Entry information : BstrPrx12Bostr.22495s0004
Entry ID 14939
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Peroxidase information: BstrPrx12Bostr.22495s0004
Name BstrPrx12Bostr.22495s0004
Class Class III peroxidase     [Orthogroup: Prx015]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrPrx12
start..stop
S start..stop
CrubPrx43 649 0 1..317 1..317
CagraPrx56 648 0 1..317 1..317
AlyPrx64 641 0 1..317 1..317
AhalPrx17 640 0 1..317 1..317
Literature and cross-references BstrPrx12Bostr.22495s0004
Protein sequence: BstrPrx12Bostr.22495s0004
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   317 (295)
PWM (Da):   %s   34699.58 (32075.2)  
PI (pH):   %s   8.74 (8.91) Peptide Signal:   %s   cut: 23 range:23-317
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MNAHFLNLLL MVILVVSFDV QALSPHYYDH SCPQADHIVT NAVKKAMSND KTVPAALLRM HFHDCFVRGC DGSVLLDSKG KNKAEKDGPP NISLHAFYVI DNAKKALEEQ CPGIVSCADI  LSLAARDAVA LSGGPTWEVP KGRKDGRISK AIETRQLPAP TFNISQLRQN FGQRGLSMHD LVVLSGGHTL GFAHCSSFQN RLHNFNTQKE VDPTLNPSFA ARLEGVCPAH NTVKNAGSTL 
DGTVTSFDNI YYKMLMQGKS LFSSDEALLA VPSTKKLVAK YASSNEEFER AFVKSMIKMS SISGNGNEVR LNCRRVR* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTAAATAC ATTTCTTTTC AGTCAAGAAA GATATATTTT GATAAATTTG TTAGTAAGTA CTTACTATTT CCGAAATGAA TGCACATTTC CTCAATCTCC TTCTCATGGT CATCTTAGTG  GTTTCTTTTG ACGTCCAAGC ACTCAGTCCT CACTACTACG ACCATTCATG TCCACAAGCT GACCACATTG TCACCAATGC AGTCAAGAAA GCCATGTCAA ACGACAAAAC AGTCCCCGCT  GCGCTCTTGA GGATGCATTT CCACGACTGC TTCGTCAGAG TACTAACTAC TTACACACCA CATTCTTGTC ATCTTTCAAT GTTATATGTG TTTAATACTC TAAATAATGT TTTTGGTGAA  TATTTTTAAT CATTAAAGGG ATGTGATGGG TCAGTTCTAC TAGACTCGAA GGGGAAGAAC AAAGCAGAGA AAGATGGACC TCCTAACATC TCACTCCATG CCTTTTATGT GATTGACAAT  GCAAAGAAGG CATTAGAAGA GCAATGTCCC GGTATCGTCT CTTGTGCCGA TATTCTTTCA CTAGCTGCAA GAGATGCTGT CGCTCTCGTG AGTCTCTCTC TCCATCTCAT ATTCCAAATA  CTACCTTTTT TGTATGATTA TGAAGATCCA CCTAAAACAT TCTTTGTGGA TGTTGTTATA TAGTCAGGAG GGCCTACATG GGAAGTGCCG AAAGGGAGAA AAGATGGAAG AATATCAAAG  GCAATAGAAA CAAGACAACT ACCAGCTCCT ACTTTCAACA TCTCTCAACT ACGTCAAAAT TTTGGCCAAA GAGGCCTCTC TATGCATGAT CTTGTTGTTC TCTCTGGTAT TCTACATTCT  CTCGTTCACC CAAAATATAT TTACAAAGAT ATCTTAAAAT CTTGTTAGTT GTTATAAAAG TATCCTTAAA GATGTAACAT AACTATATGA AAACAAAATA TAGTTTAAAT CCTAAAAATA  AGTGGCGTAT ACACAATCTA GAGGCTAGGT GCATGGTATA CGAATATAGT TTAGATGATG TTAATTATTT ATGTAAAGGA GTACAAATTG GGAATGTTGA ATGAAATGGC AGGGGGACAT  ACACTAGGAT TCGCCCACTG CTCATCGTTC CAGAATAGGC TCCACAATTT CAACACACAA AAGGAGGTTG ATCCAACACT AAACCCATCG TTCGCAGCCA GATTGGAGGG AGTGTGCCCA  GCCCATAACA CGGTGAAGAA CGCTGGATCA ACATTGGATG GAACCGTGAC GTCATTCGAC AATATCTACT ACAAAATGCT TATGCAAGGC AAGTCACTCT TCTCATCCGA CGAAGCGCTT  CTCGCAGTGC CCTCTACTAA GAAACTTGTG GCCAAGTACG CGAGTTCCAA CGAAGAGTTT GAGAGGGCTT TTGTGAAATC CATGATCAAG ATGAGTAGTA TCAGTGGCAA TGGTAATGAG  GTCAGACTTA ATTGCAGGAG GGTTCGCTAG AATCTCAATC TAACGCTTCC AACAGCAAGT TACGACATTT ATGTCTTTCT TTTTCTCTCG TCACATTGAT TACTTGTGAA TGGACCTTTC 
