Entry information : BstrPrx06Bostr.7867s1611
Entry ID 14933
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx06Bostr.7867s1611
Name BstrPrx06Bostr.7867s1611
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx011]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx06
start..stop
S start..stop
AtPrx50 626 0 1..329 1..329
AhalPrx33 622 0 3..329 1..327
CrubPrx73 617 0 23..329 24..330
AlyPrx50 617 0 25..329 23..327
Literature and cross-references BstrPrx06Bostr.7867s1611
Protein sequence: BstrPrx06Bostr.7867s1611
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   329 (304)
PWM (Da):   %s   35909.4 (33128.8) Transmb domain:   %s   i7-25o
PI (pH):   %s   9.06 (8.89) Peptide Signal:   %s   cut: 26 range:26-329
Sequence
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Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MAVVNKTNLL LLLLSLFLTL NLASAQLRRN FYAGSCPNVE QIVRNAVQKK VQQTFTTIPA TLRLYFHDCF VNGCDASVLI ASTNNNKAEK DHEDNLSLAG DGFDTVIKAK EALDAVANCR  NKVSCADILT MATRDVVNLA GGPKYDVELG RLDGLSSTAA SVGGKLPHPT DDVNKLTSLF AKNGLSLNDM IALSGAHTLG FAHCTKVFNR IYSFNKTAKV DPTVNKDYVT ELKASCPQNI 
DPRVAINMDP TTPRQFDNVY YKNLQQGKGL FTSDQVLFTD RRSKPTVDLW ASNGQLFNQA FINSMIKLGR VGVKTGTNGN IRRDCGAFN* 

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Remarks
DNA
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.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGAAATTGA GTAAAAATAA TTTAAAAAAC ATGGCTGTGG TGAACAAAAC GAATCTCTTG TTGCTTCTTC TCTCTCTCTT TCTCACCCTC AACCTCGCCT CCGCTCAACT CCGCCGCAAC  TTCTACGCCG GAAGTTGTCC GAACGTCGAA CAAATCGTTA GAAACGCCGT TCAGAAAAAA GTCCAACAAA CTTTCACCAC CATTCCCGCC ACTCTACGCC TCTATTTCCA TGATTGTTTC  GTCAATGTAA AACATTTTTT TTATTGATAA TTTTCTTTTC TTGCGTAAAA TTATTTCATT ATTTTGTCTA ATTTATGGAT TAATTGATTA ATATCATAGG GGTGTGATGC ATCAGTGCTA  ATAGCGTCGA CTAATAATAA TAAGGCGGAG AAGGATCATG AGGATAATTT ATCGTTGGCC GGAGATGGAT TCGACACCGT CATTAAAGCT AAAGAAGCTC TCGATGCCGT CGCAAATTGT  CGTAACAAAG TTTCTTGCGC CGATATTCTC ACGATGGCCA CTCGTGACGT CGTTAATCTT GTTAGTAACT CATTCTTATT TATATAATAT CAATTTTTAT TAAATTAAAA CATTAGTGTA  AGTTATTAAA TTAAATTCAA TATAGGCGGG TGGACCAAAA TACGATGTGG AATTGGGAAG GCTAGACGGA CTATCGTCGA CGGCGGCTAG CGTCGGAGGG AAGCTGCCGC ATCCGACCGA  CGATGTCAAT AAACTCACTT CACTTTTCGC GAAAAACGGC CTTAGCCTTA ACGACATGAT CGCTCTCTCC GGTAAGTGTT GAACTACTTC TCGATCAAGA ATAGTATCAT TCGGACCGAA  CTTAGCTAGT AATGACTTAA AATTGGTAAT ATTTCGGTTT AGCTTGATGT GGTTATTCGG TATGATAATA TTCTCACCGA ACTATACCCG AGTTTGATTA GGATTTTAGT CGGTTTTATA  TGTGTTTTGT TTAATTTCTG TTATTACGAT GTGAAATCTT AGATACCCAC TAATATATGT AAGATTACAT TTTCAGGTTT TGGGTTACTT TGGTTTCGGT TTAAAATGTT CCGGTACTAA  TTTAAAGTTG GTTCGATCTT AAAAAAAACA GGGGCGCACA CATTAGGATT CGCGCATTGC ACCAAAGTGT TCAATCGGAT ATACAGTTTC AACAAGACAG CTAAAGTGGA TCCCACAGTT  AACAAAGATT ACGTGACAGA GCTAAAAGCG TCGTGTCCTC AAAACATAGA TCCAAGAGTG GCTATAAACA TGGACCCAAC AACACCTAGA CAATTCGACA ACGTTTACTA CAAGAATTTG  CAGCAAGGGA AAGGATTGTT CACATCTGAT CAAGTTTTAT TCACTGATCG TCGGTCAAAG CCAACCGTTG ACTTATGGGC TAGTAATGGA CAGTTGTTTA ATCAAGCTTT TATTAACTCC  ATGATCAAGC TTGGTCGTGT TGGTGTTAAA ACCGGTACTA ATGGTAATAT CCGTCGTGAT TGTGGAGCTT TCAATTGATT TAATATATCT ATTTTAGATT TTGTTTATTT TCATTCAGTT  GTATTTGGGG ATAGGATGGG TCGTCTCACG AAGCTTGTTC AGCTAAATTG TAATAAATCT CGGCTTTGGG TTTCAGTTTA CCGCAAAACC TAGATTGTAA TATTAAAGTC AGAATAAATT 
CGAAGGAAAT AAGAAACATT ATATAATATT 

