Entry information : CagraPrx69Cagra.0645s0020
Entry ID 14915
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: CagraPrx69Cagra.0645s0020
Name CagraPrx69Cagra.0645s0020
Class Class III peroxidase    [Orthogroup: Prx035]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraPrx69
start..stop
S start..stop
CrubPrx38 721 0 1..357 1..357
BstrPrx03 660 0 1..357 1..353
AlyPrx34-2 652 0 19..357 17..355
AhalPrx51 650 0 19..357 17..355
Literature and cross-references CagraPrx69Cagra.0645s0020
Protein sequence: CagraPrx69Cagra.0645s0020
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   357 (323)
PWM (Da):   %s   39089.8 (35366.0) Transmb domain:   %s   i12-31o
PI (pH):   %s   8.32 (8.20) Peptide Signal:   %s   cut: 35 range:35-357
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MKFSATSSSS TTLFTWTILI ALGCLTLRAS MSDAQLTPTF YDTSCPNVTN IVRDTIVNEL RSDPRIAASI LRLHFHDCFV NGCDASILLD NTTSFRTEKD AGGNANSARG FPVIDRMKAA  IERACPRTVS CADTLTIAAQ QSVTLAGGPS WRVPLGRRDS LQAFLQLANA NLPGPSSTLL RLKDRFRNVG LDRPSDLVAL SGAHTFGKNQ CRFIINRLYN FNSTGLPDPT LNTTYLQTLR 
GLCPQNGNLS ALVDFDLRTP TVFDNKYYVN LGERKGLIQS DQELFSSPNA TDTIPLVRSY ASSTQTFFNA FVEAMNRMGN ITPLTGTQGQ IRLNCRVVNS NSLLQDVVEI VDFVSSM* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACTTAATCAA AGATGAAGTT CTCTGCAACT TCTTCTTCTT CTACTACTTT GTTCACTTGG ACAATCTTAA TAGCATTGGG ATGTCTTACG CTTCGTGCGT CTATGTCCGA TGCTCAACTT  ACTCCTACCT TTTATGACAC TTCATGTCCT AACGTCACCA ACATCGTAAG AGATACCATT GTCAACGAGT TAAGGTCAGA CCCTCGTATC GCCGCGAGCA TCCTTCGTCT TCACTTCCAC  GACTGCTTTG TTAATGTAAG ATATTACTTT TTTTCAGTTT TTTTTCACAT ATCAATCGCG TTACTAAACT ATATGTATCA TACTACTGAT TTTTTTCATG TTTATTTATT CATATTATTT  TAACGCATTT ATTTATTTGA TTTGATTATA TAACAATTTT AATGAGATTA TATATAAGAT TCAACTTTAT ATTTATGGAA ATTTTATCTT TATTCCGTAA AATATGTTTT TTTTTTAATT  ACATCAACTA TTTATTTATG GATCCATGTA ATACAATGAC TAACAATTTG TTAAATAATA TTTTGGACTT TTTGAAAGGG TTGTGACGCA TCGATCTTGT TAGACAACAC AACATCCTTC  CGAACAGAGA AAGATGCGGG TGGAAACGCG AATTCGGCTC GAGGATTTCC CGTGATCGAT AGAATGAAAG CTGCAATAGA GAGGGCTTGC CCGAGAACTG TTTCATGCGC TGATACGCTA  ACCATCGCTG CTCAGCAATC TGTCACTTTG GTATCTATAT