Entry information : CagraPrx66Cagra.0844s0034
Entry ID 14912
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx66Cagra.0844s0034
Name CagraPrx66Cagra.0844s0034
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx026]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx66
start..stop
S start..stop
CrubPrx54 671 0 1..325 1..325
AtPrx47 647 0 1..325 1..325
AlyPrx47 644 0 1..325 1..325
BstrPrx62 642 0 1..325 1..325
Literature and cross-references CagraPrx66Cagra.0844s0034
Protein sequence: CagraPrx66Cagra.0844s0034
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   325
PWM (Da):   %s   35996.94 Transmb domain:   %s   i12-34o
PI (pH):   %s   7.98
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MLTRVKIDNS KMIRANIVSV VLLMHAIVGF PFHARGLSMT YYMMNCPFAE QIVKNSVNNA LRADPTLAAG LIRMLFHDCF IEGCDASILL DSTKDNTAEK DSPANLSLRG YEIIDDAKEK  IEDRCPGVVS CADIIAMAAR DAVFWAGGPY YDIPKGRFDG KRSKIEDTRN LPSPFLNASE LIQAFGQRGF TPQDIVALSG AHTLGVARCS SFKARLTVPD SSMDSTFANT LSKTCSAGDN 
AEQPFDATRN DFDNAYFNAL QRKSGVLFSD QTLFNTPRTR NLVNGYALNQ ARFFFDFQQA MRKMSNLDVK LGSQGEIRQN CRIIN* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTAAACTGAT TATCATGTTG ACAAGAGTTA AGATAGACAA TAGTAAGATG ATTAGGGCAA ATATAGTGAG CGTGGTTCTG TTGATGCATG CCATTGTTGG GTTTCCTTTT CATGCGAGAG  GCTTAAGTAT GACTTACTAC ATGATGAACT GTCCTTTCGC CGAACAGATC GTGAAGAACA GTGTTAACAA TGCTCTTCGA GCCGATCCGA CTTTAGCCGC AGGTCTTATC CGTATGTTGT  TCCACGACTG TTTCATTGAG GTAACATTTT CTCTATCAAT ATTCTCATTT CATTAGTCGT GTTGTTTTAC GTAAGAAAAC TCATTAGAGA ACTTAAGCTT ATTCTTTTTT TCTGTTTATA  AGGGATGTGA CGCGTCTATC CTGCTAGATT CAACAAAAGA CAACACCGCT GAGAAGGATT CGCCTGCGAA CCTGAGTCTA CGTGGCTACG AGATCATAGA TGATGCAAAA GAGAAAATCG  AGGATAGATG TCCAGGAGTT GTTTCTTGCG CAGATATTAT TGCCATGGCT GCTAGAGATG CTGTCTTTTG GGTAACCAGA CTGATCAATA TTTTTAACCC TTGAATATAC TAATTAACTA  TGTGATTAAT TTGTCTACTT AATCTAATGA TCAGTAATTG GAATTGTTAG GCTGGTGGTC CATATTATGA CATACCAAAA GGAAGATTTG ATGGTAAAAG ATCGAAGATA GAAGATACAA  GAAACCTACC TTCACCTTTT CTTAATGCCT CGGAACTCAT TCAAGCTTTT GGGCAACGTG GCTTCACTCC ACAAGACATT GTCGCTCTCT CTGGTGAGTT CTTTATTGTT TTATTATTAC  TTTCAGAGTT ATTATATATT AAATATATTG TGGAATATAT ATAGGAGCAC ATACCCTAGG AGTTGCAAGA TGCTCCTCCT TCAAGGCTAG ACTTACGGTC CCAGACTCTT CAATGGACTC  GACTTTTGCA AATACTCTTT CCAAAACTTG CAGTGCGGGT GACAACGCAG AGCAACCCTT TGATGCGACT CGCAACGATT TCGACAATGC TTACTTCAAC GCACTTCAGA GGAAATCAGG  AGTCCTGTTT TCAGACCAAA CCTTATTTAA CACCCCAAGG ACCAGGAATC TCGTTAATGG ATATGCCCTT AACCAAGCCA GGTTCTTCTT TGATTTCCAA CAGGCCATGC GGAAAATGAG  CAATCTTGAT GTTAAGCTTG GCTCTCAAGG TGAAATCCGT CAAAATTGTC GGATCATTAA CTAGTCTAGC CATATCTAGC TATGATTTAT GTATTCATGC TCCCACTTTT AATTATATCT  ACTCTATCAT ATATATGGAA TCACGAATCT CCTGTATGCT CCCATGTAAA ATCCGCGTAC CTTAATATGC AGTTGTATAC CTATTGATGA ATTGTGGGTT TTAGATATCC ATCAAAACAT 