TAAAGATTAA GGCGGAGGTT CTTGTATCAC TATAATCTAT CATTCTCTCG TGTGTGCTTG TATAGTCATT TAATTACAAT AATCTTATCA CTAGTGCT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGAATGCAC ATTTCCTCAA TCTCCTTCTC ATGGTCATCT TAGTGGTTTC TTTTGACGTC CAAGCACTCA GTCCTCACTA CTACGACCAT TCATGTCCAC AAGCTGACCA CATTGTCACC  AATGCAGTCA AGAAAGCCAT GTCAAACGAC AAAACAGTCC CCGCTGCGCT CTTGAGGATG CATTTCCACG ACTGCTTCGT CAGAGGATGT GATGGGTCAG TTCTACTAGA CTCGAAGGGG  AAGAACAAAG CAGAGAAAGA TGGACCTCCT AACATCTCAC TCCATGCCTT TTATGTGATT GACAATGCAA AGAAGGCATT AGAAGAGCAA TGTCCCGGTA TCGTCTCTTG TGCCGATATT  CTTTCACTAG CTGCAAGAGA TGCTGTCGCT CTCTCAGGAG GGCCTACATG GGAAGTGCCG AAAGGGAGAA AAGATGGAAG AATATCAAAG GCAATAGAAA CAAGACAACT ACCAGCTCCT  ACTTTCAACA TCTCTCAACT ACGTCAAAAT TTTGGCCAAA GAGGCCTCTC TATGCATGAT CTTGTTGTTC TCTCTGGGGG ACATACACTA GGATTCGCCC ACTGCTCATC GTTCCAGAAT  AGGCTCCACA ATTTCAACAC ACAAAAGGAG GTTGATCCAA CACTAAACCC ATCGTTCGCA GCCAGATTGG AGGGAGTGTG CCCAGCCCAT AACACGGTGA AGAACGCTGG ATCAACATTG  GATGGAACCG TGACGTCATT CGACAATATC TACTACAAAA TGCTTATGCA AGGCAAGTCA CTCTTCTCAT CCGACGAAGC GCTTCTCGCA GTGCCCTCTA CTAAGAAACT TGTGGCCAAG 
TACGCGAGTT CCAACGAAGA GTTTGAGAGG GCTTTTGTGA AATCCATGAT CAAGATGAGT AGTATCAGTG GCAATGGTAA TGAGGTCAGA CTTAATTGCA GGAGGGTTCG CTAG 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
CTCTAAATAC ATTTCTTTTC AGTCAAGAAA GATATATTTT GATAAATTTG TTAGTAAGTA CTTACTATTT CCGAAATGAA TGCACATTTC CTCAATCTCC TTCTCATGGT CATCTTAGTG  GTTTCTTTTG ACGTCCAAGC ACTCAGTCCT CACTACTACG ACCATTCATG TCCACAAGCT GACCACATTG TCACCAATGC AGTCAAGAAA GCCATGTCAA ACGACAAAAC AGTCCCCGCT  GCGCTCTTGA GGATGCATTT CCACGACTGC TTCGTCAGAG GATGTGATGG GTCAGTTCTA CTAGACTCGA AGGGGAAGAA CAAAGCAGAG AAAGATGGAC CTCCTAACAT CTCACTCCAT  GCCTTTTATG TGATTGACAA TGCAAAGAAG GCATTAGAAG AGCAATGTCC CGGTATCGTC TCTTGTGCCG ATATTCTTTC ACTAGCTGCA AGAGATGCTG TCGCTCTCTC AGGAGGGCCT  ACATGGGAAG TGCCGAAAGG GAGAAAAGAT GGAAGAATAT CAAAGGCAAT AGAAACAAGA CAACTACCAG CTCCTACTTT CAACATCTCT CAACTACGTC AAAATTTTGG CCAAAGAGGC  CTCTCTATGC ATGATCTTGT TGTTCTCTCT GGGGGACATA CACTAGGATT CGCCCACTGC TCATCGTTCC AGAATAGGCT CCACAATTTC AACACACAAA AGGAGGTTGA TCCAACACTA  AACCCATCGT TCGCAGCCAG ATTGGAGGGA GTGTGCCCAG CCCATAACAC GGTGAAGAAC GCTGGATCAA CATTGGATGG AACCGTGACG TCATTCGACA ATATCTACTA CAAAATGCTT  ATGCAAGGCA AGTCACTCTT CTCATCCGAC GAAGCGCTTC TCGCAGTGCC CTCTACTAAG AAACTTGTGG CCAAGTACGC GAGTTCCAAC GAAGAGTTTG AGAGGGCTTT TGTGAAATCC  ATGATCAAGA TGAGTAGTAT CAGTGGCAAT GGTAATGAGG TCAGACTTAA TTGCAGGAGG GTTCGCTAGA ATCTCAATCT AACGCTTCCA ACAGCAAGTT ACGACATTTA TGTCTTTCTT  TTTCTCTCGT CACATTGATT ACTTGTGAAT GGACCTTTCT AAAGATTAAG GCGGAGGTTC TTGTATCACT ATAATCTATC ATTCTCTCGT GTGTGCTTGT ATAGTCATTT AATTACAATA 
ATCTTATCAC TAGTGCT 

Retrieve as FASTA