Entry information : CagraAPx07 (Cagra.3432s0010)
Entry ID 14922
Creation 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-01 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: CagraAPx07 (Cagra.3432s0010)
Name (synonym) CagraAPx07 (Cagra.3432s0010)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx004]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Capsella
Organism Capsella grandiflora    [TaxId: 264402 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value CagraAPx07
start..stop
S start..stop
CrubAPx07 700 0 1..347 1..344
AtAPx07 661 0 1..347 1..349
BstrAPx07 657 0 1..347 1..348
TsAPx07 618 0 1..347 1..347
Literature and cross-references CagraAPx07 (Cagra.3432s0010)
Protein sequence: CagraAPx07 (Cagra.3432s0010)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   347
PWM (Da):   %s   37690.46  
PI (pH):   %s   8.58
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MGGVSFLSTV PSFTTNTTNL TTLSSSSHRP VLIRCCKIEP QVSGESLPLH RRDVLKLAGT AVGMELIGHG FINHVGDAKA ADLNQRRQRS EFLSKIKLML SSAFKAKPEL VPSILKLALN  DAMTYDKATK SGGANGSIRF SSELSRAENE GLSDGLGLIE EMKKEIDSIS KGGPISYADL IQLAGQSAVK STFLASAIRK CGGNEEKGNL LYTAYGSAGQ WGLFDRNFGR TDATEADPEG 
RVPQWGKATV QEMKDKFIAV GLGPRQLAVM SAFLGPDQLA TEQLLATDPQ VAPWVQKYQR SRETVSQTDY EVDLITAFTK LSCLGQQINF EAYTYPVERI NLSKLKL* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGAG TCTCCTTCCT CTCCACTGTT CCTTCCTTCA CCACCAACAC AACAAACCTC ACCACACTCT CTTCATCTTC ACATCGCCCT GTGAGTTTCA AACCCATTTT CACATTCTCT  TTTATACTCC CAACCCATTT CTTATGCTAA CAATTTTGAT ATGATCATCA AATTCAGGTT CTCATACGAT GTTGCAAGAT AGAACCACAA GTCTCCGGAG AAAGTTTACC TCTTCACCGT  CGTGATGTTC TCAAACTTGC CGGCACTGCT GTTGGAATGG TACACTTAAC TTTGAATCAA CTCAATTACA GAACCATCTT CTTAAAGTTC ATGTCTTTAT GTCACGTTTG ATGAGTTCTT  GGTAGTGATG ATCTCTTTTG TTAGGAATTA ATAGGCCATG GTTTCATTAA TCATGTGGGT GATGCAAAAG CTGCTGACTT GAATCAACGT AGACAACGAT CTGAGTTTCT ATGTGAGTTC  TGAATCAAGA ACGTTACTAA AGAAGTACCC AAGAGGTTGA TATTGGTACT AAAGGTTTCA TTTTTATTAT GCAGCAAAGA TCAAGCTTAT GCTTTCGAGT GCCTTTAAGG CTAAACCTGA  GCTTGTACCT TCTATACTTA AACTAGCTCT CAATGATGCA ATGACTTATG ATAAGGTAAG GCTTTATAAA ATGATTGCAT AAACTCTGTT ACCCTTATTG ATGTTGGCAT TTTTTTGTTT  AGGCTACAAA ATCTGGGGGA GCCAATGGAT CAATACGGTT TAGGTACTTT ACTTACATGA TGTAAAGAAC ATTAGCATAG TAGTGTTTAG ATGATGTCTT AATGGAATCT TAGAGTTGGT  GTTATATGTT TTGTGAAGCT CTGAGTTAAG TAGAGCAGAG AATGAGGGGC TTTCTGATGG GTTGGGTTTG ATAGAGGAAA TGAAGAAGGA GATTGATTCT ATATCGAAGG GTGGACCTAT  TTCATATGCT GATCTTATTC AATTGGCAGG TGATGATGTT ATAGTGTATA CCAAGACTTG TTCATGGACA GAATTAGGAT TATATAACTG AAGTCTTTCT TGGGTTGGTG TCTTTTTGTA  GGACAATCTG CGGTTAAGTC TACGTTTTTA GCATCGGCGA TCCGAAAATG TGGTGGAAAT GAAGAAAAAG GGAACTTACT TTACACAGCA TATGGTTCAG CTGGTCAGGT ACAAAATGCT  ATGTCCTTTT GATGTGTTTT GAGCCTCGCG CATTGTTCAA ATGGACACTG AACTGTTGTG AATCTGTTTA GTGGGGCTTG TTTGATAGAA ATTTCGGAAG GACTGATGCA ACAGAGGCAG  ATCCAGAAGG CAGAGTCCCA CAGTGGGGAA AAGCAACTGT GCAAGAGATG AAAGATAAGT TCATTGCCGT TGGATTGGGT CCTCGTCAGG TACAAGATTT TGGGTTTAAA ATTATGGTTA  TCGGATCAAA TCCGTCGTAG TTACTAACCT GTATTTGAAT CAATGAGGGG ATTTCTAGCT AGCTGTAATG TCTGCATTCT TGGGTCCTGA TCAACTCGCA ACAGAACAAC TCTTGGCTAC  TGACCCGCAA GTTGCTCCAT GGGTTCAGAA GTACCAACGA AGCCGTGAAA CCGTATCACA AACAGATTAC GAGGTTTGTT TCCACTCGAT TCTCCTTACC ATATATTCTC CAACTTCAAA  CTCAAGCTTA TGTATGATTT ATAAACATAT TTGCAGGTTG ATTTGATAAC AGCATTCACA AAGCTAAGTT GCTTAGGACA ACAAATCAAC TTCGAAGCAT ACACATATCC CGTTGAACGA 
