Entry information : CagraAPx02 (Cagra.2515s0054)
Entry ID 14920
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx02 (Cagra.2515s0054)
Name (synonym) CagraAPx02 (Cagra.2515s0054)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx02
start..stop
S start..stop
BstrAPx02 498 0 1..251 1..251
AhalAPx07 498 0 1..251 1..251
AlyAPx02 495 0 1..251 1..251
AtAPx02 490 6e-179 1..251 1..251
Literature and cross-references CagraAPx02 (Cagra.2515s0054)
Protein sequence: CagraAPx02 (Cagra.2515s0054)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   251
PWM (Da):   %s   28055.49  
PI (pH):   %s   6.51
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MVKKSYPEVK EEYKKAVERC KRKLRGLIAE KHCAPIVLRL AWHSAGTFDV KTKTGGPFGT IRHPQELAHE ANNGLDIAVR LLEPIKGLFP ILSYADFYQL AGVVAVEITG GPEIPFHPGR  LDKVEPPPEG RLPQATEGVD HLRNVFGRMG LNDKDIVALS GGHTLGRCHK ERSGFEGAWT QNPLIFDNSY FKEILSGEKE GLLQLPTDKA LLEDPHFRPF VERYAADEDA FFEDYAEAHL 
KLSELGFADK E* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAAGA AGAGTTACCC GGAAGTGAAA GAAGAGTACA AGAAAGCTGT TGAGAGATGC AAGAGGAAGC TCCGTGGTCT TATCGCTGAG AAACATTGTG CTCCCATCGT CCTTCGTCTT  GCGTAAGATC GTCTCTGCTT CTAATCTGTC TGTTTCTGTA TACTCTCTTT TAAAAATTTT GGTTGCGAGT GTTGCTCCAT TTGTGAGTTG TTCAATGAAT TGCCTCTGAG AGCAATTTTG  TTGGAAAAAT CTGCAGATGG CACTCGGCTG GGACATTTGA TGTGAAGACG AAGACGGGAG GACCATTCGG GACGATTAGG CATCCTCAAG AGCTAGCCCA TGAAGCTAAC AATGGTCTTG  ATATTGCCGT CAGGCTTCTT GAGCCTATCA AGGGTTTGTT CCCTATTCTG TCATATGCTG ATTTCTACCA GGTACATTTC AACTATATGC AGAGTTTTTC TTAGCTGTAA TAGTGAAGCA  AGAGATGCAC CAAACTGTAT TAATTAGGAG TTCGATGTGA ATCATATAAT CAAGGGTTTA TGGATGCCTG ATGCATCAAT AATTGTGGGA CATTGGGAAA GATTTAAAAG TGATTTTGTT  GGTTGAAACC GCTAAGTTAT GACTTTAAAT GGGTTCTTAT TTAGCCTGAG TTTTCTACTA TTCGCCCTCT GGTTGCTGTA ACCTATATTC ACACATGTTA TACTAAAACT TAATCTCAAA  AAATTTCCTT GTGTTTTCCA TGGCTTTAAG GCCTTGAATC ATCTGTATTT CTTTGTTATT GTAGCTAGCT GGAGTTGTTG CTGTTGAGAT TACTGGAGGA CCAGAGATTC CGTTCCATCC  TGGTAGACTG GTGAGTCATT TTTAAGTTCT CAGTTCCCCT GCTACCAATT ATTTGCTTCA TTAAGTCTAA GTTTTGTACA TTTTTCTTTG CTAAGTTTTG TATTTTTGTT TATATGATTA  ACTCTGAACC TAACTTCATC TTCCAGGACA AAGTTGAGCC ACCTCCCGAA GGTCGTCTGC CTCAGGCCAC TGAAGGTAAA ACAGATAGAG GAACATGCTT TAGTGTGATT CAGGTATTAG  ATCATAGATA CATATCCATA TCTGCTTTTA TGTAAATTCA GGTGTGGATC ATCTAAGAAA TGTCTTTGGT CGGATGGGAC TCAATGACAA AGATATCGTT GCATTGTCCG GTGGACACAC  CTTGGTATGT ATGCTGCATC TAGAAACAAA GACCTATGTG CTCTTCTCAG TTTTGGCTCA TACCAACTTT TACTTTCAGG GTCGGTGCCA CAAGGAGCGC TCAGGATTTG AAGGAGCATG  GACACAAAAC CCTCTCATTT TTGACAACTC CTATTTCAAG TAAGATCAGA TTCTCTCTGC TTCTGTTTTC CTAGTGCTTG AATTGGACCG