGA GTGATAATAC CATTGCCCCC AAGCTACTTC GTCTCCTCTA CTCCGATTGT  ATGGTTAATG GATGTGATGC TTCGGTTCTT TTGCAAGGAC CAAACTCAGA GAGGACAGCT CCGCAGAATC GAGGGCTTGG AGGTTTTGTG ATAATCGATA AGATAAAACA AGTTCTTGAA  TCACGTTGTC CTGGTGTTGT TTCTTGCGCT GATATCCTCA ACCTTGCCAC TAGGGATGCT GTTCACATGA GCACAGGGAA ACCAGACCCG AGCATGAACA CGACATTGGT GTCACAACTT  CGATATCTTT GTCCTCCAAG AACACAAAAG GGCCAAACCG ATCCACTGGT TTACCTAAAC CCAGACTCAG GCTCGAGCAA CAGGTTCAGC AGCTCTTACT ATTCTCGTGT CCTGTCTCAT  AACGCTGTCT TGGGAGTAGA CCAAGAATTG CTCAACAACG AGGACACAAA GGAGATCACG CAAGAGTTCG CTGTAGGTTT CGAAGACTTC AGAAAGTCTT TTGCTTTGGC AATGTCGAGG 
ATGGGATCTA TCAATGTATT GACCGGAACA GCTGGAGAGA TTCGCCGAGA CTGCAAAGTT ACCAACGCTA ACTACGGAGC TTAA 

Retrieve as FASTA