Entry information : CagraPrx60Cagra.0450s0028
Entry ID 14906
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx60Cagra.0450s0028
Name CagraPrx60Cagra.0450s0028
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx016]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx60
start..stop
S start..stop
CrubPrx93 679 0 1..337 1..337
BstrPrx54 650 0 1..337 1..336
AlyPrx13 640 0 1..337 1..336
AhalPrx56 636 0 1..337 1..336
Literature and cross-references CagraPrx60Cagra.0450s0028
Protein sequence: CagraPrx60Cagra.0450s0028
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   337
PWM (Da):   %s   36858.53 Transmb domain:   %s   i13-32o
PI (pH):   %s   4.67
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MCRRLQEDKS IRLFGPKMIT SIALFLVLLY FHDQLGYSEA QLQFGFYSET CPSAESVVRD VVQQAVTNDP GKAAVLLRLQ FHDCFVEGCD GSILIKHDGS DDERFAAGNA GVAGFDVIDE  VKSELERLCP GVVSCADIVA LAARDAIVEA KGPFYEVPTG RRDGRVANVG HATNLPDVQD SISSLKSKFR EKGLSDQDLV LLSAGAHTIG TTACFFVIAR LDAQDPTINP EFFQILRSKC 
PQGGDVNVRI PLDWDSQFVF DDQILRNIKN GRGVILSDSV LYQDNNMKTI IDSYLETNQS SEANFAADFA KAMVKMGAIG VKIGDEGEIR RLCNATN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGTCGTA GACTACAAGA AGATAAATCG ATTCGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATCACT AGTATTGCAT TATTTCTAGT TTTGTTATAT TTCCATGATC AGTTAGGTTA TTCGGAGGCA  CAACTTCAGT TTGGATTCTA CTCAGAAACA TGTCCATCAG CCGAATCAGT CGTCCGTGAC GTTGTTCAAC AGGCGGTGAC AAACGATCCC GGAAAGGCTG CTGTCTTACT CCGTCTCCAG  TTCCACGATT GCTTCGTTGA GGTCCATTGC AAAAAACAAA AAAAAACTTG TTAATTATTA ATCAGTTTTT ATAAAAATTT TCATACTAGT CATGACATAT ATATATATTA ACTGGTTTGG  TTATATGTTG TAGGGTTGTG ATGGGTCAAT ACTGATCAAG CATGATGGGA GCGATGACGA AAGGTTTGCT GCAGGTAACG CGGGTGTGGC TGGTTTCGAT GTTATAGACG AAGTCAAATC  AGAGCTTGAA CGTCTCTGCC CGGGGGTTGT GTCTTGCGCT GACATCGTTG CTCTTGCTGC TAGAGACGCT ATTGTTGAGG TAACACTTTA ATACTTCTTC ATAGAAAAAT TGAATACACC  ATAAATATTT GTTACGTTAT ATTCGTGCTA TATTCATATT ATATTGGGTT ATAAAAGATG CTTTGATATT AAATAATATT AACTTATTAG GCAAAAGGAC CGTTTTATGA GGTTCCAACC  GGTCGGAGAG ACGGTCGGGT TGCAAATGTT GGTCATGCTA CGAACTTGCC AGATGTTCAA GATTCCATAA GCTCCTTGAA ATCGAAATTT AGAGAAAAAG GGCTTTCAGA TCAAGATCTT  GTACTTCTTA GTGCTGGTAT ATATATATAT CATAATCTCA TGCATTGACA ACTCGATAAA ATAAACACTT CCTTGCTTAC TCGAATCTTA CTTTTTGTTT AAGGTGCACA TACTATCGGT  ACAACAGCAT GCTTCTTTGT CATAGCACGT CTAGATGCGC AAGATCCTAC GATTAATCCA GAATTCTTTC AAATCTTGAG ATCAAAATGT CCCCAAGGCG GCGATGTTAA TGTCAGGATT  CCCTTGGATT GGGATAGTCA GTTTGTGTTT GATGACCAAA TCTTGCGGAA CATCAAAAAT GGTAGAGGTG TCATTTTGTC GGACTCTGTC TTGTACCAAG ACAATAACAT GAAGACAATC  ATAGATTCGT ACCTAGAAAC AAATCAAAGT TCAGAAGCTA ATTTTGCTGC GGATTTCGCT AAAGCCATGG TAAAGATGGG TGCTATTGGT GTGAAAATCG GTGATGAAGG AGAGATTAGA 
