Entry information : CagraPrx65(Cagra.10510s0005)
Entry ID 14911
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2019-02-26 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraPrx65(Cagra.10510s0005)
Name CagraPrx65(Cagra.10510s0005)
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx010]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx65
start..stop
S start..stop
CrubPrx94 686 0 1..330 1..330
AlyPrx42 678 0 1..330 1..330
AtPrx42 676 0 1..330 1..330
BstrPrx72 676 0 1..330 1..330
Literature and cross-references CagraPrx65(Cagra.10510s0005)
Protein sequence: CagraPrx65(Cagra.10510s0005)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   330 (307)
PWM (Da):   %s   37289.08 (34835.8)  
PI (pH):   %s   7.56 (7.59) Peptide Signal:   %s   cut: 24 range:24-330
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGGKGVMLVA ILCLWALSAT TEAVTEEESG LMMNFYKDTC PQAEDIIREQ VKLLYKRHKN TAFSWLRNIF HDCAVESCDA SLLLDSTRRE LGEKEHDRSF GLRNFRYIEE IKEALERECP  GVVSCSDILV LSAREGIEAV GGPHIPLKTG RRDGLKSRTD MLESYLPDHN ESISVVLDKF KSIGIDTPGL VALLGSHSVG RTHCVKLVHR LYPEVDPSLN PDHVPHMLHK CPDSIPDPKA 
VQYVRNDRGT PMVLDNNYYR NILDNKGLLL VDHQLAHDKR TRPIVKKMAK DQAYFFKEFT RAIQILSENN PLTGSKGEIR KQCNLANKNH * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
Promoter
Send to BLAST
Send to cis Analysis
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TCTCTTGGTA TTAAATCTTT GCATGGCCCC ATGGTGAATG CAACGTTAAG GACACGGATG AGTACAGTCT CCACGTGTCA AGATCAAGAT CCATGATAGT TAACTCGTAT GAGATTCAAT  TTCAACATTT TTTTACATCT TACACAGAGT TGCACATAAA TTATATGTTG GTTAGGACAT GTTAATCTGT GTTTATAGGA CACATGTGAT GTTAAGCCCA CTGAGCTGAG CTAGAGAGTG  ACATTACCGA ATTGGATTGT TACTCACAAA GCCATTTGTC GACGACACTT GGATAAGGGA ACAAACTGTC GGTGGTCACA GTTCTTTCAT TTTTTTATTT TTTTCGTATT TTGTTGTTTT  TAATCAAAAT ATCCAAATTT TGAGGTGAAC TTCGAATCTA CGGATTCAAT GCGATATCGG TTAAAGCTAC GGATACTCAC CGATTATACT ATTTAAATAT TTTTCCTTTT CAATGTCGTT  TTATCTAGTC TGCCTCTATT AAAATTAGTT TAATAAAATA CAAGAGATAA CAAATTTAAA GAACTACTCT TTTTTTTTGT AAGGGTATGA TAGTATAACT TGTTTAGTCA AATCTGAAGC  ATAAAAAGTT CTACAATTAT ATATAAAAAA ATTAACCCAC AAAAATATGG AACACTAGAG AGTGAAGAGT GGTGAACGTG TTTTAATACC ATATCACGTG GATCAAGATT CATTCAAGAT  TCATTCAATA TTTTATAACT CTCTACTGAC