AATACGTACT TGGATATCTT GTATTTAATT TTGGTTCATA AAGC 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGTTGACAA GAGTTAAGAT AGACAATAGT AAGATGATTA GGGCAAATAT AGTGAGCGTG GTTCTGTTGA TGCATGCCAT TGTTGGGTTT CCTTTTCATG CGAGAGGCTT AAGTATGACT  TACTACATGA TGAACTGTCC TTTCGCCGAA CAGATCGTGA AGAACAGTGT TAACAATGCT CTTCGAGCCG ATCCGACTTT AGCCGCAGGT CTTATCCGTA TGTTGTTCCA CGACTGTTTC  ATTGAGGGAT GTGACGCGTC TATCCTGCTA GATTCAACAA AAGACAACAC CGCTGAGAAG GATTCGCCTG CGAACCTGAG TCTACGTGGC TACGAGATCA TAGATGATGC AAAAGAGAAA  ATCGAGGATA GATGTCCAGG AGTTGTTTCT TGCGCAGATA TTATTGCCAT GGCTGCTAGA GATGCTGTCT TTTGGGCTGG TGGTCCATAT TATGACATAC CAAAAGGAAG ATTTGATGGT  AAAAGATCGA AGATAGAAGA TACAAGAAAC CTACCTTCAC CTTTTCTTAA TGCCTCGGAA CTCATTCAAG CTTTTGGGCA ACGTGGCTTC ACTCCACAAG ACATTGTCGC TCTCTCTGGA  GCACATACCC TAGGAGTTGC AAGATGCTCC TCCTTCAAGG CTAGACTTAC GGTCCCAGAC TCTTCAATGG ACTCGACTTT TGCAAATACT CTTTCCAAAA CTTGCAGTGC GGGTGACAAC  GCAGAGCAAC CCTTTGATGC GACTCGCAAC GATTTCGACA ATGCTTACTT CAACGCACTT CAGAGGAAAT CAGGAGTCCT GTTTTCAGAC CAAACCTTAT TTAACACCCC AAGGACCAGG  AATCTCGTTA ATGGATATGC CCTTAACCAA GCCAGGTTCT TCTTTGATTT CCAACAGGCC ATGCGGAAAA TGAGCAATCT TGATGTTAAG CTTGGCTCTC AAGGTGAAAT CCGTCAAAAT 
TGTCGGATCA TTAACTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTAAACTGAT TATCATGTTG ACAAGAGTTA AGATAGACAA TAGTAAGATG ATTAGGGCAA ATATAGTGAG CGTGGTTCTG TTGATGCATG CCATTGTTGG GTTTCCTTTT CATGCGAGAG  GCTTAAGTAT GACTTACTAC ATGATGAACT GTCCTTTCGC CGAACAGATC GTGAAGAACA GTGTTAACAA TGCTCTTCGA GCCGATCCGA CTTTAGCCGC AGGTCTTATC CGTATGTTGT  TCCACGACTG TTTCATTGAG GGATGTGACG CGTCTATCCT GCTAGATTCA ACAAAAGACA ACACCGCTGA GAAGGATTCG CCTGCGAACC TGAGTCTACG TGGCTACGAG ATCATAGATG  ATGCAAAAGA GAAAATCGAG GATAGATGTC CAGGAGTTGT TTCTTGCGCA GATATTATTG CCATGGCTGC TAGAGATGCT GTCTTTTGGG CTGGTGGTCC ATATTATGAC ATACCAAAAG  GAAGATTTGA TGGTAAAAGA TCGAAGATAG AAGATACAAG AAACCTACCT TCACCTTTTC TTAATGCCTC GGAACTCATT CAAGCTTTTG GGCAACGTGG CTTCACTCCA CAAGACATTG  TCGCTCTCTC TGGAGCACAT ACCCTAGGAG TTGCAAGATG CTCCTCCTTC AAGGCTAGAC TTACGGTCCC AGACTCTTCA ATGGACTCGA CTTTTGCAAA TACTCTTTCC AAAACTTGCA  GTGCGGGTGA CAACGCAGAG CAACCCTTTG ATGCGACTCG CAACGATTTC GACAATGCTT ACTTCAACGC ACTTCAGAGG AAATCAGGAG TCCTGTTTTC AGACCAAACC TTATTTAACA  CCCCAAGGAC CAGGAATCTC GTTAATGGAT ATGCCCTTAA CCAAGCCAGG TTCTTCTTTG ATTTCCAACA GGCCATGCGG AAAATGAGCA ATCTTGATGT TAAGCTTGGC TCTCAAGGTG  AAATCCGTCA AAATTGTCGG ATCATTAACT AGTCTAGCCA TATCTAGCTA TGATTTATGT ATTCATGCTC CCACTTTTAA TTATATCTAC TCTATCATAT ATATGGAATC ACGAATCTCC  TGTATGCTCC CATGTAAAAT CCGCGTACCT TAATATGCAG TTGTATACCT ATTGATGAAT TGTGGGTTTT AGATATCCAT CAAAACATAA TACGTACTTG GATATCTTGT ATTTAATTTT 
GGTTCATAAA GC 

Retrieve as FASTA