GAACTGAATC AGAAAGCTCT TTAATCTTGA  TGGTTATTAA ACAGAGAGAT ATTAAGCGGA GAGAAAGAAG GACTCCTTCA ACTACCAACC GACAAGGCTC TTCTCGAGGA TCCTCATTTT CGTCCATTTG TTGAGAGATA TGCTGCAGTA  AGTGAAATGA CACAACTCAT CATTTCATCA TTTATCATTT CATCATTCTT ATGATCATAT ATATATATAT AGTCAAACGG ATTTACCACT GATTCAAATG TTACTTTCAG GATGAGGATG  CCTTCTTCGA AGACTACGCG GAAGCTCATC TGAAGTTGTC AGAACTTGGG TAAATAACAC ACAGAACAAT CTCTTTCACT TTGTCTCTAT ATTTCTTTAT CTTTATCATA TTGTAAATTT  GCAAACATTG ATTATACCTC AGAAACGCAA CGCAGAGGAA GTTATCACAC TTACAAACAC CCGATTTTGT CTGAACACCG ATCATAGTGT CTTTGTTTAT GTGCTTCGCA GGTTTGCTGA 
CAAGGAGTAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGTGAAGA AGAGTTACCC GGAAGTGAAA GAAGAGTACA AGAAAGCTGT TGAGAGATGC AAGAGGAAGC TCCGTGGTCT TATCGCTGAG AAACATTGTG CTCCCATCGT CCTTCGTCTT  GCATGGCACT CGGCTGGGAC ATTTGATGTG AAGACGAAGA CGGGAGGACC ATTCGGGACG ATTAGGCATC CTCAAGAGCT AGCCCATGAA GCTAACAATG GTCTTGATAT TGCCGTCAGG  CTTCTTGAGC CTATCAAGGG TTTGTTCCCT ATTCTGTCAT ATGCTGATTT CTACCAGCTA GCTGGAGTTG TTGCTGTTGA GATTACTGGA GGACCAGAGA TTCCGTTCCA TCCTGGTAGA  CTGGACAAAG TTGAGCCACC TCCCGAAGGT CGTCTGCCTC AGGCCACTGA AGGTGTGGAT CATCTAAGAA ATGTCTTTGG TCGGATGGGA CTCAATGACA AAGATATCGT TGCATTGTCC  GGTGGACACA CCTTGGGTCG GTGCCACAAG GAGCGCTCAG GATTTGAAGG AGCATGGACA CAAAACCCTC TCATTTTTGA CAACTCCTAT TTCAAAGAGA TATTAAGCGG AGAGAAAGAA  GGACTCCTTC AACTACCAAC CGACAAGGCT CTTCTCGAGG ATCCTCATTT TCGTCCATTT GTTGAGAGAT ATGCTGCAGA TGAGGATGCC TTCTTCGAAG ACTACGCGGA AGCTCATCTG 
AAGTTGTCAG AACTTGGGTT TGCTGACAAG GAGTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGAGAAGCG AGTTTGAAAA AATGGTGAAG AAGAGTTACC CGGAAGTGAA AGAAGAGTAC AAGAAAGCTG TTGAGAGATG CAAGAGGAAG CTCCGTGGTC TTATCGCTGA GAAACATTGT  GCTCCCATCG TCCTTCGTCT TGCATGGCAC TCGGCTGGGA CATTTGATGT GAAGACGAAG ACGGGAGGAC CATTCGGGAC GATTAGGCAT CCTCAAGAGC TAGCCCATGA AGCTAACAAT  GGTCTTGATA TTGCCGTCAG GCTTCTTGAG CCTATCAAGG GTTTGTTCCC TATTCTGTCA TATGCTGATT TCTACCAGCT AGCTGGAGTT GTTGCTGTTG AGATTACTGG AGGACCAGAG  ATTCCGTTCC ATCCTGGTAG ACTGGACAAA GTTGAGCCAC CTCCCGAAGG TCGTCTGCCT CAGGCCACTG AAGGTGTGGA TCATCTAAGA AATGTCTTTG GTCGGATGGG ACTCAATGAC  AAAGATATCG TTGCATTGTC CGGTGGACAC ACCTTGGGTC GGTGCCACAA GGAGCGCTCA GGATTTGAAG GAGCATGGAC ACAAAACCCT CTCATTTTTG ACAACTCCTA TTTCAAAGAG  ATATTAAGCG GAGAGAAAGA AGGACTCCTT CAACTACCAA CCGACAAGGC TCTTCTCGAG GATCCTCATT TTCGTCCATT TGTTGAGAGA TATGCTGCAG ATGAGGATGC CTTCTTCGAA  GACTACGCGG AAGCTCATCT GAAGTTGTCA GAACTTGGGT TTGCTGACAA GGAGTAATCT GGAATCTGGC GTCATGTCCT ATATGTCCTT TGATTAGTGT TCCCTCACAT TATCATTGTA 
ATCATATAAG AAATGAAAAA ACAGTAAACT CGAATGAAAA GCTCTTTGTA TTGTACGTGT GCCTCGGGGG TTGTTTGTAA CTAAT 

Retrieve as FASTA