CATTTCTACA TTAAGGAAAT ACTAGTAGAA ATTTTTTGCT AATATTTATT TTTCTTGAAT TATATACAAA AATTTCAGCA GAAAAATAAA  AGTAATTGAA TATGTACAAA TGTACTATTT ATATATGTTA AAAATAATAA GAATCCACCA TGAGTTCATC GAAAATAAAG ATTCTGTTAT CCGCTTTAAC AAAATCAAAT GTTTCGGAAA  ATTGCAAATC TACCCCGTGA GTGTTTTTTG ACTTTTAGCT ATTACACCCC ATATATTATA CTTGTTGCAG CCGCCCCCCT TTGTTTGTAT TGTTAACAAA AGAAGCTGAT TTTTATTTTT  TTGGAAGATT CTTTTAGTCA CAGGGTCCAT TGAAGTGTAC TCAATGAAAC CAAAATCCAA AACTTGGTGA TTGGTTTAGC TAACCATAGC AAAACACCCC TTATATATGA GATAAATTAT  TCAAAATGCC ATCGACATTT AAATCTCCAA CGAACTTTAT TTATTATCAC ATAACACTGT CTATGACTTT AGCTATATAT AGCATGATCA CTCACACGTC TTTCGAATTA GTACCAGATT  GTGGTTTTAG ATTTGTTTAC CCAAAATTAA ACTTTCAGTA CAATGTCTAG CAAATATTTT GATTGAACTA TATTAATAAA ATGAATAATT TTAAAACTCC ATGATTTACC TTTTTATTCT  TAATTACTAA ATTAAAATTT ATAATGTTAA GGCAATAGTC AAAGTTCATA CAGAAAGAAA ATTTAGAATG TTATGACTTA TGTTATTTCA TTTTCGAGAA TTCAAATTAC ACTAATTCTG  CTGTCCGGTC AATTTATAAG AATGAAATTT TTTTTTTTTT TTGTTTAAAG TATATTCAAT TATTTATTTT GTTTAGTGTG TATGATCTAA GTTATCTTAT AATAATAGGT ATAGGCGCCC  TTTTATTGAT ATAGATATTC TTTAATCACG ACTGACGGAA CATACAATTA TTGTAGTCTT ATAATAATAT TTTTGGTTGC TCAAAGTGAA AAAAATGAAT AATGCTTCAT GATAAATGAT  CTGTCACGTA AAATGTATTA ATTTACCAAC TTGTCTTAAT TTACTATAAC CTTCAAATTA AGCTTCTCTT TTATTATTTT GAAAAAAATA AAGAAAGAAA ACTCCATTTC CCTTTATTTA 
AGGAAGCTGC ATTGCTTGCT CACTGACTCA ACTCAAGAGT GGTGTTGTAG TGAGAGAAAA GAAGATAGAG AAAAAAAAAA 

Retrieve as FASTA  
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA AAGGTGTGAT GTTGGTGGCG ATACTCTGCC TTTGGGCACT CTCTGCAACA ACTGAAGCAG TAACAGAGGA AGAGTCAGGT TTGATGATGA ACTTCTACAA GGACACGTGT  CCTCAGGCTG AAGACATCAT CCGTGAACAA GTCAAACTCC TCTACAAACG CCACAAGAAC ACTGCTTTCT CTTGGCTCCG TAACATCTTC CACGACTGCG CCGTCGAGGT CCGATCTCTC  TCCCTCTCTC TCAATGATCT TTCATGTGTT TTGCATGGTG GGTTTTGTCT GAGAATCATG TTTTGTTGGA TGGTTTAAGT GGGAAAAGTA CCGATCTTTG TGTTAAAACT TAGCTAAAAG  GTTTGATATT TCACTTGAAA CAGAGCTAAC GGTTTACTCT GTTTTTGCTT TGTTTTTTGG GGGTTGAAAA CAGTCATGTG ATGCGTCGCT TTTGCTGGAT TCGACAAGAA GAGAGCTAGG  AGAGAAAGAA CACGACAGGA GCTTCGGACT GAGAAACTTC AGGTATATTG AGGAGATCAA GGAAGCTCTC GAGAGGGAGT GCCCTGGTGT TGTCTCATGT TCCGACATTC TCGTCTTGTC  TGCAAGAGAA GGCATCGAAG CAGTAAGTTT TAAAGGACAA GAAGTTTTCT GTTTTGTGAC