CGTTTATGCA ATGCTACAAA CTAG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGTCGTA GACTACAAGA AGATAAATCG ATTCGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATCACT AGTATTGCAT TATTTCTAGT TTTGTTATAT TTCCATGATC AGTTAGGTTA TTCGGAGGCA  CAACTTCAGT TTGGATTCTA CTCAGAAACA TGTCCATCAG CCGAATCAGT CGTCCGTGAC GTTGTTCAAC AGGCGGTGAC AAACGATCCC GGAAAGGCTG CTGTCTTACT CCGTCTCCAG  TTCCACGATT GCTTCGTTGA GGGTTGTGAT GGGTCAATAC TGATCAAGCA TGATGGGAGC GATGACGAAA GGTTTGCTGC AGGTAACGCG GGTGTGGCTG GTTTCGATGT TATAGACGAA  GTCAAATCAG AGCTTGAACG TCTCTGCCCG GGGGTTGTGT CTTGCGCTGA CATCGTTGCT CTTGCTGCTA GAGACGCTAT TGTTGAGGCA AAAGGACCGT TTTATGAGGT TCCAACCGGT  CGGAGAGACG GTCGGGTTGC AAATGTTGGT CATGCTACGA ACTTGCCAGA TGTTCAAGAT TCCATAAGCT CCTTGAAATC GAAATTTAGA GAAAAAGGGC TTTCAGATCA AGATCTTGTA  CTTCTTAGTG CTGGTGCACA TACTATCGGT ACAACAGCAT GCTTCTTTGT CATAGCACGT CTAGATGCGC AAGATCCTAC GATTAATCCA GAATTCTTTC AAATCTTGAG ATCAAAATGT  CCCCAAGGCG GCGATGTTAA TGTCAGGATT CCCTTGGATT GGGATAGTCA GTTTGTGTTT GATGACCAAA TCTTGCGGAA CATCAAAAAT GGTAGAGGTG TCATTTTGTC GGACTCTGTC  TTGTACCAAG ACAATAACAT GAAGACAATC ATAGATTCGT ACCTAGAAAC AAATCAAAGT TCAGAAGCTA ATTTTGCTGC GGATTTCGCT AAAGCCATGG TAAAGATGGG TGCTATTGGT 
GTGAAAATCG GTGATGAAGG AGAGATTAGA CGTTTATGCA ATGCTACAAA CTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTGTCGTA GACTACAAGA AGATAAATCG ATTCGTTTGT TTGGTCCGAA AATGATCACT AGTATTGCAT TATTTCTAGT TTTGTTATAT TTCCATGATC AGTTAGGTTA TTCGGAGGCA  CAACTTCAGT TTGGATTCTA CTCAGAAACA TGTCCATCAG CCGAATCAGT CGTCCGTGAC GTTGTTCAAC AGGCGGTGAC AAACGATCCC GGAAAGGCTG CTGTCTTACT CCGTCTCCAG  TTCCACGATT GCTTCGTTGA GGGTTGTGAT GGGTCAATAC TGATCAAGCA TGATGGGAGC GATGACGAAA GGTTTGCTGC AGGTAACGCG GGTGTGGCTG GTTTCGATGT TATAGACGAA  GTCAAATCAG AGCTTGAACG TCTCTGCCCG GGGGTTGTGT CTTGCGCTGA CATCGTTGCT CTTGCTGCTA GAGACGCTAT TGTTGAGGCA AAAGGACCGT TTTATGAGGT TCCAACCGGT  CGGAGAGACG GTCGGGTTGC AAATGTTGGT CATGCTACGA ACTTGCCAGA TGTTCAAGAT TCCATAAGCT CCTTGAAATC GAAATTTAGA GAAAAAGGGC TTTCAGATCA AGATCTTGTA  CTTCTTAGTG CTGGTGCACA TACTATCGGT ACAACAGCAT GCTTCTTTGT CATAGCACGT CTAGATGCGC AAGATCCTAC GATTAATCCA GAATTCTTTC AAATCTTGAG ATCAAAATGT  CCCCAAGGCG GCGATGTTAA TGTCAGGATT CCCTTGGATT GGGATAGTCA GTTTGTGTTT GATGACCAAA TCTTGCGGAA CATCAAAAAT GGTAGAGGTG TCATTTTGTC GGACTCTGTC  TTGTACCAAG ACAATAACAT GAAGACAATC ATAGATTCGT ACCTAGAAAC AAATCAAAGT TCAGAAGCTA ATTTTGCTGC GGATTTCGCT AAAGCCATGG TAAAGATGGG TGCTATTGGT 
GTGAAAATCG GTGATGAAGG AGAGATTAGA CGTTTATGCA ATGCTACAAA CTAG 

Retrieve as FASTA