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CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCTGTGG TGAACAAAAC GAATCTCTTG TTGCTTCTTC TCTCTCTCTT TCTCACCCTC AACCTCGCCT CCGCTCAACT CCGCCGCAAC TTCTACGCCG GAAGTTGTCC GAACGTCGAA  CAAATCGTTA GAAACGCCGT TCAGAAAAAA GTCCAACAAA CTTTCACCAC CATTCCCGCC ACTCTACGCC TCTATTTCCA TGATTGTTTC GTCAATGGGT GTGATGCATC AGTGCTAATA  GCGTCGACTA ATAATAATAA GGCGGAGAAG GATCATGAGG ATAATTTATC GTTGGCCGGA GATGGATTCG ACACCGTCAT TAAAGCTAAA GAAGCTCTCG ATGCCGTCGC AAATTGTCGT  AACAAAGTTT CTTGCGCCGA TATTCTCACG ATGGCCACTC GTGACGTCGT TAATCTTGCG GGTGGACCAA AATACGATGT GGAATTGGGA AGGCTAGACG GACTATCGTC GACGGCGGCT  AGCGTCGGAG GGAAGCTGCC GCATCCGACC GACGATGTCA ATAAACTCAC TTCACTTTTC GCGAAAAACG GCCTTAGCCT TAACGACATG ATCGCTCTCT CCGGGGCGCA CACATTAGGA  TTCGCGCATT GCACCAAAGT GTTCAATCGG ATATACAGTT TCAACAAGAC AGCTAAAGTG GATCCCACAG TTAACAAAGA TTACGTGACA GAGCTAAAAG CGTCGTGTCC TCAAAACATA  GATCCAAGAG TGGCTATAAA CATGGACCCA ACAACACCTA GACAATTCGA CAACGTTTAC TACAAGAATT TGCAGCAAGG GAAAGGATTG TTCACATCTG ATCAAGTTTT ATTCACTGAT  CGTCGGTCAA AGCCAACCGT TGACTTATGG GCTAGTAATG GACAGTTGTT TAATCAAGCT TTTATTAACT CCATGATCAA GCTTGGTCGT GTTGGTGTTA AAACCGGTAC TAATGGTAAT 
ATCCGTCGTG ATTGTGGAGC TTTCAATTGA 

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cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
GAGAAATTGA GTAAAAATAA TTTAAAAAAC ATGGCTGTGG TGAACAAAAC GAATCTCTTG TTGCTTCTTC TCTCTCTCTT TCTCACCCTC AACCTCGCCT CCGCTCAACT CCGCCGCAAC  TTCTACGCCG GAAGTTGTCC GAACGTCGAA CAAATCGTTA GAAACGCCGT TCAGAAAAAA GTCCAACAAA CTTTCACCAC CATTCCCGCC ACTCTACGCC TCTATTTCCA TGATTGTTTC  GTCAATGGGT GTGATGCATC AGTGCTAATA GCGTCGACTA ATAATAATAA GGCGGAGAAG GATCATGAGG ATAATTTATC GTTGGCCGGA GATGGATTCG ACACCGTCAT TAAAGCTAAA  GAAGCTCTCG ATGCCGTCGC AAATTGTCGT AACAAAGTTT CTTGCGCCGA TATTCTCACG ATGGCCACTC GTGACGTCGT TAATCTTGCG GGTGGACCAA AATACGATGT GGAATTGGGA  AGGCTAGACG GACTATCGTC GACGGCGGCT AGCGTCGGAG GGAAGCTGCC GCATCCGACC GACGATGTCA ATAAACTCAC TTCACTTTTC GCGAAAAACG GCCTTAGCCT TAACGACATG  ATCGCTCTCT CCGGGGCGCA CACATTAGGA TTCGCGCATT GCACCAAAGT GTTCAATCGG ATATACAGTT TCAACAAGAC AGCTAAAGTG GATCCCACAG TTAACAAAGA TTACGTGACA  GAGCTAAAAG CGTCGTGTCC TCAAAACATA GATCCAAGAG TGGCTATAAA CATGGACCCA ACAACACCTA GACAATTCGA CAACGTTTAC TACAAGAATT TGCAGCAAGG GAAAGGATTG  TTCACATCTG ATCAAGTTTT ATTCACTGAT CGTCGGTCAA AGCCAACCGT TGACTTATGG GCTAGTAATG GACAGTTGTT TAATCAAGCT TTTATTAACT CCATGATCAA GCTTGGTCGT  GTTGGTGTTA AAACCGGTAC TAATGGTAAT ATCCGTCGTG ATTGTGGAGC TTTCAATTGA TTTAATATAT CTATTTTAGA TTTTGTTTAT TTTCATTCAG TTGTATTTGG GGATAGGATG  GGTCGTCTCA CGAAGCTTGT TCAGCTAAAT TGTAATAAAT CTCGGCTTTG GGTTTCAGTT TACCGCAAAA CCTAGATTGT AATATTAAAG TCAGAATAAA TTCGAAGGAA ATAAGAAACA 
TTATATAATA TT 

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