Entry information : BstrAPx03 (Bostr.7867s1359)
Entry ID 14940
Creation 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Last sequence changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Sequence status N/D
Reviewer Not yet reviewed
Last annotation changes 2018-03-02 (Christophe Dunand)
Peroxidase information: BstrAPx03 (Bostr.7867s1359)
Name (synonym) BstrAPx03 (Bostr.7867s1359)
Class Ascorbate peroxidase     [Orthogroup: APx003]*
Taxonomy Eukaryota Viridiplantae Streptophyta Brassicaceae Boechera
Organism Boechera stricta    [TaxId: 72658 ]
Cellular localisation N/D
Tissue type N/D
Inducer N/D
Repressor N/D
Best BLASTp hits
Perox score E-value BstrAPx03
start..stop
S start..stop
CagraAPx03-1 584 0 1..287 1..287
CrubAPx03-1 564 0 1..287 1..287
BnAPx03-1Aa_other 543 0 1..287 1..287
AtAPx03 535 0 1..287 1..287
Literature and cross-references BstrAPx03 (Bostr.7867s1359)
Protein sequence: BstrAPx03 (Bostr.7867s1359)
Sequence Properties
first value : protein
second value (mature protein)
Length (aa):   %s   287
PWM (Da):   %s   31693.23 Transmb domain:   %s   o258-280i
PI (pH):   %s   6.89
Sequence
Send to BLAST
Send to Peroxiscan
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
MATPIVDAEY LKEITKVRRD LRSLISNKNC APIMLRLAWH DAGTYDAQSK TGGPNGSIRN EEEYTHGANS GLKIALDLCE GVKAKHPKIT YADLYQLAGV VAVEVTGGPD ISFVPGRKDS  KVSTREGRLP DAKQGFQHLR DVFYRMGLSD KDIVALSGAH TLGRAHPERS GFDGPWTQEP LKFDNSYFVE LLKGESEGLL KLPTDKTLLE DPEFRRYVEL YAKDEDAFFR DYAESHKKLS 
ELGFNPSSSA GKAVADSAIL AQSAFGVAVA AAVVAFSYFY EIRKRMK* 

Retrieve as FASTA  
Remarks
DNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTGGCCCAA ACTTCAGTGT AACCAAAAAA AATCTTCACA CCTCTTGACC ATTTTCTTCT TCATCGCTCT CTCTATCTCC TTCACCAATC CCAGACGAGC AGGAGCTATG GCGACACCGA  TTGTTGACGC AGAGTACTTG AAAGAGATCA CCAAGGTTCG CCGTGACCTC CGCTCTCTCA TCTCGAACAA GAACTGTGCT CCGATCATGC TCCGATTGGC GTAAGTTTCG ATTTCTTTGG  TTTTCTTCGA TCCACTTATG TTGACTGCAA CGTATTTCGT TTTTTTTTCT GTAGAAATAG CTCGATTATA GTTAGGCTGT AGATATCGCT CAATCGTTTG TTTTTTAAAT GGTGAAATGT  TGTCTCATCT GGTTTTTGTG AAGATGGCAC GATGCTGGAA CCTATGATGC TCAGTCGAAG ACCGGTGGAC CTAATGGCTC TATCAGGAAC GAAGAGGAGT ACACTCATGG TGCCAACAGT  GGTTTGAAGA TCGCTCTCGA TCTCTGTGGT AGGATTTTGA TTTAGTTATT GTAGAATCGT TTTCTGGATA ATTTCTCTTC AGCTGCGCTT TCTTTGTTCC TCATTTTCGT TGGTGACGAG  AGATTACTCT ATACGCAGAC TTGGTGTGTA CTGTTTATAT TTCTCGATTT ACTTACATAG TCCGTGGATT AGATTGTTCT TGAATTTTGG ATAGCCAATA CTGTGCTCTC ATGTGGTGTC  TCCTTTTTAT CTTATGGTTT AAGAACACCG TTCTAAATTA TTCCATTATG TTTTTTTGGA ATGGACTTTA AATTTTTTAG TAATGAGATC TTATCTTTGA TGTCTCAGAG GGCGTGAAAG  CTAAGCATCC CAAAATCACA TACGCAGACC