AAAACTGCGT GTTGTTTGTT TCCCTTTTTT TGACAAAACA GTGTGTGGGG TTTTTTTTGT  AGGTGGGAGG ACCGCATATT CCTTTGAAGA CAGGAAGGAG AGATGGACTG AAGAGCAGGA CAGATATGCT CGAGTCATAT CTTCCTGACC ACAACGAGAG TATCTCCGTC GTTCTTGACA  AATTCAAATC CATCGGAATC GACACTCCCG GCCTCGTAGC TCTCTTAGGT ACCGTTATCT TTCTCCTCCT TTGATTATCT CTCACCAGTC ACTAGTCTCC GGCAAAAACG TAACGCTCGA  AAGTCTATAA CTATTTGACC ATCCAAAAAG TGCTTTTTCT ACCATATCCT AATCAAGGGT ATTTTCGTCT GTTTGATTTA TGCATGTAAA AATCTTAGGT AGATTAATGA AACCATTTGA  GGTAATCTTG CCGGTTCACA TCGGAATATG CGATCTGAGT TGGAAAGTTG AATCTTGAAT GTAACTCTTA TCCGATCTCT CGGTAGTCCT TGTTTAATGG ATTAGCTAGC ACAAGGTTAT  TTTGGTCCAT TAACCCATGT ATGATTAATT TTAGGCTAGC AAAGTTTAAG TTTCTTGTTA GATTATTTCA GTTTGGATAG TGTTAGATTT TGACTTTTTG TTATGATGAC ACGTGCAGGG  TCACACAGCG TGGGAAGAAC TCACTGTGTT AAGCTGGTCC ATCGTTTGTA CCCTGAGGTG GACCCGTCCT TGAACCCGGA CCACGTCCCT CACATGCTAC ACAAGTGTCC TGACTCGATC  CCTGACCCAA AGGCTGTTCA GTACGTGCGT AATGACCGTG GCACTCCCAT GGTGCTAGAC AACAATTACT ACCGTAACAT CCTAGACAAC AAGGGTTTGC TCCTTGTCGA CCATCAGCTC  GCACACGACA AAAGGACCAG ACCAATTGTT AAGAAGATGG CTAAGGACCA GGCCTACTTC TTCAAGGAGT TCACTAGAGC GATCCAGATC TTATCCGAGA ACAACCCTTT GACCGGCTCT  AAGGGTGAGA TTAGGAAGCA ATGTAATCTC GCAAACAAGA ACCACTAAAG TTGGAAAAAA GTGAGAAAAG ACAGAGGCTC TGGTGTGTTG GGGTTCTCTG CTTGGTACGT ATCGAAACCA  AGATGAATAA AGGAATCTTT TAAAGTTAAA ATCAAAGAAA GGGTGATGAT GAATGCATCA TGGTGGTGAC CACTCCCTTC TTTTGTGTGT TCTTGTTGTA GCCTTAATGC TTTAATTATG  ATGTTAGTGG TCTTTGAGTT ATTTAAATCT AAAATGTTGG CTCTTTGTTG ATTTTGGGTT TGTGGTGGGG ATGATAAAAA GATAATGGAA AGGATGTATG ATATGATGGA TGGTGTTGGG 
TATCATGTAT GACTATGTAA TGATAAGTAA ACAGTCCG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGCA AAGGTGTGAT GTTGGTGGCG ATACTCTGCC TTTGGGCACT CTCTGCAACA ACTGAAGCAG TAACAGAGGA AGAGTCAGGT TTGATGATGA ACTTCTACAA GGACACGTGT  CCTCAGGCTG AAGACATCAT CCGTGAACAA GTCAAACTCC TCTACAAACG CCACAAGAAC ACTGCTTTCT CTTGGCTCCG TAACATCTTC CACGACTGCG CCGTCGAGTC ATGTGATGCG  TCGCTTTTGC TGGATTCGAC AAGAAGAGAG CTAGGAGAGA AAGAACACGA CAGGAGCTTC GGACTGAGAA ACTTCAGGTA TATTGAGGAG ATCAAGGAAG CTCTCGAGAG GGAGTGCCCT  GGTGTTGTCT CATGTTCCGA CATTCTCGTC TTGTCTGCAA GAGAAGGCAT CGAAGCAGTG GGAGGACCGC ATATTCCTTT GAAGACAGGA AGGAGAGATG GACTGAAGAG CAGGACAGAT  ATGCTCGAGT CATATCTTCC TGACCACAAC GAGAGTATCT