Entry information : BstrAPx01(Bostr.25219s0159)
Entry ID 14931
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Bruno Savelli)
Sequence status complete
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2020-09-30 (Bruno Savelli)
Peroxidase information: BstrAPx01(Bostr.25219s0159)
Name BstrAPx01(Bostr.25219s0159)
Class Ascorbate peroxidase    [Orthogroup: APx001]
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrAPx01
start..stop
S start..stop
CagraAPx01 509 0 1..250 1..250
AlyAPx01 506 0 1..250 1..250
AhalAPx02 505 0 1..250 1..250
TparAPx01 504 0 1..250 1..250
Literature and cross-references BstrAPx01(Bostr.25219s0159)
Protein sequence: BstrAPx01(Bostr.25219s0159)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   250
PWM (Da):   %s   27494.83  
PI (pH):   %s   6.04
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MTKNYPTVSE DYLKAIEKCK RKLRGLIAEK NCAPIMVRLA WHSAGTFDCA SRTGGPFGTM RFDAEQAHGA NSGLHIALRL LEPIREQFPT ISVADFHQLA GVVAVEVTGG PEIPFHPGRE  DKPQPPPEGR LPDATKGCDH LRDVFKKQMG LSDKDIVALS GAHTLGRCHK DRSGFEGAWT SNPLIFDNSY FKELLSGEKE GLIQLVSDKA LLDDPVFRPL VEKYAADEDA FFADYAEAHM 
KLSELGFADA * 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGAAGA ACTACCCAAC CGTGAGCGAA GATTACCTGA AGGCTATTGA GAAGTGCAAG AGAAAGCTTA GAGGCTTGAT CGCCGAGAAG AACTGTGCAC CCATCATGGT CCGACTTGCG  TAAGTAACTA ATCATAACAG CGTGCTGTTT CTGAAGTATT TAGGATGTGT AACACTTCTC ATGGCTGATC TGTTTGGCTA AACTGCAGAT GGCACTCTGC TGGAACATTC GATTGCGCCT  CAAGGACTGG TGGTCCCTTT GGAACAATGA GGTTTGATGC TGAGCAAGCT CATGGAGCCA ACAGTGGTCT CCACATTGCT CTTAGGTTGT TGGAGCCCAT CAGGGAGCAA TTCCCAACCA  TCTCTGTTGC TGATTTCCAT CAGGTACAGG ATTTAAATTT TTTTTTTTTA AAACACTATT TGGTTAACGG TGACTAACTC CGCGGTTTGG AATCTTACTC ACGATGATGT TTTGGTGTGA  AATTGAACTT TCAGCTTGCT GGTGTTGTGG CCGTTGAAGT TACTGGTGGC CCTGAAATTC CTTTTCACCC TGGAAGAGAG GTTAGTTAGT CTTTGCTGTA GATTTGTTTG TCGTGTATAC  GATTATCATA TGCTCAGTTA GTCGAGAGAA TGTTTTCTGC TTATTCGTAT AGATGGCTAA TGGATAATGT AGCCATTCTA TCACTACTGT GGGACTTGAT TTCGTGTTGC TAACACGCAT  ATCTTGCTTT CAGGACAAGC CCCAGCCACC TCCAGAGGGT CGTCTTCCTG ATGCTACAAA GGGTTGTGAT CACTTGAGAG ATGTCTTTAA AAAGCAGATG GGCTTATCTG ACAAGGACAT  TGTTGCCTTA TCTGGTGCCC ACACTCTGGT TTGTTTCTCT CCAACTGCTT GAACACTTTA TTTTTTGGTT CCAACCTTAC AAATTGTGAT GAATGCCTGC AAATTATGAT AACACAGGGA  AGATGCCACA AGGATAGGTC TGGCTTCGAA GGTGCCTGGA CTTCAAATCC TCTTATTTTC GACAACTCTT ACTTCAAGTG AGTATCCCAA CATGTTGGAG GATTCAATTA AGCTGATATG  GTTATTAATC AAATTATATA TGACCAGGGA ACTCTTGAGC GGAGAGAAGG AAGGCCTCAT TCAGCTTGTC TCTGACAAGG CGCTATTGGA CGATCCTGTT TTCCGTCCTT TAGTCGAGAA  ATACGCCGCT GTATGCATCC TTTCTTTCTT CCTTTCTCTT TTCCCTGTTC TTCACTTGGT AGATAGAGAA CTCATGGTTT CTTGTGCCAC AATGTGAACA GGATGAAGAC GCCTTTTTCG  CTGATTACGC TGAGGCCCAC ATGAAGCTTT CAGAGCTTGG GTACTTACTT ATCTTGAATA TATGAATCAT TAGAAGGTAA ATATTAGTTC AGTGGTATGA TTTGAGTTTG TATTTTTTGG  TTGCAGGTTT GCTGATGCTT AAGCTGTGAC GTATGTGTGT GTGTCTCCGA GACTCATGGC TGTTTTTGGT TGGGGGAGGC CGGAGGGGTC GCATTGCATT TGAACTTTGT CATATGATTG 