TATATCAGGT GATTATGAGA TTTTGCTTAA AGTATTTTGA TTACAGTGAG GTTCTAACAA AATTAAGACT GAAATAAATC CATAATTGAT  GCAATTTTAT TAGTTTTGCT GGCCATATAG TTACTATAGC CAACCAGACT CGAGCCTTGT TGTTTTCCTG TGCTCTTTTG TCAAAATTCT ATGGAACCTA ATACTCATCG TGTCTCATAG  ACTCATCCCA TGTTCTAGCT TGTTTGGTAG ACTCGGTTGA GTTGTGTAAT CTTGGTCACA GGATATTGCA ACAATGGAAT AAGAATTTTA TTTTTCTAGG AAATGTTGCG GATTGTGTTT  TGATATCTTG ACTATGTCCA TTTGTTCCAA GAAAGACAGA TTGACTATGT TGTTCAAGTA GAAACGTTTT CTCTTACAAG TAGAAACTAG ATTCAAGTAA AATATGCTCT CAAGAATGAG  TTTGTAACAA AACCTCAAGC TATTCCCATG CTAGGGGATA TGCTTCATGG TCGACCAGAA TAAATCTGCC TATTTTATCC TTCCTGTAAA TCTTGACTTT TAATTCCTGA ATTTGTCATG  ACCAGGAGGT TTGGCAAATT CATCAATTAG TTTCGTGATA TTGTTTACTC ATCTGTTTTA TTGACTTAAG ACTTGGACTG AGTAGAATTC ACATGTCTGT CGCTTGCACC TATATTATAT  GAATGCCCAG AAGAAGTTTC CAATTGGAGC AGCAGTTTAA TAGCAATTTA TATAATTCTT GTGTTTCAGC TTGCTGGTGT GGTAGCAGTG GAGGTGACTG GTGGACCTGA CATCAGCTTC  GTTCCTGGGA GAAAAGTATA GTTTCTCATT CTTCAAAACA TTATAACAGT TTACCAGTTT TAGCGCTGAA GCAAATAACC GTAATACTGT ATGTTTCTTC TTGATAGGAT TCAAAGGTCT  CCACCAGGGA AGGAAGACTT CCTGATGCTA AACAAGGTAC AATAAATCTT TTATCATTTA TAGGACACTT TGATGTTCTC TAATGTAACT CTAATCATGG AATTGGAAGA TCTTCTTTCT  AAATTTACCT TGTTTATTTG TCTGTAGGTT TTCAACATCT AAGAGATGTA TTCTACCGCA TGGGATTATC TGATAAGGAT ATTGTGGCAC TCTCAGGGGC TCATACTCTG GTAAATTCAT  TGGTCACTTA CTTAAAACCC GCTTTTTTTT AACAAATAAA AGGTAATGCA TGTGCTTATG ATCACTTTTT GGTGTTTAGG GAAGGGCTCA TCCAGAGAGG TCAGGCTTCG ATGGACCATG  GACTCAAGAG CCTCTGAAGT TTGATAACTC CTACTTCGTG TAATTTTCTT CATTTCTTTA TCCTCAGAGA TTCTTTGTTT TTTTTTTTAA TCTTTTTTGT TTGTGAAGAA GAACAAGAAG  CAAACAACTA CTTTATTACA AGATCTGTTT AACCCATGAA TACTTACTGT TTTGGTACCA GGGAACTGCT GAAAGGAGAA TCAGAGGGCT TGTTGAAACT TCCAACTGAC AAGACTCTAT  TAGAAGACCC GGAATTCCGT CGTTATGTTG AGCTCTATGC AAAGGTAAAA TAAAACTGGA ATTCTTCTGT GTCTCTTTAA CCATTTGTTT CTTGCTTTGC TATGATAAGA ACATAACTCG  ATTTCATGTA TTGATTTCAC ATACTCACTG AACCCACTAG CACAAAGAAT CACAAACCAA AATATTATGG TTTTGTTCTT TGAGAACCCC ATGAATCCTA ATCACCAATA ATAGTTGCTG  ATGTTGCAAA GTGAAAATAT GAACACGCTT ATGAATTCTT ATCATCTTAT CATGGTGTTC TTCATGTTTG TTGTCAACTA AAATCAGTTT TTCTAAGAAC TGTAAATAAA AATCATGACG  CTTCTCTATG ATTTCCTTTC TTGATTAATG ATTCAAAATT TGATAATTAG CTACATATAT AGTGGTTCAT CCTATTTGTC CTGTTTTTGT GTTGTTAGAT GTTATTTTGA CAAGTTCTAC  TGGTGTTACC AGGATGAAGA TGCATTCTTC AGAGACTACG CTGAATCGCA CAAGAAACTC TCTGAGCTTG GTTTCAACCC AAGCTCCTCA GCGGGCAAAG CGGTTGCAGA CAGTGCGATT  CTGGCACAGA GCGCGTTCGG GGTTGCGGTT GCTGCTGCGG TTGTGGCCTT TAGTTACTTT TACGAGATTC GGAAGAGGAT GAAGTAAATG GAATAGAAGG AAAACTATCA GATAATACCC  TATTTTGCTG CTACAATATG CTAAACTCTT TAATCCACGA TCATACTGTT TTGTAGTAAA AAGTCAAAAG TCAGATAAGA ATTTGGGGTA AAATTGATCG TAATTGATGG TTGCGTAACT 