CCGTCGTTCT TGACAAATTC AAATCCATCG GAATCGACAC TCCCGGCCTC GTAGCTCTCT TAGGGTCACA CAGCGTGGGA  AGAACTCACT GTGTTAAGCT GGTCCATCGT TTGTACCCTG AGGTGGACCC GTCCTTGAAC CCGGACCACG TCCCTCACAT GCTACACAAG TGTCCTGACT CGATCCCTGA CCCAAAGGCT  GTTCAGTACG TGCGTAATGA CCGTGGCACT CCCATGGTGC TAGACAACAA TTACTACCGT AACATCCTAG ACAACAAGGG TTTGCTCCTT GTCGACCATC AGCTCGCACA CGACAAAAGG  ACCAGACCAA TTGTTAAGAA GATGGCTAAG GACCAGGCCT ACTTCTTCAA GGAGTTCACT AGAGCGATCC AGATCTTATC CGAGAACAAC CCTTTGACCG GCTCTAAGGG TGAGATTAGG 
AAGCAATGTA ATCTCGCAAA CAAGAACCAC TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
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GTGTTGTAGT GAGAGAAAAG AAGATAGAGA AAAAAAAAAA TGGGAGGCAA AGGTGTGATG TTGGTGGCGA TACTCTGCCT TTGGGCACTC TCTGCAACAA CTGAAGCAGT AACAGAGGAA  GAGTCAGGTT TGATGATGAA CTTCTACAAG GACACGTGTC CTCAGGCTGA AGACATCATC CGTGAACAAG TCAAACTCCT CTACAAACGC CACAAGAACA CTGCTTTCTC TTGGCTCCGT  AACATCTTCC ACGACTGCGC CGTCGAGTCA TGTGATGCGT CGCTTTTGCT GGATTCGACA AGAAGAGAGC TAGGAGAGAA AGAACACGAC AGGAGCTTCG GACTGAGAAA CTTCAGGTAT  ATTGAGGAGA TCAAGGAAGC TCTCGAGAGG GAGTGCCCTG GTGTTGTCTC ATGTTCCGAC ATTCTCGTCT TGTCTGCAAG AGAAGGCATC GAAGCAGTGG GAGGACCGCA TATTCCTTTG  AAGACAGGAA GGAGAGATGG ACTGAAGAGC AGGACAGATA TGCTCGAGTC ATATCTTCCT GACCACAACG AGAGTATCTC CGTCGTTCTT GACAAATTCA AATCCATCGG AATCGACACT  CCCGGCCTCG TAGCTCTCTT AGGGTCACAC AGCGTGGGAA GAACTCACTG TGTTAAGCTG GTCCATCGTT TGTACCCTGA GGTGGACCCG TCCTTGAACC CGGACCACGT CCCTCACATG  CTACACAAGT GTCCTGACTC GATCCCTGAC CCAAAGGCTG TTCAGTACGT GCGTAATGAC CGTGGCACTC CCATGGTGCT AGACAACAAT TACTACCGTA ACATCCTAGA CAACAAGGGT  TTGCTCCTTG TCGACCATCA GCTCGCACAC GACAAAAGGA CCAGACCAAT TGTTAAGAAG ATGGCTAAGG ACCAGGCCTA CTTCTTCAAG GAGTTCACTA GAGCGATCCA GATCTTATCC  GAGAACAACC CTTTGACCGG CTCTAAGGGT GAGATTAGGA AGCAATGTAA TCTCGCAAAC AAGAACCACT AAAGTTGGAA AAAAGTGAGA AAAGACAGAG GCTCTGGTGT GTTGGGGTTC  TCTGCTTGGT ACGTATCGAA ACCAAGATGA ATAAAGGAAT CTTTTAAAGT TAAAATCAAA GAAAGGGTGA TGATGAATGC ATCATGGTGG TGACCACTCC CTTCTTTTGT GTGTTCTTGT  TGTAGCCTTA ATGCTTTAAT TATGATGTTA GTGGTCTTTG AGTTATTTAA ATCTAAAATG TTGGCTCTTT GTTGATTTTG GGTTTGTGGT GGGGATGATA AAAAGATAAT GGAAAGGATG 
TATGATATGA TGGATGGTGT TGGGTATCAT GTATGACTAT GTAATGATAA GTAAACAGTC CG 

Retrieve as FASTA