TTTGGCACTT ATCATTAATT ATTTTATTCA TTACTGCTTA AGAGTCACTT AATTAACAAA TTAAACACGA CTATTAATTT  TGAAAATATG ATATATATCT TGTTTGTTTG AGAAGGTCAC GCACTCAATA TTTAGTATCA ACTTTCCAAC CATTTGACAA ATAATTCAAA ATTATTAGGG AAAATATTCA AAACGAGTGG  TCCCGTAATT GAATTTTGAT GGCTTTTACT ACTATTGTTG AAAAAAAAAG AAAAGGAAAA TAGATCACAT ATCACAATAG TGTAATTGGT AACCAAAAAG AGTTACTTAT ATTTTTCCTA  TTTTGTTAAA GAAAATATTG GAGATTAAAA ACCTTCATAT CAAGTAGTCT ATGAAATAAT ATAACATGTT TTTTTCTTTG AACACATTGA AATTTAATGA TGATATCATC GTATAGGCAG  GAGGTCCTTC ATGGAGAGTT CCTTTAGGGA GAAGAGACAG CTTACAAGCA TTTTTGCAAC TCGCTAATGC GAATCTTCCT GGTCCATCCT CCACACTTCT ACGACTTAAA GATAGATTTA  GAAACGTTGG CCTCGACCGT CCTTCTGACC TCGTTGCTCT ATCCGGTAAA CAAAAAGATA TTAAACACCA TTTGATATAG TTAGTTGTAA TCAACTGAGT TTGTTATTTA TCGATCTTAT  GGCCTTTCTT TTTGTTAGGT GCCCATACAT TTGGTAAAAA CCAATGCCGG TTTATTATAA ACAGACTATA CAACTTTAAC AGCACCGGTT TACCCGACCC TACTCTCAAC ACTACTTACC  TCCAAACCCT TCGTGGACTA TGTCCCCAAA ATGGTAATCT AAGTGCCTTG GTGGATTTTG ATCTGCGCAC GCCCACGGTT TTCGACAACA AATACTACGT AAATCTTGGT GAGAGAAAAG  GTCTTATCCA GAGCGACCAA GAGCTGTTCT CTAGCCCCAA TGCCACGGAC ACAATCCCTT TGGTGAGATC ATATGCTAGT AGCACACAAA CCTTCTTCAA TGCGTTTGTG GAGGCCATGA  ATAGGATGGG AAATATCACA CCTCTTACTG GAACTCAAGG ACAAATCAGG TTGAATTGTA GGGTGGTGAA TTCCAACTCT CTACTCCAAG ATGTGGTGGA AATTGTTGAC TTTGTTAGCT  CCATGTGAGA ATTGTTTACT AAATATGTAT GTGGCTATAA GAATACGTGT TAATGAATAA AACTCTCAAG ATGTTACTTG AGGATATGTA ATTTAAATCT CTCTTTTTCT AGTTTTTTTC 
CTAAAACATA GTATATACTA AATGTTCCCA CGTTCAAGTT TTTTCATCG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAAGTTCT CTGCAACTTC TTCTTCTTCT ACTACTTTGT TCACTTGGAC AATCTTAATA GCATTGGGAT GTCTTACGCT TCGTGCGTCT ATGTCCGATG CTCAACTTAC TCCTACCTTT  TATGACACTT CATGTCCTAA CGTCACCAAC ATCGTAAGAG ATACCATTGT CAACGAGTTA AGGTCAGACC CTCGTATCGC CGCGAGCATC CTTCGTCTTC ACTTCCACGA CTGCTTTGTT  AATGGTTGTG ACGCATCGAT CTTGTTAGAC AACACAACAT CCTTCCGAAC AGAGAAAGAT GCGGGTGGAA ACGCGAATTC GGCTCGAGGA TTTCCCGTGA TCGATAGAAT GAAAGCTGCA  ATAGAGAGGG CTTGCCCGAG AACTGTTTCA TGCGCTGATA CGCTAACCAT CGCTGCTCAG CAATCTGTCA CTTTGGCAGG AGGTCCTTCA TGGAGAGTTC CTTTAGGGAG AAGAGACAGC  TTACAAGCAT TTTTGCAACT CGCTAATGCG