CTTAATGTAC TCTCGGATTT GCGTATCTTG TTTTTCAGTG GGTTGTGATT TGACACATCC GTTGCGCTTT TGCTGGTTAG ACATTTTAAT AAAAATTATT TCTCTCAATA TTTATG 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGACGAAGA ACTACCCAAC CGTGAGCGAA GATTACCTGA AGGCTATTGA GAAGTGCAAG AGAAAGCTTA GAGGCTTGAT CGCCGAGAAG AACTGTGCAC CCATCATGGT CCGACTTGCA  TGGCACTCTG CTGGAACATT CGATTGCGCC TCAAGGACTG GTGGTCCCTT TGGAACAATG AGGTTTGATG CTGAGCAAGC TCATGGAGCC AACAGTGGTC TCCACATTGC TCTTAGGTTG  TTGGAGCCCA TCAGGGAGCA ATTCCCAACC ATCTCTGTTG CTGATTTCCA TCAGCTTGCT GGTGTTGTGG CCGTTGAAGT TACTGGTGGC CCTGAAATTC CTTTTCACCC TGGAAGAGAG  GACAAGCCCC AGCCACCTCC AGAGGGTCGT CTTCCTGATG CTACAAAGGG TTGTGATCAC TTGAGAGATG TCTTTAAAAA GCAGATGGGC TTATCTGACA AGGACATTGT TGCCTTATCT  GGTGCCCACA CTCTGGGAAG ATGCCACAAG GATAGGTCTG GCTTCGAAGG TGCCTGGACT TCAAATCCTC TTATTTTCGA CAACTCTTAC TTCAAGGAAC TCTTGAGCGG AGAGAAGGAA  GGCCTCATTC AGCTTGTCTC TGACAAGGCG CTATTGGACG ATCCTGTTTT CCGTCCTTTA GTCGAGAAAT ACGCCGCTGA TGAAGACGCC TTTTTCGCTG ATTACGCTGA GGCCCACATG 
AAGCTTTCAG AGCTTGGGTT TGCTGATGCT TAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CACAACCGTT GATTTTATTG GCAAATATTT ACCACACGAT ATCCGTCATC TAACGGCATC TATAAGATCT ACTAGAACGT TCTCTTCATG AAACAGCTCC ATTATATATT TCGCATTTCT  TCTCCTCAGC GCTCTCAATA AAAAGTACTC GTGTCCTACT TGTGCCAGCC ACTCGCATTT CTCAGATTTT ATTATCCTTT CCTCGGAAAA AGATTTTAGC TAAGATGACG AAGAACTACC  CAACCGTGAG CGAAGATTAC CTGAAGGCTA TTGAGAAGTG CAAGAGAAAG CTTAGAGGCT TGATCGCCGA GAAGAACTGT GCACCCATCA TGGTCCGACT TGCATGGCAC TCTGCTGGAA  CATTCGATTG CGCCTCAAGG ACTGGTGGTC CCTTTGGAAC AATGAGGTTT GATGCTGAGC AAGCTCATGG AGCCAACAGT GGTCTCCACA TTGCTCTTAG GTTGTTGGAG CCCATCAGGG  AGCAATTCCC AACCATCTCT GTTGCTGATT TCCATCAGCT TGCTGGTGTT GTGGCCGTTG AAGTTACTGG TGGCCCTGAA ATTCCTTTTC ACCCTGGAAG AGAGGACAAG CCCCAGCCAC  CTCCAGAGGG TCGTCTTCCT GATGCTACAA AGGGTTGTGA TCACTTGAGA GATGTCTTTA AAAAGCAGAT GGGCTTATCT GACAAGGACA TTGTTGCCTT ATCTGGTGCC CACACTCTGG  GAAGATGCCA CAAGGATAGG TCTGGCTTCG AAGGTGCCTG GACTTCAAAT CCTCTTATTT TCGACAACTC TTACTTCAAG GAACTCTTGA GCGGAGAGAA GGAAGGCCTC ATTCAGCTTG  TCTCTGACAA GGCGCTATTG GACGATCCTG TTTTCCGTCC TTTAGTCGAG AAATACGCCG CTGATGAAGA CGCCTTTTTC GCTGATTACG CTGAGGCCCA CATGAAGCTT TCAGAGCTTG  GGTTTGCTGA TGCTTAAGCT GTGACGTATG TGTGTGTGTC TCCGAGACTC ATGGCTGTTT TTGGTTGGGG GAGGCCGGAG GGGTCGCATT GCATTTGAAC TTTGTCATAT GATTGCTTAA 
TGTACTCTCG GATTTGCGTA TCTTGTTTTT CAGTGGGTTG TGATTTGACA CATCCGTTGC GCTTTTGCTG GTTAGACATT TTAATAAAAA TTATTTCTCT CAATATTTAT G 

Retrieve as FASTA