GTTCATTGCA ACGTTCGTTA CCATT 

Retrieve as FASTA  
CDS
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
ATGGCGACAC CGATTGTTGA CGCAGAGTAC TTGAAAGAGA TCACCAAGGT TCGCCGTGAC CTCCGCTCTC TCATCTCGAA CAAGAACTGT GCTCCGATCA TGCTCCGATT GGCATGGCAC  GATGCTGGAA CCTATGATGC TCAGTCGAAG ACCGGTGGAC CTAATGGCTC TATCAGGAAC GAAGAGGAGT ACACTCATGG TGCCAACAGT GGTTTGAAGA TCGCTCTCGA TCTCTGTGAG  GGCGTGAAAG CTAAGCATCC CAAAATCACA TACGCAGACC TATATCAGCT TGCTGGTGTG GTAGCAGTGG AGGTGACTGG TGGACCTGAC ATCAGCTTCG TTCCTGGGAG AAAAGATTCA  AAGGTCTCCA CCAGGGAAGG AAGACTTCCT GATGCTAAAC AAGGTTTTCA ACATCTAAGA GATGTATTCT ACCGCATGGG ATTATCTGAT AAGGATATTG TGGCACTCTC AGGGGCTCAT  ACTCTGGGAA GGGCTCATCC AGAGAGGTCA GGCTTCGATG GACCATGGAC TCAAGAGCCT CTGAAGTTTG ATAACTCCTA CTTCGTGGAA CTGCTGAAAG GAGAATCAGA GGGCTTGTTG  AAACTTCCAA CTGACAAGAC TCTATTAGAA GACCCGGAAT TCCGTCGTTA TGTTGAGCTC TATGCAAAGG ATGAAGATGC ATTCTTCAGA GACTACGCTG AATCGCACAA GAAACTCTCT  GAGCTTGGTT TCAACCCAAG CTCCTCAGCG GGCAAAGCGG TTGCAGACAG TGCGATTCTG GCACAGAGCG CGTTCGGGGT TGCGGTTGCT GCTGCGGTTG TGGCCTTTAG TTACTTTTAC 
GAGATTCGGA AGAGGATGAA GTAA 

Retrieve as FASTA  
cDNA
Send to BLAST
.........1 .........2 .........3 .........4 .........5 .........6 .........7 .........8 .........9 .........0 .........1 .........2
TTTGGCCCAA ACTTCAGTGT AACCAAAAAA AATCTTCACA CCTCTTGACC ATTTTCTTCT TCATCGCTCT CTCTATCTCC TTCACCAATC CCAGACGAGC AGGAGCTATG GCGACACCGA  TTGTTGACGC AGAGTACTTG AAAGAGATCA CCAAGGTTCG CCGTGACCTC CGCTCTCTCA TCTCGAACAA GAACTGTGCT CCGATCATGC TCCGATTGGC ATGGCACGAT GCTGGAACCT  ATGATGCTCA GTCGAAGACC GGTGGACCTA ATGGCTCTAT CAGGAACGAA GAGGAGTACA CTCATGGTGC CAACAGTGGT TTGAAGATCG CTCTCGATCT CTGTGAGGGC GTGAAAGCTA  AGCATCCCAA AATCACATAC GCAGACCTAT ATCAGCTTGC TGGTGTGGTA GCAGTGGAGG TGACTGGTGG ACCTGACATC AGCTTCGTTC CTGGGAGAAA AGATTCAAAG GTCTCCACCA  GGGAAGGAAG ACTTCCTGAT GCTAAACAAG GTTTTCAACA TCTAAGAGAT GTATTCTACC GCATGGGATT ATCTGATAAG GATATTGTGG CACTCTCAGG GGCTCATACT CTGGGAAGGG  CTCATCCAGA GAGGTCAGGC TTCGATGGAC CATGGACTCA AGAGCCTCTG AAGTTTGATA ACTCCTACTT CGTGGAACTG CTGAAAGGAG AATCAGAGGG CTTGTTGAAA CTTCCAACTG  ACAAGACTCT ATTAGAAGAC CCGGAATTCC GTCGTTATGT TGAGCTCTAT GCAAAGGATG AAGATGCATT CTTCAGAGAC TACGCTGAAT CGCACAAGAA ACTCTCTGAG CTTGGTTTCA  ACCCAAGCTC CTCAGCGGGC AAAGCGGTTG CAGACAGTGC GATTCTGGCA CAGAGCGCGT TCGGGGTTGC GGTTGCTGCT GCGGTTGTGG CCTTTAGTTA CTTTTACGAG ATTCGGAAGA  GGATGAAGTA AATGGAATAG AAGGAAAACT ATCAGATAAT ACCCTATTTT GCTGCTACAA TATGCTAAAC TCTTTAATCC ACGATCATAC TGTTTTGTAG TAAAAAGTCA AAAGTCAGAT 
AAGAATTTGG GGTAAAATTG ATCGTAATTG ATGGTTGCGT AACTGTTCAT TGCAACGTTC GTTACCATT 

Retrieve as FASTA