AATCTTCCTG GTCCATCCTC CACACTTCTA CGACTTAAAG ATAGATTTAG AAACGTTGGC CTCGACCGTC CTTCTGACCT CGTTGCTCTA  TCCGGTGCCC ATACATTTGG TAAAAACCAA TGCCGGTTTA TTATAAACAG ACTATACAAC TTTAACAGCA CCGGTTTACC CGACCCTACT CTCAACACTA CTTACCTCCA AACCCTTCGT  GGACTATGTC CCCAAAATGG TAATCTAAGT GCCTTGGTGG ATTTTGATCT GCGCACGCCC ACGGTTTTCG ACAACAAATA CTACGTAAAT CTTGGTGAGA GAAAAGGTCT TATCCAGAGC  GACCAAGAGC TGTTCTCTAG CCCCAATGCC ACGGACACAA TCCCTTTGGT GAGATCATAT GCTAGTAGCA CACAAACCTT CTTCAATGCG TTTGTGGAGG CCATGAATAG GATGGGAAAT 
ATCACACCTC TTACTGGAAC TCAAGGACAA ATCAGGTTGA ATTGTAGGGT GGTGAATTCC AACTCTCTAC TCCAAGATGT GGTGGAAATT GTTGACTTTG TTAGCTCCAT GTGA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ACTTAATCAA AGATGAAGTT CTCTGCAACT TCTTCTTCTT CTACTACTTT GTTCACTTGG ACAATCTTAA TAGCATTGGG ATGTCTTACG CTTCGTGCGT CTATGTCCGA TGCTCAACTT  ACTCCTACCT TTTATGACAC TTCATGTCCT AACGTCACCA ACATCGTAAG AGATACCATT GTCAACGAGT TAAGGTCAGA CCCTCGTATC GCCGCGAGCA TCCTTCGTCT TCACTTCCAC  GACTGCTTTG TTAATGGTTG TGACGCATCG ATCTTGTTAG ACAACACAAC ATCCTTCCGA ACAGAGAAAG ATGCGGGTGG AAACGCGAAT TCGGCTCGAG GATTTCCCGT GATCGATAGA  ATGAAAGCTG CAATAGAGAG GGCTTGCCCG AGAACTGTTT CATGCGCTGA TACGCTAACC ATCGCTGCTC AGCAATCTGT CACTTTGGCA GGAGGTCCTT CATGGAGAGT TCCTTTAGGG  AGAAGAGACA GCTTACAAGC ATTTTTGCAA CTCGCTAATG CGAATCTTCC TGGTCCATCC TCCACACTTC TACGACTTAA AGATAGATTT AGAAACGTTG GCCTCGACCG TCCTTCTGAC  CTCGTTGCTC TATCCGGTGC CCATACATTT GGTAAAAACC AATGCCGGTT TATTATAAAC AGACTATACA ACTTTAACAG CACCGGTTTA CCCGACCCTA CTCTCAACAC TACTTACCTC  CAAACCCTTC GTGGACTATG TCCCCAAAAT GGTAATCTAA GTGCCTTGGT GGATTTTGAT CTGCGCACGC CCACGGTTTT CGACAACAAA TACTACGTAA ATCTTGGTGA GAGAAAAGGT  CTTATCCAGA GCGACCAAGA GCTGTTCTCT AGCCCCAATG CCACGGACAC AATCCCTTTG GTGAGATCAT ATGCTAGTAG CACACAAACC TTCTTCAATG CGTTTGTGGA GGCCATGAAT  AGGATGGGAA ATATCACACC TCTTACTGGA ACTCAAGGAC AAATCAGGTT GAATTGTAGG GTGGTGAATT CCAACTCTCT ACTCCAAGAT GTGGTGGAAA TTGTTGACTT TGTTAGCTCC  ATGTGAGAAT TGTTTACTAA ATATGTATGT GGCTATAAGA ATACGTGTTA ATGAATAAAA CTCTCAAGAT GTTACTTGAG GATATGTAAT TTAAATCTCT CTTTTTCTAG TTTTTTTCCT 
AAAACATAGT ATATACTAAA TGTTCCCACG TTCAAGTTTT TTCATCG 

Retrieve as FASTA