ATCAATCTGA GCAAACTCAA GCTATAA 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGGAGGAG TCTCCTTCCT CTCCACTGTT CCTTCCTTCA CCACCAACAC AACAAACCTC ACCACACTCT CTTCATCTTC ACATCGCCCT GTTCTCATAC GATGTTGCAA GATAGAACCA  CAAGTCTCCG GAGAAAGTTT ACCTCTTCAC CGTCGTGATG TTCTCAAACT TGCCGGCACT GCTGTTGGAA TGGAATTAAT AGGCCATGGT TTCATTAATC ATGTGGGTGA TGCAAAAGCT  GCTGACTTGA ATCAACGTAG ACAACGATCT GAGTTTCTAT CAAAGATCAA GCTTATGCTT TCGAGTGCCT TTAAGGCTAA ACCTGAGCTT GTACCTTCTA TACTTAAACT AGCTCTCAAT  GATGCAATGA CTTATGATAA GGCTACAAAA TCTGGGGGAG CCAATGGATC AATACGGTTT AGCTCTGAGT TAAGTAGAGC AGAGAATGAG GGGCTTTCTG ATGGGTTGGG TTTGATAGAG  GAAATGAAGA AGGAGATTGA TTCTATATCG AAGGGTGGAC CTATTTCATA TGCTGATCTT ATTCAATTGG CAGGACAATC TGCGGTTAAG TCTACGTTTT TAGCATCGGC GATCCGAAAA  TGTGGTGGAA ATGAAGAAAA AGGGAACTTA CTTTACACAG CATATGGTTC AGCTGGTCAG TGGGGCTTGT TTGATAGAAA TTTCGGAAGG ACTGATGCAA CAGAGGCAGA TCCAGAAGGC  AGAGTCCCAC AGTGGGGAAA AGCAACTGTG CAAGAGATGA AAGATAAGTT CATTGCCGTT GGATTGGGTC CTCGTCAGCT AGCTGTAATG TCTGCATTCT TGGGTCCTGA TCAACTCGCA  ACAGAACAAC TCTTGGCTAC TGACCCGCAA GTTGCTCCAT GGGTTCAGAA GTACCAACGA AGCCGTGAAA CCGTATCACA AACAGATTAC GAGGTTGATT TGATAACAGC ATTCACAAAG 
CTAAGTTGCT TAGGACAACA AATCAACTTC GAAGCATACA CATATCCCGT TGAACGAATC AATCTGAGCA AACTCAAGCT ATAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CAGACATCTC TCTTCTCTCT TCTCTGTCTC ATCACAAACC AAACCAAAAC AATGGGAGGA GTCTCCTTCC TCTCCACTGT TCCTTCCTTC ACCACCAACA CAACAAACCT CACCACACTC  TCTTCATCTT CACATCGCCC TGTTCTCATA CGATGTTGCA AGATAGAACC ACAAGTCTCC GGAGAAAGTT TACCTCTTCA CCGTCGTGAT GTTCTCAAAC TTGCCGGCAC TGCTGTTGGA  ATGGAATTAA TAGGCCATGG TTTCATTAAT CATGTGGGTG ATGCAAAAGC TGCTGACTTG AATCAACGTA GACAACGATC TGAGTTTCTA TCAAAGATCA AGCTTATGCT TTCGAGTGCC  TTTAAGGCTA AACCTGAGCT TGTACCTTCT ATACTTAAAC TAGCTCTCAA TGATGCAATG ACTTATGATA AGGCTACAAA ATCTGGGGGA GCCAATGGAT CAATACGGTT TAGCTCTGAG  TTAAGTAGAG CAGAGAATGA GGGGCTTTCT GATGGGTTGG GTTTGATAGA GGAAATGAAG AAGGAGATTG ATTCTATATC GAAGGGTGGA CCTATTTCAT ATGCTGATCT TATTCAATTG  GCAGGACAAT CTGCGGTTAA GTCTACGTTT TTAGCATCGG CGATCCGAAA ATGTGGTGGA AATGAAGAAA AAGGGAACTT ACTTTACACA GCATATGGTT CAGCTGGTCA GTGGGGCTTG  TTTGATAGAA ATTTCGGAAG GACTGATGCA ACAGAGGCAG ATCCAGAAGG CAGAGTCCCA CAGTGGGGAA AAGCAACTGT GCAAGAGATG AAAGATAAGT TCATTGCCGT TGGATTGGGT  CCTCGTCAGC TAGCTGTAAT GTCTGCATTC TTGGGTCCTG ATCAACTCGC AACAGAACAA CTCTTGGCTA CTGACCCGCA AGTTGCTCCA TGGGTTCAGA AGTACCAACG AAGCCGTGAA  ACCGTATCAC AAACAGATTA CGAGGTTGAT TTGATAACAG CATTCACAAA GCTAAGTTGC TTAGGACAAC AAATCAACTT CGAAGCATAC ACATATCCCG TTGAACGAAT CAATCTGAGC  AAACTCAAGC TATAAGCTAT GTACACTATA TGTATAACCT GAGAGTAAAC TTGAACTTAT TCAGTAATTG ATTGCTGAAA TAAACCAAAG ATTTTTCTCG ACATTGAAAC AAGAAAAGAT 
GAATCCATTA 

Retrieve as FASTA